FuNGI

M2R3M4

Protein Details

Accession

M2R3M4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
700-720	EEEKKKGRPTAKKHPVVRMKA	Basic
901-928	DADGEVVPKKKKKRGPRVRKDNVEDEFS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
703-713	KKKGRPTAKKH
908-920	PKKKKKRGPRVRK

Subcellular Location(s)

cyto 12.5, cyto_nucl 10.5, nucl 7.5, pero 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024075 DNA-dir_RNA_pol_helix_hairp_sf IPR046950 DNA-dir_Rpol_C_phage-type IPR002092 DNA-dir_Rpol_phage-type IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR037159 RNA_POL_N_sf IPR029262 RPOL_N
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF00940 RNA_pol PF14700 RPOL_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS00900 RNA_POL_PHAGE_1 PS00489 RNA_POL_PHAGE_2

Amino Acid Sequences

MPDDVAARQKLLEDSVYDVAVKQMEHQAQMLEELGLNNRGLKQADLQSWMWGWHQKLQKRLQAEIENLVEEERKLGGKYQGVKTSLSPFLTLLKPEKLSLITILELMNLHGTGGVSDGMKTARALLGVGRAVELEHKAQMCKKNNIAIPQSQFARQDTSLFTRLGYRDLQARRVAARKYMEDAEDWTSDWSQLVRVKVGGFLVDCLMDVATITRSMTDPNGEEIYSEEQPAFFHSYEYVRGHKLGVIKLNPVVAERMAKDRIKNTLHPRHLPMLVKPKPWLGPDQGGYMYNRTTAMRYKDSVEQANYLRHASAAGNLELVYAALDVLGSTPWNINRRIFDIVLTVWNSGKRMCKMPPVVSDIPEPERPENYETDQQARAIYLQRHKLYAQQKANNHSDRCSVNYKIEIARAFLGDTIFMPHNVDFRGRAYPVPPHLSHIGDDLSRGLLLFGEAKPLGERGFWWLKVHLANLYGYDKGSFPERIAFVEAHLDDIFDSVDHPLDGRMWWTKADDPWQCLATCMELKAAIESGDPHKYECALPIHQDGTCNGLQHYAALGGDTQGAAQVNLAVTDRPSDVYTYVADMVEGRIREDVAKGDKVAMLLQGKVARKVVKQTVMTTVYGVTYIGARAQIEKQLASRGDIPAEECWAASSYLAKHVLGSIGDLFRGAKDIQLWFTSCARLIAKSIPPERIPHACGLVEEEKKKGRPTAKKHPVVRMKAEQMTSVVWTTPLGLPIVQPYRTVKRKQIMTGLQTVFISDPNQPAAVNSQKQASAFPPNFIHSLDATHMMLTALECRAQGLTFASVHDSYWTHAGDIDNMSAIIRDTFIALHSSDVLLQLHNEFLERYKGYKIPLNSLRSTPFEKKAFAIARMSADELEVHRARREAGEPEEPVEEEDVEIDADGEVVPKKKKKRGPRVRKDNVEDEFSDEGHYMGQFIDLLDILPSVPQKGDFDVKTIKKSLYFFS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.21
3	0.21
4	0.19
5	0.17
6	0.17
7	0.17
8	0.16
9	0.14
10	0.2
11	0.22
12	0.24
13	0.24
14	0.24
15	0.22
16	0.23
17	0.21
18	0.14
19	0.12
20	0.12
21	0.13
22	0.15
23	0.14
24	0.15
25	0.16
26	0.19
27	0.19
28	0.19
29	0.23
30	0.28
31	0.31
32	0.34
33	0.33
34	0.33
35	0.33
36	0.33
37	0.3
38	0.28
39	0.27
40	0.3
41	0.37
42	0.39
43	0.48
44	0.55
45	0.58
46	0.57
47	0.59
48	0.6
49	0.58
50	0.57
51	0.54
52	0.46
53	0.41
54	0.37
55	0.33
56	0.26
57	0.19
58	0.17
59	0.13
60	0.13
61	0.12
62	0.17
63	0.21
64	0.26
65	0.34
66	0.4
67	0.45
68	0.45
69	0.46
70	0.44
71	0.45
72	0.44
73	0.38
74	0.31
75	0.25
76	0.28
77	0.29
78	0.3
79	0.28
80	0.29
81	0.29
82	0.29
83	0.31
84	0.27
85	0.26
86	0.24
87	0.22
88	0.17
89	0.17
90	0.16
91	0.14
92	0.13
93	0.12
94	0.11
