FuNGI

B0CSP6

Protein Details

Accession

B0CSP6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
511-530	GAYGGRPGKKKGGKKRVGGF	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
515-528	GRPGKKKGGKKRVG

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, cyto_nucl 9.5, mito 7, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019350 RNA_pol_I-sp_TIF_RRN6-like
KEGG	lbc:LACBIDRAFT_306087 -
Pfam	View protein in Pfam PF10214 Rrn6

Amino Acid Sequences

MRANFFKSKSINKFFSIAGSHELFTSIEDISDDNILRLCSTKDISWIDQRYPSKPLLSYRHDREFDRCLETWTISLDTPLTFLSSRKNGLVSVYDAGCSDDGLFRMASPPYSLVPGSGNWGRYAGQTFLQQPLTNATKTSLSLVRLSERGSVQCYDLFSDHHKESPVSVLPSGDLQANFSDFSKLPPDPGPLGVQELSGPGLFQLLSNDVELDEEEQHGAASALMERLPSYWEKEDVPFETMLTTYDIAFRTSVEPGQASRADFLAGCVLNSRQGYRAFTEGRLPMVSLESGALWHHNIAPTLTCLDGTLVSNIGELEELLHQYDLADGTDRSSTSVRLESTAREQLVLDMALSCDVFSSQSFSKSQDAGQALEVMTEALSLEDEPPPVSFGYLRPVQKEPVEDGPEDFTSPLGVRLLLKDWDIGSDPEKYVYLDVYDGSTNSQPVRRMTHTQPTEISATPQVSQVPPQILPSTSAFLPRNTVGFGSQQNLASGVPTWSQELVASTQVLPGAYGGRPGKKKGGKKRVGGF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.52
2	0.5
3	0.43
4	0.35
5	0.32
6	0.29
7	0.27
8	0.24
9	0.24
10	0.19
11	0.17
12	0.16
13	0.11
14	0.09
15	0.09
16	0.09
17	0.1
18	0.13
19	0.12
20	0.11
21	0.13
22	0.13
23	0.13
24	0.14
25	0.14
26	0.15
27	0.18
28	0.18
29	0.24
30	0.28
31	0.32
32	0.4
33	0.42
34	0.42
35	0.47
36	0.49
37	0.46
38	0.46
39	0.44
40	0.39
41	0.39
42	0.44
43	0.45
44	0.49
45	0.55
46	0.59
47	0.65
48	0.64
49	0.63
50	0.6
51	0.58
52	0.54
53	0.51
54	0.44
55	0.39
56	0.38
57	0.37
58	0.32
59	0.28
60	0.25
61	0.19
62	0.19
63	0.16
64	0.13
65	0.13
66	0.12
67	0.12
68	0.1
69	0.11
70	0.18
71	0.21
72	0.23
73	0.24
74	0.25
75	0.23
76	0.24
77	0.26
78	0.22
79	0.21
80	0.19
81	0.18
82	0.17
83	0.17
84	0.15
85	0.13
86	0.11
87	0.09
88	0.09
89	0.1
90	0.1
91	0.09
92	0.12
93	0.12
94	0.12
95	0.11
96	0.13
97	0.12
98	0.14
99	0.14
100	0.12
101	0.13
102	0.13
103	0.17
104	0.18
105	0.18
106	0.17
107	0.18
108	0.18
109	0.18
110	0.2
111	0.16
112	0.15
113	0.18
114	0.19
115	0.22
116	0.24
117	0.23
118	0.2
119	0.25
120	0.26
121	0.23
122	0.22
123	0.19
124	0.18
125	0.19
126	0.22
127	0.19
128	0.17
129	0.2
130	0.21
131	0.22
132	0.22
133	0.22
134	0.22
135	0.21
136	0.21
137	0.21
138	0.2
139	0.19
140	0.19
141	0.19
142	0.17
143	0.16
144	0.16
145	0.17
146	0.21
147	0.21
148	0.21
149	0.22
150	0.2
151	0.21
152	0.23
153	0.22
154	0.19
155	0.18
156	0.16
157	0.15
158	0.16
159	0.16
160	0.13
161	0.1
162	0.09
163	0.1
164	0.1
165	0.1
166	0.1
167	0.13
168	0.1
169	0.12
170	0.16
171	0.15
172	0.17
173	0.18
174	0.21
175	0.19
176	0.2
177	0.2
178	0.16
179	0.18
180	0.16
181	0.14
182	0.11
183	0.1
184	0.1
185	0.08
186	0.07
187	0.05
188	0.05
189	0.05
190	0.05
191	0.05
192	0.06
193	0.07
194	0.07
195	0.07
196	0.07
197	0.07
198	0.07
199	0.08
200	0.06
201	0.06
202	0.06
203	0.06
204	0.06
205	0.06
206	0.06
207	0.04
208	0.04
209	0.04
210	0.04
211	0.05
212	0.05
213	0.05
214	0.05
215	0.07
216	0.07
217	0.1
218	0.11
219	0.13
220	0.14
221	0.15
222	0.17
223	0.17
224	0.18
225	0.15
226	0.14
227	0.12
228	0.11
229	0.1
230	0.09
231	0.08
232	0.06
233	0.09
234	0.09
235	0.09
236	0.09
237	0.09
238	0.09
239	0.1
240	0.1
241	0.08
242	0.08
243	0.08
244	0.11
245	0.12
246	0.11
247	0.11
248	0.1
249	0.1
250	0.09
251	0.09
252	0.09
253	0.08
254	0.07
255	0.08
256	0.08
257	0.1
258	0.11
259	0.11
260	0.11
261	0.13
262	0.15
263	0.15
264	0.19
265	0.17
266	0.18
267	0.21
268	0.19
269	0.19
270	0.17
271	0.16
272	0.12
273	0.11
274	0.1
275	0.07
276	0.06
277	0.05
278	0.05
279	0.05
280	0.05
281	0.05
282	0.05
283	0.06
284	0.07
285	0.07
286	0.07
287	0.08
288	0.08
289	0.09
290	0.08
291	0.07
292	0.06
293	0.07
294	0.07
295	0.07
296	0.07
297	0.06
298	0.06
299	0.07
300	0.06
301	0.06
302	0.05
303	0.04
304	0.05
305	0.05
306	0.05
307	0.05
308	0.05
309	0.05
310	0.05
311	0.06
312	0.05
313	0.05
314	0.06
315	0.05
316	0.07
317	0.08
318	0.08
319	0.09
320	0.1
321	0.1
322	0.11
323	0.14
324	0.13
325	0.14
326	0.15
327	0.15
328	0.2
329	0.23
330	0.21
331	0.19
332	0.19
333	0.17
334	0.18
335	0.16
336	0.11
337	0.06
338	0.06
339	0.06
340	0.06
341	0.05
342	0.04
343	0.04
344	0.05
345	0.05
346	0.09
347	0.09
348	0.12
349	0.14
350	0.16
351	0.19
352	0.19
353	0.2
354	0.22
355	0.22
356	0.2
357	0.2
358	0.19
359	0.16
360	0.15
361	0.15
362	0.08
363	0.07
364	0.06
365	0.05
366	0.03
367	0.04
368	0.04
369	0.05
370	0.06
371	0.07
372	0.07
373	0.08
374	0.09
375	0.09
376	0.09
377	0.09
378	0.09
379	0.14
380	0.2
381	0.22
382	0.24
383	0.26
384	0.29
385	0.3
386	0.32
387	0.3
388	0.32
389	0.33
390	0.3
391	0.29
392	0.29
393	0.27
394	0.25
395	0.21
396	0.14
397	0.12
398	0.12
399	0.12
400	0.09
401	0.09
402	0.09
403	0.11
404	0.14
405	0.13
406	0.14
407	0.14
408	0.14
409	0.15
410	0.16
411	0.16
412	0.15
413	0.17
414	0.17
415	0.16
416	0.17
417	0.16
418	0.14
419	0.14
420	0.13
421	0.1
422	0.1
423	0.1
424	0.11
425	0.1
426	0.12
427	0.13
428	0.14
429	0.16
430	0.19
431	0.2
432	0.23
433	0.3
434	0.33
435	0.38
436	0.43
437	0.51
438	0.51
439	0.51
440	0.49
441	0.46
442	0.44
443	0.38
444	0.34
445	0.28
446	0.27
447	0.24
448	0.24
449	0.23
450	0.2
451	0.23
452	0.24
453	0.24
454	0.22
455	0.25
456	0.25
457	0.23
458	0.25
459	0.25
460	0.24
461	0.21
462	0.28
463	0.26
464	0.25
465	0.28
466	0.27
467	0.26
468	0.23
469	0.24
470	0.18
471	0.21
472	0.23
473	0.21
474	0.23
475	0.22
476	0.22
477	0.22
478	0.2
479	0.16
480	0.15
481	0.14
482	0.12
483	0.13
484	0.14
485	0.14
486	0.14
487	0.14
488	0.15
489	0.15
490	0.15
491	0.16
492	0.14
493	0.15
494	0.16
495	0.15
496	0.12
497	0.11
498	0.12
499	0.11
500	0.18
501	0.21
502	0.29
503	0.33
504	0.38
505	0.47
506	0.53
507	0.63
508	0.67
509	0.74
510	0.75

B0CSP6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer