FuNGI

N1S669

Protein Details

Accession

N1S669

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
132-152	KRDFHCIVRRAKRQYWRNLID	Hydrophilic
907-931	SEIPPRGFRHIPRKIRPCQRTPGLF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
90-95	RPARKG

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 11.5, cyto 3.5, mito 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR012337 RNaseH-like_sf IPR002156 RNaseH_domain IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom
Gene Ontology	GO:0005739 C:mitochondrion GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0004523 F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity
Pfam	View protein in Pfam PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50879 RNASE_H_1 PS50878 RT_POL
CDD	cd09276 Rnase_HI_RT_non_LTR cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

MPLAEATVEDHLATSSDHFTLSLTFPDIKATPSQPGKIRVTTEDELKRFVEIVELGATEIPGTGSTSKELDELASSLVCLLTSAAKAAGRPARKGGRPAPWWTEECAVAVAAFRAIRRLYPVGFNQDVQIAKRDFHCIVRRAKRQYWRNLIDSFSSSSAVFKAVRWLKSPGAFQPPPLQVDNVVYETQMDKAYALRQATLERRTADDDIDTPWASVSASRSIPFSPEISLDEAQYATLHTGNTSPGSDNITVNLLRAVWHVIGTHVRRLFEGCLTIGHHPRPFKEAEVVMITKPGRRDLTSPRAWRPVSLLSCLGKGLERLIARRLAWAAVHFSVLHPQQAGALPKRSATDLVTALIHDIEEAFARNKVVTLVTMDIQGAFDTVMRNRLVLRLRQQGWPDHLARWAGSFMDGRSARVRYQDTVTPSSPLLCGLPQGSPVSPILFLLYTEPIYRLSNPQGRFGYADDTAILSIGDTVEETSIRASSSIDEMVRWGAANGVSFDPKKTEVMHFSRSKLRTTPAVRHGDVEKHPEAALRWLGIWLDSRLSFRIHVEKWAAKAKAVAYHLRGLTNTIHGPLPSAVRSAVRACVEPVLLHGSEAWYPGKTRPRWTQPMKDLPSSNQHLLQRMSKAMNQTMRAILPVWKTMPATILHRESGIPPIDQLLDARRLRFSTRLKSLDEAHPLASRTRPPCQPAYHDLIKRRYQAQTESSFRTRLRRTDELLAPCARPKLVQRRFHQELLPPLQMASKDKSADAFSHWVESLDPLTLVVYSDGSLSSEGAASYGFTIHQNNIPISDGSGRLGPAEVFDAEATGALEGLKAALNLRELATQNIYICLDNLAAATCLRGTPSDSSQDVFLEFQALATSHGAIQVRWVPGHSDETQSQGNHRLPARAIAPACSLAPSAGSEIPPRGFRHIPRKIRPCQRTPGLFIWPTQSTRSHLLLQKSTAALSSEARTLTEYSSQSSNGKRLHQIHRPVQGQRVLWKDMPSPLGDDDQRSTRISLSLFIFYSSPLFNLSLSLLPVPGQTKGVPAPFIWP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.12
3	0.12
4	0.12
5	0.12
6	0.12
7	0.14
8	0.15
9	0.15
10	0.16
11	0.17
12	0.17
13	0.21
14	0.21
15	0.21
16	0.25
17	0.25
18	0.3
19	0.34
20	0.41
21	0.42
22	0.5
23	0.53
24	0.53
25	0.54
26	0.49
27	0.52
28	0.49
29	0.52
30	0.52
31	0.48
32	0.47
33	0.44
34	0.4
35	0.33
36	0.29
37	0.24
38	0.16
39	0.16
40	0.15
41	0.14
42	0.14
43	0.13
44	0.13
45	0.09
46	0.09
47	0.07
48	0.06
49	0.08
50	0.09
51	0.1
52	0.12
53	0.13
54	0.13
55	0.14
56	0.14
57	0.12
58	0.13
59	0.12
60	0.12
61	0.11
62	0.1
63	0.1
64	0.09
65	0.08
66	0.07
67	0.07
68	0.07
69	0.08
70	0.09
71	0.11
72	0.11
73	0.12
74	0.19
75	0.26
76	0.27
77	0.3
78	0.37
79	0.44
80	0.48
81	0.56
82	0.56
83	0.59
84	0.61
85	0.65
86	0.64
87	0.61
88	0.59
89	0.54
90	0.49
91	0.4
92	0.35
93	0.29
94	0.22
95	0.16
96	0.14
97	0.11
98	0.1
99	0.1
100	0.09
101	0.13
102	0.13
103	0.14
104	0.19
105	0.22
106	0.22
107	0.28
108	0.32
109	0.36
110	0.37
111	0.37
112	0.33
113	0.34
114	0.33
115	0.28
116	0.31
117	0.24
118	0.24
119	0.25
120	0.3
121	0.27
122	0.33
123	0.4
124	0.4
125	0.5
126	0.58
127	0.65
128	0.69
129	0.75
130	0.77
131	0.79
132	0.82
133	0.83
134	0.79
135	0.75
136	0.69
137	0.63
138	0.56
139	0.5
140	0.42
141	0.32
142	0.27
143	0.21
144	0.2
145	0.18
146	0.17
147	0.15
148	0.12
149	0.21
150	0.26
151	0.29
152	0.31
153	0.35
154	0.37
155	0.41
156	0.44
157	0.4
158	0.43
159	0.41
160	0.4
161	0.45
162	0.43
163	0.42
164	0.4
165	0.35
166	0.26
167	0.29
168	0.29
169	0.23
170	0.2
171	0.16
172	0.16
173	0.16
174	0.16
175	0.14
176	0.11
177	0.09
178	0.11
179	0.13
180	0.17
181	0.16
182	0.16
183	0.16
184	0.22
185	0.28
186	0.3
187	0.31
188	0.28
189	0.3
190	0.33
191	0.33
192	0.28
193	0.24
194	0.21
195	0.19
196	0.22
197	0.19
198	0.15
199	0.14
200	0.13
201	0.11
202	0.12
203	0.13
204	0.14
205	0.15
206	0.16
207	0.17
208	0.17
209	0.19
210	0.19
211	0.18
212	0.14
213	0.14
214	0.16
215	0.19
216	0.19
217	0.17
218	0.16
219	0.15
220	0.14
221	0.12
222	0.11
223	0.07
224	0.08
225	0.08
226	0.07
227	0.08
228	0.09
229	0.11
230	0.11
231	0.11
232	0.12
233	0.16
234	0.17
235	0.16
236	0.16
237	0.17
238	0.16
239	0.15
240	0.15
241	0.11
242	0.1
243	0.1
244	0.12
245	0.09
246	0.09
247	0.09
248	0.11
249	0.17
250	0.19
251	0.25
252	0.25
253	0.25
254	0.25
255	0.27
256	0.26
257	0.21
258	0.21
259	0.15
260	0.14
261	0.16
262	0.2
263	0.23
264	0.25
265	0.27
266	0.28
267	0.29
268	0.31
269	0.3
270	0.27
271	0.28
272	0.24
273	0.23
274	0.26
275	0.25
276	0.22
277	0.24
278	0.23
279	0.2
280	0.21
281	0.23
282	0.21
283	0.21
284	0.26
285	0.31
286	0.4
287	0.46
288	0.51
289	0.52
290	0.57
291	0.55
292	0.51
293	0.46
294	0.45
295	0.38
296	0.35
297	0.34
298	0.27
299	0.28
300	0.27
301	0.23
302	0.16
303	0.14
304	0.12
305	0.13
306	0.13
307	0.14
308	0.17
309	0.2
310	0.19
311	0.21
312	0.2
313	0.16
314	0.16
315	0.15
316	0.16
317	0.13
318	0.14
319	0.12
320	0.11
321	0.16
322	0.16
323	0.16
324	0.12
325	0.12
326	0.13
327	0.16
328	0.2
329	0.19
330	0.22
331	0.21
332	0.22
333	0.23
334	0.22
335	0.2
336	0.17
337	0.17
338	0.14
339	0.15
340	0.14
341	0.13
342	0.12
343	0.11
344	0.09
345	0.06
346	0.05
347	0.04
348	0.04
349	0.06
350	0.06
351	0.07
352	0.07
353	0.07
354	0.08
355	0.08
356	0.08
357	0.07
358	0.08
359	0.09
360	0.09
361	0.1
362	0.09
363	0.09
364	0.08
365	0.08
366	0.06
367	0.05
368	0.05
369	0.06
370	0.06
371	0.1
372	0.1
373	0.1
374	0.11
375	0.16
376	0.18
377	0.21
378	0.27
379	0.33
380	0.35
381	0.39
382	0.41
383	0.4
384	0.41
385	0.42
386	0.37
387	0.29
388	0.29
389	0.26
390	0.23
391	0.2
392	0.16
393	0.11
394	0.11
395	0.11
396	0.08
397	0.15
398	0.15
399	0.16
400	0.19
401	0.2
402	0.2
403	0.24
404	0.26
405	0.2
406	0.23
407	0.25
408	0.27
409	0.3
410	0.29
411	0.26
412	0.24
413	0.23
414	0.2
415	0.16
416	0.12
417	0.08
418	0.08
419	0.08
420	0.08
421	0.09
422	0.1
423	0.09
424	0.1
425	0.1
426	0.1
427	0.09
428	0.09
429	0.08
430	0.07
431	0.07
432	0.07
433	0.07
434	0.07
435	0.08
436	0.08
437	0.09
438	0.1
439	0.11
440	0.12
441	0.18
442	0.24
443	0.24
444	0.29
445	0.29
446	0.28
447	0.28
448	0.26
449	0.23
450	0.17
451	0.16
452	0.11
453	0.1
454	0.09
455	0.08
456	0.07
457	0.04
458	0.04
459	0.03
460	0.03
461	0.03
462	0.03
463	0.03
464	0.03
465	0.04
466	0.04
467	0.04
468	0.04
469	0.05
470	0.05
471	0.05
472	0.06
473	0.08
474	0.07
475	0.07
476	0.08
477	0.08
478	0.07
479	0.07
480	0.05
481	0.05
482	0.05
483	0.06
484	0.06
485	0.07
486	0.09
487	0.09
488	0.09
489	0.1
490	0.11
491	0.11
492	0.12
493	0.13
494	0.18
495	0.22
496	0.29
497	0.3
498	0.32
499	0.38
500	0.38
501	0.38
502	0.33
503	0.31
504	0.31
505	0.33
506	0.37
507	0.38
508	0.42
509	0.41
510	0.41
511	0.4
512	0.38
513	0.36
514	0.34
515	0.26
516	0.22
517	0.21
518	0.2
519	0.19
520	0.17
521	0.15
522	0.1
523	0.09
524	0.09
525	0.08
526	0.08
527	0.09
528	0.07
529	0.07
530	0.08
531	0.09
532	0.09
533	0.1
534	0.1
535	0.11
536	0.16
537	0.16
538	0.18
539	0.21
540	0.21
541	0.24
542	0.3
543	0.28
544	0.22
545	0.24
546	0.22
547	0.24
548	0.24
549	0.24
550	0.19
551	0.23
552	0.23
553	0.22
554	0.21
555	0.18
556	0.16
557	0.16
558	0.14
559	0.12
560	0.11
561	0.11
562	0.12
563	0.11
564	0.12
565	0.09
566	0.1
567	0.09
568	0.09
569	0.11
570	0.11
571	0.13
572	0.12
573	0.13
574	0.12
575	0.13
576	0.13
577	0.11
578	0.11
579	0.11
580	0.1
581	0.09
582	0.09
583	0.09
584	0.09
585	0.1
586	0.1
587	0.07
588	0.09
589	0.14
590	0.22
591	0.23
592	0.3
593	0.37
594	0.45
595	0.54
596	0.6
597	0.64
598	0.64
599	0.72
600	0.69
601	0.65
602	0.58
603	0.5
604	0.51
605	0.46
606	0.4
607	0.34
608	0.32
609	0.31
610	0.32
611	0.32
612	0.27
613	0.25
614	0.25
615	0.23
616	0.24
617	0.25
618	0.27
619	0.26
620	0.25
621	0.24
622	0.22
623	0.21
624	0.19
625	0.18
626	0.15
627	0.16
628	0.15
629	0.15
630	0.15
631	0.15
632	0.16
633	0.14
634	0.16
635	0.19
636	0.2
637	0.19
638	0.19
639	0.2
640	0.18
641	0.21
642	0.19
643	0.15
644	0.12
645	0.13
646	0.13
647	0.13
648	0.12
649	0.11
650	0.17
651	0.18
652	0.19
653	0.19
654	0.2
655	0.22
656	0.29
657	0.32
658	0.33
659	0.4
660	0.42
661	0.42
662	0.44
663	0.46
664	0.44
665	0.43
666	0.36
667	0.29
668	0.28
669	0.27
670	0.26
671	0.25
672	0.26
673	0.24
674	0.29
675	0.31
676	0.33
677	0.38
678	0.4
679	0.43
680	0.43
681	0.46
682	0.48
683	0.49
684	0.52
685	0.54
686	0.56
687	0.53
688	0.52
689	0.49
690	0.44
691	0.44
692	0.44
693	0.44
694	0.44
695	0.46
696	0.44
697	0.44
698	0.42
699	0.45
700	0.43
701	0.41
702	0.44
703	0.43
704	0.46
705	0.5
706	0.55
707	0.5
708	0.5
709	0.47
710	0.4
711	0.37
712	0.33
713	0.26
714	0.21
715	0.25
716	0.32
717	0.39
718	0.47
719	0.51
720	0.59
721	0.64
722	0.66
723	0.61
724	0.54
725	0.53
726	0.5
727	0.46
728	0.37
729	0.31
730	0.3
731	0.28
732	0.27
733	0.22
734	0.2
735	0.19
736	0.2
737	0.21
738	0.21
739	0.21
740	0.21
741	0.21
742	0.18
743	0.19
744	0.19
745	0.18
746	0.16
747	0.16
748	0.13
749	0.1
750	0.09
751	0.07
752	0.07
753	0.07
754	0.07
755	0.06
756	0.05
757	0.05
758	0.05
759	0.05
760	0.06
761	0.06
762	0.06
763	0.06
764	0.06
765	0.06
766	0.05
767	0.05
768	0.05
769	0.05
770	0.05
771	0.06
772	0.07
773	0.09
774	0.1
775	0.13
776	0.16
777	0.16
778	0.16
779	0.18
780	0.16
781	0.16
782	0.17
783	0.14
784	0.13
785	0.14
786	0.13
787	0.11
788	0.12
789	0.1
790	0.08
791	0.1
792	0.09
793	0.08
794	0.08
795	0.08
796	0.07
797	0.07
798	0.07
799	0.05
800	0.05
801	0.04
802	0.04
803	0.04
804	0.04
805	0.04
806	0.04
807	0.05
808	0.07
809	0.08
810	0.09
811	0.1
812	0.14
813	0.14
814	0.16
815	0.18
816	0.18
817	0.17
818	0.18
819	0.18
820	0.15
821	0.14
822	0.13
823	0.1
824	0.09
825	0.09
826	0.07
827	0.07
828	0.07
829	0.07
830	0.06
831	0.06
832	0.07
833	0.08
834	0.1
835	0.13
836	0.16
837	0.21
838	0.22
839	0.22
840	0.22
841	0.22
842	0.21
843	0.17
844	0.14
845	0.11
846	0.1
847	0.09
848	0.09
849	0.09
850	0.09
851	0.09
852	0.1
853	0.08
854	0.12
855	0.12
856	0.11
857	0.14
858	0.18
859	0.2
860	0.19
861	0.2
862	0.19
863	0.21
864	0.27
865	0.24
866	0.24
867	0.23
868	0.27
869	0.3
870	0.29
871	0.29
872	0.31
873	0.33
874	0.33
875	0.34
876	0.34
877	0.31
878	0.35
879	0.34
880	0.32
881	0.3
882	0.26
883	0.27
884	0.24
885	0.24
886	0.2
887	0.19
888	0.13
889	0.13
890	0.11
891	0.12
892	0.13
893	0.14
894	0.15
895	0.18
896	0.2
897	0.24
898	0.25
899	0.29
900	0.33
901	0.39
902	0.48
903	0.55
904	0.63
905	0.69
906	0.77
907	0.8
908	0.86
909	0.87
910	0.83
911	0.83
912	0.82
913	0.78
914	0.75
915	0.7
916	0.67
917	0.6
918	0.53
919	0.49
920	0.43
921	0.39
922	0.36
923	0.34
924	0.3
925	0.34
926	0.36
927	0.38
928	0.39
929	0.44
930	0.45
931	0.45
932	0.44
933	0.4
934	0.36
935	0.3
936	0.27
937	0.21
938	0.2
939	0.19
940	0.18
941	0.18
942	0.18
943	0.18
944	0.18
945	0.18
946	0.22
947	0.21
948	0.21
949	0.23
950	0.25
951	0.28
952	0.31
953	0.37
954	0.35
955	0.39
956	0.45
957	0.51
958	0.58
959	0.62
960	0.67
961	0.68
962	0.73
963	0.74
964	0.7
965	0.69
966	0.66
967	0.6
968	0.57
969	0.55
970	0.51
971	0.48
972	0.47
973	0.43
974	0.42
975	0.41
976	0.35
977	0.33
978	0.29
979	0.33
980	0.31
981	0.31
982	0.3
983	0.32
984	0.34
985	0.33
986	0.31
987	0.27
988	0.28
989	0.25
990	0.26
991	0.24
992	0.26
993	0.24
994	0.24
995	0.22
996	0.2
997	0.22
998	0.17
999	0.15
1000	0.13
1001	0.14
1002	0.12
1003	0.14
1004	0.15
1005	0.14
1006	0.15
1007	0.15
1008	0.13
1009	0.13
1010	0.16
1011	0.16
1012	0.16
1013	0.16
1014	0.15
1015	0.19
1016	0.23
1017	0.25
1018	0.24

N1S669

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer