Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1RNP1

Protein Details
Accession N1RNP1    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
236-262EDEPKQPRQKPLKPSAKPKPRSCDQLEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
243-254RQKPLKPSAKPK
Subcellular Location(s) mito 12, cyto_nucl 9.5, cyto 8.5, nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR008676  MRG  
IPR025995  Tudor-knot  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006325  P:chromatin organization  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF11717  Tudor-knot  
CDD cd18983  CBD_MSL3_like  
Amino Acid Sequences MAPARQQPAPPPFSKDEKVLCFHMDMLYEAKIMDVQPGEKPSDGYKYKVHYKGWKNTWDDWVLVDRIRPFDDEHKELAAQLHAQLKHNIQRSTKQPKKGLRSGAESARVSEERSGSATVQGGRGGRRGKDWELEQHLPPVTPSPSSTAKHCGVMEPTGGLSAPQGFFPVSNVRGSPDLAQPGKSMDSFKSSKKVKLTDLKEPKDHLTLLPSSGHRYVTESGKLIHDDRYVMPLTVEDEPKQPRQKPLKPSAKPKPRSCDQLETXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXLLSASSNTVPQLNLPLHVPNLERYISEVLEARYHDEEPSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.53
3 0.52
4 0.5
5 0.52
6 0.48
7 0.44
8 0.38
9 0.36
10 0.31
11 0.24
12 0.2
13 0.19
14 0.16
15 0.15
16 0.13
17 0.12
18 0.12
19 0.11
20 0.13
21 0.12
22 0.12
23 0.16
24 0.19
25 0.21
26 0.2
27 0.22
28 0.21
29 0.29
30 0.29
31 0.29
32 0.32
33 0.36
34 0.45
35 0.5
36 0.54
37 0.54
38 0.62
39 0.68
40 0.71
41 0.73
42 0.69
43 0.67
44 0.67
45 0.59
46 0.5
47 0.41
48 0.37
49 0.3
50 0.26
51 0.24
52 0.2
53 0.2
54 0.21
55 0.2
56 0.2
57 0.26
58 0.32
59 0.33
60 0.32
61 0.31
62 0.3
63 0.3
64 0.28
65 0.21
66 0.15
67 0.15
68 0.19
69 0.19
70 0.21
71 0.23
72 0.26
73 0.31
74 0.37
75 0.38
76 0.35
77 0.4
78 0.47
79 0.55
80 0.58
81 0.6
82 0.61
83 0.65
84 0.71
85 0.72
86 0.71
87 0.64
88 0.64
89 0.6
90 0.57
91 0.54
92 0.46
93 0.4
94 0.35
95 0.31
96 0.26
97 0.23
98 0.2
99 0.14
100 0.15
101 0.15
102 0.12
103 0.13
104 0.13
105 0.12
106 0.12
107 0.13
108 0.13
109 0.12
110 0.16
111 0.18
112 0.17
113 0.19
114 0.23
115 0.23
116 0.25
117 0.26
118 0.28
119 0.33
120 0.35
121 0.32
122 0.31
123 0.29
124 0.25
125 0.24
126 0.2
127 0.14
128 0.11
129 0.12
130 0.13
131 0.17
132 0.18
133 0.2
134 0.23
135 0.23
136 0.25
137 0.24
138 0.21
139 0.18
140 0.18
141 0.16
142 0.11
143 0.1
144 0.07
145 0.07
146 0.06
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.08
155 0.11
156 0.1
157 0.11
158 0.11
159 0.12
160 0.13
161 0.14
162 0.14
163 0.13
164 0.17
165 0.17
166 0.18
167 0.17
168 0.17
169 0.18
170 0.16
171 0.16
172 0.11
173 0.17
174 0.18
175 0.2
176 0.27
177 0.29
178 0.33
179 0.37
180 0.4
181 0.41
182 0.48
183 0.51
184 0.53
185 0.61
186 0.6
187 0.58
188 0.57
189 0.52
190 0.45
191 0.42
192 0.31
193 0.25
194 0.22
195 0.2
196 0.21
197 0.19
198 0.2
199 0.21
200 0.21
201 0.17
202 0.2
203 0.22
204 0.22
205 0.24
206 0.21
207 0.21
208 0.22
209 0.24
210 0.22
211 0.22
212 0.19
213 0.19
214 0.18
215 0.21
216 0.2
217 0.17
218 0.16
219 0.13
220 0.15
221 0.17
222 0.18
223 0.16
224 0.21
225 0.25
226 0.33
227 0.41
228 0.42
229 0.48
230 0.57
231 0.63
232 0.68
233 0.75
234 0.78
235 0.78
236 0.84
237 0.85
238 0.86
239 0.87
240 0.86
241 0.84
242 0.8
243 0.81
244 0.77
245 0.75
246 0.68
247 0.67
248 0.59
249 0.52
250 0.46
251 0.38
252 0.31
253 0.22
254 0.2
255 0.12
256 0.12
257 0.11
258 0.11
259 0.11
260 0.12
261 0.18
262 0.17
263 0.17
264 0.18
265 0.19
266 0.19
267 0.22
268 0.23
269 0.2
270 0.23
271 0.22
272 0.2
273 0.22
274 0.24
275 0.21
276 0.21
277 0.22
278 0.2
279 0.22
280 0.23
281 0.24
282 0.23
283 0.23