Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0DCV4

Protein Details
Accession B0DCV4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-66NLNGPKKTLKNNQKLLERNDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-28NAGEPKAPEDAPKKRGRK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 11.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021109  Peptidase_aspartic_dom_sf  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_298443  -  
CDD cd00303  retropepsin_like  
Amino Acid Sequences MKGPSSKTKPNAGEPKAPEDAPKKRGRKVVIIKESEEEETPPEKPENLNGPKKTLKNNQKLLERNDDVEDPNPRHKQLPYLGIPDLNSNTKESVEEYDPVPFYEKRPIAYKHLAPIENVKNEEQALNSLLKAPVTLSAEVLMSISPGVRQELFKALAKKEVPIQTAHNRTVTIVEEVDKDAPPIKKQEDNFNFGKININDLDIKATFMCTTEDDGVIPKGSIVLTDPVEQYLQGLGSSETPKEIYVSKESHALKSIYPVINKFRQVESLLDGGSQIVSMDAEVAKKLAVPWDPDITIQMQSANRTVEKTLGLAKNVPFNFGGITIYLQVHVIRDPAYKVLLGRPFDVLTGSVVVNSTDGGQTVTITDPNSGRRAMLPTFDRGKPPVMMKMHTEEDLQPKTEKVFQPLMI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.68
3 0.63
4 0.58
5 0.54
6 0.53
7 0.55
8 0.55
9 0.61
10 0.61
11 0.64
12 0.71
13 0.7
14 0.72
15 0.74
16 0.76
17 0.76
18 0.74
19 0.69
20 0.64
21 0.61
22 0.52
23 0.42
24 0.32
25 0.27
26 0.24
27 0.23
28 0.23
29 0.22
30 0.22
31 0.22
32 0.28
33 0.34
34 0.41
35 0.49
36 0.48
37 0.53
38 0.59
39 0.62
40 0.65
41 0.65
42 0.67
43 0.68
44 0.75
45 0.76
46 0.77
47 0.8
48 0.77
49 0.76
50 0.68
51 0.6
52 0.54
53 0.48
54 0.41
55 0.38
56 0.39
57 0.33
58 0.39
59 0.41
60 0.39
61 0.41
62 0.4
63 0.43
64 0.42
65 0.47
66 0.43
67 0.43
68 0.43
69 0.4
70 0.4
71 0.35
72 0.32
73 0.26
74 0.23
75 0.2
76 0.2
77 0.19
78 0.19
79 0.17
80 0.19
81 0.18
82 0.18
83 0.17
84 0.21
85 0.21
86 0.2
87 0.23
88 0.19
89 0.19
90 0.27
91 0.27
92 0.26
93 0.32
94 0.35
95 0.39
96 0.45
97 0.45
98 0.42
99 0.48
100 0.46
101 0.41
102 0.46
103 0.44
104 0.41
105 0.41
106 0.35
107 0.29
108 0.29
109 0.28
110 0.2
111 0.15
112 0.14
113 0.12
114 0.11
115 0.13
116 0.12
117 0.11
118 0.11
119 0.09
120 0.11
121 0.13
122 0.13
123 0.11
124 0.12
125 0.12
126 0.11
127 0.11
128 0.07
129 0.05
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.05
134 0.06
135 0.07
136 0.08
137 0.09
138 0.13
139 0.16
140 0.19
141 0.23
142 0.22
143 0.27
144 0.27
145 0.27
146 0.29
147 0.31
148 0.28
149 0.26
150 0.31
151 0.33
152 0.38
153 0.38
154 0.33
155 0.29
156 0.28
157 0.27
158 0.23
159 0.16
160 0.12
161 0.11
162 0.11
163 0.12
164 0.13
165 0.11
166 0.1
167 0.14
168 0.14
169 0.15
170 0.18
171 0.2
172 0.24
173 0.25
174 0.36
175 0.35
176 0.39
177 0.39
178 0.37
179 0.35
180 0.3
181 0.35
182 0.24
183 0.23
184 0.18
185 0.18
186 0.16
187 0.16
188 0.17
189 0.11
190 0.12
191 0.09
192 0.08
193 0.07
194 0.07
195 0.08
196 0.06
197 0.08
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.1
202 0.09
203 0.09
204 0.08
205 0.06
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.07
211 0.08
212 0.1
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.1
217 0.09
218 0.07
219 0.06
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.07
224 0.09
225 0.08
226 0.08
227 0.09
228 0.09
229 0.1
230 0.11
231 0.11
232 0.15
233 0.16
234 0.17
235 0.24
236 0.25
237 0.25
238 0.26
239 0.25
240 0.2
241 0.22
242 0.29
243 0.24
244 0.24
245 0.26
246 0.29
247 0.32
248 0.35
249 0.34
250 0.28
251 0.28
252 0.28
253 0.27
254 0.24
255 0.2
256 0.17
257 0.15
258 0.14
259 0.11
260 0.09
261 0.08
262 0.05
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.04
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.06
273 0.07
274 0.1
275 0.11
276 0.14
277 0.17
278 0.2
279 0.21
280 0.21
281 0.22
282 0.19
283 0.18
284 0.15
285 0.16
286 0.14
287 0.15
288 0.18
289 0.18
290 0.18
291 0.18
292 0.18
293 0.17
294 0.16
295 0.16
296 0.22
297 0.22
298 0.22
299 0.25
300 0.26
301 0.32
302 0.31
303 0.32
304 0.24
305 0.22
306 0.21
307 0.17
308 0.17
309 0.09
310 0.1
311 0.1
312 0.1
313 0.1
314 0.1
315 0.1
316 0.1
317 0.1
318 0.1
319 0.1
320 0.12
321 0.13
322 0.14
323 0.15
324 0.15
325 0.16
326 0.21
327 0.25
328 0.26
329 0.25
330 0.26
331 0.25
332 0.25
333 0.24
334 0.18
335 0.13
336 0.13
337 0.12
338 0.1
339 0.1
340 0.1
341 0.09
342 0.09
343 0.08
344 0.07
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.09
350 0.1
351 0.1
352 0.11
353 0.14
354 0.16
355 0.2
356 0.22
357 0.22
358 0.21
359 0.22
360 0.27
361 0.26
362 0.3
363 0.29
364 0.34
365 0.4
366 0.42
367 0.43
368 0.4
369 0.43
370 0.4
371 0.41
372 0.42
373 0.4
374 0.4
375 0.4
376 0.44
377 0.43
378 0.4
379 0.39
380 0.35
381 0.4
382 0.41
383 0.39
384 0.34
385 0.32
386 0.35
387 0.4
388 0.39
389 0.37