FuNGI

N1RLM5

Protein Details

Accession

N1RLM5

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1107-1132	FYHNRLERSNKDKSQRSRKLQLSDVD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 10, mito 7, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR003890 MIF4G-like_typ-3 IPR039762 Nmd2/UPF2 IPR007193 Upf2/Nmd2_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0003723 F:RNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF02854 MIF4G PF04050 Upf2

Amino Acid Sequences

MDRARKRIISHHPSYLYSELRTLNEKAWDGESDLFPVAKTLDSSLKKNTALIKRLRTAITAATLSTFLQEIRTLSLHKYLSEIISACYEGLCRLKSPGEIEAGVEIVSALHQRFGPNEFTEYLAWLLGKGMATPDKGILKTLAPEVREKEEKERIIRQRALLRVVTELWLVGVIRTLDDVSRPDDATKGAAGKTPELKTRTNKGTGAEPFPLEVLKDLLGHDREHANLPLLVIFVKSFSWDILGVKPTGADGRKTVEEDGTTEGNEAEDGNSGNEASPDADQPFTEPEMRDRFRSILKKYFDDVKGHITRDQKSIQSQARRNAEAYVKSGEVFEDRQANYEKQVKAQERLVSNAQVIADAIGAEMPDLKDSDDSFAASNGSIGLVKTGDYLRSMGDGAGIWEDEDERRFYENLVDLKGKVPAILLEDGKKKKTDTDEQVGKKLDPSEASEAPKTAETADDQSTSIANRTIGAQVDALLARLPELTNKDIADQTAIDFCFLNSKASRNRLVKALTEVPKGRSDLLPSWSRLVATLGRYMPDVPKGLVDYLDAEFRSLQRRKEKDFLGQVRLSNIRYLAELTKFGIVPEHVVFHCLKVSLDDFSRMNIEILCNLIENCGRYLLRNPETAPRMMSFLETLQRKKSVQHIGQPERMLIDNAVYYVDPPERLAIEQKERTPMELFVRKLIYVDMTKRNYSKILKQIRRLHWEETEVVAILEKVFSKPGKVKYGSVHLLGILLSALYRYHPAFVVKVIDNVIESMTFGLEQNDYRFYQRRIAEVKYLGELYNYRMLEHPVIFDTMYKIMTFGYGGPPVPGKYIPLDPPDDFFRIRLVSTMLETCGMFFNRGAAGKKLDYFLSFFQYYIFTKVSLPMDIEFLVQDTFALTRPQWKLATSLDEAVKAFQLAVAQDQKSAGVDKGIDVDDATSDASSDDDNVDNDEDGDDNEDSASEEEEAEDVEEDSDDESTFDEEAIVVTRQEEEVDPEDEADFEREYAKMMAESLESRKFERKQLFDVPLPVRSKNREATSTEGGEGESPPGHTMAFSLLTKKGNRQQTRTVELPSDSTFAIAMKNQQQAEREEQQRIKNLVLNYDLQQNEDQDGGNERPATFYHNRLERSNKDKSQRSRKLQLSDVDW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.58
3	0.5
4	0.42
5	0.4
6	0.34
7	0.34
8	0.36
9	0.33
10	0.31
11	0.33
12	0.33
13	0.31
14	0.31
15	0.29
16	0.28
17	0.3
18	0.26
19	0.23
20	0.23
21	0.21
22	0.18
23	0.18
24	0.15
25	0.12
26	0.12
27	0.13
28	0.21
29	0.25
30	0.29
31	0.35
32	0.4
33	0.4
34	0.43
35	0.49
36	0.49
37	0.53
38	0.58
39	0.59
40	0.59
41	0.64
42	0.61
43	0.54
44	0.47
45	0.42
46	0.38
47	0.3
48	0.25
49	0.21
50	0.2
51	0.19
52	0.17
53	0.14
54	0.09
55	0.1
56	0.12
57	0.11
58	0.14
59	0.16
60	0.17
61	0.19
62	0.26
63	0.25
64	0.23
65	0.25
66	0.24
67	0.23
68	0.25
69	0.23
70	0.18
71	0.19
72	0.19
73	0.16
74	0.14
75	0.13
76	0.13
77	0.17
78	0.16
79	0.16
80	0.19
81	0.21
82	0.24
83	0.26
84	0.27
85	0.26
86	0.25
87	0.24
88	0.22
89	0.2
90	0.17
91	0.13
92	0.1
93	0.06
94	0.06
95	0.08
96	0.08
97	0.09
98	0.11
99	0.12
100	0.14
101	0.17
102	0.21
103	0.21
104	0.24
105	0.23
106	0.25
107	0.24
108	0.23
109	0.21
110	0.17
111	0.14
112	0.11
113	0.11
114	0.1
115	0.1
116	0.08
117	0.11
118	0.13
119	0.14
120	0.15
121	0.19
122	0.21
123	0.21
124	0.23
125	0.21
126	0.2
127	0.21
128	0.27
129	0.26
130	0.24
131	0.28
132	0.3
133	0.36
134	0.4
135	0.4
136	0.42
137	0.47
138	0.52
139	0.53
140	0.59
141	0.61
142	0.65
143	0.66
144	0.64
145	0.63
146	0.62
147	0.61
148	0.53
149	0.45
150	0.39
151	0.35
152	0.3
153	0.23
154	0.18
155	0.13
156	0.11
157	0.1
158	0.07
159	0.09
160	0.07
161	0.07
162	0.08
163	0.09
164	0.08
165	0.1
166	0.12
167	0.12
168	0.15
169	0.16
170	0.16
171	0.16
172	0.17
173	0.17
174	0.17
175	0.17
176	0.15
177	0.17
178	0.18
179	0.21
180	0.27
181	0.29
182	0.34
183	0.35
184	0.41
185	0.44
186	0.52
187	0.54
188	0.52
189	0.51
190	0.47
191	0.51
192	0.5
193	0.48
194	0.41
195	0.35
196	0.3
197	0.28
198	0.26
199	0.18
200	0.14
201	0.11
202	0.09
203	0.09
204	0.1
205	0.15
206	0.17
207	0.17
208	0.18
209	0.19
210	0.2
211	0.22
212	0.22
213	0.19
214	0.17
215	0.17
216	0.15
217	0.14
218	0.12
219	0.1
220	0.09
221	0.07
222	0.07
223	0.08
224	0.07
225	0.07
226	0.09
227	0.09
228	0.11
229	0.14
230	0.16
231	0.15
232	0.14
233	0.14
234	0.13
235	0.18
236	0.18
237	0.16
238	0.15
239	0.19
240	0.21
241	0.23
242	0.23
243	0.2
244	0.19
245	0.19
246	0.21
247	0.17
248	0.16
249	0.14
250	0.13
251	0.11
252	0.11
253	0.09
254	0.06
255	0.06
256	0.07
257	0.07
258	0.07
259	0.07
260	0.07
261	0.07
262	0.07
263	0.07
264	0.08
265	0.09
266	0.1
267	0.1
268	0.1
269	0.11
270	0.13
271	0.14
272	0.16
273	0.15
274	0.2
275	0.28
276	0.3
277	0.31
278	0.31
279	0.32
280	0.37
281	0.44
282	0.44
283	0.44
284	0.46
285	0.47
286	0.48
287	0.54
288	0.49
289	0.45
290	0.41
291	0.42
292	0.42
293	0.41
294	0.43
295	0.39
296	0.39
297	0.4
298	0.41
299	0.35
300	0.34
301	0.41
302	0.43
303	0.47
304	0.5
305	0.54
306	0.56
307	0.55
308	0.52
309	0.48
310	0.46
311	0.39
312	0.36
313	0.3
314	0.24
315	0.23
316	0.22
317	0.18
318	0.15
319	0.14
320	0.14
321	0.17
322	0.17
323	0.2
324	0.23
325	0.23
326	0.26
327	0.32
328	0.31
329	0.29
330	0.37
331	0.37
332	0.37
333	0.41
334	0.42
335	0.36
336	0.39
337	0.37
338	0.3
339	0.27
340	0.25
341	0.2
342	0.15
343	0.13
344	0.09
345	0.07
346	0.05
347	0.05
348	0.04
349	0.03
350	0.03
351	0.05
352	0.04
353	0.05
354	0.05
355	0.06
356	0.07
357	0.08
358	0.1
359	0.09
360	0.1
361	0.1
362	0.1
363	0.1
364	0.09
365	0.08
366	0.06
367	0.06
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.05
372	0.05
373	0.07
374	0.07
375	0.07
376	0.08
377	0.09
378	0.08
379	0.09
380	0.09
381	0.07
382	0.07
383	0.07
384	0.06
385	0.06
386	0.06
387	0.05
388	0.05
389	0.06
390	0.06
391	0.07
392	0.08
393	0.08
394	0.1
395	0.11
396	0.11
397	0.14
398	0.18
399	0.18
400	0.2
401	0.2
402	0.19
403	0.19
404	0.21
405	0.18
406	0.13
407	0.11
408	0.09
409	0.11
410	0.13
411	0.13
412	0.15
413	0.22
414	0.24
415	0.26
416	0.27
417	0.24
418	0.26
419	0.32
420	0.37
421	0.37
422	0.44
423	0.51
424	0.52
425	0.57
426	0.54
427	0.47
428	0.4
429	0.34
430	0.26
431	0.19
432	0.2
433	0.21
434	0.22
435	0.25
436	0.23
437	0.22
438	0.22
439	0.21
440	0.17
441	0.12
442	0.1
443	0.09
444	0.11
445	0.12
446	0.12
447	0.12
448	0.12
449	0.12
450	0.12
451	0.11
452	0.09
453	0.08
454	0.07
455	0.08
456	0.09
457	0.09
458	0.09
459	0.08
460	0.08
461	0.09
462	0.09
463	0.08
464	0.06
465	0.06
466	0.05
467	0.06
468	0.05
469	0.06
470	0.09
471	0.1
472	0.12
473	0.12
474	0.13
475	0.13
476	0.13
477	0.12
478	0.09
479	0.09
480	0.1
481	0.1
482	0.09
483	0.09
484	0.08
485	0.11
486	0.12
487	0.14
488	0.12
489	0.16
490	0.21
491	0.25
492	0.33
493	0.31
494	0.32
495	0.34
496	0.35
497	0.32
498	0.32
499	0.35
500	0.31
501	0.33
502	0.33
503	0.31
504	0.31
505	0.31
506	0.27
507	0.2
508	0.21
509	0.19
510	0.22
511	0.23
512	0.22
513	0.23
514	0.21
515	0.2
516	0.17
517	0.16
518	0.14
519	0.12
520	0.15
521	0.13
522	0.14
523	0.14
524	0.14
525	0.14
526	0.14
527	0.13
528	0.09
529	0.1
530	0.1
531	0.1
532	0.09
533	0.09
534	0.08
535	0.08
536	0.09
537	0.08
538	0.08
539	0.08
540	0.09
541	0.17
542	0.19
543	0.23
544	0.31
545	0.36
546	0.4
547	0.46
548	0.47
549	0.45
550	0.51
551	0.5
552	0.47
553	0.44
554	0.4
555	0.37
556	0.37
557	0.31
558	0.22
559	0.18
560	0.13
561	0.11
562	0.12
563	0.11
564	0.1
565	0.1
566	0.1
567	0.11
568	0.11
569	0.1
570	0.1
571	0.08
572	0.09
573	0.09
574	0.1
575	0.09
576	0.1
577	0.11
578	0.1
579	0.11
580	0.09
581	0.09
582	0.08
583	0.09
584	0.09
585	0.09
586	0.11
587	0.11
588	0.11
589	0.12
590	0.11
591	0.11
592	0.09
593	0.09
594	0.07
595	0.07
596	0.07
597	0.06
598	0.06
599	0.06
600	0.07
601	0.07
602	0.07
603	0.09
604	0.09
605	0.09
606	0.14
607	0.21
608	0.22
609	0.23
610	0.24
611	0.28
612	0.31
613	0.3
614	0.27
615	0.2
616	0.19
617	0.18
618	0.17
619	0.11
620	0.1
621	0.15
622	0.17
623	0.18
624	0.19
625	0.21
626	0.21
627	0.23
628	0.29
629	0.33
630	0.34
631	0.39
632	0.47
633	0.5
634	0.54
635	0.52
636	0.44
637	0.36
638	0.33
639	0.26
640	0.16
641	0.11
642	0.07
643	0.07
644	0.07
645	0.06
646	0.05
647	0.07
648	0.07
649	0.07
650	0.07
651	0.08
652	0.08
653	0.09
654	0.13
655	0.15
656	0.21
657	0.24
658	0.25
659	0.3
660	0.3
661	0.31
662	0.29
663	0.27
664	0.27
665	0.3
666	0.29
667	0.26
668	0.27
669	0.25
670	0.24
671	0.22
672	0.17
673	0.14
674	0.19
675	0.23
676	0.25
677	0.28
678	0.29
679	0.3
680	0.32
681	0.33
682	0.35
683	0.37
684	0.45
685	0.49
686	0.57
687	0.66
688	0.68
689	0.72
690	0.69
691	0.63
692	0.54
693	0.51
694	0.43
695	0.34
696	0.27
697	0.19
698	0.16
699	0.12
700	0.1
701	0.07
702	0.06
703	0.05
704	0.05
705	0.08
706	0.08
707	0.11
708	0.17
709	0.23
710	0.3
711	0.32
712	0.34
713	0.35
714	0.42
715	0.41
716	0.37
717	0.31
718	0.23
719	0.21
720	0.18
721	0.15
722	0.07
723	0.05
724	0.03
725	0.03
726	0.03
727	0.04
728	0.06
729	0.06
730	0.07
731	0.09
732	0.1
733	0.1
734	0.12
735	0.16
736	0.14
737	0.15
738	0.15
739	0.14
740	0.13
741	0.12
742	0.11
743	0.07
744	0.06
745	0.05
746	0.05
747	0.05
748	0.05
749	0.06
750	0.06
751	0.07
752	0.09
753	0.12
754	0.13
755	0.16
756	0.2
757	0.21
758	0.28
759	0.29
760	0.33
761	0.34
762	0.36
763	0.38
764	0.36
765	0.35
766	0.29
767	0.29
768	0.22
769	0.2
770	0.18
771	0.16
772	0.2
773	0.18
774	0.17
775	0.17
776	0.2
777	0.21
778	0.21
779	0.19
780	0.13
781	0.14
782	0.14
783	0.13
784	0.13
785	0.11
786	0.11
787	0.1
788	0.09
789	0.08
790	0.08
791	0.08
792	0.07
793	0.09
794	0.1
795	0.1
796	0.11
797	0.12
798	0.13
799	0.14
800	0.13
801	0.12
802	0.13
803	0.17
804	0.19
805	0.21
806	0.25
807	0.24
808	0.26
809	0.28
810	0.28
811	0.25
812	0.22
813	0.21
814	0.18
815	0.18
816	0.16
817	0.14
818	0.12
819	0.14
820	0.14
821	0.12
822	0.12
823	0.12
824	0.12
825	0.13
826	0.13
827	0.12
828	0.11
829	0.12
830	0.13
831	0.16
832	0.18
833	0.17
834	0.2
835	0.2
836	0.22
837	0.22
838	0.21
839	0.19
840	0.19
841	0.18
842	0.21
843	0.2
844	0.18
845	0.17
846	0.19
847	0.19
848	0.2
849	0.19
850	0.14
851	0.14
852	0.19
853	0.19
854	0.18
855	0.18
856	0.15
857	0.16
858	0.15
859	0.15
860	0.1
861	0.1
862	0.09
863	0.07
864	0.07
865	0.06
866	0.06
867	0.07
868	0.09
869	0.08
870	0.16
871	0.19
872	0.23
873	0.24
874	0.24
875	0.26
876	0.27
877	0.32
878	0.26
879	0.29
880	0.25
881	0.26
882	0.25
883	0.23
884	0.2
885	0.15
886	0.13
887	0.09
888	0.09
889	0.08
890	0.12
891	0.17
892	0.17
893	0.17
894	0.18
895	0.17
896	0.17
897	0.18
898	0.14
899	0.1
900	0.1
901	0.1
902	0.13
903	0.13
904	0.12
905	0.1
906	0.1
907	0.09
908	0.09
909	0.09
910	0.06
911	0.06
912	0.06
913	0.06
914	0.06
915	0.06
916	0.07
917	0.08
918	0.09
919	0.1
920	0.11
921	0.11
922	0.11
923	0.11
924	0.09
925	0.08
926	0.11
927	0.1
928	0.09
929	0.09
930	0.08
931	0.09
932	0.09
933	0.1
934	0.07
935	0.07
936	0.07
937	0.07
938	0.07
939	0.07
940	0.07
941	0.06
942	0.06
943	0.06
944	0.06
945	0.06
946	0.07
947	0.06
948	0.06
949	0.06
950	0.07
951	0.07
952	0.07
953	0.06
954	0.06
955	0.06
956	0.08
957	0.08
958	0.07
959	0.08
960	0.09
961	0.09
962	0.1
963	0.1
964	0.13
965	0.15
966	0.17
967	0.16
968	0.16
969	0.16
970	0.15
971	0.16
972	0.13
973	0.1
974	0.09
975	0.1
976	0.1
977	0.12
978	0.12
979	0.12
980	0.1
981	0.1
982	0.11
983	0.12
984	0.15
985	0.18
986	0.23
987	0.24
988	0.27
989	0.35
990	0.37
991	0.44
992	0.5
993	0.5
994	0.51
995	0.58
996	0.61
997	0.56
998	0.62
999	0.56
1000	0.54
1001	0.53
1002	0.5
1003	0.47
1004	0.47
1005	0.5
1006	0.5
1007	0.52
1008	0.5
1009	0.5
1010	0.53
1011	0.53
1012	0.5
1013	0.44
1014	0.36
1015	0.31
1016	0.27
1017	0.24
1018	0.19
1019	0.13
1020	0.12
1021	0.12
1022	0.12
1023	0.11
1024	0.1
1025	0.1
1026	0.11
1027	0.14
1028	0.14
1029	0.16
1030	0.2
1031	0.25
1032	0.28
1033	0.36
1034	0.41
1035	0.48
1036	0.55
1037	0.58
1038	0.64
1039	0.68
1040	0.72
1041	0.68
1042	0.63
1043	0.57
1044	0.5
1045	0.47
1046	0.39
1047	0.33
1048	0.25
1049	0.22
1050	0.18
1051	0.15
1052	0.15
1053	0.14
1054	0.18
1055	0.23
1056	0.29
1057	0.3
1058	0.33
1059	0.36
1060	0.4
1061	0.46
1062	0.49
1063	0.47
1064	0.5
1065	0.54
1066	0.57
1067	0.62
1068	0.6
1069	0.55
1070	0.51
1071	0.48
1072	0.43
1073	0.41
1074	0.38
1075	0.31
1076	0.37
1077	0.34
1078	0.32
1079	0.32
1080	0.29
1081	0.27
1082	0.24
1083	0.22
1084	0.16
1085	0.21
1086	0.2
1087	0.22
1088	0.22
1089	0.21
1090	0.22
1091	0.22
1092	0.28
1093	0.27
1094	0.32
1095	0.36
1096	0.42
1097	0.45
1098	0.5
1099	0.58
1100	0.59
1101	0.62
1102	0.67
1103	0.66
1104	0.69
1105	0.75
1106	0.79
1107	0.82
1108	0.84
1109	0.86
1110	0.86
1111	0.86
1112	0.83
1113	0.81

N1RLM5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer