FuNGI

M2RE28

Protein Details

Accession

M2RE28

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
267-378	DESDGERRGKKRKKKSSDSRKRKRSKRSKETDSESESDEESSPEKKKSKKKRKKSQDSDENESDTDRKRKKKKRKISKSDDESSSDGEASSRTKRKKRKSSKRRDSSESESE	Basic
384-415	SSSDSEDERRRRRSKSRSKSRKQSSSPAPDFS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
273-295	RRGKKRKKKSSDSRKRKRSKRSK
310-321	EKKKSKKKRKKS
333-344	RKRKKKKRKISK
357-370	SRTKRKKRKSSKRR
392-405	RRRRRSKSRSKSRK

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 15

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007832 RNA_pol_Rpc34 IPR016049 RNA_pol_Rpc34-like IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05158 RNA_pol_Rpc34

Amino Acid Sequences

MSRKLNAHEQKLYQAALSDPSKTLTTKEVEALIPDNAVRMNTINFLLGTGLLKPLKDAKGQLSFRAVQKKELELKKDLTDEESLVLSYIQSAGNEGIWTKHLKAKTELHQTVIDRSLKSLTQKQLIKAVKSVKFPTRKIYMLSHLEPSVEMTGGPWYTDNELDTEFIKLLCSACLRFIRDRSTPKTKASEDAPARTQPLFSISAAPSYPTAQQILTFLGKSRITETQLAIEHVESLLNVLVLDGEVEKVPAFGAVMWGNNADEENQDESDGERRGKKRKKKSSDSRKRKRSKRSKETDSESESDEESSPEKKKSKKKRKKSQDSDENESDTDRKRKKKKRKISKSDDESSSDGEASSRTKRKKRKSSKRRDSSESESESESDTSSSDSEDERRRRRSKSRSKSRKQSSSPAPDFSAAMDTDFGGGAYVYRAVKQEKVAFGLAQAPCTRCPTFEFCKVGGPVNPQECVYYGEWLGAAVVARE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.34
2	0.28
3	0.28
4	0.27
5	0.23
6	0.21
7	0.22
8	0.24
9	0.23
10	0.24
11	0.23
12	0.25
13	0.24
14	0.26
15	0.27
16	0.25
17	0.27
18	0.27
19	0.22
20	0.19
21	0.17
22	0.15
23	0.13
24	0.12
25	0.11
26	0.11
27	0.12
28	0.13
29	0.14
30	0.14
31	0.13
32	0.13
33	0.12
34	0.11
35	0.11
36	0.09
37	0.13
38	0.13
39	0.13
40	0.15
41	0.21
42	0.24
43	0.26
44	0.29
45	0.31
46	0.4
47	0.42
48	0.43
49	0.43
50	0.44
51	0.47
52	0.54
53	0.48
54	0.44
55	0.46
56	0.51
57	0.54
58	0.57
59	0.56
60	0.51
61	0.54
62	0.51
63	0.5
64	0.43
65	0.37
66	0.32
67	0.27
68	0.23
69	0.2
70	0.16
71	0.13
72	0.12
73	0.09
74	0.07
75	0.08
76	0.07
77	0.06
78	0.08
79	0.08
80	0.09
81	0.09
82	0.09
83	0.09
84	0.1
85	0.13
86	0.14
87	0.19
88	0.21
89	0.24
90	0.3
91	0.37
92	0.43
93	0.52
94	0.51
95	0.49
96	0.51
97	0.48
98	0.46
99	0.45
100	0.39
101	0.29
102	0.29
103	0.28
104	0.25
105	0.29
106	0.33
107	0.31
108	0.36
109	0.39
110	0.4
111	0.47
112	0.49
113	0.45
114	0.43
115	0.47
116	0.44
117	0.45
118	0.49
119	0.48
120	0.52
121	0.52
122	0.54
123	0.5
124	0.47
125	0.46
126	0.45
127	0.44
128	0.42
129	0.42
130	0.38
131	0.33
132	0.31
133	0.28
134	0.25
135	0.18
136	0.12
137	0.1
138	0.07
139	0.09
140	0.09
141	0.09
142	0.08
143	0.08
144	0.09
145	0.1
146	0.1
147	0.09
148	0.1
149	0.1
150	0.1
151	0.1
152	0.09
153	0.08
154	0.08
155	0.08
156	0.07
157	0.08
158	0.09
159	0.09
160	0.13
161	0.16
162	0.2
163	0.22
164	0.25
165	0.3
166	0.34
167	0.41
168	0.44
169	0.5
170	0.5
171	0.51
172	0.54
173	0.5
174	0.47
175	0.43
176	0.45
177	0.38
178	0.39
179	0.37
180	0.32
181	0.33
182	0.29
183	0.27
184	0.18
185	0.18
186	0.16
187	0.13
188	0.16
189	0.14
190	0.16
191	0.15
192	0.16
193	0.13
194	0.13
195	0.13
196	0.1
197	0.11
198	0.09
199	0.1
200	0.1
201	0.12
202	0.11
203	0.1
204	0.1
205	0.13
206	0.13
207	0.13
208	0.15
209	0.15
210	0.17
211	0.19
212	0.18
213	0.18
214	0.19
215	0.19
216	0.17
217	0.14
218	0.12
219	0.1
220	0.09
221	0.05
222	0.05
223	0.04
224	0.04
225	0.03
226	0.03
227	0.03
228	0.03
229	0.03
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.03
236	0.04
237	0.03
238	0.03
239	0.03
240	0.05
241	0.05
242	0.06
243	0.06
244	0.06
245	0.06
246	0.06
247	0.06
248	0.05
249	0.05
250	0.06
251	0.08
252	0.08
253	0.08
254	0.08
255	0.08
256	0.12
257	0.14
258	0.14
259	0.18
260	0.22
261	0.33
262	0.42
263	0.51
264	0.59
265	0.68
266	0.76
267	0.81
268	0.89
269	0.9
270	0.93
271	0.94
272	0.94
273	0.94
274	0.94
275	0.92
276	0.92
277	0.92
278	0.92
279	0.92
280	0.91
281	0.89
282	0.87
283	0.86
284	0.81
285	0.75
286	0.65
287	0.56
288	0.47
289	0.37
290	0.3
291	0.23
292	0.17
293	0.13
294	0.15
295	0.16
296	0.21
297	0.26
298	0.33
299	0.43
300	0.53
301	0.64
302	0.71
303	0.8
304	0.85
305	0.92
306	0.95
307	0.96
308	0.95
309	0.94
310	0.91
311	0.88
312	0.8
313	0.7
314	0.59
315	0.49
316	0.41
317	0.36
318	0.37
319	0.36
320	0.43
321	0.52
322	0.62
323	0.73
324	0.81
325	0.87
326	0.89
327	0.93
328	0.95
329	0.95
330	0.95
331	0.92
332	0.89
333	0.81
334	0.73
335	0.63
336	0.54
337	0.44
338	0.33
339	0.24
340	0.17
341	0.14
342	0.14
343	0.2
344	0.26
345	0.34
346	0.43
347	0.53
348	0.64
349	0.74
350	0.82
351	0.86
352	0.9
353	0.93
354	0.95
355	0.96
356	0.93
357	0.89
358	0.85
359	0.82
360	0.79
361	0.72
362	0.63
363	0.54
364	0.46
365	0.41
366	0.33
367	0.26
368	0.17
369	0.12
370	0.11
371	0.1
372	0.1
373	0.09
374	0.1
375	0.16
376	0.26
377	0.35
378	0.42
379	0.52
380	0.58
381	0.65
382	0.74
383	0.79
384	0.81
385	0.83
386	0.86
387	0.88
388	0.92
389	0.95
390	0.95
391	0.94
392	0.9
393	0.89
394	0.88
395	0.87
396	0.81
397	0.74
398	0.66
399	0.56
400	0.49
401	0.4
402	0.33
403	0.21
404	0.18
405	0.14
406	0.12
407	0.11
408	0.11
409	0.09
410	0.06
411	0.06
412	0.05
413	0.06
414	0.09
415	0.09
416	0.11
417	0.14
418	0.17
419	0.2
420	0.26
421	0.32
422	0.31
423	0.35
424	0.35
425	0.31
426	0.3
427	0.34
428	0.29
429	0.26
430	0.27
431	0.26
432	0.26
433	0.32
434	0.32
435	0.25
436	0.3
437	0.34
438	0.38
439	0.44
440	0.47
441	0.42
442	0.49
443	0.49
444	0.48
445	0.45
446	0.45
447	0.44
448	0.43
449	0.43
450	0.36
451	0.36
452	0.32
453	0.33
454	0.27
455	0.23
456	0.19
457	0.19
458	0.18
459	0.17
460	0.15
461	0.12

M2RE28

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer