Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1R8N2

Protein Details
Accession N1R8N2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
236-257DRDERRSQSRGRSRSRSRSRSPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
146-152RKLRRRG
244-257SRGRSRSRSRSRSP
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11.5, cyto 6.5, mito 2, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MSRNKDTVHADARRFLDERGSNVSVAPNGLNPATIMEKAVKDRIVDSYFYKEQCFALNEADIVDRVVEHVNFIGGTYGVTQKPSPFLCLAFKLLELSPSDAVLMEYLKYGGEAFKYLRALACFYFRLTRQAKDVYEMLEPFLEDRRKLRRRGRAGVVLTFMDEFVDELLTKERVCGTSLWKMPKREVLEDLEILEPRVSPLGDLEDLLEEEDEAEEENGTREESGEISDRDDMEVDRDERRSQSRGRSRSRSRSRSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.39
3 0.39
4 0.35
5 0.36
6 0.37
7 0.36
8 0.32
9 0.31
10 0.33
11 0.24
12 0.23
13 0.2
14 0.13
15 0.13
16 0.13
17 0.12
18 0.11
19 0.12
20 0.13
21 0.13
22 0.13
23 0.14
24 0.16
25 0.19
26 0.23
27 0.22
28 0.2
29 0.22
30 0.26
31 0.26
32 0.25
33 0.25
34 0.29
35 0.31
36 0.32
37 0.31
38 0.26
39 0.25
40 0.26
41 0.26
42 0.2
43 0.18
44 0.18
45 0.17
46 0.16
47 0.16
48 0.12
49 0.1
50 0.08
51 0.06
52 0.06
53 0.08
54 0.07
55 0.07
56 0.07
57 0.08
58 0.07
59 0.08
60 0.07
61 0.05
62 0.05
63 0.06
64 0.09
65 0.09
66 0.11
67 0.12
68 0.12
69 0.16
70 0.16
71 0.18
72 0.16
73 0.17
74 0.18
75 0.2
76 0.21
77 0.17
78 0.17
79 0.16
80 0.15
81 0.15
82 0.13
83 0.14
84 0.12
85 0.11
86 0.11
87 0.09
88 0.09
89 0.07
90 0.07
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.04
95 0.04
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.06
100 0.07
101 0.09
102 0.1
103 0.1
104 0.11
105 0.11
106 0.12
107 0.11
108 0.13
109 0.11
110 0.12
111 0.14
112 0.13
113 0.21
114 0.21
115 0.22
116 0.22
117 0.25
118 0.25
119 0.25
120 0.25
121 0.19
122 0.18
123 0.17
124 0.15
125 0.11
126 0.11
127 0.09
128 0.13
129 0.12
130 0.11
131 0.15
132 0.26
133 0.31
134 0.4
135 0.48
136 0.53
137 0.6
138 0.67
139 0.69
140 0.67
141 0.63
142 0.57
143 0.5
144 0.4
145 0.33
146 0.25
147 0.19
148 0.1
149 0.08
150 0.06
151 0.04
152 0.05
153 0.04
154 0.05
155 0.07
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.1
160 0.1
161 0.11
162 0.12
163 0.15
164 0.22
165 0.27
166 0.36
167 0.4
168 0.41
169 0.43
170 0.48
171 0.48
172 0.43
173 0.42
174 0.38
175 0.36
176 0.34
177 0.33
178 0.28
179 0.24
180 0.21
181 0.18
182 0.12
183 0.1
184 0.11
185 0.09
186 0.07
187 0.08
188 0.1
189 0.1
190 0.11
191 0.11
192 0.1
193 0.1
194 0.11
195 0.1
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.08
210 0.08
211 0.11
212 0.14
213 0.14
214 0.16
215 0.18
216 0.17
217 0.17
218 0.18
219 0.16
220 0.15
221 0.2
222 0.19
223 0.21
224 0.24
225 0.26
226 0.29
227 0.34
228 0.37
229 0.38
230 0.47
231 0.54
232 0.61
233 0.68
234 0.74
235 0.79
236 0.85
237 0.9