Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PHC4

Protein Details
Accession A0A1D8PHC4    Localization Confidence High Confidence Score 20.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-22GNKAKGVKRSADKYNNKSSKKHydrophilic
470-493EELAYKKTSKKDKQQRKSELLERSHydrophilic
634-653QLEKSPKAEKLKKAIKKLSLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-22SSKK
640-649KAEKLKKAIK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR012959  CPL_dom  
IPR033133  PUM-HD  
IPR040059  PUM3  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
Gene Ontology GO:0015934  C:large ribosomal subunit  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0101031  C:protein folding chaperone complex  
GO:0003730  F:mRNA 3'-UTR binding  
GO:0048027  F:mRNA 5'-UTR binding  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000900  F:mRNA regulatory element binding translation repressor activity  
GO:0050821  P:protein stabilization  
GO:0006417  P:regulation of translation  
KEGG cal:CAALFM_C205160CA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08144  CPL  
PF00806  PUF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50302  PUM  
PS50303  PUM_HD  
Amino Acid Sequences MGNKAKGVKRSADKYNNKSSKKAKVAEKLPSPSSESERSEDRIDESDAESSSGDDLDISEDEDELDDLDDEDVKEDNDEEEQEEEEEEDQENGNNDNIDPNKKSSKEQHSEQKKVLNERKLQRKAGIQVQKIKSLWEKLRVTKPAPTKAQRDKLCDEVWELSHDVINDLVMKHDASRVVQTLVKYSSKERRDIIVNSLKGSFYQLATSAYGKYLLIKLLHYGSKESRAIIVDELHGKLRKLMRHKEGAYVVEDLYVLYSTSEQRQQMIREFWGSQYAVFRDSGKGKTVLDITRESAEKKQLIMSNLYGTIKASVEKGSTGFQILHAAMKEYVTVLKDDIDANDSAIRDFIDLLGEQFAELVHTQEGSDVACNLIALANAKERKVIIRGLKTHTNELIKNEYGNIVLITLFMTVDDTVLISKSFGAEIFTSELVPELIQDKFSRRPILYLLKGLDGKYFAPNVKNALLGYEELAYKKTSKKDKQQRKSELLERSISPIYKALLDEESIIKLLQVNIAAQVITELILTSTNVEDVNKNLRPQLVDTIFQKTICGDVLEDYHLLNKVPFVSRLVKSLIQGNEFKFDNESKKLVKTGQAASPGIGSEFAERVADEINVEDWVSGQPAFVLVSVIEVLQLEKSPKAEKLKKAIKKLSLSSDDKGAKLLKNII
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.82
3 0.83
4 0.78
5 0.79
6 0.77
7 0.77
8 0.76
9 0.77
10 0.75
11 0.75
12 0.78
13 0.79
14 0.8
15 0.76
16 0.69
17 0.64
18 0.59
19 0.53
20 0.52
21 0.49
22 0.44
23 0.41
24 0.42
25 0.43
26 0.41
27 0.38
28 0.35
29 0.31
30 0.29
31 0.28
32 0.25
33 0.24
34 0.22
35 0.21
36 0.18
37 0.15
38 0.14
39 0.12
40 0.1
41 0.07
42 0.07
43 0.08
44 0.08
45 0.09
46 0.08
47 0.08
48 0.09
49 0.09
50 0.09
51 0.07
52 0.07
53 0.06
54 0.07
55 0.07
56 0.08
57 0.08
58 0.09
59 0.09
60 0.09
61 0.09
62 0.09
63 0.1
64 0.1
65 0.11
66 0.11
67 0.12
68 0.12
69 0.12
70 0.12
71 0.12
72 0.11
73 0.11
74 0.1
75 0.1
76 0.1
77 0.11
78 0.12
79 0.12
80 0.12
81 0.12
82 0.11
83 0.16
84 0.2
85 0.24
86 0.25
87 0.3
88 0.36
89 0.38
90 0.44
91 0.48
92 0.55
93 0.57
94 0.63
95 0.68
96 0.71
97 0.75
98 0.73
99 0.7
100 0.65
101 0.68
102 0.68
103 0.66
104 0.65
105 0.68
106 0.75
107 0.76
108 0.74
109 0.68
110 0.67
111 0.64
112 0.65
113 0.65
114 0.6
115 0.62
116 0.61
117 0.63
118 0.56
119 0.53
120 0.49
121 0.48
122 0.47
123 0.46
124 0.49
125 0.5
126 0.59
127 0.61
128 0.58
129 0.57
130 0.6
131 0.6
132 0.63
133 0.63
134 0.64
135 0.68
136 0.75
137 0.73
138 0.72
139 0.67
140 0.63
141 0.58
142 0.49
143 0.43
144 0.36
145 0.31
146 0.27
147 0.24
148 0.18
149 0.18
150 0.17
151 0.14
152 0.11
153 0.1
154 0.09
155 0.08
156 0.09
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.11
161 0.12
162 0.11
163 0.14
164 0.15
165 0.16
166 0.18
167 0.18
168 0.19
169 0.22
170 0.23
171 0.22
172 0.26
173 0.33
174 0.35
175 0.39
176 0.37
177 0.38
178 0.41
179 0.42
180 0.44
181 0.44
182 0.41
183 0.38
184 0.37
185 0.33
186 0.27
187 0.28
188 0.21
189 0.12
190 0.12
191 0.12
192 0.12
193 0.14
194 0.14
195 0.12
196 0.11
197 0.11
198 0.1
199 0.11
200 0.11
201 0.12
202 0.11
203 0.11
204 0.13
205 0.15
206 0.17
207 0.16
208 0.19
209 0.18
210 0.23
211 0.23
212 0.22
213 0.21
214 0.2
215 0.2
216 0.18
217 0.17
218 0.13
219 0.15
220 0.15
221 0.16
222 0.17
223 0.16
224 0.19
225 0.22
226 0.26
227 0.32
228 0.4
229 0.43
230 0.5
231 0.51
232 0.52
233 0.5
234 0.47
235 0.4
236 0.33
237 0.27
238 0.19
239 0.17
240 0.12
241 0.09
242 0.07
243 0.05
244 0.04
245 0.05
246 0.06
247 0.09
248 0.13
249 0.13
250 0.15
251 0.18
252 0.2
253 0.24
254 0.25
255 0.24
256 0.22
257 0.23
258 0.21
259 0.22
260 0.19
261 0.15
262 0.15
263 0.15
264 0.14
265 0.14
266 0.14
267 0.13
268 0.17
269 0.17
270 0.17
271 0.18
272 0.16
273 0.18
274 0.21
275 0.19
276 0.19
277 0.19
278 0.18
279 0.19
280 0.2
281 0.19
282 0.18
283 0.21
284 0.19
285 0.18
286 0.21
287 0.22
288 0.22
289 0.23
290 0.21
291 0.18
292 0.19
293 0.18
294 0.14
295 0.12
296 0.11
297 0.09
298 0.09
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.09
307 0.08
308 0.08
309 0.09
310 0.09
311 0.09
312 0.08
313 0.09
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.06
318 0.07
319 0.06
320 0.07
321 0.06
322 0.06
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.08
327 0.08
328 0.08
329 0.09
330 0.09
331 0.08
332 0.08
333 0.08
334 0.06
335 0.06
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.05
348 0.04
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.06
353 0.05
354 0.05
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.05
363 0.06
364 0.1
365 0.12
366 0.12
367 0.13
368 0.13
369 0.14
370 0.16
371 0.2
372 0.21
373 0.27
374 0.31
375 0.35
376 0.41
377 0.41
378 0.42
379 0.4
380 0.38
381 0.33
382 0.32
383 0.32
384 0.25
385 0.24
386 0.22
387 0.18
388 0.15
389 0.13
390 0.1
391 0.06
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.04
405 0.05
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.05
410 0.05
411 0.06
412 0.06
413 0.07
414 0.09
415 0.09
416 0.09
417 0.09
418 0.09
419 0.07
420 0.07
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.08
425 0.09
426 0.12
427 0.17
428 0.21
429 0.26
430 0.24
431 0.26
432 0.3
433 0.37
434 0.36
435 0.35
436 0.32
437 0.31
438 0.32
439 0.31
440 0.26
441 0.19
442 0.18
443 0.17
444 0.18
445 0.16
446 0.17
447 0.18
448 0.2
449 0.2
450 0.2
451 0.17
452 0.15
453 0.14
454 0.13
455 0.12
456 0.11
457 0.11
458 0.1
459 0.11
460 0.11
461 0.13
462 0.18
463 0.24
464 0.33
465 0.41
466 0.52
467 0.62
468 0.72
469 0.8
470 0.86
471 0.88
472 0.85
473 0.84
474 0.81
475 0.78
476 0.71
477 0.64
478 0.54
479 0.49
480 0.44
481 0.36
482 0.3
483 0.24
484 0.2
485 0.18
486 0.18
487 0.15
488 0.13
489 0.13
490 0.14
491 0.13
492 0.13
493 0.12
494 0.11
495 0.09
496 0.1
497 0.1
498 0.09
499 0.09
500 0.09
501 0.09
502 0.1
503 0.09
504 0.08
505 0.07
506 0.06
507 0.05
508 0.05
509 0.04
510 0.04
511 0.05
512 0.05
513 0.06
514 0.06
515 0.06
516 0.07
517 0.08
518 0.09
519 0.11
520 0.2
521 0.21
522 0.22
523 0.24
524 0.26
525 0.27
526 0.28
527 0.35
528 0.29
529 0.31
530 0.31
531 0.36
532 0.35
533 0.33
534 0.31
535 0.22
536 0.2
537 0.17
538 0.16
539 0.1
540 0.1
541 0.12
542 0.13
543 0.13
544 0.12
545 0.14
546 0.14
547 0.14
548 0.12
549 0.12
550 0.14
551 0.16
552 0.17
553 0.19
554 0.25
555 0.26
556 0.29
557 0.32
558 0.3
559 0.29
560 0.35
561 0.35
562 0.32
563 0.35
564 0.34
565 0.34
566 0.33
567 0.32
568 0.29
569 0.3
570 0.31
571 0.31
572 0.34
573 0.33
574 0.36
575 0.39
576 0.38
577 0.4
578 0.4
579 0.41
580 0.41
581 0.44
582 0.41
583 0.38
584 0.36
585 0.3
586 0.24
587 0.19
588 0.15
589 0.11
590 0.11
591 0.11
592 0.1
593 0.1
594 0.1
595 0.11
596 0.1
597 0.08
598 0.09
599 0.09
600 0.09
601 0.09
602 0.08
603 0.08
604 0.08
605 0.1
606 0.08
607 0.08
608 0.07
609 0.08
610 0.08
611 0.08
612 0.08
613 0.06
614 0.07
615 0.07
616 0.07
617 0.07
618 0.07
619 0.07
620 0.07
621 0.1
622 0.11
623 0.13
624 0.16
625 0.19
626 0.25
627 0.36
628 0.43
629 0.49
630 0.58
631 0.67
632 0.73
633 0.8
634 0.82
635 0.8
636 0.8
637 0.78
638 0.77
639 0.75
640 0.72
641 0.64
642 0.64
643 0.58
644 0.51
645 0.48
646 0.43
647 0.37