95	0.08
96	0.08
97	0.07
98	0.07
99	0.06
100	0.07
101	0.08
102	0.07
103	0.07
104	0.09
105	0.08
106	0.09
107	0.09
108	0.1
109	0.1
110	0.1
111	0.1
112	0.1
113	0.14
114	0.14
115	0.14
116	0.13
117	0.12
118	0.12
119	0.14
120	0.15
121	0.12
122	0.15
123	0.16
124	0.19
125	0.26
126	0.35
127	0.4
128	0.46
129	0.48
130	0.52
131	0.55
132	0.6
133	0.58
134	0.56
135	0.53
136	0.51
137	0.48
138	0.44
139	0.43
140	0.37
141	0.37
142	0.3
143	0.28
144	0.27
145	0.31
146	0.3
147	0.28
148	0.27
149	0.27
150	0.27
151	0.28
152	0.25
153	0.21
154	0.26
155	0.29
156	0.34
157	0.31
158	0.33
159	0.35
160	0.4
161	0.4
162	0.39
163	0.4
164	0.37
165	0.39
166	0.39
167	0.35
168	0.3
169	0.31
170	0.28
171	0.24
172	0.22
173	0.19
174	0.17
175	0.16
176	0.15
177	0.13
178	0.13
179	0.16
180	0.17
181	0.17
182	0.17
183	0.17
184	0.18
185	0.18
186	0.16
187	0.12
188	0.11
189	0.11
190	0.09
191	0.09
192	0.08
193	0.07
194	0.06
195	0.05
196	0.05
197	0.06
198	0.06
199	0.06
200	0.07
201	0.07
202	0.09
203	0.1
204	0.12
205	0.12
206	0.15
207	0.16
208	0.15
209	0.15
210	0.16
211	0.19
212	0.17
213	0.17
214	0.13
215	0.12
216	0.12
217	0.16
218	0.17
219	0.13
220	0.13
221	0.14
222	0.15
223	0.2
224	0.23
225	0.23
226	0.21
227	0.21
228	0.21
229	0.22
230	0.24
231	0.23
232	0.27
233	0.26
234	0.26
235	0.27
236	0.27
237	0.25
238	0.22
239	0.19
240	0.14
241	0.15
242	0.14
243	0.18
244	0.22
245	0.24
246	0.27
247	0.28
248	0.35
249	0.37
250	0.43
251	0.49
252	0.54
253	0.58
254	0.6
255	0.61
256	0.58
257	0.58
258	0.53
259	0.49
260	0.49
261	0.48
262	0.46
263	0.43
264	0.42
265	0.41
266	0.4
267	0.38
268	0.32
269	0.33
270	0.32
271	0.33
272	0.3
273	0.28
274	0.27
275	0.24
276	0.2
277	0.15
278	0.15
279	0.12
280	0.14
281	0.17
282	0.22
283	0.24
284	0.25
285	0.27
286	0.32
287	0.35
288	0.37
289	0.34
290	0.32
291	0.31
292	0.32
293	0.3
294	0.25
295	0.21
296	0.17
297	0.17
298	0.13
299	0.15
300	0.14
301	0.13
302	0.12
303	0.12
304	0.12
305	0.11
306	0.1
307	0.06
308	0.04
309	0.03
310	0.03
311	0.03
312	0.03
313	0.03
314	0.03
315	0.03
316	0.04
317	0.06
318	0.09
319	0.13
320	0.16
321	0.18
322	0.2
323	0.23
324	0.26
325	0.24
326	0.21
327	0.2
328	0.18
329	0.19
330	0.18
331	0.15
332	0.13
333	0.13
334	0.14
335	0.14
336	0.19
337	0.18
338	0.21
339	0.23
340	0.29
341	0.34
342	0.38
343	0.39
344	0.42
345	0.41
346	0.39
347	0.38
348	0.33
349	0.32
350	0.3
351	0.29
352	0.22
353	0.22
354	0.23
355	0.23
356	0.23
357	0.23
358	0.26
359	0.25
360	0.28
361	0.27
362	0.25
363	0.23
364	0.21
365	0.18
366	0.17
367	0.21
368	0.23
369	0.29
370	0.29
371	0.31
372	0.31
373	0.37
374	0.39
375	0.44
376	0.46
377	0.45
378	0.48
379	0.53
380	0.61
381	0.59
382	0.54
383	0.46
384	0.42
385	0.37
386	0.37
387	0.35
388	0.29
389	0.25
390	0.25
391	0.26
392	0.23
393	0.25
394	0.21
395	0.18
396	0.17
397	0.15
398	0.13
399	0.12
400	0.1
401	0.07
402	0.07
403	0.08
404	0.08
405	0.08
406	0.09
407	0.08
408	0.1
409	0.1
410	0.11
411	0.09
412	0.11
413	0.13
414	0.13
415	0.13
416	0.13
417	0.17
418	0.2
419	0.24
420	0.23
421	0.23
422	0.24
423	0.24
424	0.23
425	0.21
426	0.18
427	0.12
428	0.12
429	0.1
430	0.08
431	0.07
432	0.06
433	0.05
434	0.04
435	0.04
436	0.05
437	0.05
438	0.07
439	0.07
440	0.07
441	0.08
442	0.08
443	0.08
444	0.07
445	0.07
446	0.1
447	0.14
448	0.14
449	0.15
450	0.15
451	0.17
452	0.18
453	0.18
454	0.13
455	0.11
456	0.11
457	0.11
458	0.12
459	0.1
460	0.09
461	0.09
462	0.09
463	0.08
464	0.1
465	0.09
466	0.08
467	0.11
468	0.11
469	0.12
470	0.13
471	0.13
472	0.1
473	0.13
474	0.13
475	0.11
476	0.1
477	0.1
478	0.08
479	0.08
480	0.08
481	0.04
482	0.05
483	0.04
484	0.04
485	0.04
486	0.04
487	0.04
488	0.05
489	0.05
490	0.06
491	0.08
492	0.08
493	0.09
494	0.11
495	0.12
496	0.13
497	0.21
498	0.21
499	0.22
500	0.23
501	0.24
502	0.22
503	0.21
504	0.2
505	0.15
506	0.13
507	0.11
508	0.09
509	0.08
510	0.08
511	0.08
512	0.08
513	0.06
514	0.05
515	0.06
516	0.09
517	0.12
518	0.12
519	0.12
520	0.12
521	0.13
522	0.13
523	0.15
524	0.16
525	0.14
526	0.16
527	0.17
528	0.18
529	0.17
530	0.18
531	0.15
532	0.16
533	0.15
534	0.14
535	0.12
536	0.12
537	0.11
538	0.11
539	0.11
540	0.07
541	0.06
542	0.05
543	0.05
544	0.04
545	0.05
546	0.04
547	0.04
548	0.04
549	0.05
550	0.04
551	0.04
552	0.05
553	0.04
554	0.05
555	0.05
556	0.04
557	0.05
558	0.06
559	0.06
560	0.07
561	0.08
562	0.08
563	0.08
564	0.09
565	0.09
566	0.09
567	0.09
568	0.08
569	0.08
570	0.07
571	0.08
572	0.09
573	0.09
574	0.08
575	0.08
576	0.08
577	0.09
578	0.09
579	0.11
580	0.13
581	0.14
582	0.13
583	0.14
584	0.14
585	0.14
586	0.14
587	0.14
588	0.11
589	0.1
590	0.12
591	0.16
592	0.16
593	0.17
594	0.19
595	0.19
596	0.19
597	0.25
598	0.29
599	0.3
600	0.31
601	0.32
602	0.35
603	0.35
604	0.34
605	0.28
606	0.23
607	0.17
608	0.15
609	0.13
610	0.07
611	0.05
612	0.05
613	0.05
614	0.06
615	0.06
616	0.07
617	0.09
618	0.12
619	0.13
620	0.13
621	0.13
622	0.18
623	0.18
624	0.18
625	0.19
626	0.17
627	0.17
628	0.16
629	0.17
630	0.13
631	0.14
632	0.12
633	0.1
634	0.1
635	0.1
636	0.1
637	0.08
638	0.1
639	0.09
640	0.14
641	0.15
642	0.14
643	0.13
644	0.13
645	0.15
646	0.12
647	0.12
648	0.1
649	0.09
650	0.09
651	0.09
652	0.08
653	0.07
654	0.1
655	0.09
656	0.08
657	0.1
658	0.11
659	0.13
660	0.15
661	0.16
662	0.16
663	0.17
664	0.17
665	0.15
666	0.17
667	0.16
668	0.15
669	0.15
670	0.18
671	0.21
672	0.27
673	0.3
674	0.32
675	0.32
676	0.34
677	0.37
678	0.36
679	0.34
680	0.28
681	0.28
682	0.24
683	0.22
684	0.25
685	0.27
686	0.28
687	0.27
688	0.29
689	0.31
690	0.34
691	0.36
692	0.37
693	0.4
694	0.45
695	0.53
696	0.61
697	0.67
698	0.74
699	0.77
700	0.81
701	0.81
702	0.77
703	0.76
704	0.71
705	0.67
706	0.62
707	0.57
708	0.48
709	0.39
710	0.34
711	0.28
712	0.21
713	0.15
714	0.1
715	0.1
716	0.11
717	0.11
718	0.11
719	0.1
720	0.09
721	0.1
722	0.15
723	0.2
724	0.18
725	0.19
726	0.23
727	0.32
728	0.39
729	0.44
730	0.46
731	0.49
732	0.55
733	0.57
734	0.61
735	0.59
736	0.56
737	0.6
738	0.52
739	0.46
740	0.4
741	0.36
742	0.28
743	0.22
744	0.19
745	0.12
746	0.13
747	0.13
748	0.14
749	0.13
750	0.13
751	0.18
752	0.24
753	0.24
754	0.24
755	0.25
756	0.26
757	0.26
758	0.27
759	0.25
760	0.27
761	0.26
762	0.28
763	0.28
764	0.29
765	0.3
766	0.29
767	0.28
768	0.18
769	0.19
770	0.17
771	0.17
772	0.15
773	0.14
774	0.14
775	0.11
776	0.11
777	0.09
778	0.1
779	0.08
780	0.09
781	0.09
782	0.09
783	0.1
784	0.1
785	0.1
786	0.1
787	0.12
788	0.11
789	0.12
790	0.15
791	0.14
792	0.15
793	0.16
794	0.15
795	0.13
796	0.17
797	0.17
798	0.13
799	0.15
800	0.16
801	0.16
802	0.17
803	0.16
804	0.13
805	0.13
806	0.12
807	0.1
808	0.1
809	0.07
810	0.06
811	0.06
812	0.06
813	0.07
814	0.08
815	0.09
816	0.09
817	0.09
818	0.1
819	0.1
820	0.1
821	0.11
822	0.11
823	0.1
824	0.1
825	0.1
826	0.1
827	0.1
828	0.1
829	0.09
830	0.11
831	0.17
832	0.17
833	0.18
834	0.22
835	0.24
836	0.27
837	0.33
838	0.33
839	0.37
840	0.44
841	0.48
842	0.47
843	0.48
844	0.49
845	0.47
846	0.52
847	0.49
848	0.49
849	0.46
850	0.45
851	0.43
852	0.48
853	0.47
854	0.43
855	0.4
856	0.35
857	0.34
858	0.34
859	0.34
860	0.25
861	0.21
862	0.2
863	0.17
864	0.23
865	0.22
866	0.22
867	0.23
868	0.24
869	0.25
870	0.27
871	0.29
872	0.27
873	0.31
874	0.36
875	0.35
876	0.36
877	0.36
878	0.33
879	0.3
880	0.25
881	0.2
882	0.13
883	0.12
884	0.1
885	0.09
886	0.08
887	0.07
888	0.06
889	0.06
890	0.05
891	0.07
892	0.09
893	0.14
894	0.22
895	0.29
896	0.38
897	0.47
898	0.57
899	0.66
900	0.75
901	0.82
902	0.86
903	0.9
904	0.93
905	0.94
906	0.96
907	0.92
908	0.9
909	0.83
910	0.77
911	0.66
912	0.6
913	0.51
914	0.4
915	0.34
916	0.25
917	0.21
918	0.16
919	0.15
920	0.1
921	0.08
922	0.09
923	0.07
924	0.07
925	0.08
926	0.07
927	0.08
928	0.07
929	0.07
930	0.07
931	0.09
932	0.09
933	0.1
934	0.11
935	0.12
936	0.14
937	0.18
938	0.26
939	0.25
940	0.29
941	0.37
942	0.41
943	0.45
944	0.47
945	0.45
946	0.42

M2R3M4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer