Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2R5C6

Protein Details
Accession M2R5C6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
88-110PSTSDRPPTRRPYHPNPPTQRSEHydrophilic
576-600WIRTHRLPFHRTRHLRNPWNHDREVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12.5, cyto 7, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR007275  YTH_domain  
IPR045168  YTH_prot  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04146  YTH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS50882  YTH  
CDD cd00590  RRM_SF  
cd21134  YTH  
Amino Acid Sequences MTSREVESYSQPGPSSIPSMHYPMSPRSGPVHYATSHTHAPESHSTSPVQSTSAGTGTAVPRGKPPEAGQPPEPPSSVASSSRSVPVPSTSDRPPTRRPYHPNPPTQRSEWVMWAGNVPSDATHDELWRFFNQPPSPALAAGGGGGRGDEGDEEEPLWGGVSSIFLISRSNCAFVNFESEAHLHAAIQRFNGRPLRPDDLRCPRLVCRVRSRNDDLKAGVGGQRGAGIHVRWIREQKEKAQEEARRRSTSSSDAITTPSSSPSDIAPIMTGLSIESDDEGGLRRVRRPEPHSSSSGSHASTNSSILQQYFPKRYFILKSLTQFDLDLSVEKGLWATQKHNEGILDQAYRTSKDVYLIFGVNKSGEFYGYARMVGPILRGEHRVSWASRTDSPPQRRSSQPSSMSDSPPTTRRDYAYFGTPDEHRQYGSPLPVSPDPLATLEQTPRTEDVPVREHLTAPAEMHQPHHRLSRLTIPHPEQNFDSRAATFPTSQLAKFPSDTFELDPRAPARNLREHNAPVASGSGSRAEWEPSSATTLAAVKEEDEKQAVSAEQSGEPSQEQPREEGPVWGSSFKVEWIRTHRLPFHRTRHLRNPWNHDREVKVSRDGTELEPSVGQALLEEWDRPDPSPAASPTIDRRPASARVPEESSYPPAAGEG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.24
3 0.2
4 0.22
5 0.23
6 0.27
7 0.28
8 0.29
9 0.31
10 0.31
11 0.37
12 0.33
13 0.33
14 0.34
15 0.36
16 0.36
17 0.36
18 0.36
19 0.31
20 0.34
21 0.35
22 0.35
23 0.36
24 0.33
25 0.32
26 0.27
27 0.32
28 0.36
29 0.4
30 0.38
31 0.36
32 0.36
33 0.36
34 0.38
35 0.33
36 0.26
37 0.2
38 0.18
39 0.19
40 0.19
41 0.17
42 0.14
43 0.17
44 0.17
45 0.22
46 0.23
47 0.21
48 0.25
49 0.31
50 0.32
51 0.32
52 0.33
53 0.38
54 0.43
55 0.48
56 0.47
57 0.5
58 0.53
59 0.52
60 0.5
61 0.4
62 0.34
63 0.33
64 0.32
65 0.27
66 0.26
67 0.25
68 0.27
69 0.3
70 0.29
71 0.25
72 0.24
73 0.24
74 0.26
75 0.27
76 0.3
77 0.3
78 0.39
79 0.44
80 0.49
81 0.54
82 0.59
83 0.63
84 0.68
85 0.73
86 0.73
87 0.78
88 0.81
89 0.83
90 0.82
91 0.83
92 0.8
93 0.74
94 0.69
95 0.63
96 0.57
97 0.49
98 0.44
99 0.38
100 0.32
101 0.31
102 0.26
103 0.21
104 0.19
105 0.15
106 0.11
107 0.11
108 0.12
109 0.12
110 0.13
111 0.14
112 0.16
113 0.17
114 0.2
115 0.19
116 0.21
117 0.21
118 0.28
119 0.28
120 0.29
121 0.3
122 0.32
123 0.31
124 0.28
125 0.27
126 0.18
127 0.16
128 0.14
129 0.12
130 0.07
131 0.06
132 0.05
133 0.05
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.06
138 0.06
139 0.07
140 0.07
141 0.08
142 0.08
143 0.07
144 0.08
145 0.05
146 0.05
147 0.04
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.07
154 0.08
155 0.12
156 0.13
157 0.14
158 0.14
159 0.15
160 0.17
161 0.16
162 0.22
163 0.18
164 0.17
165 0.18
166 0.18
167 0.18
168 0.17
169 0.17
170 0.1
171 0.13
172 0.16
173 0.15
174 0.16
175 0.2
176 0.19
177 0.25
178 0.31
179 0.29
180 0.3
181 0.34
182 0.39
183 0.39
184 0.42
185 0.46
186 0.51
187 0.53
188 0.49
189 0.47
190 0.43
191 0.49
192 0.52
193 0.49
194 0.49
195 0.56
196 0.6
197 0.64
198 0.69
199 0.67
200 0.64
201 0.6
202 0.5
203 0.42
204 0.37
205 0.3
206 0.25
207 0.18
208 0.14
209 0.11
210 0.12
211 0.1
212 0.11
213 0.11
214 0.09
215 0.13
216 0.16
217 0.18
218 0.19
219 0.24
220 0.27
221 0.34
222 0.37
223 0.4
224 0.47
225 0.47
226 0.48
227 0.51
228 0.53
229 0.54
230 0.61
231 0.6
232 0.51
233 0.51
234 0.49
235 0.44
236 0.43
237 0.37
238 0.29
239 0.24
240 0.22
241 0.23
242 0.21
243 0.19
244 0.15
245 0.14
246 0.13
247 0.11
248 0.11
249 0.1
250 0.12
251 0.1
252 0.1
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.07
257 0.07
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.05
267 0.06
268 0.09
269 0.1
270 0.13
271 0.18
272 0.22
273 0.3
274 0.34
275 0.43
276 0.48
277 0.51
278 0.5
279 0.49
280 0.46
281 0.43
282 0.39
283 0.3
284 0.23
285 0.19
286 0.18
287 0.16
288 0.16
289 0.12
290 0.11
291 0.11
292 0.1
293 0.12
294 0.14
295 0.18
296 0.22
297 0.22
298 0.23
299 0.24
300 0.26
301 0.26
302 0.26
303 0.26
304 0.25
305 0.27
306 0.29
307 0.29
308 0.26
309 0.24
310 0.2
311 0.17
312 0.13
313 0.11
314 0.08
315 0.07
316 0.07
317 0.06
318 0.06
319 0.05
320 0.07
321 0.08
322 0.1
323 0.13
324 0.17
325 0.18
326 0.19
327 0.18
328 0.16
329 0.17
330 0.16
331 0.13
332 0.1
333 0.12
334 0.11
335 0.12
336 0.13
337 0.12
338 0.11
339 0.13
340 0.13
341 0.13
342 0.14
343 0.14
344 0.13
345 0.12
346 0.12
347 0.09
348 0.09
349 0.09
350 0.07
351 0.06
352 0.07
353 0.07
354 0.1
355 0.1
356 0.1
357 0.09
358 0.09
359 0.09
360 0.09
361 0.09
362 0.07
363 0.09
364 0.1
365 0.12
366 0.13
367 0.13
368 0.15
369 0.17
370 0.16
371 0.17
372 0.2
373 0.21
374 0.24
375 0.27
376 0.33
377 0.4
378 0.47
379 0.5
380 0.51
381 0.53
382 0.53
383 0.57
384 0.56
385 0.55
386 0.53
387 0.51
388 0.54
389 0.53
390 0.5
391 0.45
392 0.4
393 0.34
394 0.33
395 0.33
396 0.29
397 0.27
398 0.27
399 0.28
400 0.3
401 0.29
402 0.31
403 0.29
404 0.26
405 0.26
406 0.25
407 0.27
408 0.26
409 0.24
410 0.18
411 0.18
412 0.2
413 0.21
414 0.23
415 0.2
416 0.17
417 0.2
418 0.21
419 0.23
420 0.21
421 0.18
422 0.16
423 0.16
424 0.16
425 0.13
426 0.15
427 0.14
428 0.17
429 0.17
430 0.18
431 0.18
432 0.18
433 0.19
434 0.19
435 0.21
436 0.22
437 0.23
438 0.25
439 0.24
440 0.23
441 0.23
442 0.23
443 0.19
444 0.16
445 0.18
446 0.18
447 0.18
448 0.21
449 0.26
450 0.25
451 0.27
452 0.32
453 0.3
454 0.28
455 0.31
456 0.37
457 0.37
458 0.39
459 0.44
460 0.42
461 0.47
462 0.47
463 0.47
464 0.39
465 0.38
466 0.36
467 0.3
468 0.28
469 0.21
470 0.21
471 0.22
472 0.21
473 0.17
474 0.16
475 0.19
476 0.19
477 0.18
478 0.19
479 0.19
480 0.2
481 0.21
482 0.21
483 0.19
484 0.2
485 0.22
486 0.22
487 0.24
488 0.25
489 0.24
490 0.26
491 0.25
492 0.27
493 0.26
494 0.28
495 0.29
496 0.36
497 0.39
498 0.41
499 0.46
500 0.43
501 0.46
502 0.42
503 0.36
504 0.27
505 0.25
506 0.21
507 0.14
508 0.14
509 0.11
510 0.1
511 0.12
512 0.12
513 0.13
514 0.13
515 0.14
516 0.14
517 0.13
518 0.17
519 0.16
520 0.15
521 0.14
522 0.16
523 0.15
524 0.14
525 0.14
526 0.11
527 0.16
528 0.17
529 0.17
530 0.17
531 0.16
532 0.16
533 0.17
534 0.16
535 0.13
536 0.14
537 0.14
538 0.14
539 0.16
540 0.16
541 0.16
542 0.16
543 0.19
544 0.22
545 0.24
546 0.24
547 0.25
548 0.26
549 0.31
550 0.31
551 0.31
552 0.27
553 0.28
554 0.29
555 0.27
556 0.25
557 0.2
558 0.2
559 0.2
560 0.24
561 0.21
562 0.25
563 0.32
564 0.41
565 0.44
566 0.5
567 0.55
568 0.57
569 0.63
570 0.67
571 0.68
572 0.71
573 0.74
574 0.77
575 0.8
576 0.82
577 0.84
578 0.84
579 0.85
580 0.84
581 0.84
582 0.79
583 0.74
584 0.68
585 0.66
586 0.64
587 0.58
588 0.54
589 0.49
590 0.46
591 0.44
592 0.41
593 0.36
594 0.35
595 0.32
596 0.27
597 0.25
598 0.23
599 0.21
600 0.18
601 0.15
602 0.09
603 0.08
604 0.09
605 0.1
606 0.1
607 0.11
608 0.15
609 0.17
610 0.18
611 0.21
612 0.2
613 0.22
614 0.28
615 0.28
616 0.29
617 0.29
618 0.32
619 0.36
620 0.44
621 0.48
622 0.41
623 0.43
624 0.43
625 0.48
626 0.5
627 0.51
628 0.46
629 0.44
630 0.48
631 0.46
632 0.44
633 0.42
634 0.41
635 0.35
636 0.31