Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2PD42

Protein Details
Accession M2PD42    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-71VSSAAAPPKKCKRHGSQKSKVDGSEHydrophilic
95-120TLSSRSRSTGKKDRKQEKRRGRGMYQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
101-116RSTGKKDRKQEKRRGR
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 10.5, mito 9, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR042246  ZCCHC9  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MTRYTNFARKRTYVDAGFNTSALDPVDSGNQDVHENPQPDNAENTIVSSAAAPPKKCKRHGSQKSKVDGSENGIASTTGDADAAAPSGQSSGDATLSSRSRSTGKKDRKQEKRRGRGMYQAVSSSERRRLQRIDDRHADTICFACREKGHTARDCTTFIAPATDGAEGQGGGARAKPGRSAVGICYRCGSWRHNLSKCREPVDPENPLPYASCFVCSGQGHLASSCPKNQSKGIYPNGGSCKLCGETTHLAKDCPLRKKETVTASTVFLGTGREAGADEDDFHTLKRKNAEIDQAEKFVEKTKRQANVKVGAFTGVVKAFGKASAPVTKKKVVTF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.55
3 0.54
4 0.51
5 0.44
6 0.39
7 0.31
8 0.27
9 0.2
10 0.16
11 0.09
12 0.1
13 0.14
14 0.13
15 0.14
16 0.14
17 0.15
18 0.16
19 0.16
20 0.2
21 0.23
22 0.24
23 0.24
24 0.29
25 0.3
26 0.3
27 0.32
28 0.28
29 0.24
30 0.22
31 0.23
32 0.17
33 0.15
34 0.14
35 0.11
36 0.13
37 0.18
38 0.22
39 0.22
40 0.3
41 0.41
42 0.49
43 0.55
44 0.61
45 0.65
46 0.72
47 0.82
48 0.84
49 0.84
50 0.85
51 0.86
52 0.81
53 0.71
54 0.64
55 0.55
56 0.49
57 0.45
58 0.37
59 0.29
60 0.25
61 0.24
62 0.2
63 0.18
64 0.13
65 0.06
66 0.06
67 0.05
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.05
72 0.05
73 0.04
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.06
80 0.06
81 0.07
82 0.11
83 0.13
84 0.14
85 0.14
86 0.15
87 0.19
88 0.23
89 0.31
90 0.37
91 0.47
92 0.54
93 0.64
94 0.73
95 0.8
96 0.86
97 0.89
98 0.89
99 0.89
100 0.89
101 0.86
102 0.78
103 0.76
104 0.72
105 0.65
106 0.56
107 0.46
108 0.39
109 0.35
110 0.35
111 0.29
112 0.3
113 0.31
114 0.32
115 0.35
116 0.36
117 0.41
118 0.48
119 0.52
120 0.52
121 0.54
122 0.56
123 0.54
124 0.52
125 0.43
126 0.35
127 0.29
128 0.22
129 0.16
130 0.13
131 0.12
132 0.12
133 0.16
134 0.21
135 0.26
136 0.32
137 0.35
138 0.39
139 0.41
140 0.42
141 0.39
142 0.35
143 0.29
144 0.23
145 0.18
146 0.15
147 0.11
148 0.09
149 0.09
150 0.07
151 0.07
152 0.06
153 0.06
154 0.05
155 0.05
156 0.06
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.07
162 0.07
163 0.08
164 0.08
165 0.09
166 0.1
167 0.11
168 0.13
169 0.22
170 0.22
171 0.22
172 0.22
173 0.21
174 0.22
175 0.24
176 0.23
177 0.22
178 0.3
179 0.38
180 0.44
181 0.51
182 0.54
183 0.6
184 0.6
185 0.56
186 0.48
187 0.45
188 0.45
189 0.45
190 0.45
191 0.38
192 0.37
193 0.34
194 0.33
195 0.28
196 0.21
197 0.18
198 0.12
199 0.13
200 0.11
201 0.11
202 0.16
203 0.15
204 0.16
205 0.16
206 0.17
207 0.16
208 0.15
209 0.17
210 0.16
211 0.18
212 0.19
213 0.22
214 0.23
215 0.26
216 0.29
217 0.32
218 0.36
219 0.43
220 0.44
221 0.44
222 0.43
223 0.47
224 0.48
225 0.47
226 0.39
227 0.31
228 0.29
229 0.25
230 0.24
231 0.18
232 0.2
233 0.23
234 0.27
235 0.33
236 0.31
237 0.3
238 0.32
239 0.39
240 0.4
241 0.42
242 0.43
243 0.43
244 0.45
245 0.51
246 0.56
247 0.57
248 0.53
249 0.49
250 0.46
251 0.41
252 0.39
253 0.33
254 0.26
255 0.18
256 0.15
257 0.1
258 0.09
259 0.08
260 0.07
261 0.07
262 0.08
263 0.09
264 0.09
265 0.1
266 0.11
267 0.12
268 0.12
269 0.12
270 0.19
271 0.2
272 0.24
273 0.28
274 0.3
275 0.33
276 0.38
277 0.47
278 0.45
279 0.49
280 0.49
281 0.45
282 0.42
283 0.38
284 0.33
285 0.32
286 0.35
287 0.32
288 0.37
289 0.43
290 0.52
291 0.57
292 0.64
293 0.64
294 0.65
295 0.65
296 0.59
297 0.52
298 0.44
299 0.39
300 0.31
301 0.27
302 0.19
303 0.17
304 0.15
305 0.15
306 0.14
307 0.14
308 0.15
309 0.14
310 0.18
311 0.25
312 0.29
313 0.36
314 0.42
315 0.48