Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2PDB8

Protein Details
Accession M2PDB8    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
244-267TSKASVVKRTRKEKGPRKSCACDLHydrophilic
300-324VVCESTRIPRRKGRRPNSVKAAMRIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
199-209RKDKRSSGRKR
252-260RTRKEKGPR
308-315PRRKGRRP
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 13, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001138  Zn2Cys6_DnaBD  
Gene Ontology GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
CDD cd00067  GAL4  
Amino Acid Sequences MHALQRHIEPGHAPVPTGALPELSRPYYYQEQETPRHIDPGPETDYQAYVHTNNVTLRDAPLAERERLFAPTQFEAIVGPDATPTSTYGSQWEWDMPIFPSHDTFQDGFVFQSRLDPVYYPAPLDFSIAHEEEARPSYAGYLQSNVEMLGTNTSMPVGSSQVSINDLPPEADVPAVYEAGLPAMSTASSEEPGPSSDPRKDKRSSGRKRLAARQYNLQPFEQVLDLGIDPLIKDDDTSQTAGETSKASVVKRTRKEKGPRKSCACDLCHALKLRCLTAPGQSTCGTCVKTNMDLPADQQVVCESTRIPRRKGRRPNSVKAAMRIIGLIA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.21
3 0.2
4 0.21
5 0.16
6 0.13
7 0.14
8 0.17
9 0.22
10 0.2
11 0.21
12 0.2
13 0.26
14 0.32
15 0.35
16 0.36
17 0.39
18 0.44
19 0.48
20 0.53
21 0.52
22 0.45
23 0.47
24 0.42
25 0.39
26 0.36
27 0.37
28 0.36
29 0.31
30 0.32
31 0.28
32 0.29
33 0.25
34 0.23
35 0.19
36 0.15
37 0.17
38 0.16
39 0.17
40 0.18
41 0.2
42 0.2
43 0.18
44 0.19
45 0.18
46 0.18
47 0.16
48 0.22
49 0.24
50 0.24
51 0.24
52 0.25
53 0.24
54 0.27
55 0.27
56 0.22
57 0.23
58 0.21
59 0.22
60 0.2
61 0.18
62 0.16
63 0.15
64 0.14
65 0.09
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.1
73 0.11
74 0.11
75 0.13
76 0.15
77 0.15
78 0.16
79 0.15
80 0.12
81 0.12
82 0.13
83 0.12
84 0.13
85 0.13
86 0.12
87 0.13
88 0.13
89 0.14
90 0.17
91 0.16
92 0.16
93 0.16
94 0.16
95 0.14
96 0.15
97 0.15
98 0.11
99 0.13
100 0.12
101 0.12
102 0.12
103 0.12
104 0.13
105 0.15
106 0.16
107 0.13
108 0.13
109 0.13
110 0.13
111 0.13
112 0.11
113 0.1
114 0.13
115 0.13
116 0.13
117 0.13
118 0.13
119 0.13
120 0.14
121 0.13
122 0.09
123 0.09
124 0.09
125 0.1
126 0.12
127 0.11
128 0.11
129 0.11
130 0.11
131 0.11
132 0.11
133 0.08
134 0.06
135 0.06
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.04
142 0.04
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.06
147 0.06
148 0.07
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.08
153 0.08
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.06
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.04
166 0.05
167 0.05
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.04
174 0.05
175 0.05
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.08
180 0.09
181 0.11
182 0.14
183 0.19
184 0.27
185 0.31
186 0.37
187 0.38
188 0.44
189 0.53
190 0.6
191 0.65
192 0.69
193 0.73
194 0.74
195 0.78
196 0.8
197 0.79
198 0.77
199 0.69
200 0.67
201 0.66
202 0.66
203 0.62
204 0.53
205 0.43
206 0.34
207 0.33
208 0.24
209 0.16
210 0.09
211 0.08
212 0.08
213 0.07
214 0.07
215 0.06
216 0.05
217 0.06
218 0.06
219 0.05
220 0.06
221 0.07
222 0.1
223 0.12
224 0.13
225 0.12
226 0.11
227 0.12
228 0.12
229 0.12
230 0.09
231 0.08
232 0.12
233 0.14
234 0.15
235 0.22
236 0.3
237 0.38
238 0.46
239 0.55
240 0.58
241 0.65
242 0.76
243 0.79
244 0.82
245 0.82
246 0.83
247 0.83
248 0.82
249 0.79
250 0.77
251 0.7
252 0.63
253 0.59
254 0.54
255 0.52
256 0.5
257 0.44
258 0.4
259 0.39
260 0.37
261 0.32
262 0.29
263 0.25
264 0.26
265 0.33
266 0.3
267 0.31
268 0.31
269 0.3
270 0.31
271 0.33
272 0.29
273 0.22
274 0.25
275 0.25
276 0.28
277 0.3
278 0.31
279 0.3
280 0.28
281 0.29
282 0.32
283 0.3
284 0.25
285 0.23
286 0.2
287 0.19
288 0.19
289 0.18
290 0.12
291 0.19
292 0.29
293 0.35
294 0.4
295 0.48
296 0.58
297 0.68
298 0.78
299 0.8
300 0.82
301 0.85
302 0.89
303 0.9
304 0.9
305 0.85
306 0.78
307 0.75
308 0.64
309 0.55