FuNGI

N1S5T7

Protein Details

Accession

N1S5T7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
606-627	ELEHVRKRMQRHYDPKRLKGPT	Basic
749-776	LTNAQQLLKKFHQNRKNQERHQDPTNPT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 12, mito 10.5, cyto_mito 7, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016197 Chromo-like_dom_sf IPR000953 Chromo/chromo_shadow_dom IPR023780 Chromo_domain IPR023779 Chromodomain_CS IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom IPR041577 RT_RNaseH_2
Gene Ontology	GO:0005739 C:mitochondrion GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0006338 P:chromatin remodeling GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF00385 Chromo PF17921 Integrase_H2C2 PF17919 RT_RNaseH_2 PF00665 rve PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS00598 CHROMO_1 PS50013 CHROMO_2 PS50994 INTEGRASE PS50878 RT_POL
CDD	cd00024 CD_CSD cd09274 RNase_HI_RT_Ty3 cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

RLTNAPATFQRMINNVLRQYLDVFVVCYLDDILIFSDSEEEHKEHVHKVLKALQDANLLVEPEKSHFHVKEVDFLGHTITPGEIRMERKKISAVADWPLPTTVKEVQSFLGFANYYRRFIRDFSKIANPLTELTKKDRKFVWKQDAQEAFEQLRQAILSEPVLVMFDPNKEIELETDSSDFALGGQIGQRDDQGKLHPIAFYSHKLHGPELNYPIYDKEFLAIVNCFKEFRHYLMGSMHQIKVYTDHQNISHFATTQELNRRQLRYAEYLCEFDFVIIHRKGSDNGRADAISRRPDYDTGTPKTKEQLLEKNQKGEYQFTQPTQTLGWIQTKETREIPGEPQKFIQGFHADPLHGHQGVTKTWKRLLRQGYQTTKEVVEKVIKQCDICARTKAQRHKPYGTLQPIEVAERPWSSITMDFITKLPLSEEPSTGIFYDSIMVIVDRLTKYSIYLPYREATDAEEMAYIFYDRVVRERGLPKEILSDRGPTFASKFWQSLMAHMGVNHRLTTAFRPQADGQTERMNQVLEQYLRCYINYEQDNWVEKLPSAQLAYNTAYNESTKLTPFDANIGFTPDAYHDAREPKNVNPAAIIASDKLREIHEELKTELEHVRKRMQRHYDPKRLKGPTFAEGDMVYLSTKNIKTDRPSHKLDYKYLGPVKIKRRTGEDRYELDLPPNIRCHPIYHISMLESAADTIHVRTGNEPRQITGPEVYEAEAIRKMDKINGQKMYLIKWKNYPESENTWEPTKHLTNAQQLLKKFHQNRKNQERHQDPTNPTQTVQQRRTSPGRTHRP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.44
2	0.38
3	0.38
4	0.37
5	0.34
6	0.33
7	0.3
8	0.25
9	0.18
10	0.17
11	0.14
12	0.14
13	0.12
14	0.11
15	0.1
16	0.08
17	0.07
18	0.07
19	0.08
20	0.08
21	0.09
22	0.08
23	0.09
24	0.1
25	0.12
26	0.15
27	0.15
28	0.16
29	0.2
30	0.23
31	0.24
32	0.31
33	0.36
34	0.35
35	0.38
36	0.44
37	0.45
38	0.46
39	0.46
40	0.41
41	0.38
42	0.36
43	0.33
44	0.28
45	0.24
46	0.2
47	0.2
48	0.17
49	0.16
50	0.19
51	0.19
52	0.25
53	0.25
54	0.28
55	0.34
56	0.34
57	0.4
58	0.39
59	0.38
60	0.32
61	0.32
62	0.31
63	0.23
64	0.22
65	0.15
66	0.12
67	0.11
68	0.11
69	0.14
70	0.15
71	0.21
72	0.29
73	0.35
74	0.36
75	0.37
76	0.4
77	0.41
78	0.41
79	0.41
80	0.36
81	0.35
82	0.38
83	0.36
84	0.34
85	0.31
86	0.27
87	0.22
88	0.23
89	0.24
90	0.24
91	0.25
92	0.26
93	0.26
94	0.26
95	0.26
96	0.22
97	0.2
98	0.15
99	0.15
100	0.23
101	0.24
102	0.26
103	0.26
104	0.28
105	0.26
106	0.29
107	0.35
108	0.33
109	0.34
110	0.36
111	0.44
112	0.46
113	0.45
114	0.44
115	0.38
116	0.32
117	0.34
118	0.34
119	0.28
120	0.33
121	0.41
122	0.4
123	0.44
124	0.48
125	0.52
126	0.57
127	0.65
128	0.68
129	0.65
130	0.68
131	0.72
132	0.71
133	0.65
134	0.58
135	0.51
136	0.41
137	0.37
138	0.33
139	0.23
140	0.19
141	0.15
142	0.13
143	0.11
144	0.11
145	0.1
146	0.1
147	0.1
148	0.09
149	0.1
150	0.09
151	0.09
152	0.08
153	0.09
154	0.1
155	0.1
156	0.11
157	0.11
158	0.11
159	0.11
160	0.14
161	0.14
162	0.14
163	0.14
164	0.14
165	0.13
166	0.13
167	0.11
168	0.07
169	0.07
170	0.06
171	0.05
172	0.07
173	0.09
174	0.09
175	0.1
176	0.11
177	0.12
178	0.13
179	0.15
180	0.16
181	0.2
182	0.21
183	0.22
184	0.2
185	0.2
186	0.22
187	0.23
188	0.25
189	0.25
190	0.27
191	0.29
192	0.3
193	0.3
194	0.31
195	0.3
196	0.3
197	0.3
198	0.28
199	0.25
200	0.24
201	0.24
202	0.23
203	0.21
204	0.16
205	0.12
206	0.11
207	0.11
208	0.12
209	0.12
210	0.11
211	0.12
212	0.12
213	0.12
214	0.12
215	0.17
216	0.17
217	0.19
218	0.25
219	0.23
220	0.25
221	0.27
222	0.31
223	0.3
224	0.32
225	0.29
226	0.22
227	0.22
228	0.21
229	0.22
230	0.22
231	0.24
232	0.22
233	0.24
234	0.24
235	0.26
236	0.28
237	0.27
238	0.24
239	0.18
240	0.16
241	0.16
242	0.16
243	0.19
244	0.27
245	0.28
246	0.33
247	0.38
248	0.4
249	0.39
250	0.42
251	0.41
252	0.39
253	0.36
254	0.34
255	0.31
256	0.31
257	0.29
258	0.26
259	0.22
260	0.15
261	0.13
262	0.1
263	0.16
264	0.14
265	0.15
266	0.15
267	0.16
268	0.18
269	0.22
270	0.28
271	0.24
272	0.25
273	0.26
274	0.26
275	0.26
276	0.29
277	0.28
278	0.27
279	0.24
280	0.25
281	0.25
282	0.26
283	0.29
284	0.32
285	0.35
286	0.33
287	0.39
288	0.38
289	0.37
290	0.39
291	0.38
292	0.34
293	0.32
294	0.37
295	0.4
296	0.49
297	0.5
298	0.53
299	0.5
300	0.49
301	0.45
302	0.39
303	0.33
304	0.3
305	0.31
306	0.26
307	0.29
308	0.26
309	0.26
310	0.22
311	0.21
312	0.15
313	0.15
314	0.18
315	0.15
316	0.16
317	0.21
318	0.23
319	0.24
320	0.24
321	0.23
322	0.21
323	0.22
324	0.27
325	0.31
326	0.31
327	0.29
328	0.29
329	0.3
330	0.29
331	0.27
332	0.24
333	0.17
334	0.16
335	0.17
336	0.17
337	0.14
338	0.14
339	0.16
340	0.16
341	0.13
342	0.13
343	0.12
344	0.13
345	0.15
346	0.22
347	0.22
348	0.21
349	0.26
350	0.3
351	0.3
352	0.36
353	0.41
354	0.41
355	0.47
356	0.54
357	0.56
358	0.55
359	0.54
360	0.48
361	0.43
362	0.36
363	0.28
364	0.22
365	0.19
366	0.2
367	0.22
368	0.24
369	0.24
370	0.22
371	0.23
372	0.27
373	0.27
374	0.25
375	0.24
376	0.24
377	0.29
378	0.37
379	0.45
380	0.49
381	0.54
382	0.58
383	0.59
384	0.6
385	0.59
386	0.6
387	0.56
388	0.47
389	0.38
390	0.34
391	0.31
392	0.28
393	0.23
394	0.16
395	0.12
396	0.11
397	0.12
398	0.09
399	0.1
400	0.09
401	0.09
402	0.1
403	0.1
404	0.1
405	0.1
406	0.1
407	0.11
408	0.1
409	0.1
410	0.09
411	0.09
412	0.13
413	0.14
414	0.14
415	0.14
416	0.14
417	0.15
418	0.14
419	0.13
420	0.09
421	0.07
422	0.08
423	0.06
424	0.05
425	0.05
426	0.04
427	0.04
428	0.04
429	0.07
430	0.06
431	0.07
432	0.08
433	0.08
434	0.09
435	0.12
436	0.18
437	0.18
438	0.19
439	0.2
440	0.21
441	0.22
442	0.22
443	0.18
444	0.14
445	0.14
446	0.12
447	0.11
448	0.1
449	0.09
450	0.08
451	0.08
452	0.06
453	0.04
454	0.05
455	0.07
456	0.06
457	0.09
458	0.11
459	0.12
460	0.17
461	0.23
462	0.26
463	0.27
464	0.27
465	0.25
466	0.31
467	0.31
468	0.3
469	0.25
470	0.26
471	0.23
472	0.25
473	0.25
474	0.18
475	0.19
476	0.16
477	0.18
478	0.16
479	0.16
480	0.15
481	0.2
482	0.2
483	0.2
484	0.21
485	0.19
486	0.17
487	0.18
488	0.2
489	0.16
490	0.17
491	0.15
492	0.13
493	0.12
494	0.13
495	0.16
496	0.21
497	0.23
498	0.22
499	0.27
500	0.28
501	0.33
502	0.35
503	0.33
504	0.27
505	0.3
506	0.31
507	0.27
508	0.27
509	0.21
510	0.18
511	0.18
512	0.21
513	0.15
514	0.15
515	0.16
516	0.19
517	0.19
518	0.19
519	0.2
520	0.16
521	0.23
522	0.24
523	0.25
524	0.25
525	0.28
526	0.32
527	0.3
528	0.3
529	0.22
530	0.2
531	0.2
532	0.17
533	0.15
534	0.13
535	0.13
536	0.13
537	0.15
538	0.17
539	0.17
540	0.17
541	0.16
542	0.15
543	0.14
544	0.15
545	0.14
546	0.14
547	0.13
548	0.14
549	0.15
550	0.15
551	0.15
552	0.19
553	0.17
554	0.17
555	0.17
556	0.2
557	0.17
558	0.16
559	0.17
560	0.13
561	0.16
562	0.15
563	0.16
564	0.14
565	0.22
566	0.23
567	0.29
568	0.3
569	0.28
570	0.37
571	0.37
572	0.34
573	0.28
574	0.27
575	0.23
576	0.21
577	0.2
578	0.11
579	0.12
580	0.12
581	0.12
582	0.12
583	0.12
584	0.13
585	0.16
586	0.21
587	0.23
588	0.25
589	0.25
590	0.27
591	0.26
592	0.26
593	0.26
594	0.26
595	0.27
596	0.29
597	0.37
598	0.39
599	0.44
600	0.51
601	0.58
602	0.61
603	0.68
604	0.74
605	0.77
606	0.81
607	0.83
608	0.84
609	0.8
610	0.71
611	0.68
612	0.62
613	0.56
614	0.53
615	0.45
616	0.37
617	0.31
618	0.3
619	0.21
620	0.17
621	0.12
622	0.08
623	0.08
624	0.13
625	0.13
626	0.17
627	0.2
628	0.24
629	0.3
630	0.4
631	0.5
632	0.5
633	0.56
634	0.59
635	0.64
636	0.64
637	0.62
638	0.59
639	0.53
640	0.55
641	0.53
642	0.52
643	0.5
644	0.53
645	0.59
646	0.61
647	0.63
648	0.57
649	0.61
650	0.64
651	0.66
652	0.69
653	0.66
654	0.61
655	0.6
656	0.61
657	0.52
658	0.46
659	0.42
660	0.34
661	0.3
662	0.3
663	0.27
664	0.27
665	0.28
666	0.28
667	0.3
668	0.35
669	0.34
670	0.33
671	0.33
672	0.31
673	0.31
674	0.28
675	0.23
676	0.16
677	0.13
678	0.1
679	0.1
680	0.09
681	0.08
682	0.11
683	0.12
684	0.12
685	0.16
686	0.25
687	0.32
688	0.38
689	0.39
690	0.37
691	0.4
692	0.41
693	0.4
694	0.34
695	0.29
696	0.23
697	0.23
698	0.23
699	0.21
700	0.19
701	0.19
702	0.18
703	0.17
704	0.17
705	0.18
706	0.18
707	0.22
708	0.29
709	0.36
710	0.41
711	0.45
712	0.46
713	0.48
714	0.49
715	0.49
716	0.5
717	0.46
718	0.42
719	0.45
720	0.51
721	0.55
722	0.58
723	0.56
724	0.53
725	0.56
726	0.59
727	0.57
728	0.52
729	0.5
730	0.46
731	0.43
732	0.44
733	0.41
734	0.37
735	0.38
736	0.42
737	0.45
738	0.53
739	0.59
740	0.57
741	0.55
742	0.6
743	0.6
744	0.63
745	0.63
746	0.65
747	0.67
748	0.72
749	0.8
750	0.84
751	0.88
752	0.87
753	0.88
754	0.87
755	0.84
756	0.82
757	0.81
758	0.75
759	0.75
760	0.74
761	0.65
762	0.56
763	0.59
764	0.59
765	0.61
766	0.61
767	0.59
768	0.57
769	0.63
770	0.71
771	0.7
772	0.7

N1S5T7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer