FuNGI

M2R8H0

Protein Details

Accession

M2R8H0

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
31-57	SQGSSTPSKPRIPRPPRPKPDAKDDLK	Hydrophilic
171-192	KDKGAAAKKRFQKKTKQVFLVP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
39-52	KPRIPRPPRPKPDA
164-185	AKGKEKEKDKGAAAKKRFQKKT
598-623	KRKAEESGGAGAAPGAAPKLKKRKAQ

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 10.5, mito 7, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MDILFHPKKKSVISVAKKEGNGSGSQSPSGSQGSSTPSKPRIPRPPRPKPDAKDDLKPPPPEGPYAEFRLMSSALNGWKYDVMKFDSRKPVDIMEWTTPVKLNRKEPRRDEPDIAVAAAPQAVGPMLGPDGKPVIGMDGRIVMVDAEGRPIRPGETHTNGSGDAKGKEKEKDKGAAAKKRFQKKTKQVFLVPEATRQLRREERFPWIMEDSAGKEVWVGKMEEVSKSETHAMFMPAANDVFKFVPAHRWYKFQKRPHYHIPTLEEAESLMSKIQKNKDPERWLLRRRNGQGPSEATLATIKAERAGSLGPGAGSQSLGPGGRRLKTVDSGMSGLFGDDDDEEGVDRKRRVKRELGAEGDLDELDFEEAFADDEDRMEPDDREDEEAKELEERLKREYRNANKLRDAGVDESEDEEDENQLTGAGKNLQKTLRKLEKDVAYDDSDEEKNPYASSEEEEEEEEPPVTQTGPAIIPPEPRPARSASQTPGPANGTKTPTISQPPVNIKTETQIPSSVSRPGSPIPTSPTGHGGHLLVAKRATSPKVPKPGSPRPGSPLVGSTSPPMSRATSPVAASANGSRPGSPLQSPVIPASISKITNKRKAEESGGAGAAPGAAPKLKKRKAQGPPGGVELEDRMVIEWLRNTPNATTRDCIHHFTPYLTDEGKKARFTALVKEVAQLNKGVLVLRPAYRDSLPSPALTPSATAAA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.64
2	0.69
3	0.72
4	0.69
5	0.65
6	0.58
7	0.5
8	0.42
9	0.37
10	0.34
11	0.3
12	0.3
13	0.28
14	0.25
15	0.25
16	0.25
17	0.2
18	0.15
19	0.16
20	0.21
21	0.26
22	0.29
23	0.33
24	0.37
25	0.45
26	0.52
27	0.59
28	0.64
29	0.69
30	0.77
31	0.8
32	0.86
33	0.88
34	0.9
35	0.9
36	0.85
37	0.86
38	0.85
39	0.8
40	0.78
41	0.76
42	0.76
43	0.74
44	0.71
45	0.63
46	0.59
47	0.56
48	0.5
49	0.47
50	0.42
51	0.4
52	0.43
53	0.43
54	0.35
55	0.33
56	0.33
57	0.29
58	0.24
59	0.2
60	0.17
61	0.19
62	0.2
63	0.2
64	0.18
65	0.21
66	0.22
67	0.23
68	0.23
69	0.25
70	0.31
71	0.34
72	0.41
73	0.48
74	0.49
75	0.5
76	0.48
77	0.45
78	0.4
79	0.42
80	0.39
81	0.32
82	0.34
83	0.32
84	0.31
85	0.31
86	0.33
87	0.37
88	0.38
89	0.45
90	0.51
91	0.6
92	0.69
93	0.73
94	0.79
95	0.78
96	0.78
97	0.73
98	0.67
99	0.63
100	0.54
101	0.47
102	0.36
103	0.28
104	0.22
105	0.17
106	0.12
107	0.06
108	0.05
109	0.04
110	0.04
111	0.04
112	0.04
113	0.05
114	0.07
115	0.07
116	0.08
117	0.1
118	0.1
119	0.1
120	0.09
121	0.12
122	0.11
123	0.11
124	0.11
125	0.11
126	0.11
127	0.11
128	0.11
129	0.07
130	0.07
131	0.08
132	0.08
133	0.11
134	0.11
135	0.12
136	0.13
137	0.13
138	0.14
139	0.14
140	0.19
141	0.23
142	0.28
143	0.3
144	0.3
145	0.31
146	0.31
147	0.31
148	0.29
149	0.24
150	0.2
151	0.21
152	0.23
153	0.25
154	0.31
155	0.36
156	0.39
157	0.41
158	0.45
159	0.45
160	0.51
161	0.57
162	0.59
163	0.59
164	0.61
165	0.64
166	0.69
167	0.75
168	0.72
169	0.74
170	0.76
171	0.82
172	0.83
173	0.81
174	0.76
175	0.73
176	0.71
177	0.68
178	0.58
179	0.5
180	0.45
181	0.41
182	0.4
183	0.35
184	0.37
185	0.37
186	0.4
187	0.41
188	0.4
189	0.45
190	0.46
191	0.46
192	0.42
193	0.36
194	0.33
195	0.28
196	0.27
197	0.21
198	0.19
199	0.17
200	0.13
201	0.12
202	0.12
203	0.13
204	0.13
205	0.12
206	0.1
207	0.13
208	0.15
209	0.15
210	0.16
211	0.18
212	0.16
213	0.17
214	0.21
215	0.17
216	0.17
217	0.17
218	0.17
219	0.15
220	0.15
221	0.14
222	0.11
223	0.11
224	0.1
225	0.09
226	0.09
227	0.08
228	0.09
229	0.1
230	0.09
231	0.18
232	0.21
233	0.28
234	0.27
235	0.34
236	0.39
237	0.49
238	0.57
239	0.57
240	0.64
241	0.67
242	0.73
243	0.77
244	0.8
245	0.73
246	0.69
247	0.65
248	0.58
249	0.52
250	0.44
251	0.33
252	0.24
253	0.21
254	0.16
255	0.12
256	0.09
257	0.09
258	0.11
259	0.17
260	0.22
261	0.27
262	0.34
263	0.41
264	0.48
265	0.51
266	0.56
267	0.6
268	0.63
269	0.67
270	0.69
271	0.69
272	0.69
273	0.68
274	0.7
275	0.65
276	0.58
277	0.54
278	0.47
279	0.43
280	0.36
281	0.31
282	0.22
283	0.19
284	0.16
285	0.12
286	0.1
287	0.07
288	0.08
289	0.08
290	0.08
291	0.08
292	0.08
293	0.08
294	0.07
295	0.07
296	0.05
297	0.05
298	0.06
299	0.05
300	0.05
301	0.04
302	0.04
303	0.05
304	0.05
305	0.05
306	0.09
307	0.12
308	0.13
309	0.14
310	0.15
311	0.16
312	0.18
313	0.2
314	0.17
315	0.16
316	0.15
317	0.14
318	0.13
319	0.11
320	0.09
321	0.07
322	0.06
323	0.05
324	0.04
325	0.04
326	0.04
327	0.04
328	0.04
329	0.05
330	0.06
331	0.09
332	0.11
333	0.18
334	0.24
335	0.29
336	0.34
337	0.4
338	0.44
339	0.5
340	0.55
341	0.51
342	0.46
343	0.41
344	0.36
345	0.29
346	0.24
347	0.15
348	0.08
349	0.05
350	0.04
351	0.03
352	0.03
353	0.03
354	0.03
355	0.03
356	0.03
357	0.04
358	0.04
359	0.04
360	0.05
361	0.05
362	0.06
363	0.07
364	0.07
365	0.07
366	0.1
367	0.1
368	0.14
369	0.14
370	0.14
371	0.14
372	0.15
373	0.14
374	0.12
375	0.12
376	0.13
377	0.15
378	0.16
379	0.2
380	0.25
381	0.25
382	0.32
383	0.41
384	0.45
385	0.53
386	0.58
387	0.58
388	0.56
389	0.57
390	0.52
391	0.44
392	0.38
393	0.29
394	0.23
395	0.19
396	0.15
397	0.15
398	0.13
399	0.11
400	0.09
401	0.07
402	0.06
403	0.06
404	0.05
405	0.04
406	0.04
407	0.05
408	0.05
409	0.06
410	0.11
411	0.12
412	0.13
413	0.17
414	0.22
415	0.26
416	0.29
417	0.37
418	0.41
419	0.42
420	0.43
421	0.47
422	0.48
423	0.45
424	0.45
425	0.38
426	0.31
427	0.29
428	0.28
429	0.24
430	0.19
431	0.17
432	0.16
433	0.14
434	0.13
435	0.12
436	0.12
437	0.1
438	0.1
439	0.11
440	0.13
441	0.12
442	0.13
443	0.14
444	0.14
445	0.13
446	0.13
447	0.11
448	0.09
449	0.08
450	0.08
451	0.07
452	0.06
453	0.05
454	0.07
455	0.07
456	0.08
457	0.09
458	0.1
459	0.14
460	0.16
461	0.26
462	0.25
463	0.26
464	0.27
465	0.29
466	0.32
467	0.33
468	0.36
469	0.29
470	0.34
471	0.37
472	0.35
473	0.34
474	0.33
475	0.31
476	0.29
477	0.31
478	0.28
479	0.25
480	0.27
481	0.24
482	0.25
483	0.29
484	0.29
485	0.27
486	0.3
487	0.37
488	0.39
489	0.41
490	0.39
491	0.34
492	0.34
493	0.38
494	0.33
495	0.27
496	0.25
497	0.24
498	0.25
499	0.26
500	0.29
501	0.23
502	0.21
503	0.22
504	0.23
505	0.25
506	0.24
507	0.24
508	0.25
509	0.29
510	0.3
511	0.28
512	0.32
513	0.29
514	0.28
515	0.27
516	0.21
517	0.18
518	0.21
519	0.21
520	0.17
521	0.16
522	0.16
523	0.18
524	0.2
525	0.21
526	0.25
527	0.32
528	0.38
529	0.48
530	0.5
531	0.53
532	0.59
533	0.67
534	0.67
535	0.64
536	0.6
537	0.55
538	0.59
539	0.55
540	0.47
541	0.39
542	0.34
543	0.3
544	0.28
545	0.24
546	0.22
547	0.2
548	0.2
549	0.19
550	0.19
551	0.19
552	0.22
553	0.24
554	0.24
555	0.24
556	0.26
557	0.25
558	0.22
559	0.22
560	0.23
561	0.22
562	0.23
563	0.23
564	0.2
565	0.21
566	0.23
567	0.25
568	0.23
569	0.21
570	0.21
571	0.22
572	0.23
573	0.23
574	0.22
575	0.18
576	0.17
577	0.18
578	0.2
579	0.2
580	0.24
581	0.33
582	0.4
583	0.49
584	0.53
585	0.52
586	0.53
587	0.56
588	0.57
589	0.53
590	0.48
591	0.44
592	0.4
593	0.36
594	0.3
595	0.25
596	0.18
597	0.12
598	0.08
599	0.05
600	0.07
601	0.1
602	0.18
603	0.3
604	0.37
605	0.44
606	0.52
607	0.61
608	0.69
609	0.78
610	0.79
611	0.76
612	0.72
613	0.69
614	0.62
615	0.51
616	0.42
617	0.33
618	0.24
619	0.16
620	0.14
621	0.1
622	0.11
623	0.11
624	0.12
625	0.14
626	0.17
627	0.2
628	0.21
629	0.23
630	0.25
631	0.32
632	0.34
633	0.35
634	0.33
635	0.33
636	0.4
637	0.42
638	0.44
639	0.38
640	0.4
641	0.38
642	0.37
643	0.38
644	0.31
645	0.32
646	0.29
647	0.28
648	0.25
649	0.32
650	0.35
651	0.33
652	0.32
653	0.31
654	0.35
655	0.35
656	0.4
657	0.39
658	0.41
659	0.4
660	0.42
661	0.44
662	0.41
663	0.4
664	0.31
665	0.25
666	0.21
667	0.21
668	0.19
669	0.15
670	0.17
671	0.2
672	0.22
673	0.25
674	0.24
675	0.27
676	0.28
677	0.3
678	0.28
679	0.32
680	0.31
681	0.29
682	0.29
683	0.27
684	0.28
685	0.24
686	0.22

M2R8H0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer