Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1RDF6

Protein Details
Accession N1RDF6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-33AAVAGGPKERHRRAQRSQYDHTAPHydrophilic
303-329ARTPATPKPKGKVKKAKPSSPISPRAIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
304-321RTPATPKPKGKVKKAKPS
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018744  DUF2293  
Pfam View protein in Pfam  
PF10056  DUF2293  
Amino Acid Sequences MGREKRNLPAAVAGGPKERHRRAQRSQYDHTAPVPPGFVAKPALPKTTKHHSYFEFVENKDKKKKLEFQITTKKTPPPGFEFVPAGNPELTQACKELSREKDAMIFIVSNAKEASGSNILAHQVHRIGHHVRETIVEEARAGLGHIMENMLPAARGAPEPIPESQEEYDAQVDAALRDLFPRIPNTDRQMIIEHAFRRDPTNKNNKEKVGLSDDITLARRVQLAVLAHIRHTHTSGRDQLDEILREVVVISDSEGEESGNESDSSIEEVVCQYTNPIPSRPVQNISGQAGPGHHQSPRPNQGARTPATPKPKGKVKKAKPSSPISPRAISSVYPWSPAAYGSGPFR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.32
3 0.38
4 0.43
5 0.46
6 0.52
7 0.6
8 0.68
9 0.72
10 0.81
11 0.83
12 0.82
13 0.84
14 0.83
15 0.78
16 0.71
17 0.63
18 0.58
19 0.49
20 0.42
21 0.35
22 0.26
23 0.24
24 0.22
25 0.21
26 0.18
27 0.19
28 0.26
29 0.28
30 0.35
31 0.33
32 0.37
33 0.42
34 0.49
35 0.55
36 0.51
37 0.54
38 0.5
39 0.54
40 0.55
41 0.56
42 0.52
43 0.44
44 0.51
45 0.5
46 0.54
47 0.58
48 0.57
49 0.55
50 0.57
51 0.66
52 0.65
53 0.71
54 0.7
55 0.71
56 0.78
57 0.79
58 0.75
59 0.7
60 0.65
61 0.61
62 0.59
63 0.54
64 0.5
65 0.5
66 0.46
67 0.45
68 0.42
69 0.35
70 0.36
71 0.31
72 0.25
73 0.2
74 0.17
75 0.16
76 0.15
77 0.15
78 0.12
79 0.12
80 0.11
81 0.13
82 0.15
83 0.21
84 0.23
85 0.28
86 0.28
87 0.28
88 0.31
89 0.29
90 0.28
91 0.22
92 0.18
93 0.12
94 0.17
95 0.17
96 0.14
97 0.13
98 0.13
99 0.12
100 0.12
101 0.15
102 0.11
103 0.11
104 0.11
105 0.12
106 0.13
107 0.13
108 0.13
109 0.11
110 0.11
111 0.12
112 0.12
113 0.15
114 0.17
115 0.19
116 0.22
117 0.21
118 0.19
119 0.2
120 0.21
121 0.2
122 0.18
123 0.15
124 0.12
125 0.12
126 0.11
127 0.09
128 0.07
129 0.05
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.03
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.05
144 0.06
145 0.08
146 0.1
147 0.1
148 0.12
149 0.11
150 0.14
151 0.13
152 0.14
153 0.13
154 0.12
155 0.12
156 0.1
157 0.1
158 0.07
159 0.07
160 0.06
161 0.06
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.06
166 0.06
167 0.08
168 0.1
169 0.11
170 0.14
171 0.17
172 0.21
173 0.25
174 0.24
175 0.24
176 0.24
177 0.23
178 0.23
179 0.24
180 0.21
181 0.18
182 0.19
183 0.18
184 0.21
185 0.25
186 0.29
187 0.34
188 0.44
189 0.51
190 0.59
191 0.64
192 0.61
193 0.59
194 0.56
195 0.5
196 0.45
197 0.38
198 0.31
199 0.27
200 0.25
201 0.23
202 0.22
203 0.19
204 0.13
205 0.12
206 0.11
207 0.09
208 0.09
209 0.1
210 0.1
211 0.12
212 0.16
213 0.15
214 0.15
215 0.17
216 0.19
217 0.16
218 0.18
219 0.19
220 0.18
221 0.22
222 0.29
223 0.29
224 0.29
225 0.29
226 0.3
227 0.31
228 0.29
229 0.25
230 0.19
231 0.16
232 0.15
233 0.14
234 0.11
235 0.07
236 0.06
237 0.05
238 0.06
239 0.06
240 0.07
241 0.07
242 0.06
243 0.06
244 0.08
245 0.08
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.08
250 0.08
251 0.1
252 0.09
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.1
257 0.09
258 0.09
259 0.08
260 0.11
261 0.17
262 0.19
263 0.2
264 0.21
265 0.25
266 0.32
267 0.34
268 0.36
269 0.32
270 0.35
271 0.38
272 0.39
273 0.36
274 0.3
275 0.27
276 0.24
277 0.24
278 0.23
279 0.2
280 0.19
281 0.22
282 0.29
283 0.38
284 0.46
285 0.49
286 0.49
287 0.5
288 0.55
289 0.57
290 0.53
291 0.5
292 0.47
293 0.48
294 0.55
295 0.6
296 0.58
297 0.59
298 0.67
299 0.69
300 0.74
301 0.79
302 0.8
303 0.83
304 0.87
305 0.88
306 0.86
307 0.85
308 0.84
309 0.83
310 0.81
311 0.76
312 0.69
313 0.61
314 0.57
315 0.51
316 0.41
317 0.35
318 0.36
319 0.31
320 0.3
321 0.3
322 0.27
323 0.25
324 0.25
325 0.24
326 0.17