Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1RD30

Protein Details
Accession N1RD30    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-50LDPTTKGPERRARDRRWVNSSPYHydrophilic
98-119DEIPRQNHKRDINQRRRVLRDIHydrophilic
471-491RFKTLNRTKMCQKQNCKILYNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) extr 10, golg 7, E.R. 4, vacu 3, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009291  Vps62  
Pfam View protein in Pfam  
PF06101  Vps62  
Amino Acid Sequences MIWLRRFTILLSFMLLISFGAWLLPRILDPTTKGPERRARDRRWVNSSPYFLDRQACRWISLCGLHHLRSDPASRGNNEDEEPEWGELKRRSLAWEPDEIPRQNHKRDINQRRRVLRDIPDYVTKHAPLVHLYSGEEFWPSDIRQHVEHMTAYADDEPINSTEKWTLHNLHELNKYSGKITLRSDDDVESRPNWLHSHYNVPKPFPDDKDDDQNRDIPVGNPGGEPEAREPSTWYDVDKTRPVHKISDPRNRKLQNRRRSESNSHKPEANGYSAAPAVLVVVDKGSGIVDAFWFFFYSYNLGQTVLNIRFGNHVGDWEHCMMRFEHGIPRGVFFSEHEGGQAYAFEAVEKRGDRPVIYSAVGSHAMYALPGNHAYILPFKLLKDVTDKGPLWDPSLNNYAYHYDYTKEDNHDLYEQHELLSLVPAASNPHAPTSWFHYQGHWGDEVYSLADARQWRFFGQYHYVTGPDGPRFKTLNRTKMCQKQNCKILYNLDPKNTWY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.17
3 0.11
4 0.08
5 0.08
6 0.05
7 0.05
8 0.06
9 0.07
10 0.08
11 0.08
12 0.08
13 0.11
14 0.13
15 0.15
16 0.18
17 0.25
18 0.31
19 0.37
20 0.4
21 0.46
22 0.54
23 0.6
24 0.67
25 0.7
26 0.7
27 0.75
28 0.83
29 0.83
30 0.83
31 0.81
32 0.79
33 0.76
34 0.73
35 0.66
36 0.6
37 0.54
38 0.47
39 0.48
40 0.41
41 0.38
42 0.42
43 0.39
44 0.37
45 0.35
46 0.34
47 0.31
48 0.34
49 0.32
50 0.31
51 0.34
52 0.34
53 0.36
54 0.36
55 0.35
56 0.33
57 0.34
58 0.29
59 0.33
60 0.37
61 0.35
62 0.39
63 0.4
64 0.39
65 0.36
66 0.35
67 0.27
68 0.26
69 0.26
70 0.22
71 0.2
72 0.18
73 0.23
74 0.24
75 0.26
76 0.26
77 0.24
78 0.28
79 0.35
80 0.42
81 0.39
82 0.43
83 0.42
84 0.45
85 0.52
86 0.48
87 0.45
88 0.48
89 0.52
90 0.5
91 0.56
92 0.55
93 0.58
94 0.68
95 0.75
96 0.76
97 0.79
98 0.81
99 0.82
100 0.81
101 0.76
102 0.72
103 0.69
104 0.67
105 0.61
106 0.57
107 0.56
108 0.52
109 0.5
110 0.47
111 0.39
112 0.31
113 0.28
114 0.26
115 0.2
116 0.22
117 0.2
118 0.17
119 0.17
120 0.17
121 0.16
122 0.15
123 0.13
124 0.1
125 0.09
126 0.11
127 0.11
128 0.13
129 0.15
130 0.17
131 0.17
132 0.21
133 0.21
134 0.2
135 0.2
136 0.17
137 0.15
138 0.13
139 0.13
140 0.11
141 0.1
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.09
146 0.11
147 0.1
148 0.11
149 0.14
150 0.15
151 0.17
152 0.2
153 0.22
154 0.21
155 0.29
156 0.29
157 0.32
158 0.37
159 0.37
160 0.36
161 0.35
162 0.34
163 0.28
164 0.3
165 0.26
166 0.24
167 0.23
168 0.25
169 0.25
170 0.26
171 0.26
172 0.24
173 0.25
174 0.24
175 0.23
176 0.19
177 0.18
178 0.16
179 0.17
180 0.15
181 0.16
182 0.18
183 0.17
184 0.28
185 0.31
186 0.39
187 0.39
188 0.4
189 0.39
190 0.41
191 0.44
192 0.36
193 0.35
194 0.33
195 0.34
196 0.43
197 0.44
198 0.42
199 0.39
200 0.39
201 0.34
202 0.3
203 0.28
204 0.17
205 0.17
206 0.15
207 0.14
208 0.11
209 0.11
210 0.12
211 0.11
212 0.11
213 0.1
214 0.14
215 0.13
216 0.13
217 0.14
218 0.15
219 0.19
220 0.18
221 0.17
222 0.16
223 0.18
224 0.21
225 0.24
226 0.24
227 0.26
228 0.31
229 0.32
230 0.32
231 0.35
232 0.41
233 0.46
234 0.54
235 0.56
236 0.55
237 0.62
238 0.63
239 0.67
240 0.69
241 0.7
242 0.69
243 0.71
244 0.72
245 0.7
246 0.72
247 0.73
248 0.73
249 0.73
250 0.71
251 0.63
252 0.6
253 0.53
254 0.5
255 0.43
256 0.34
257 0.24
258 0.17
259 0.16
260 0.14
261 0.14
262 0.09
263 0.07
264 0.05
265 0.04
266 0.04
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.03
272 0.03
273 0.03
274 0.03
275 0.03
276 0.04
277 0.04
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.06
282 0.06
283 0.07
284 0.09
285 0.09
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.1
291 0.16
292 0.14
293 0.16
294 0.15
295 0.16
296 0.16
297 0.17
298 0.18
299 0.12
300 0.13
301 0.11
302 0.12
303 0.15
304 0.15
305 0.15
306 0.13
307 0.14
308 0.13
309 0.14
310 0.15
311 0.14
312 0.17
313 0.19
314 0.23
315 0.22
316 0.23
317 0.22
318 0.21
319 0.2
320 0.15
321 0.19
322 0.16
323 0.15
324 0.14
325 0.14
326 0.14
327 0.14
328 0.13
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.07
335 0.11
336 0.11
337 0.12
338 0.15
339 0.17
340 0.16
341 0.18
342 0.21
343 0.2
344 0.2
345 0.18
346 0.15
347 0.17
348 0.18
349 0.15
350 0.12
351 0.1
352 0.09
353 0.09
354 0.09
355 0.07
356 0.07
357 0.08
358 0.08
359 0.08
360 0.08
361 0.09
362 0.12
363 0.12
364 0.12
365 0.13
366 0.13
367 0.17
368 0.17
369 0.18
370 0.2
371 0.22
372 0.23
373 0.3
374 0.3
375 0.28
376 0.34
377 0.34
378 0.32
379 0.33
380 0.3
381 0.27
382 0.32
383 0.31
384 0.25
385 0.26
386 0.25
387 0.23
388 0.24
389 0.2
390 0.17
391 0.18
392 0.23
393 0.25
394 0.27
395 0.28
396 0.27
397 0.29
398 0.3
399 0.28
400 0.26
401 0.27
402 0.22
403 0.2
404 0.2
405 0.17
406 0.15
407 0.17
408 0.15
409 0.09
410 0.09
411 0.09
412 0.11
413 0.12
414 0.15
415 0.14
416 0.16
417 0.16
418 0.18
419 0.2
420 0.25
421 0.31
422 0.32
423 0.32
424 0.31
425 0.39
426 0.41
427 0.41
428 0.34
429 0.27
430 0.24
431 0.24
432 0.22
433 0.16
434 0.13
435 0.1
436 0.09
437 0.12
438 0.15
439 0.17
440 0.21
441 0.21
442 0.22
443 0.26
444 0.28
445 0.31
446 0.36
447 0.36
448 0.35
449 0.35
450 0.35
451 0.32
452 0.33
453 0.32
454 0.3
455 0.32
456 0.3
457 0.34
458 0.37
459 0.39
460 0.46
461 0.5
462 0.54
463 0.55
464 0.6
465 0.64
466 0.71
467 0.79
468 0.79
469 0.79
470 0.79
471 0.82
472 0.82
473 0.76
474 0.71
475 0.68
476 0.68
477 0.68
478 0.64
479 0.61