Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1RPD1

Protein Details
Accession N1RPD1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
166-186DEAPKGKKAKKSKYNFTHRMLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
161-178PGPIKDEAPKGKKAKKSK
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 11, nucl 8.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017774  Bicupin_oxalate_deCO2ase/Oxase  
IPR006045  Cupin_1  
IPR014710  RmlC-like_jellyroll  
IPR011051  RmlC_Cupin_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0033609  P:oxalate metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00190  Cupin_1  
CDD cd20305  cupin_OxDC_C  
cd20304  cupin_OxDC_N  
Amino Acid Sequences MRWSFADSHIRIEEGGWTRQTTVRELPTSVELAGVNMRLGEGVYRELHWHQEAEWAYVLDGEVRVTALDYEGGNFIDDLKKGDLWYFPSGVPHSLQGLSPNGTEFLLIFDNGHFSEESTFVLTDWLAHTPKSVIAKNFDLDPEVFARLPESEKYIFKGRTPGPIKDEAPKGKKAKKSKYNFTHRMLDQEPLKTSGGQVRITDSKNFPISKTVAAAHAIIEPGAIREMHWHPSADEWSFFIKGRARVTIFASEGNARTFDYVPGDVGIVPKNMGHFVENIGDEPIEMLEIFRSDEFRDISLFKWMGETPKKQVIDTLFADDPKNAAKFWDRIKDADNDVITKPDFVRSKPDADEEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.3
3 0.26
4 0.26
5 0.28
6 0.32
7 0.33
8 0.3
9 0.33
10 0.35
11 0.35
12 0.35
13 0.35
14 0.34
15 0.34
16 0.29
17 0.23
18 0.16
19 0.15
20 0.16
21 0.14
22 0.11
23 0.09
24 0.09
25 0.08
26 0.08
27 0.07
28 0.07
29 0.1
30 0.11
31 0.12
32 0.15
33 0.16
34 0.21
35 0.21
36 0.21
37 0.18
38 0.24
39 0.24
40 0.24
41 0.24
42 0.2
43 0.18
44 0.18
45 0.17
46 0.11
47 0.1
48 0.08
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.06
54 0.05
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.08
59 0.09
60 0.08
61 0.08
62 0.09
63 0.1
64 0.11
65 0.13
66 0.13
67 0.14
68 0.14
69 0.16
70 0.17
71 0.19
72 0.21
73 0.2
74 0.19
75 0.22
76 0.23
77 0.22
78 0.21
79 0.17
80 0.17
81 0.15
82 0.15
83 0.15
84 0.16
85 0.16
86 0.15
87 0.14
88 0.13
89 0.12
90 0.12
91 0.09
92 0.09
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.07
97 0.09
98 0.09
99 0.1
100 0.08
101 0.08
102 0.09
103 0.09
104 0.1
105 0.09
106 0.09
107 0.08
108 0.09
109 0.08
110 0.07
111 0.08
112 0.1
113 0.09
114 0.09
115 0.1
116 0.1
117 0.13
118 0.17
119 0.19
120 0.18
121 0.21
122 0.23
123 0.24
124 0.24
125 0.21
126 0.18
127 0.16
128 0.15
129 0.12
130 0.12
131 0.11
132 0.1
133 0.11
134 0.1
135 0.11
136 0.1
137 0.12
138 0.13
139 0.14
140 0.17
141 0.23
142 0.23
143 0.22
144 0.29
145 0.27
146 0.34
147 0.38
148 0.38
149 0.35
150 0.4
151 0.4
152 0.38
153 0.43
154 0.4
155 0.4
156 0.44
157 0.47
158 0.48
159 0.54
160 0.58
161 0.62
162 0.65
163 0.69
164 0.72
165 0.76
166 0.8
167 0.81
168 0.76
169 0.73
170 0.64
171 0.61
172 0.52
173 0.45
174 0.37
175 0.32
176 0.28
177 0.23
178 0.23
179 0.18
180 0.17
181 0.18
182 0.18
183 0.18
184 0.17
185 0.18
186 0.21
187 0.23
188 0.26
189 0.23
190 0.23
191 0.27
192 0.27
193 0.24
194 0.24
195 0.24
196 0.21
197 0.22
198 0.19
199 0.15
200 0.16
201 0.15
202 0.12
203 0.11
204 0.1
205 0.08
206 0.07
207 0.06
208 0.05
209 0.06
210 0.05
211 0.04
212 0.09
213 0.12
214 0.16
215 0.17
216 0.17
217 0.16
218 0.19
219 0.22
220 0.18
221 0.17
222 0.14
223 0.15
224 0.16
225 0.16
226 0.17
227 0.19
228 0.21
229 0.23
230 0.26
231 0.26
232 0.26
233 0.29
234 0.29
235 0.26
236 0.22
237 0.22
238 0.2
239 0.19
240 0.18
241 0.16
242 0.12
243 0.13
244 0.13
245 0.13
246 0.14
247 0.13
248 0.12
249 0.12
250 0.12
251 0.11
252 0.12
253 0.12
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.1
258 0.11
259 0.11
260 0.11
261 0.1
262 0.11
263 0.14
264 0.14
265 0.14
266 0.14
267 0.13
268 0.11
269 0.11
270 0.09
271 0.06
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.06
276 0.07
277 0.07
278 0.09
279 0.09
280 0.13
281 0.14
282 0.14
283 0.16
284 0.16
285 0.17
286 0.23
287 0.22
288 0.19
289 0.2
290 0.21
291 0.27
292 0.34
293 0.37
294 0.36
295 0.44
296 0.45
297 0.42
298 0.46
299 0.41
300 0.4
301 0.38
302 0.37
303 0.31
304 0.32
305 0.33
306 0.28
307 0.25
308 0.23
309 0.22
310 0.16
311 0.18
312 0.22
313 0.27
314 0.34
315 0.43
316 0.41
317 0.42
318 0.46
319 0.48
320 0.46
321 0.47
322 0.42
323 0.35
324 0.33
325 0.35
326 0.32
327 0.29
328 0.26
329 0.27
330 0.28
331 0.27
332 0.35
333 0.35
334 0.41
335 0.41