Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0CQT0

Protein Details
Accession B0CQT0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-69RPLFEVKKKGRPVSQCNKCRELRQSKKLHSKCTCDHydrophilic
174-195PSSNSMKKHPHKLKRLHSRPGTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
180-202KKHPHKLKRLHSRPGTPPLATRK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10.5, mito 6, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001083  Cu_fist_DNA-bd_dom  
IPR036395  Cu_fist_DNA-bd_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005507  F:copper ion binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_300881  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00649  Copper-fist  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50073  COPPER_FIST_2  
Amino Acid Sequences MSSLPLSMVFVNSKKFACESCIKGHRSSSCHHTDRPLFEVKKKGRPVSQCNKCRELRQSKKLHSKCTCDPKDRMTQEQLIPLSAGSKSRRFIPIVPALPNGLKDVLNPARSSCSKEPDSRQKVDSLLNPCTCNSVWKCNCSRDSASSSKVSDAESLTTLARVAAMHDSALLETPSSNSMKKHPHKLKRLHSRPGTPPLATRKRSSEIRHILHYSKGPDLPPILSVPSSSQLPVSIPEFASMPPMSEITSLAGSGCTCGLQCACPGCPEHRGSDNVAKDRRNCADGCGTCIDYAGTTIKDKNLPNSDFLDRFFARAAALPPPPAHRRYGSRTLDPTDVTIYRASESLLSGSGSLPKLECCGGQCLCPSGRCSCGTSCDGSCLAGGPSSSAQLAAATITPPPTGCQNCRQKTV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.26
3 0.25
4 0.28
5 0.33
6 0.34
7 0.41
8 0.49
9 0.51
10 0.52
11 0.58
12 0.58
13 0.54
14 0.54
15 0.53
16 0.54
17 0.56
18 0.55
19 0.57
20 0.58
21 0.58
22 0.58
23 0.6
24 0.54
25 0.55
26 0.62
27 0.6
28 0.63
29 0.66
30 0.68
31 0.66
32 0.72
33 0.76
34 0.77
35 0.8
36 0.79
37 0.78
38 0.79
39 0.75
40 0.73
41 0.73
42 0.73
43 0.73
44 0.75
45 0.78
46 0.8
47 0.88
48 0.86
49 0.86
50 0.82
51 0.8
52 0.79
53 0.8
54 0.78
55 0.75
56 0.73
57 0.7
58 0.73
59 0.69
60 0.66
61 0.61
62 0.59
63 0.54
64 0.56
65 0.49
66 0.39
67 0.35
68 0.28
69 0.23
70 0.17
71 0.2
72 0.17
73 0.21
74 0.22
75 0.26
76 0.31
77 0.32
78 0.34
79 0.37
80 0.42
81 0.42
82 0.43
83 0.39
84 0.37
85 0.35
86 0.33
87 0.26
88 0.19
89 0.15
90 0.12
91 0.2
92 0.23
93 0.24
94 0.24
95 0.23
96 0.28
97 0.29
98 0.37
99 0.32
100 0.34
101 0.37
102 0.43
103 0.51
104 0.56
105 0.63
106 0.59
107 0.57
108 0.52
109 0.5
110 0.47
111 0.44
112 0.39
113 0.38
114 0.37
115 0.36
116 0.34
117 0.34
118 0.3
119 0.32
120 0.29
121 0.33
122 0.33
123 0.39
124 0.44
125 0.47
126 0.49
127 0.47
128 0.48
129 0.42
130 0.46
131 0.43
132 0.42
133 0.38
134 0.37
135 0.32
136 0.3
137 0.25
138 0.21
139 0.17
140 0.15
141 0.13
142 0.13
143 0.11
144 0.1
145 0.1
146 0.08
147 0.07
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.07
155 0.06
156 0.07
157 0.06
158 0.04
159 0.04
160 0.05
161 0.07
162 0.09
163 0.1
164 0.1
165 0.16
166 0.27
167 0.32
168 0.42
169 0.5
170 0.58
171 0.66
172 0.75
173 0.8
174 0.81
175 0.83
176 0.82
177 0.78
178 0.75
179 0.71
180 0.7
181 0.62
182 0.51
183 0.48
184 0.49
185 0.51
186 0.47
187 0.43
188 0.39
189 0.41
190 0.47
191 0.46
192 0.46
193 0.46
194 0.46
195 0.48
196 0.46
197 0.43
198 0.39
199 0.38
200 0.3
201 0.23
202 0.23
203 0.19
204 0.18
205 0.18
206 0.15
207 0.14
208 0.12
209 0.11
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.1
214 0.1
215 0.09
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.12
227 0.1
228 0.1
229 0.09
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.05
242 0.04
243 0.04
244 0.05
245 0.06
246 0.06
247 0.08
248 0.09
249 0.1
250 0.12
251 0.14
252 0.15
253 0.2
254 0.21
255 0.23
256 0.24
257 0.26
258 0.29
259 0.34
260 0.37
261 0.39
262 0.42
263 0.42
264 0.42
265 0.46
266 0.44
267 0.4
268 0.35
269 0.32
270 0.36
271 0.33
272 0.34
273 0.3
274 0.28
275 0.25
276 0.25
277 0.21
278 0.12
279 0.13
280 0.11
281 0.09
282 0.11
283 0.12
284 0.15
285 0.2
286 0.21
287 0.28
288 0.34
289 0.34
290 0.35
291 0.39
292 0.4
293 0.36
294 0.36
295 0.35
296 0.27
297 0.27
298 0.24
299 0.2
300 0.16
301 0.18
302 0.19
303 0.17
304 0.18
305 0.19
306 0.2
307 0.26
308 0.3
309 0.3
310 0.32
311 0.32
312 0.38
313 0.44
314 0.53
315 0.52
316 0.54
317 0.57
318 0.57
319 0.55
320 0.48
321 0.42
322 0.36
323 0.31
324 0.26
325 0.22
326 0.19
327 0.17
328 0.17
329 0.15
330 0.12
331 0.12
332 0.11
333 0.11
334 0.1
335 0.1
336 0.1
337 0.14
338 0.14
339 0.14
340 0.14
341 0.13
342 0.15
343 0.16
344 0.17
345 0.14
346 0.2
347 0.2
348 0.22
349 0.23
350 0.26
351 0.27
352 0.29
353 0.3
354 0.27
355 0.31
356 0.3
357 0.33
358 0.3
359 0.34
360 0.34
361 0.36
362 0.32
363 0.32
364 0.3
365 0.26
366 0.24
367 0.2
368 0.17
369 0.14
370 0.13
371 0.12
372 0.12
373 0.13
374 0.13
375 0.12
376 0.11
377 0.1
378 0.1
379 0.08
380 0.08
381 0.07
382 0.09
383 0.1
384 0.11
385 0.11
386 0.12
387 0.2
388 0.26
389 0.31
390 0.4
391 0.5