FuNGI

M2PV38

Protein Details

Accession

M2PV38

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
783-805	ALKQLSERERERKRRLSENCESL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 14, cyto_nucl 10.5, plas 6, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019321 Nucleoporin_Nup88 IPR037700 NUP88/NUP82 IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005643 C:nuclear pore GO:0017056 F:structural constituent of nuclear pore GO:0051028 P:mRNA transport GO:0015031 P:protein transport GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus GO:0000056 P:ribosomal small subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF10168 Nup88

Amino Acid Sequences

MQLTPQEDDWDALFKDHPIFELAKDSKLARRDISLELSLSSLPDFTSLDPENDSPAPSGRRQTMLIKDSELIVAVGNEIRMTNLGDSRVGKATRKSYKILHTPNVTFDIHHMALNPNGKLLAVAGAFQVAVVVLPRAGFTRLVPTIVDCKSLQIGQYYHAANSSAPIAQVEWHPWGEGGSTLLVMTIDGKLREYDISMDADEPQQVLSFVPERKRNTFDATDASEREVASFSLGKGRADWGPLTIYALMRSGDIYSICPYIPQNTSIPSSYVHALECFVAAKQEYLSRSSSGASTSNLSAVYDYQHKYVTALMKQLPPGTVFPAPSRLVTVHPPTTIKSSPKRQGPFLLQPSPRNLEGSEGGDATDMIYMSFGNNVDADEEKADRIGVVLVTFQDGKVDVYLDVEKVEARWDHKEHPQDDLPMLAVYEIIDLGVVSTLKKITTRQSEPSLLGLLSGNYPVFLPDPIQDDTVYVHHAFGVHALQLAPLIDFTKTASRLQDSATSASTLKNSAGTNVFPLVSTFSVEHRSSSPVVGVAVPNDVYLTYSIFVLTAALRVTVLPLNLRPDSPTLPSSELPPVSPTDSPTRASRHHTDAAEARPYVSLLGSESFVLPPILASPSGLPHNALLSLPASARGEFQLTPDTLRFLASTAERLSTQKHEALLAHRTAEAREELQRQEFRRQQEKLRELLDRVTGLKDARQAKTQEKIRKAQEAQKTLLARMDRTLRALMEKASPELSEHETKWFEELRRMKEEVVGAGRYDERSLVTRTNLLRKEVDRLLPALKQLSERERERKRRLSENCESLGASQAFELGERSSEERVRIGKLEKELLRIADKLDTTLGRPPSHRGQPSES

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.21
3	0.2
4	0.2
5	0.19
6	0.2
7	0.19
8	0.29
9	0.28
10	0.26
11	0.29
12	0.3
13	0.33
14	0.37
15	0.4
16	0.32
17	0.34
18	0.36
19	0.38
20	0.41
21	0.37
22	0.33
23	0.29
24	0.28
25	0.24
26	0.2
27	0.16
28	0.11
29	0.09
30	0.09
31	0.1
32	0.09
33	0.16
34	0.17
35	0.18
36	0.21
37	0.21
38	0.24
39	0.24
40	0.25
41	0.2
42	0.23
43	0.26
44	0.27
45	0.33
46	0.32
47	0.35
48	0.37
49	0.43
50	0.46
51	0.47
52	0.45
53	0.41
54	0.38
55	0.36
56	0.33
57	0.26
58	0.17
59	0.12
60	0.1
61	0.09
62	0.09
63	0.08
64	0.08
65	0.07
66	0.08
67	0.08
68	0.1
69	0.11
70	0.13
71	0.14
72	0.17
73	0.19
74	0.22
75	0.27
76	0.28
77	0.3
78	0.34
79	0.42
80	0.48
81	0.51
82	0.52
83	0.53
84	0.6
85	0.66
86	0.68
87	0.66
88	0.64
89	0.62
90	0.61
91	0.59
92	0.5
93	0.4
94	0.34
95	0.33
96	0.26
97	0.25
98	0.22
99	0.2
100	0.25
101	0.29
102	0.27
103	0.2
104	0.19
105	0.19
106	0.17
107	0.15
108	0.14
109	0.09
110	0.09
111	0.09
112	0.09
113	0.09
114	0.08
115	0.08
116	0.04
117	0.04
118	0.04
119	0.04
120	0.04
121	0.05
122	0.05
123	0.07
124	0.08
125	0.09
126	0.09
127	0.16
128	0.17
129	0.18
130	0.18
131	0.19
132	0.24
133	0.24
134	0.27
135	0.19
136	0.2
137	0.22
138	0.23
139	0.21
140	0.19
141	0.19
142	0.18
143	0.24
144	0.23
145	0.21
146	0.2
147	0.2
148	0.15
149	0.16
150	0.15
151	0.1
152	0.09
153	0.1
154	0.09
155	0.1
156	0.12
157	0.13
158	0.14
159	0.14
160	0.14
161	0.14
162	0.14
163	0.13
164	0.11
165	0.1
166	0.07
167	0.07
168	0.06
169	0.06
170	0.06
171	0.05
172	0.06
173	0.06
174	0.08
175	0.08
176	0.09
177	0.1
178	0.11
179	0.11
180	0.11
181	0.12
182	0.12
183	0.13
184	0.13
185	0.13
186	0.13
187	0.14
188	0.13
189	0.11
190	0.09
191	0.08
192	0.08
193	0.07
194	0.09
195	0.13
196	0.16
197	0.23
198	0.3
199	0.35
200	0.39
201	0.43
202	0.44
203	0.46
204	0.44
205	0.4
206	0.38
207	0.38
208	0.36
209	0.33
210	0.32
211	0.27
212	0.24
213	0.22
214	0.18
215	0.13
216	0.12
217	0.12
218	0.11
219	0.16
220	0.17
221	0.16
222	0.16
223	0.18
224	0.17
225	0.18
226	0.18
227	0.13
228	0.14
229	0.13
230	0.14
231	0.13
232	0.12
233	0.11
234	0.12
235	0.11
236	0.09
237	0.1
238	0.08
239	0.08
240	0.08
241	0.09
242	0.1
243	0.1
244	0.1
245	0.11
246	0.11
247	0.14
248	0.15
249	0.16
250	0.16
251	0.18
252	0.2
253	0.2
254	0.2
255	0.17
256	0.17
257	0.16
258	0.16
259	0.14
260	0.12
261	0.12
262	0.11
263	0.1
264	0.09
265	0.07
266	0.07
267	0.07
268	0.07
269	0.07
270	0.11
271	0.12
272	0.14
273	0.15
274	0.15
275	0.15
276	0.16
277	0.15
278	0.14
279	0.14
280	0.13
281	0.13
282	0.12
283	0.12
284	0.12
285	0.11
286	0.1
287	0.09
288	0.1
289	0.13
290	0.14
291	0.14
292	0.15
293	0.15
294	0.15
295	0.18
296	0.21
297	0.17
298	0.2
299	0.22
300	0.23
301	0.24
302	0.25
303	0.22
304	0.19
305	0.19
306	0.18
307	0.17
308	0.16
309	0.16
310	0.19
311	0.19
312	0.18
313	0.18
314	0.16
315	0.16
316	0.19
317	0.23
318	0.2
319	0.21
320	0.22
321	0.22
322	0.26
323	0.27
324	0.29
325	0.32
326	0.39
327	0.44
328	0.51
329	0.53
330	0.5
331	0.52
332	0.53
333	0.54
334	0.52
335	0.53
336	0.48
337	0.48
338	0.49
339	0.47
340	0.41
341	0.33
342	0.26
343	0.21
344	0.19
345	0.19
346	0.15
347	0.12
348	0.12
349	0.1
350	0.1
351	0.08
352	0.07
353	0.05
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.05
359	0.05
360	0.05
361	0.05
362	0.05
363	0.06
364	0.06
365	0.07
366	0.07
367	0.07
368	0.07
369	0.07
370	0.06
371	0.05
372	0.05
373	0.05
374	0.04
375	0.04
376	0.04
377	0.04
378	0.05
379	0.06
380	0.05
381	0.05
382	0.05
383	0.05
384	0.05
385	0.06
386	0.05
387	0.06
388	0.07
389	0.07
390	0.06
391	0.06
392	0.06
393	0.06
394	0.08
395	0.07
396	0.09
397	0.13
398	0.16
399	0.19
400	0.25
401	0.32
402	0.3
403	0.34
404	0.33
405	0.3
406	0.28
407	0.25
408	0.2
409	0.13
410	0.12
411	0.07
412	0.05
413	0.04
414	0.04
415	0.03
416	0.02
417	0.02
418	0.02
419	0.02
420	0.03
421	0.03
422	0.03
423	0.04
424	0.04
425	0.05
426	0.06
427	0.08
428	0.13
429	0.21
430	0.25
431	0.28
432	0.32
433	0.34
434	0.34
435	0.33
436	0.28
437	0.2
438	0.17
439	0.13
440	0.09
441	0.07
442	0.07
443	0.06
444	0.05
445	0.05
446	0.05
447	0.05
448	0.05
449	0.06
450	0.07
451	0.11
452	0.12
453	0.12
454	0.12
455	0.12
456	0.13
457	0.12
458	0.13
459	0.09
460	0.08
461	0.08
462	0.08
463	0.08
464	0.08
465	0.08
466	0.06
467	0.06
468	0.06
469	0.06
470	0.06
471	0.06
472	0.05
473	0.04
474	0.05
475	0.04
476	0.04
477	0.06
478	0.09
479	0.11
480	0.12
481	0.14
482	0.15
483	0.15
484	0.17
485	0.21
486	0.18
487	0.18
488	0.18
489	0.17
490	0.16
491	0.16
492	0.16
493	0.11
494	0.1
495	0.11
496	0.11
497	0.12
498	0.13
499	0.12
500	0.13
501	0.13
502	0.13
503	0.1
504	0.1
505	0.1
506	0.09
507	0.09
508	0.09
509	0.09
510	0.14
511	0.15
512	0.16
513	0.15
514	0.17
515	0.17
516	0.17
517	0.16
518	0.11
519	0.11
520	0.11
521	0.1
522	0.08
523	0.08
524	0.07
525	0.07
526	0.06
527	0.06
528	0.06
529	0.06
530	0.06
531	0.05
532	0.05
533	0.05
534	0.05
535	0.05
536	0.05
537	0.05
538	0.05
539	0.05
540	0.05
541	0.05
542	0.05
543	0.07
544	0.07
545	0.07
546	0.08
547	0.09
548	0.13
549	0.14
550	0.14
551	0.14
552	0.16
553	0.18
554	0.2
555	0.19
556	0.18
557	0.2
558	0.2
559	0.22
560	0.23
561	0.22
562	0.19
563	0.2
564	0.19
565	0.18
566	0.18
567	0.18
568	0.2
569	0.22
570	0.24
571	0.26
572	0.29
573	0.3
574	0.36
575	0.38
576	0.38
577	0.42
578	0.4
579	0.4
580	0.4
581	0.41
582	0.39
583	0.34
584	0.28
585	0.22
586	0.22
587	0.18
588	0.13
589	0.1
590	0.07
591	0.08
592	0.07
593	0.08
594	0.08
595	0.08
596	0.08
597	0.08
598	0.07
599	0.06
600	0.06
601	0.07
602	0.06
603	0.07
604	0.07
605	0.09
606	0.11
607	0.12
608	0.11
609	0.1
610	0.11
611	0.11
612	0.1
613	0.09
614	0.08
615	0.09
616	0.08
617	0.1
618	0.1
619	0.1
620	0.11
621	0.11
622	0.13
623	0.12
624	0.14
625	0.16
626	0.16
627	0.18
628	0.17
629	0.18
630	0.16
631	0.16
632	0.15
633	0.1
634	0.13
635	0.12
636	0.14
637	0.14
638	0.15
639	0.15
640	0.16
641	0.19
642	0.21
643	0.23
644	0.23
645	0.22
646	0.23
647	0.24
648	0.27
649	0.29
650	0.26
651	0.23
652	0.23
653	0.22
654	0.21
655	0.21
656	0.19
657	0.16
658	0.2
659	0.23
660	0.24
661	0.31
662	0.36
663	0.37
664	0.45
665	0.48
666	0.5
667	0.55
668	0.57
669	0.59
670	0.64
671	0.66
672	0.61
673	0.6
674	0.56
675	0.48
676	0.47
677	0.41
678	0.32
679	0.28
680	0.25
681	0.23
682	0.2
683	0.21
684	0.25
685	0.28
686	0.29
687	0.34
688	0.37
689	0.4
690	0.49
691	0.55
692	0.57
693	0.58
694	0.63
695	0.62
696	0.68
697	0.68
698	0.67
699	0.68
700	0.64
701	0.6
702	0.58
703	0.55
704	0.46
705	0.45
706	0.38
707	0.3
708	0.29
709	0.32
710	0.27
711	0.28
712	0.3
713	0.26
714	0.28
715	0.28
716	0.26
717	0.24
718	0.25
719	0.24
720	0.23
721	0.22
722	0.2
723	0.22
724	0.25
725	0.25
726	0.24
727	0.28
728	0.28
729	0.28
730	0.31
731	0.33
732	0.29
733	0.34
734	0.4
735	0.41
736	0.46
737	0.47
738	0.44
739	0.42
740	0.43
741	0.38
742	0.35
743	0.29
744	0.24
745	0.24
746	0.25
747	0.22
748	0.21
749	0.17
750	0.14
751	0.17
752	0.2
753	0.21
754	0.22
755	0.27
756	0.31
757	0.4
758	0.42
759	0.42
760	0.44
761	0.43
762	0.48
763	0.47
764	0.47
765	0.4
766	0.39
767	0.39
768	0.35
769	0.36
770	0.32
771	0.28
772	0.28
773	0.31
774	0.36
775	0.41
776	0.46
777	0.53
778	0.61
779	0.7
780	0.76
781	0.79
782	0.79
783	0.81
784	0.84
785	0.83
786	0.82
787	0.8
788	0.73
789	0.65
790	0.59
791	0.49
792	0.47
793	0.37
794	0.28
795	0.19
796	0.18
797	0.16
798	0.15
799	0.16
800	0.09
801	0.1
802	0.12
803	0.14
804	0.18
805	0.21
806	0.22
807	0.26
808	0.28
809	0.3
810	0.33
811	0.36
812	0.37
813	0.39
814	0.46
815	0.44
816	0.46
817	0.46
818	0.44
819	0.42
820	0.38
821	0.34
822	0.31
823	0.29
824	0.25
825	0.26
826	0.24
827	0.23
828	0.29
829	0.33
830	0.31
831	0.33
832	0.38
833	0.43
834	0.52
835	0.56

M2PV38

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer