FuNGI

N1RF51

Protein Details

Accession

N1RF51

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
98-121	AADERKARGRSRFRSKRSRGDAMG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
70-77	RFRPKNIR
94-119	ASERAADERKARGRSRFRSKRSRGDA

Subcellular Location(s)

mito 17, nucl 7, cyto_nucl 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MNRGRAAARGSRRGAAAASSRAAGESNAGSSTPAVADTPGSATPVPQSIATTSTRGGATTRATRAPAAGRFRPKNIRRDEAERDSLARQEEQKASERAADERKARGRSRFRSKRSRGDAMGRGGFGRVISGASGPFSSGAAGSGGRGSGGWFGGGGSGGGGFGGGGGKGFKSDSKPGFAQASRSREARINADKLHVHTPEEDLDSEDEAMIEALNSRAVSVLPMGIYRREHKDEGVIVATTAELEAAENAQAIPPTPSKEEESLWVDGDADEPLLTDENAEDGGIWKNNSKTPVIKKEPGLDDSMDLDIEAKTDAGDKDKQASETPAPQTKKPKQDPEEAMIQTDLEILANELGAVEISEGEDGKTEGPSNKDGRMYLFQFPPVLPPLKPITQPSSINKVKPEPGEGEDNVLESTPAAADTEPVDLTNDKNTTGFNVPGFEDPEQKAGFMSSLLSTGGMVGQLKVRKSGRVELDWGGSTMELNPATGMNFLTTAVIIEENDEKPRPGVIGGESIGMGKIMGRFVLAPKWDDEEDWEVSSEDLRIE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.41
2	0.37
3	0.34
4	0.29
5	0.27
6	0.25
7	0.24
8	0.23
9	0.22
10	0.17
11	0.15
12	0.12
13	0.12
14	0.12
15	0.12
16	0.12
17	0.11
18	0.12
19	0.1
20	0.09
21	0.08
22	0.08
23	0.09
24	0.09
25	0.12
26	0.11
27	0.13
28	0.12
29	0.12
30	0.14
31	0.16
32	0.16
33	0.14
34	0.15
35	0.14
36	0.18
37	0.19
38	0.19
39	0.17
40	0.19
41	0.19
42	0.18
43	0.17
44	0.18
45	0.21
46	0.26
47	0.29
48	0.29
49	0.3
50	0.31
51	0.33
52	0.36
53	0.37
54	0.39
55	0.42
56	0.5
57	0.52
58	0.59
59	0.67
60	0.68
61	0.7
62	0.71
63	0.71
64	0.67
65	0.71
66	0.73
67	0.7
68	0.68
69	0.6
70	0.55
71	0.48
72	0.45
73	0.4
74	0.34
75	0.29
76	0.3
77	0.32
78	0.33
79	0.37
80	0.36
81	0.35
82	0.35
83	0.34
84	0.33
85	0.35
86	0.38
87	0.35
88	0.42
89	0.47
90	0.51
91	0.54
92	0.59
93	0.63
94	0.66
95	0.74
96	0.77
97	0.79
98	0.83
99	0.86
100	0.87
101	0.85
102	0.83
103	0.77
104	0.75
105	0.73
106	0.68
107	0.62
108	0.51
109	0.43
110	0.36
111	0.3
112	0.21
113	0.15
114	0.09
115	0.07
116	0.06
117	0.07
118	0.07
119	0.07
120	0.07
121	0.07
122	0.07
123	0.07
124	0.06
125	0.06
126	0.06
127	0.06
128	0.06
129	0.06
130	0.06
131	0.06
132	0.05
133	0.05
134	0.05
135	0.06
136	0.06
137	0.06
138	0.05
139	0.05
140	0.06
141	0.06
142	0.05
143	0.03
144	0.03
145	0.03
146	0.03
147	0.03
148	0.02
149	0.02
150	0.03
151	0.03
152	0.03
153	0.03
154	0.04
155	0.04
156	0.05
157	0.07
158	0.11
159	0.19
160	0.21
161	0.25
162	0.26
163	0.28
164	0.33
165	0.31
166	0.35
167	0.34
168	0.38
169	0.36
170	0.36
171	0.36
172	0.35
173	0.36
174	0.36
175	0.36
176	0.35
177	0.33
178	0.36
179	0.36
180	0.35
181	0.37
182	0.3
183	0.25
184	0.22
185	0.22
186	0.2
187	0.2
188	0.17
189	0.14
190	0.14
191	0.13
192	0.12
193	0.1
194	0.08
195	0.06
196	0.06
197	0.04
198	0.04
199	0.03
200	0.03
201	0.04
202	0.04
203	0.04
204	0.04
205	0.05
206	0.05
207	0.05
208	0.05
209	0.05
210	0.06
211	0.07
212	0.09
213	0.11
214	0.14
215	0.19
216	0.22
217	0.23
218	0.23
219	0.25
220	0.24
221	0.23
222	0.21
223	0.16
224	0.12
225	0.11
226	0.1
227	0.07
228	0.06
229	0.04
230	0.02
231	0.02
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.03
236	0.03
237	0.04
238	0.04
239	0.04
240	0.06
241	0.07
242	0.09
243	0.1
244	0.12
245	0.14
246	0.16
247	0.16
248	0.17
249	0.2
250	0.19
251	0.17
252	0.16
253	0.14
254	0.12
255	0.12
256	0.08
257	0.05
258	0.04
259	0.04
260	0.04
261	0.04
262	0.04
263	0.03
264	0.03
265	0.04
266	0.04
267	0.03
268	0.03
269	0.04
270	0.06
271	0.07
272	0.07
273	0.09
274	0.1
275	0.12
276	0.14
277	0.15
278	0.2
279	0.26
280	0.36
281	0.4
282	0.43
283	0.43
284	0.47
285	0.48
286	0.44
287	0.38
288	0.29
289	0.23
290	0.21
291	0.19
292	0.12
293	0.1
294	0.08
295	0.06
296	0.06
297	0.05
298	0.04
299	0.04
300	0.06
301	0.07
302	0.09
303	0.12
304	0.12
305	0.16
306	0.18
307	0.19
308	0.18
309	0.21
310	0.2
311	0.24
312	0.28
313	0.31
314	0.32
315	0.35
316	0.44
317	0.48
318	0.56
319	0.58
320	0.63
321	0.61
322	0.68
323	0.69
324	0.62
325	0.63
326	0.52
327	0.45
328	0.35
329	0.3
330	0.21
331	0.16
332	0.13
333	0.05
334	0.04
335	0.04
336	0.04
337	0.04
338	0.03
339	0.03
340	0.03
341	0.03
342	0.03
343	0.02
344	0.03
345	0.03
346	0.03
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.05
351	0.05
352	0.06
353	0.07
354	0.1
355	0.12
356	0.17
357	0.19
358	0.22
359	0.23
360	0.23
361	0.25
362	0.29
363	0.29
364	0.29
365	0.28
366	0.27
367	0.26
368	0.26
369	0.25
370	0.23
371	0.22
372	0.17
373	0.19
374	0.23
375	0.25
376	0.27
377	0.28
378	0.3
379	0.33
380	0.37
381	0.38
382	0.43
383	0.44
384	0.44
385	0.44
386	0.43
387	0.43
388	0.4
389	0.39
390	0.33
391	0.32
392	0.35
393	0.32
394	0.31
395	0.26
396	0.25
397	0.21
398	0.17
399	0.14
400	0.09
401	0.09
402	0.05
403	0.05
404	0.05
405	0.05
406	0.06
407	0.07
408	0.08
409	0.08
410	0.08
411	0.1
412	0.1
413	0.11
414	0.16
415	0.16
416	0.15
417	0.15
418	0.15
419	0.18
420	0.2
421	0.21
422	0.16
423	0.17
424	0.18
425	0.2
426	0.23
427	0.2
428	0.22
429	0.21
430	0.25
431	0.23
432	0.22
433	0.2
434	0.17
435	0.16
436	0.11
437	0.12
438	0.07
439	0.08
440	0.08
441	0.08
442	0.07
443	0.07
444	0.07
445	0.07
446	0.07
447	0.07
448	0.12
449	0.15
450	0.16
451	0.23
452	0.24
453	0.28
454	0.32
455	0.39
456	0.41
457	0.42
458	0.45
459	0.41
460	0.43
461	0.39
462	0.35
463	0.27
464	0.2
465	0.17
466	0.13
467	0.15
468	0.11
469	0.1
470	0.1
471	0.1
472	0.11
473	0.11
474	0.11
475	0.08
476	0.08
477	0.08
478	0.08
479	0.08
480	0.07
481	0.08
482	0.08
483	0.07
484	0.09
485	0.13
486	0.14
487	0.18
488	0.19
489	0.19
490	0.19
491	0.21
492	0.19
493	0.16
494	0.17
495	0.15
496	0.19
497	0.18
498	0.19
499	0.18
500	0.17
501	0.16
502	0.13
503	0.11
504	0.08
505	0.09
506	0.08
507	0.08
508	0.09
509	0.1
510	0.13
511	0.19
512	0.2
513	0.2
514	0.22
515	0.27
516	0.27
517	0.26
518	0.29
519	0.28
520	0.28
521	0.27
522	0.26
523	0.21
524	0.21
525	0.21

N1RF51

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer