Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1RFS0

Protein Details
Accession N1RFS0    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
305-327GEDKRKRRDYRQARKEQFKRPEPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
41-43KKG
46-46K
49-67SKATDKPAKEASPPPRKRS
308-325KRKRRDYRQARKEQFKRP
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 2.5, cyto_mito 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028942  WHIM1_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF15612  WHIM1  
Amino Acid Sequences MSAEDDSSDLSSLSSLSPAPSDIELDEPVQEPVQEPVAKPKKGIQKYFSKATDKPAKEASPPPRKRSPSPPHEYVLADNPDIAFIVMFRSRFNDAFPKSLAHFGPQELERDIVEPIPGDRAEHFLCALLGLLLNRKQDVKPGHYGRALEDAVSTHKNQWAPAWEDKSPLSGGATFASMNPTQRLTLLRYLILWTLSSSDTVKGLINQSYKQNRHEDDTNQPRSVQPWGSDGDKRRYFLIEGQDDTAFRVYRESNPAGTNRTWWSVAGTIEELKALAEKLQVKDGGPKATKLAQKMFSAVPRFEAGEDKRKRRDYRQARKEQFKRPEPGFSLYEGRTRGKKMKYTYSDDEDIFTTDSTTRRSTRNTGTHTPAETGPVTTASGRQIKAPTRLNPTTGSSAPGSVQGDTSEVDREQSVGPTGRPRRSAAVNHGTTGWAENNKGPRHNASDDSDDESEADFGDDEEDVDEHVPEESEDEDDFDEDEAMMDDDLEEKNRSLVVKLSVTPPKLRNVLGPNSQAGNKLPTPSSDKTGEEHRLGESPLVEMQDAPEATSNKEAQAAAQESPTPNTNFAERNNASPAALYATSLAFRGSPEKTHAQPVPRPLDVGANHE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.08
3 0.09
4 0.1
5 0.11
6 0.13
7 0.13
8 0.14
9 0.13
10 0.15
11 0.16
12 0.16
13 0.17
14 0.16
15 0.16
16 0.15
17 0.14
18 0.13
19 0.13
20 0.19
21 0.19
22 0.19
23 0.29
24 0.38
25 0.38
26 0.39
27 0.45
28 0.49
29 0.56
30 0.64
31 0.6
32 0.62
33 0.68
34 0.75
35 0.74
36 0.7
37 0.64
38 0.66
39 0.69
40 0.6
41 0.58
42 0.57
43 0.53
44 0.51
45 0.58
46 0.59
47 0.59
48 0.65
49 0.68
50 0.7
51 0.74
52 0.75
53 0.77
54 0.77
55 0.77
56 0.78
57 0.76
58 0.69
59 0.66
60 0.61
61 0.53
62 0.5
63 0.43
64 0.34
65 0.29
66 0.25
67 0.22
68 0.2
69 0.17
70 0.09
71 0.05
72 0.09
73 0.11
74 0.11
75 0.12
76 0.15
77 0.19
78 0.2
79 0.23
80 0.29
81 0.29
82 0.32
83 0.33
84 0.33
85 0.31
86 0.36
87 0.32
88 0.27
89 0.26
90 0.23
91 0.27
92 0.25
93 0.26
94 0.22
95 0.22
96 0.19
97 0.18
98 0.18
99 0.13
100 0.12
101 0.1
102 0.09
103 0.12
104 0.12
105 0.12
106 0.12
107 0.16
108 0.17
109 0.17
110 0.17
111 0.13
112 0.13
113 0.12
114 0.11
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.11
119 0.13
120 0.15
121 0.16
122 0.18
123 0.18
124 0.25
125 0.3
126 0.31
127 0.38
128 0.42
129 0.46
130 0.47
131 0.47
132 0.42
133 0.42
134 0.37
135 0.27
136 0.22
137 0.18
138 0.19
139 0.21
140 0.2
141 0.16
142 0.2
143 0.21
144 0.21
145 0.23
146 0.25
147 0.28
148 0.34
149 0.36
150 0.33
151 0.35
152 0.34
153 0.33
154 0.27
155 0.22
156 0.16
157 0.12
158 0.12
159 0.11
160 0.11
161 0.09
162 0.09
163 0.12
164 0.12
165 0.13
166 0.14
167 0.14
168 0.13
169 0.15
170 0.17
171 0.17
172 0.21
173 0.21
174 0.2
175 0.19
176 0.2
177 0.2
178 0.18
179 0.14
180 0.09
181 0.1
182 0.1
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.1
189 0.1
190 0.13
191 0.16
192 0.17
193 0.19
194 0.27
195 0.35
196 0.37
197 0.4
198 0.45
199 0.42
200 0.45
201 0.48
202 0.43
203 0.45
204 0.52
205 0.53
206 0.47
207 0.45
208 0.4
209 0.38
210 0.38
211 0.29
212 0.2
213 0.17
214 0.19
215 0.21
216 0.26
217 0.29
218 0.34
219 0.35
220 0.34
221 0.33
222 0.32
223 0.31
224 0.3
225 0.33
226 0.27
227 0.26
228 0.27
229 0.26
230 0.24
231 0.24
232 0.21
233 0.14
234 0.1
235 0.12
236 0.11
237 0.14
238 0.2
239 0.21
240 0.21
241 0.23
242 0.25
243 0.26
244 0.25
245 0.25
246 0.21
247 0.21
248 0.19
249 0.17
250 0.17
251 0.15
252 0.15
253 0.13
254 0.12
255 0.1
256 0.1
257 0.1
258 0.08
259 0.06
260 0.06
261 0.05
262 0.05
263 0.08
264 0.11
265 0.12
266 0.14
267 0.15
268 0.15
269 0.21
270 0.23
271 0.26
272 0.23
273 0.23
274 0.22
275 0.28
276 0.3
277 0.26
278 0.29
279 0.26
280 0.26
281 0.28
282 0.28
283 0.26
284 0.26
285 0.23
286 0.2
287 0.17
288 0.17
289 0.15
290 0.19
291 0.17
292 0.25
293 0.3
294 0.34
295 0.41
296 0.48
297 0.51
298 0.54
299 0.62
300 0.63
301 0.69
302 0.75
303 0.79
304 0.79
305 0.86
306 0.86
307 0.85
308 0.83
309 0.78
310 0.74
311 0.65
312 0.63
313 0.55
314 0.52
315 0.43
316 0.36
317 0.33
318 0.27
319 0.29
320 0.26
321 0.25
322 0.23
323 0.25
324 0.3
325 0.3
326 0.35
327 0.37
328 0.44
329 0.48
330 0.53
331 0.54
332 0.52
333 0.51
334 0.45
335 0.41
336 0.32
337 0.27
338 0.2
339 0.15
340 0.11
341 0.09
342 0.11
343 0.12
344 0.15
345 0.16
346 0.19
347 0.23
348 0.27
349 0.34
350 0.4
351 0.44
352 0.46
353 0.5
354 0.5
355 0.47
356 0.44
357 0.36
358 0.31
359 0.24
360 0.19
361 0.14
362 0.12
363 0.11
364 0.09
365 0.11
366 0.12
367 0.16
368 0.16
369 0.18
370 0.22
371 0.26
372 0.33
373 0.38
374 0.39
375 0.43
376 0.44
377 0.44
378 0.41
379 0.4
380 0.38
381 0.32
382 0.29
383 0.21
384 0.2
385 0.18
386 0.19
387 0.17
388 0.13
389 0.12
390 0.1
391 0.11
392 0.1
393 0.11
394 0.09
395 0.08
396 0.09
397 0.09
398 0.1
399 0.1
400 0.1
401 0.12
402 0.11
403 0.13
404 0.21
405 0.28
406 0.31
407 0.33
408 0.34
409 0.36
410 0.4
411 0.44
412 0.44
413 0.47
414 0.44
415 0.42
416 0.4
417 0.36
418 0.31
419 0.28
420 0.21
421 0.13
422 0.14
423 0.17
424 0.24
425 0.27
426 0.29
427 0.3
428 0.31
429 0.36
430 0.38
431 0.39
432 0.35
433 0.37
434 0.36
435 0.38
436 0.34
437 0.28
438 0.25
439 0.21
440 0.17
441 0.12
442 0.11
443 0.06
444 0.05
445 0.06
446 0.05
447 0.05
448 0.06
449 0.05
450 0.06
451 0.06
452 0.06
453 0.06
454 0.06
455 0.06
456 0.05
457 0.06
458 0.06
459 0.07
460 0.07
461 0.08
462 0.08
463 0.09
464 0.09
465 0.09
466 0.08
467 0.07
468 0.07
469 0.06
470 0.06
471 0.06
472 0.05
473 0.05
474 0.06
475 0.07
476 0.09
477 0.09
478 0.09
479 0.1
480 0.12
481 0.13
482 0.12
483 0.16
484 0.18
485 0.2
486 0.22
487 0.28
488 0.32
489 0.35
490 0.4
491 0.39
492 0.41
493 0.41
494 0.4
495 0.4
496 0.41
497 0.46
498 0.46
499 0.46
500 0.42
501 0.41
502 0.41
503 0.37
504 0.32
505 0.3
506 0.25
507 0.26
508 0.24
509 0.25
510 0.32
511 0.33
512 0.36
513 0.33
514 0.33
515 0.32
516 0.39
517 0.42
518 0.36
519 0.35
520 0.32
521 0.31
522 0.3
523 0.29
524 0.22
525 0.17
526 0.17
527 0.17
528 0.15
529 0.12
530 0.13
531 0.16
532 0.16
533 0.15
534 0.18
535 0.18
536 0.2
537 0.25
538 0.25
539 0.2
540 0.23
541 0.22
542 0.18
543 0.25
544 0.26
545 0.21
546 0.22
547 0.25
548 0.23
549 0.26
550 0.3
551 0.24
552 0.24
553 0.25
554 0.27
555 0.28
556 0.29
557 0.37
558 0.33
559 0.35
560 0.38
561 0.37
562 0.32
563 0.29
564 0.27
565 0.22
566 0.21
567 0.17
568 0.14
569 0.14
570 0.14
571 0.14
572 0.14
573 0.09
574 0.1
575 0.15
576 0.17
577 0.19
578 0.24
579 0.31
580 0.33
581 0.41
582 0.45
583 0.48
584 0.52
585 0.58
586 0.59
587 0.53
588 0.52
589 0.44
590 0.47