Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0CU47

Protein Details
Accession B0CU47    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
269-288NGSKRRKGKGRAKGKDKQEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
271-285SKRRKGKGRAKGKDK
Subcellular Location(s) cyto 12, cyto_nucl 11, nucl 8, mito 3, E.R. 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028884  Trm82  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0036265  P:RNA (guanine-N7)-methylation  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_305397  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
Amino Acid Sequences MTIYYPYTHLFPGPSHTVAISGPHIQVINTTTGDVLHSTTLFTDEARNAVLKSGPVRCAAVDKESKYLITTGEDKILKLWEVDGLKLLSERELPKKPTGLAFSADAQSILASDKFGDIFRYPFVHVPSTVTQKKDALSSHENPSGGQLILGHASPLNAFLLTHDERYIITADRDEHIRVSWYPQGYNIEMYCLGHSKFVSAIHVPQFDQSKLISGGGDPDLKIWDWMTGEVKHAIDVADAIDPFLVVRAVKRRRGGHDDDEEDEAVEGNGSKRRKGKGRAKGKDKQEEEKESEEGPIASSSQTTTDNAEKVLVIRKIGSLEADGVPTVIFSAVGATALFTLPYRDGVTMSNIRHFDFGRPITDFAIANDGLIWILLDSEWTPDGVPSGSGSPFVKVLQFSLGQLVEAPSGSHSALLLTLNETSLLEASVDDIKKLSLYIDLQTMPKYADKPEETEETTAEDTSDKKLSNKELGRMKRKQIVLAKAGGVGVGEGEEEEEPLSKKNKSEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.25
3 0.24
4 0.24
5 0.22
6 0.24
7 0.2
8 0.19
9 0.18
10 0.19
11 0.19
12 0.17
13 0.19
14 0.19
15 0.19
16 0.16
17 0.16
18 0.14
19 0.14
20 0.15
21 0.14
22 0.12
23 0.1
24 0.1
25 0.1
26 0.1
27 0.12
28 0.11
29 0.11
30 0.14
31 0.14
32 0.15
33 0.16
34 0.17
35 0.15
36 0.17
37 0.18
38 0.16
39 0.2
40 0.25
41 0.26
42 0.26
43 0.27
44 0.26
45 0.29
46 0.29
47 0.31
48 0.33
49 0.32
50 0.34
51 0.34
52 0.34
53 0.3
54 0.29
55 0.22
56 0.19
57 0.21
58 0.19
59 0.25
60 0.25
61 0.24
62 0.25
63 0.25
64 0.22
65 0.19
66 0.18
67 0.16
68 0.16
69 0.17
70 0.18
71 0.16
72 0.16
73 0.17
74 0.16
75 0.12
76 0.17
77 0.21
78 0.25
79 0.32
80 0.36
81 0.39
82 0.42
83 0.43
84 0.43
85 0.42
86 0.37
87 0.32
88 0.3
89 0.29
90 0.27
91 0.25
92 0.2
93 0.15
94 0.13
95 0.11
96 0.1
97 0.07
98 0.06
99 0.06
100 0.07
101 0.08
102 0.09
103 0.11
104 0.11
105 0.12
106 0.14
107 0.16
108 0.17
109 0.19
110 0.22
111 0.21
112 0.21
113 0.24
114 0.26
115 0.33
116 0.35
117 0.34
118 0.33
119 0.33
120 0.33
121 0.32
122 0.3
123 0.28
124 0.32
125 0.34
126 0.38
127 0.39
128 0.38
129 0.34
130 0.35
131 0.29
132 0.22
133 0.17
134 0.12
135 0.09
136 0.1
137 0.1
138 0.08
139 0.06
140 0.07
141 0.06
142 0.07
143 0.06
144 0.05
145 0.05
146 0.06
147 0.12
148 0.13
149 0.14
150 0.13
151 0.13
152 0.13
153 0.15
154 0.16
155 0.1
156 0.1
157 0.11
158 0.12
159 0.13
160 0.15
161 0.14
162 0.13
163 0.13
164 0.15
165 0.13
166 0.16
167 0.19
168 0.18
169 0.18
170 0.19
171 0.22
172 0.21
173 0.22
174 0.18
175 0.16
176 0.15
177 0.15
178 0.13
179 0.12
180 0.12
181 0.11
182 0.11
183 0.1
184 0.11
185 0.11
186 0.13
187 0.12
188 0.15
189 0.16
190 0.18
191 0.17
192 0.19
193 0.21
194 0.18
195 0.18
196 0.15
197 0.14
198 0.13
199 0.13
200 0.11
201 0.08
202 0.1
203 0.11
204 0.11
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.1
210 0.08
211 0.07
212 0.07
213 0.08
214 0.1
215 0.1
216 0.11
217 0.13
218 0.13
219 0.12
220 0.11
221 0.1
222 0.08
223 0.07
224 0.06
225 0.06
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.03
234 0.05
235 0.14
236 0.19
237 0.23
238 0.29
239 0.33
240 0.38
241 0.45
242 0.49
243 0.46
244 0.48
245 0.46
246 0.42
247 0.4
248 0.34
249 0.27
250 0.22
251 0.15
252 0.09
253 0.06
254 0.05
255 0.05
256 0.09
257 0.1
258 0.13
259 0.18
260 0.23
261 0.31
262 0.41
263 0.5
264 0.55
265 0.66
266 0.73
267 0.77
268 0.79
269 0.8
270 0.8
271 0.74
272 0.72
273 0.67
274 0.64
275 0.58
276 0.53
277 0.46
278 0.37
279 0.34
280 0.26
281 0.19
282 0.14
283 0.1
284 0.08
285 0.07
286 0.06
287 0.06
288 0.07
289 0.08
290 0.08
291 0.11
292 0.13
293 0.13
294 0.13
295 0.13
296 0.12
297 0.12
298 0.17
299 0.15
300 0.13
301 0.13
302 0.14
303 0.15
304 0.15
305 0.14
306 0.08
307 0.1
308 0.1
309 0.1
310 0.09
311 0.08
312 0.07
313 0.07
314 0.06
315 0.04
316 0.03
317 0.03
318 0.03
319 0.03
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.05
326 0.04
327 0.05
328 0.06
329 0.07
330 0.08
331 0.08
332 0.09
333 0.1
334 0.15
335 0.2
336 0.2
337 0.24
338 0.24
339 0.25
340 0.26
341 0.26
342 0.23
343 0.25
344 0.26
345 0.23
346 0.24
347 0.24
348 0.24
349 0.25
350 0.22
351 0.15
352 0.18
353 0.15
354 0.13
355 0.12
356 0.11
357 0.08
358 0.08
359 0.07
360 0.03
361 0.03
362 0.03
363 0.04
364 0.04
365 0.05
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.08
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.09
375 0.09
376 0.11
377 0.12
378 0.12
379 0.12
380 0.13
381 0.14
382 0.12
383 0.13
384 0.14
385 0.14
386 0.13
387 0.16
388 0.15
389 0.13
390 0.13
391 0.13
392 0.11
393 0.1
394 0.1
395 0.07
396 0.09
397 0.09
398 0.08
399 0.07
400 0.07
401 0.08
402 0.08
403 0.08
404 0.08
405 0.08
406 0.08
407 0.09
408 0.08
409 0.08
410 0.07
411 0.07
412 0.06
413 0.05
414 0.07
415 0.13
416 0.13
417 0.13
418 0.13
419 0.13
420 0.13
421 0.13
422 0.12
423 0.1
424 0.12
425 0.13
426 0.17
427 0.18
428 0.2
429 0.21
430 0.21
431 0.19
432 0.2
433 0.2
434 0.2
435 0.27
436 0.28
437 0.31
438 0.35
439 0.38
440 0.38
441 0.37
442 0.34
443 0.3
444 0.29
445 0.24
446 0.2
447 0.16
448 0.15
449 0.17
450 0.21
451 0.19
452 0.21
453 0.27
454 0.32
455 0.41
456 0.45
457 0.49
458 0.55
459 0.63
460 0.7
461 0.72
462 0.74
463 0.73
464 0.7
465 0.71
466 0.7
467 0.68
468 0.64
469 0.6
470 0.53
471 0.46
472 0.43
473 0.34
474 0.25
475 0.16
476 0.11
477 0.07
478 0.05
479 0.04
480 0.06
481 0.06
482 0.06
483 0.07
484 0.09
485 0.1
486 0.15
487 0.19
488 0.21