Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1RC12

Protein Details
Accession N1RC12    Localization Confidence High Confidence Score 22.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
119-145IDATEDKSNKDRKRKRKNENDDLEGRYBasic
412-431FPPMLPRKLRVTRAKDPRKTHydrophilic
474-493GRSAAVQQRHKKRPSTQGASHydrophilic
523-551PKDLKLGKKGKGKGRSSRPQNRGARRAAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
128-135KDRKRKRK
416-442LPRKLRVTRAKDPRKTALAQERARGKN
517-556SAKDGTPKDLKLGKKGKGKGRSSRPQNRGARRAAEWKKKS
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 9.5, cyto_mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MAKRSKGLTASSKAVDALFASSAGPVQAPAKSRYSTLVEQKVREPPKPRVQLEEQDADDEVLSEISEELSFEEDGPSDEEEDGSDASEPEGESEDEQQQEEESSDEPMKDTPVELEDIIDATEDKSNKDRKRKRKNENDDLEGRYLDKLVAEEEAERAGKRQKNDAPNKTEKAVAEDEDAGNDSDIPVHETLAKDSKSSDLEKAARTVFLANVSTEAINSKAAKKTLMAHLSSILDKDATPPQTIESLRFRSVAFAGGSLPKRAAYITKSLMDATTKSANAYVVYSTSAAARKAAAELNGTQVLERHLRVDSVAHPSPTDHRRCVFVGNLGFVDDETVLNTNADGDTTEKKKNKTPSDVEEGLWRTFSTQGKVENVRVVRDSKTRVGKGFAYVQFYDGNDVEAALLLDGKKFPPMLPRKLRVTRAKDPRKTALAQERARGKNVVPNGAAKSTKYKHKATPEEQSMAGRTSKLLGRSAAVQQRHKKRPSTQGASEDAQNIPFNIKGPEQFVFEGRRASAKDGTPKDLKLGKKGKGKGRSSRPQNRGARRAAEWKKKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.29
3 0.21
4 0.17
5 0.12
6 0.11
7 0.1
8 0.09
9 0.1
10 0.09
11 0.09
12 0.08
13 0.09
14 0.12
15 0.16
16 0.2
17 0.24
18 0.25
19 0.26
20 0.3
21 0.35
22 0.39
23 0.44
24 0.51
25 0.51
26 0.53
27 0.57
28 0.62
29 0.6
30 0.6
31 0.58
32 0.58
33 0.63
34 0.7
35 0.67
36 0.66
37 0.68
38 0.69
39 0.69
40 0.66
41 0.56
42 0.47
43 0.46
44 0.38
45 0.3
46 0.22
47 0.15
48 0.09
49 0.07
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.09
60 0.09
61 0.1
62 0.12
63 0.12
64 0.11
65 0.11
66 0.11
67 0.1
68 0.11
69 0.1
70 0.09
71 0.09
72 0.07
73 0.07
74 0.09
75 0.08
76 0.08
77 0.1
78 0.1
79 0.1
80 0.14
81 0.17
82 0.17
83 0.17
84 0.16
85 0.15
86 0.15
87 0.14
88 0.12
89 0.09
90 0.11
91 0.12
92 0.12
93 0.13
94 0.13
95 0.14
96 0.13
97 0.13
98 0.11
99 0.11
100 0.13
101 0.12
102 0.12
103 0.11
104 0.1
105 0.1
106 0.09
107 0.07
108 0.07
109 0.1
110 0.1
111 0.12
112 0.19
113 0.28
114 0.36
115 0.47
116 0.56
117 0.64
118 0.75
119 0.84
120 0.88
121 0.9
122 0.93
123 0.93
124 0.91
125 0.88
126 0.82
127 0.75
128 0.65
129 0.54
130 0.44
131 0.33
132 0.25
133 0.18
134 0.12
135 0.09
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.1
142 0.1
143 0.1
144 0.11
145 0.19
146 0.21
147 0.23
148 0.31
149 0.37
150 0.47
151 0.58
152 0.64
153 0.65
154 0.7
155 0.71
156 0.63
157 0.59
158 0.49
159 0.44
160 0.37
161 0.29
162 0.23
163 0.22
164 0.21
165 0.18
166 0.18
167 0.13
168 0.11
169 0.09
170 0.07
171 0.06
172 0.06
173 0.08
174 0.07
175 0.08
176 0.1
177 0.1
178 0.13
179 0.18
180 0.18
181 0.15
182 0.16
183 0.18
184 0.2
185 0.21
186 0.21
187 0.21
188 0.24
189 0.25
190 0.27
191 0.24
192 0.22
193 0.2
194 0.19
195 0.14
196 0.13
197 0.12
198 0.1
199 0.1
200 0.1
201 0.1
202 0.09
203 0.09
204 0.07
205 0.09
206 0.1
207 0.12
208 0.14
209 0.15
210 0.16
211 0.16
212 0.19
213 0.24
214 0.28
215 0.25
216 0.23
217 0.24
218 0.25
219 0.24
220 0.2
221 0.13
222 0.09
223 0.08
224 0.1
225 0.13
226 0.13
227 0.14
228 0.14
229 0.14
230 0.18
231 0.19
232 0.2
233 0.21
234 0.23
235 0.23
236 0.24
237 0.23
238 0.2
239 0.2
240 0.19
241 0.14
242 0.11
243 0.11
244 0.14
245 0.15
246 0.14
247 0.14
248 0.11
249 0.11
250 0.11
251 0.12
252 0.1
253 0.14
254 0.16
255 0.17
256 0.17
257 0.17
258 0.17
259 0.16
260 0.14
261 0.13
262 0.13
263 0.11
264 0.11
265 0.12
266 0.11
267 0.11
268 0.11
269 0.08
270 0.06
271 0.07
272 0.07
273 0.06
274 0.08
275 0.09
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.09
281 0.1
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.11
286 0.12
287 0.12
288 0.1
289 0.1
290 0.12
291 0.12
292 0.12
293 0.1
294 0.1
295 0.1
296 0.1
297 0.11
298 0.12
299 0.17
300 0.18
301 0.17
302 0.17
303 0.17
304 0.23
305 0.29
306 0.31
307 0.27
308 0.27
309 0.29
310 0.3
311 0.32
312 0.27
313 0.25
314 0.21
315 0.2
316 0.19
317 0.16
318 0.15
319 0.12
320 0.12
321 0.07
322 0.06
323 0.05
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.06
333 0.11
334 0.15
335 0.22
336 0.26
337 0.28
338 0.35
339 0.44
340 0.49
341 0.53
342 0.55
343 0.54
344 0.59
345 0.58
346 0.52
347 0.49
348 0.45
349 0.36
350 0.3
351 0.24
352 0.17
353 0.2
354 0.21
355 0.18
356 0.18
357 0.2
358 0.25
359 0.28
360 0.29
361 0.29
362 0.28
363 0.27
364 0.27
365 0.26
366 0.25
367 0.27
368 0.3
369 0.31
370 0.38
371 0.4
372 0.39
373 0.4
374 0.38
375 0.37
376 0.4
377 0.36
378 0.33
379 0.3
380 0.3
381 0.28
382 0.27
383 0.26
384 0.18
385 0.17
386 0.11
387 0.11
388 0.09
389 0.08
390 0.08
391 0.05
392 0.06
393 0.05
394 0.06
395 0.07
396 0.07
397 0.08
398 0.09
399 0.1
400 0.19
401 0.27
402 0.37
403 0.45
404 0.51
405 0.59
406 0.65
407 0.74
408 0.73
409 0.74
410 0.74
411 0.76
412 0.81
413 0.79
414 0.78
415 0.76
416 0.72
417 0.65
418 0.64
419 0.63
420 0.62
421 0.58
422 0.58
423 0.61
424 0.57
425 0.57
426 0.5
427 0.41
428 0.38
429 0.39
430 0.38
431 0.29
432 0.31
433 0.32
434 0.34
435 0.34
436 0.29
437 0.34
438 0.34
439 0.42
440 0.45
441 0.47
442 0.51
443 0.61
444 0.69
445 0.66
446 0.72
447 0.69
448 0.66
449 0.61
450 0.55
451 0.47
452 0.39
453 0.34
454 0.24
455 0.18
456 0.18
457 0.2
458 0.2
459 0.21
460 0.2
461 0.2
462 0.24
463 0.31
464 0.35
465 0.38
466 0.44
467 0.51
468 0.61
469 0.69
470 0.72
471 0.73
472 0.74
473 0.79
474 0.8
475 0.79
476 0.76
477 0.73
478 0.72
479 0.66
480 0.6
481 0.52
482 0.42
483 0.36
484 0.29
485 0.22
486 0.19
487 0.17
488 0.16
489 0.16
490 0.18
491 0.18
492 0.21
493 0.22
494 0.24
495 0.25
496 0.27
497 0.29
498 0.28
499 0.29
500 0.26
501 0.29
502 0.28
503 0.31
504 0.33
505 0.34
506 0.43
507 0.44
508 0.5
509 0.5
510 0.49
511 0.51
512 0.51
513 0.49
514 0.5
515 0.54
516 0.56
517 0.6
518 0.68
519 0.7
520 0.74
521 0.8
522 0.8
523 0.82
524 0.84
525 0.86
526 0.89
527 0.86
528 0.86
529 0.87
530 0.87
531 0.85
532 0.82
533 0.77
534 0.72
535 0.76
536 0.76