Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PSF2

Protein Details
Accession A0A1D8PSF2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MSTNSKQLNKKKTRLYNSRTIKSQHydrophilic
72-107LPRALRRRAASHNVKRIPKRLRKRAKHEMSSNLPVKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
75-121ALRRRAASHNVKRIPKRLRKRAKHEMSSNLPVKKMPRGRRLYKLLVR
Subcellular Location(s) nucl 18, mito_nucl 12.333, cyto_nucl 11.333, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039182  Pop1  
IPR009723  Pop1_N  
IPR012590  POPLD_dom  
Gene Ontology GO:0005655  C:nucleolar ribonuclease P complex  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0090502  P:RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG cal:CAALFM_CR03200CA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06978  POP1  
PF08170  POPLD  
Amino Acid Sequences MSTNSKQLNKKKTRLYNSRTIKSQINDQAYDKKQRVLDVNSFIHSRNFEIRSFEQSQLNSKNASSTRVFQDLPRALRRRAASHNVKRIPKRLRKRAKHEMSSNLPVKKMPRGRRLYKLLVRNRLLKVASKMKQNKYDPLENLVNKKNLRKQFKAIRDEIKKIDQEKPKSSTVEGFTKLNNSVGSRDNTGVNELAPRPKGSIKYYKRQREFVWIPTHIWLVKRFHMSKKYGYQIPYTPTQKCFKLMNRWNRQKAVCFDTSYFPTFILYVSDGTMFGDIAKQLCGKKVSKKILNGEKSYNGWIHIDGETKVCPGFAYMNQSLNTIMVRVVPSMYEQLFQSYKAKIESIPNSTINDCRYALGSIELSGPLSIKCLSKIFHFQNISPDLKNIWASLSKIKDSDLVPVGTTFTFNLQDPRIWQRPTKLRHNHNGDQDIYDIIIALNSSPHIDQDIVKSLTTSEGRYASYKDQLSIKELGKFHANLNKKPSDISHSQIPVLLSKTDSQKWLLILPWHWILPFWIQITKVTDIKPGGSKQMHQFQFENHKPYYPQDFPWSYDGWQYNKLVGEANQIKASKLPKSQVSVQQSEKNYSVIFNANKCDWTNLRNMVLLMKYSKMDRKTIKKDSGQPDFAQYDGPERIINSVHDLLQTTKSVENDITDVNETTVELYTNNQSQVDFYNNTYKIANLAEIVHTKLPVVQVSLIVVNDGTIEDNARLYSDSSGTDIHCVGFVTTGAMNLNLGKYSGIGTIIAQKWLIEENGHKLYVRNPGKSKVYSVSFRVI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.87
3 0.86
4 0.86
5 0.85
6 0.8
7 0.74
8 0.7
9 0.62
10 0.64
11 0.62
12 0.59
13 0.54
14 0.53
15 0.58
16 0.57
17 0.64
18 0.56
19 0.53
20 0.49
21 0.51
22 0.54
23 0.52
24 0.53
25 0.52
26 0.52
27 0.49
28 0.49
29 0.44
30 0.41
31 0.35
32 0.32
33 0.31
34 0.31
35 0.3
36 0.36
37 0.37
38 0.41
39 0.44
40 0.44
41 0.41
42 0.4
43 0.46
44 0.44
45 0.44
46 0.38
47 0.33
48 0.37
49 0.34
50 0.37
51 0.32
52 0.32
53 0.35
54 0.38
55 0.39
56 0.33
57 0.42
58 0.43
59 0.47
60 0.51
61 0.51
62 0.48
63 0.54
64 0.56
65 0.52
66 0.54
67 0.58
68 0.6
69 0.65
70 0.74
71 0.75
72 0.8
73 0.81
74 0.81
75 0.82
76 0.81
77 0.82
78 0.83
79 0.86
80 0.88
81 0.91
82 0.93
83 0.92
84 0.91
85 0.88
86 0.86
87 0.82
88 0.81
89 0.78
90 0.69
91 0.6
92 0.53
93 0.49
94 0.49
95 0.51
96 0.51
97 0.55
98 0.62
99 0.68
100 0.75
101 0.8
102 0.8
103 0.78
104 0.79
105 0.78
106 0.78
107 0.75
108 0.73
109 0.67
110 0.63
111 0.57
112 0.52
113 0.5
114 0.51
115 0.51
116 0.53
117 0.61
118 0.63
119 0.71
120 0.7
121 0.71
122 0.68
123 0.71
124 0.63
125 0.61
126 0.61
127 0.55
128 0.58
129 0.55
130 0.54
131 0.5
132 0.55
133 0.57
134 0.58
135 0.63
136 0.62
137 0.65
138 0.69
139 0.75
140 0.76
141 0.74
142 0.75
143 0.73
144 0.73
145 0.68
146 0.64
147 0.6
148 0.55
149 0.57
150 0.56
151 0.56
152 0.58
153 0.58
154 0.56
155 0.53
156 0.5
157 0.48
158 0.44
159 0.43
160 0.38
161 0.34
162 0.31
163 0.32
164 0.31
165 0.27
166 0.24
167 0.18
168 0.19
169 0.22
170 0.24
171 0.23
172 0.24
173 0.24
174 0.23
175 0.23
176 0.21
177 0.16
178 0.18
179 0.17
180 0.21
181 0.2
182 0.2
183 0.21
184 0.25
185 0.29
186 0.31
187 0.4
188 0.42
189 0.51
190 0.61
191 0.69
192 0.7
193 0.71
194 0.67
195 0.67
196 0.64
197 0.61
198 0.59
199 0.5
200 0.47
201 0.43
202 0.43
203 0.34
204 0.32
205 0.29
206 0.25
207 0.28
208 0.34
209 0.36
210 0.41
211 0.48
212 0.5
213 0.51
214 0.55
215 0.56
216 0.53
217 0.52
218 0.48
219 0.44
220 0.44
221 0.45
222 0.42
223 0.39
224 0.39
225 0.41
226 0.39
227 0.38
228 0.41
229 0.4
230 0.46
231 0.52
232 0.58
233 0.65
234 0.74
235 0.76
236 0.77
237 0.72
238 0.68
239 0.64
240 0.59
241 0.51
242 0.44
243 0.39
244 0.37
245 0.37
246 0.33
247 0.28
248 0.21
249 0.19
250 0.16
251 0.14
252 0.12
253 0.1
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.06
261 0.05
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.07
266 0.09
267 0.1
268 0.13
269 0.17
270 0.2
271 0.28
272 0.36
273 0.44
274 0.48
275 0.53
276 0.58
277 0.64
278 0.67
279 0.62
280 0.56
281 0.5
282 0.46
283 0.43
284 0.34
285 0.26
286 0.2
287 0.17
288 0.15
289 0.14
290 0.14
291 0.12
292 0.13
293 0.12
294 0.12
295 0.11
296 0.09
297 0.08
298 0.07
299 0.09
300 0.09
301 0.16
302 0.17
303 0.2
304 0.21
305 0.21
306 0.21
307 0.19
308 0.17
309 0.1
310 0.09
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.06
315 0.06
316 0.07
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.08
321 0.11
322 0.11
323 0.12
324 0.14
325 0.13
326 0.14
327 0.14
328 0.14
329 0.13
330 0.19
331 0.22
332 0.24
333 0.26
334 0.26
335 0.27
336 0.27
337 0.28
338 0.22
339 0.21
340 0.17
341 0.14
342 0.13
343 0.12
344 0.12
345 0.11
346 0.1
347 0.08
348 0.08
349 0.07
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.05
354 0.06
355 0.07
356 0.07
357 0.08
358 0.09
359 0.1
360 0.12
361 0.2
362 0.21
363 0.26
364 0.27
365 0.27
366 0.31
367 0.35
368 0.34
369 0.27
370 0.25
371 0.19
372 0.19
373 0.19
374 0.13
375 0.1
376 0.09
377 0.1
378 0.14
379 0.16
380 0.15
381 0.15
382 0.15
383 0.17
384 0.16
385 0.19
386 0.16
387 0.15
388 0.14
389 0.14
390 0.14
391 0.11
392 0.11
393 0.08
394 0.07
395 0.07
396 0.08
397 0.1
398 0.1
399 0.11
400 0.13
401 0.2
402 0.24
403 0.24
404 0.26
405 0.31
406 0.38
407 0.44
408 0.52
409 0.54
410 0.56
411 0.64
412 0.71
413 0.69
414 0.67
415 0.65
416 0.55
417 0.47
418 0.41
419 0.31
420 0.22
421 0.16
422 0.1
423 0.06
424 0.05
425 0.04
426 0.03
427 0.03
428 0.03
429 0.04
430 0.04
431 0.04
432 0.05
433 0.06
434 0.07
435 0.09
436 0.16
437 0.16
438 0.15
439 0.15
440 0.15
441 0.17
442 0.18
443 0.16
444 0.12
445 0.12
446 0.13
447 0.15
448 0.17
449 0.16
450 0.21
451 0.2
452 0.2
453 0.22
454 0.22
455 0.24
456 0.27
457 0.26
458 0.26
459 0.26
460 0.25
461 0.25
462 0.26
463 0.25
464 0.27
465 0.3
466 0.28
467 0.35
468 0.36
469 0.33
470 0.33
471 0.31
472 0.31
473 0.29
474 0.29
475 0.29
476 0.27
477 0.27
478 0.28
479 0.27
480 0.22
481 0.21
482 0.18
483 0.13
484 0.15
485 0.19
486 0.19
487 0.2
488 0.2
489 0.2
490 0.2
491 0.21
492 0.2
493 0.18
494 0.17
495 0.19
496 0.18
497 0.17
498 0.16
499 0.14
500 0.14
501 0.13
502 0.15
503 0.13
504 0.13
505 0.13
506 0.16
507 0.19
508 0.21
509 0.22
510 0.2
511 0.22
512 0.21
513 0.23
514 0.25
515 0.23
516 0.27
517 0.26
518 0.28
519 0.31
520 0.4
521 0.4
522 0.39
523 0.38
524 0.37
525 0.46
526 0.47
527 0.46
528 0.37
529 0.37
530 0.35
531 0.38
532 0.41
533 0.33
534 0.31
535 0.33
536 0.35
537 0.35
538 0.37
539 0.35
540 0.27
541 0.31
542 0.32
543 0.27
544 0.29
545 0.27
546 0.27
547 0.26
548 0.26
549 0.21
550 0.18
551 0.25
552 0.24
553 0.25
554 0.27
555 0.27
556 0.26
557 0.28
558 0.31
559 0.27
560 0.28
561 0.3
562 0.3
563 0.35
564 0.42
565 0.47
566 0.5
567 0.51
568 0.51
569 0.54
570 0.51
571 0.5
572 0.44
573 0.37
574 0.3
575 0.25
576 0.23
577 0.22
578 0.23
579 0.22
580 0.25
581 0.24
582 0.26
583 0.26
584 0.29
585 0.25
586 0.25
587 0.29
588 0.3
589 0.3
590 0.29
591 0.29
592 0.27
593 0.26
594 0.24
595 0.19
596 0.17
597 0.16
598 0.19
599 0.25
600 0.25
601 0.32
602 0.38
603 0.47
604 0.56
605 0.64
606 0.69
607 0.7
608 0.77
609 0.78
610 0.78
611 0.72
612 0.63
613 0.6
614 0.52
615 0.45
616 0.37
617 0.28
618 0.25
619 0.21
620 0.21
621 0.16
622 0.15
623 0.17
624 0.16
625 0.17
626 0.17
627 0.18
628 0.18
629 0.18
630 0.19
631 0.19
632 0.21
633 0.21
634 0.18
635 0.19
636 0.18
637 0.19
638 0.19
639 0.18
640 0.17
641 0.16
642 0.16
643 0.15
644 0.15
645 0.14
646 0.13
647 0.12
648 0.11
649 0.11
650 0.09
651 0.08
652 0.1
653 0.13
654 0.16
655 0.18
656 0.17
657 0.16
658 0.17
659 0.2
660 0.23
661 0.21
662 0.21
663 0.29
664 0.29
665 0.31
666 0.3
667 0.27
668 0.24
669 0.23
670 0.21
671 0.13
672 0.14
673 0.16
674 0.17
675 0.2
676 0.19
677 0.17
678 0.17
679 0.18
680 0.18
681 0.16
682 0.16
683 0.14
684 0.14
685 0.15
686 0.17
687 0.14
688 0.12
689 0.11
690 0.09
691 0.08
692 0.08
693 0.07
694 0.06
695 0.08
696 0.08
697 0.09
698 0.09
699 0.1
700 0.1
701 0.1
702 0.12
703 0.12
704 0.12
705 0.13
706 0.15
707 0.15
708 0.17
709 0.16
710 0.14
711 0.13
712 0.13
713 0.12
714 0.11
715 0.1
716 0.1
717 0.1
718 0.1
719 0.1
720 0.1
721 0.1
722 0.11
723 0.12
724 0.09
725 0.1
726 0.09
727 0.09
728 0.1
729 0.1
730 0.1
731 0.09
732 0.1
733 0.19
734 0.2
735 0.21
736 0.19
737 0.18
738 0.19
739 0.21
740 0.21
741 0.15
742 0.18
743 0.24
744 0.28
745 0.29
746 0.28
747 0.27
748 0.31
749 0.38
750 0.42
751 0.44
752 0.45
753 0.52
754 0.59
755 0.6
756 0.6
757 0.57
758 0.57
759 0.54