Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0CUJ6

Protein Details
Accession B0CUJ6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
156-180HSSIHLKYPRGRRRSRQAILRQLFCHydrophilic
751-773SYIPDSPTKPAKRRRTSPDSLDDHydrophilic
865-887RCPSCSSWKKMIPKGRRIHSFESHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 5, cyto 5, cyto_mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR016059  DNA_ligase_ATP-dep_CS  
IPR012308  DNA_ligase_ATP-dep_N  
IPR036599  DNA_ligase_N_sf  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_305555  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF04675  DNA_ligase_A_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00697  DNA_LIGASE_A1  
PS00333  DNA_LIGASE_A2  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
CDD cd08039  Adenylation_DNA_ligase_Fungal  
Amino Acid Sequences MQPQADVARANRRDSLLLVPPLKSSARNQKTFEKEPNYPAIQIFRRWFNKLNSDFSPLPKGTTAACFRLLFPEEDIRRKYDMQETRLAECLAHVFGVDSEQFRAWNAEEASGCLGQEVKIVLQRSCHTTDGFISPLTIEQVDELLDELASNSGYSHSSIHLKYPRGRRRSRQAILRQLFCPLPPFDASCLTQIILKDLRPIMYPLSETHYAASLRDFNSAAVKMLTKEHAMNVWDPSGLMRKSFQVRSSIDIAAGNHELPHHLKRKFEPELGIPIQIPKSEKGRRCIDALAYFFRSKRVWAETKYDGERAQIHVVVNADGSSRITIFSKSKRDSTHDRHAVHYIIRKALGLPSDYTHSKITAGSKIKHNVILDAEMVAFNGTQVDEFWRIRRLIENTAHGIRGVGKGTRVTEYQDEPISQTSMLSDDSEARQLGLVFFDVLMLDSKSLLSKSYSERRDILESLISVTPGEARLSERFPIDMNGSHPPARLRTIFARHIATHQEGLVLKCDESRYNDYRLPWVKLKRDYIPGYGDALDLVILGASWDKKRAYELRVSPTVLTTFYVGTVQNARDRRLNPSIRPHFLVYFTVSYGLSRAHLEDLNFLIRSLDPISFSPSMDTKKLAFTFTLFPGLQPPPSVIFPTPLLAELFGAGFTKSPASPHYELRFPRITKVHRPSERGWDECVDLETLHKIACESVGRDGTDKEIRDCVNAIWGQPASPGVKSSSTLQARIDEWEVKLAILDGEEPSVSYIPDSPTKPAKRRRTSPDSLDDVLSQPLGVKTNVVGITEGKHALDPPKSSSQISQNRRYLPSPFSSPCRPASRNAFPSRAGVTFPIRTSLAKKPSCMEELLDQVLVWFVGRRGRCPSCSSWKKMIPKGRRIHSFESLLAACGWKDGVPGVPWIQRGIIIVDGHDENGKDGVQKQLELCHKSMTSSQREDRKGVWMFKCGAMRDAICLME
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.39
3 0.37
4 0.41
5 0.41
6 0.38
7 0.36
8 0.38
9 0.38
10 0.34
11 0.35
12 0.38
13 0.45
14 0.51
15 0.55
16 0.61
17 0.68
18 0.73
19 0.74
20 0.71
21 0.67
22 0.66
23 0.7
24 0.63
25 0.56
26 0.51
27 0.49
28 0.45
29 0.47
30 0.46
31 0.47
32 0.49
33 0.52
34 0.57
35 0.56
36 0.62
37 0.61
38 0.62
39 0.56
40 0.58
41 0.56
42 0.52
43 0.53
44 0.43
45 0.41
46 0.35
47 0.33
48 0.27
49 0.33
50 0.34
51 0.29
52 0.33
53 0.31
54 0.31
55 0.37
56 0.37
57 0.31
58 0.3
59 0.36
60 0.36
61 0.43
62 0.45
63 0.42
64 0.43
65 0.43
66 0.44
67 0.44
68 0.47
69 0.45
70 0.51
71 0.5
72 0.49
73 0.51
74 0.46
75 0.36
76 0.29
77 0.26
78 0.18
79 0.15
80 0.12
81 0.09
82 0.09
83 0.12
84 0.12
85 0.11
86 0.13
87 0.13
88 0.13
89 0.14
90 0.16
91 0.15
92 0.2
93 0.19
94 0.21
95 0.21
96 0.22
97 0.24
98 0.22
99 0.21
100 0.14
101 0.14
102 0.11
103 0.12
104 0.12
105 0.1
106 0.14
107 0.17
108 0.17
109 0.21
110 0.24
111 0.27
112 0.3
113 0.3
114 0.27
115 0.26
116 0.29
117 0.28
118 0.26
119 0.21
120 0.17
121 0.15
122 0.16
123 0.16
124 0.13
125 0.09
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.05
139 0.06
140 0.07
141 0.08
142 0.09
143 0.11
144 0.17
145 0.18
146 0.25
147 0.3
148 0.36
149 0.43
150 0.53
151 0.59
152 0.64
153 0.72
154 0.74
155 0.79
156 0.84
157 0.84
158 0.83
159 0.84
160 0.85
161 0.83
162 0.78
163 0.67
164 0.6
165 0.53
166 0.43
167 0.37
168 0.27
169 0.23
170 0.21
171 0.22
172 0.2
173 0.24
174 0.24
175 0.22
176 0.21
177 0.18
178 0.19
179 0.17
180 0.2
181 0.18
182 0.17
183 0.21
184 0.21
185 0.22
186 0.21
187 0.22
188 0.2
189 0.19
190 0.2
191 0.16
192 0.21
193 0.21
194 0.2
195 0.2
196 0.21
197 0.2
198 0.19
199 0.2
200 0.18
201 0.17
202 0.19
203 0.19
204 0.16
205 0.2
206 0.2
207 0.18
208 0.15
209 0.15
210 0.14
211 0.16
212 0.17
213 0.15
214 0.16
215 0.16
216 0.18
217 0.19
218 0.19
219 0.19
220 0.18
221 0.16
222 0.15
223 0.15
224 0.19
225 0.17
226 0.17
227 0.16
228 0.2
229 0.26
230 0.3
231 0.31
232 0.31
233 0.32
234 0.35
235 0.38
236 0.33
237 0.28
238 0.26
239 0.24
240 0.2
241 0.2
242 0.16
243 0.12
244 0.12
245 0.13
246 0.14
247 0.21
248 0.26
249 0.27
250 0.31
251 0.35
252 0.44
253 0.47
254 0.47
255 0.43
256 0.38
257 0.45
258 0.42
259 0.39
260 0.3
261 0.28
262 0.25
263 0.24
264 0.23
265 0.17
266 0.25
267 0.31
268 0.36
269 0.41
270 0.46
271 0.46
272 0.47
273 0.47
274 0.43
275 0.4
276 0.38
277 0.35
278 0.32
279 0.32
280 0.3
281 0.3
282 0.26
283 0.22
284 0.24
285 0.27
286 0.29
287 0.31
288 0.37
289 0.39
290 0.44
291 0.45
292 0.43
293 0.36
294 0.32
295 0.31
296 0.28
297 0.25
298 0.21
299 0.19
300 0.18
301 0.19
302 0.16
303 0.14
304 0.11
305 0.09
306 0.07
307 0.08
308 0.06
309 0.06
310 0.07
311 0.07
312 0.1
313 0.15
314 0.21
315 0.29
316 0.32
317 0.36
318 0.39
319 0.44
320 0.51
321 0.55
322 0.59
323 0.59
324 0.57
325 0.55
326 0.54
327 0.5
328 0.43
329 0.41
330 0.32
331 0.26
332 0.25
333 0.22
334 0.2
335 0.21
336 0.19
337 0.14
338 0.13
339 0.12
340 0.16
341 0.16
342 0.18
343 0.17
344 0.15
345 0.15
346 0.16
347 0.17
348 0.21
349 0.26
350 0.27
351 0.32
352 0.36
353 0.37
354 0.38
355 0.35
356 0.3
357 0.26
358 0.24
359 0.18
360 0.14
361 0.12
362 0.09
363 0.08
364 0.07
365 0.05
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.03
370 0.04
371 0.06
372 0.1
373 0.11
374 0.12
375 0.16
376 0.17
377 0.17
378 0.22
379 0.23
380 0.26
381 0.29
382 0.31
383 0.31
384 0.31
385 0.31
386 0.26
387 0.22
388 0.17
389 0.15
390 0.13
391 0.1
392 0.1
393 0.11
394 0.12
395 0.14
396 0.13
397 0.14
398 0.15
399 0.17
400 0.18
401 0.17
402 0.17
403 0.16
404 0.16
405 0.14
406 0.12
407 0.1
408 0.07
409 0.07
410 0.07
411 0.07
412 0.06
413 0.07
414 0.08
415 0.1
416 0.09
417 0.08
418 0.08
419 0.08
420 0.08
421 0.07
422 0.06
423 0.05
424 0.04
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.05
429 0.04
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.05
434 0.05
435 0.06
436 0.06
437 0.08
438 0.14
439 0.22
440 0.24
441 0.26
442 0.28
443 0.29
444 0.31
445 0.29
446 0.25
447 0.18
448 0.16
449 0.16
450 0.14
451 0.12
452 0.09
453 0.08
454 0.07
455 0.07
456 0.07
457 0.05
458 0.07
459 0.09
460 0.1
461 0.11
462 0.11
463 0.11
464 0.11
465 0.12
466 0.11
467 0.11
468 0.12
469 0.14
470 0.15
471 0.16
472 0.16
473 0.16
474 0.16
475 0.17
476 0.16
477 0.16
478 0.19
479 0.24
480 0.26
481 0.27
482 0.28
483 0.26
484 0.27
485 0.27
486 0.24
487 0.19
488 0.16
489 0.15
490 0.14
491 0.14
492 0.15
493 0.12
494 0.11
495 0.11
496 0.13
497 0.12
498 0.15
499 0.21
500 0.21
501 0.25
502 0.28
503 0.27
504 0.34
505 0.36
506 0.35
507 0.35
508 0.38
509 0.4
510 0.44
511 0.47
512 0.43
513 0.47
514 0.45
515 0.42
516 0.38
517 0.33
518 0.29
519 0.25
520 0.21
521 0.14
522 0.11
523 0.08
524 0.06
525 0.04
526 0.03
527 0.02
528 0.02
529 0.03
530 0.05
531 0.05
532 0.08
533 0.08
534 0.09
535 0.13
536 0.18
537 0.21
538 0.27
539 0.32
540 0.36
541 0.38
542 0.39
543 0.35
544 0.31
545 0.28
546 0.21
547 0.16
548 0.11
549 0.08
550 0.08
551 0.09
552 0.08
553 0.08
554 0.1
555 0.11
556 0.16
557 0.18
558 0.19
559 0.23
560 0.24
561 0.3
562 0.36
563 0.4
564 0.39
565 0.48
566 0.53
567 0.51
568 0.52
569 0.47
570 0.4
571 0.36
572 0.33
573 0.25
574 0.19
575 0.16
576 0.15
577 0.13
578 0.12
579 0.11
580 0.1
581 0.08
582 0.07
583 0.08
584 0.09
585 0.1
586 0.11
587 0.11
588 0.12
589 0.14
590 0.13
591 0.12
592 0.11
593 0.09
594 0.11
595 0.11
596 0.1
597 0.09
598 0.1
599 0.15
600 0.15
601 0.15
602 0.15
603 0.17
604 0.19
605 0.19
606 0.2
607 0.16
608 0.2
609 0.21
610 0.21
611 0.18
612 0.17
613 0.2
614 0.19
615 0.23
616 0.18
617 0.17
618 0.21
619 0.22
620 0.2
621 0.17
622 0.17
623 0.14
624 0.15
625 0.17
626 0.13
627 0.14
628 0.14
629 0.15
630 0.14
631 0.12
632 0.12
633 0.1
634 0.09
635 0.07
636 0.07
637 0.06
638 0.06
639 0.05
640 0.05
641 0.05
642 0.07
643 0.06
644 0.07
645 0.09
646 0.16
647 0.18
648 0.25
649 0.28
650 0.33
651 0.33
652 0.39
653 0.44
654 0.38
655 0.42
656 0.43
657 0.46
658 0.5
659 0.57
660 0.61
661 0.6
662 0.65
663 0.62
664 0.65
665 0.65
666 0.57
667 0.51
668 0.43
669 0.38
670 0.33
671 0.3
672 0.2
673 0.14
674 0.13
675 0.12
676 0.1
677 0.09
678 0.09
679 0.08
680 0.07
681 0.09
682 0.11
683 0.1
684 0.15
685 0.17
686 0.17
687 0.19
688 0.19
689 0.21
690 0.24
691 0.24
692 0.21
693 0.24
694 0.23
695 0.24
696 0.24
697 0.2
698 0.21
699 0.21
700 0.19
701 0.18
702 0.17
703 0.16
704 0.16
705 0.18
706 0.13
707 0.13
708 0.14
709 0.12
710 0.13
711 0.15
712 0.17
713 0.24
714 0.25
715 0.26
716 0.26
717 0.27
718 0.27
719 0.28
720 0.28
721 0.22
722 0.2
723 0.21
724 0.2
725 0.17
726 0.16
727 0.14
728 0.1
729 0.08
730 0.09
731 0.06
732 0.06
733 0.06
734 0.06
735 0.07
736 0.07
737 0.07
738 0.07
739 0.09
740 0.11
741 0.17
742 0.18
743 0.21
744 0.31
745 0.39
746 0.48
747 0.56
748 0.64
749 0.69
750 0.76
751 0.82
752 0.82
753 0.82
754 0.81
755 0.79
756 0.74
757 0.66
758 0.58
759 0.49
760 0.41
761 0.34
762 0.26
763 0.17
764 0.12
765 0.12
766 0.12
767 0.11
768 0.1
769 0.1
770 0.16
771 0.16
772 0.15
773 0.15
774 0.14
775 0.16
776 0.18
777 0.18
778 0.13
779 0.13
780 0.14
781 0.18
782 0.22
783 0.22
784 0.26
785 0.32
786 0.34
787 0.35
788 0.37
789 0.43
790 0.48
791 0.54
792 0.58
793 0.58
794 0.61
795 0.64
796 0.62
797 0.56
798 0.51
799 0.48
800 0.46
801 0.44
802 0.44
803 0.47
804 0.48
805 0.51
806 0.55
807 0.51
808 0.51
809 0.56
810 0.6
811 0.63
812 0.66
813 0.62
814 0.55
815 0.56
816 0.53
817 0.44
818 0.35
819 0.29
820 0.28
821 0.28
822 0.27
823 0.27
824 0.25
825 0.26
826 0.29
827 0.35
828 0.39
829 0.39
830 0.4
831 0.41
832 0.45
833 0.46
834 0.42
835 0.36
836 0.3
837 0.32
838 0.31
839 0.27
840 0.22
841 0.19
842 0.18
843 0.15
844 0.11
845 0.08
846 0.07
847 0.14
848 0.15
849 0.18
850 0.27
851 0.32
852 0.36
853 0.41
854 0.47
855 0.52
856 0.6
857 0.65
858 0.66
859 0.69
860 0.74
861 0.77
862 0.8
863 0.79
864 0.8
865 0.82
866 0.82
867 0.83
868 0.81
869 0.79
870 0.76
871 0.69
872 0.6
873 0.56
874 0.47
875 0.39
876 0.32
877 0.26
878 0.18
879 0.15
880 0.15
881 0.09
882 0.09
883 0.09
884 0.12
885 0.12
886 0.16
887 0.2
888 0.23
889 0.23
890 0.24
891 0.23
892 0.21
893 0.21
894 0.19
895 0.19
896 0.16
897 0.15
898 0.18
899 0.18
900 0.17
901 0.18
902 0.16
903 0.13
904 0.14
905 0.15
906 0.13
907 0.15
908 0.22
909 0.22
910 0.24
911 0.25
912 0.32
913 0.39
914 0.42
915 0.41
916 0.39
917 0.37
918 0.38
919 0.43
920 0.44
921 0.44
922 0.48
923 0.55
924 0.59
925 0.63
926 0.63
927 0.59
928 0.59
929 0.58
930 0.59
931 0.54
932 0.51
933 0.5
934 0.52
935 0.56
936 0.48
937 0.42
938 0.38
939 0.35
940 0.32