Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1RDI6

Protein Details
Accession N1RDI6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
170-195TKPRPHPNGFPKRRGRPPKQPSPPPEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
141-190RGRGRPKGSTNKSKGLQTAAGARQARQAATKPRPHPNGFPKRRGRPPKQP
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
Amino Acid Sequences MSFESINPGNQSKKTQHTLLPSHITRFGSVSDSLESEDPLARDAPTRSHSQSPVKQHPGSLTPSGRSSLAVVLTRSPAHLEAYRGVSIDEEDGFDAPVTSDLTPRGRPKSLFKAVNALKTSSPGGTQTGVSSDATSTTPARGRGRPKGSTNKSKGLQTAAGARQARQAATKPRPHPNGFPKRRGRPPKQPSPPPETIYYQVDAPIFPFLCEWRDCKAELHNLETLRRHVYIIHGDDINCLWGECGMLEKPSEFETDAGFKEHIEEAHLVPLSWHCGDGFNNNLGERSLPNTAEDVPDYLKDERGNQVTPSIRDQQTAGRRFVYVEKEPAETQGAAHSYERQPPR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.52
3 0.53
4 0.57
5 0.59
6 0.6
7 0.62
8 0.56
9 0.54
10 0.54
11 0.49
12 0.41
13 0.36
14 0.3
15 0.24
16 0.23
17 0.21
18 0.18
19 0.18
20 0.18
21 0.17
22 0.16
23 0.14
24 0.16
25 0.14
26 0.14
27 0.14
28 0.13
29 0.16
30 0.17
31 0.21
32 0.21
33 0.27
34 0.3
35 0.35
36 0.41
37 0.47
38 0.53
39 0.57
40 0.64
41 0.67
42 0.63
43 0.59
44 0.57
45 0.52
46 0.49
47 0.47
48 0.39
49 0.34
50 0.34
51 0.34
52 0.3
53 0.26
54 0.22
55 0.18
56 0.18
57 0.18
58 0.17
59 0.17
60 0.19
61 0.18
62 0.17
63 0.17
64 0.14
65 0.15
66 0.17
67 0.17
68 0.18
69 0.22
70 0.22
71 0.2
72 0.19
73 0.16
74 0.15
75 0.14
76 0.11
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.08
81 0.07
82 0.07
83 0.06
84 0.06
85 0.07
86 0.07
87 0.08
88 0.11
89 0.14
90 0.19
91 0.23
92 0.27
93 0.3
94 0.32
95 0.38
96 0.45
97 0.51
98 0.5
99 0.46
100 0.51
101 0.5
102 0.55
103 0.49
104 0.41
105 0.32
106 0.3
107 0.3
108 0.21
109 0.19
110 0.13
111 0.13
112 0.12
113 0.12
114 0.1
115 0.1
116 0.11
117 0.1
118 0.1
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.1
123 0.09
124 0.1
125 0.12
126 0.16
127 0.2
128 0.24
129 0.3
130 0.38
131 0.44
132 0.47
133 0.51
134 0.58
135 0.62
136 0.67
137 0.66
138 0.64
139 0.6
140 0.57
141 0.52
142 0.43
143 0.37
144 0.27
145 0.28
146 0.22
147 0.26
148 0.24
149 0.23
150 0.24
151 0.24
152 0.23
153 0.18
154 0.21
155 0.24
156 0.31
157 0.39
158 0.4
159 0.47
160 0.53
161 0.54
162 0.58
163 0.6
164 0.64
165 0.63
166 0.68
167 0.69
168 0.7
169 0.78
170 0.8
171 0.77
172 0.77
173 0.8
174 0.81
175 0.82
176 0.82
177 0.78
178 0.76
179 0.73
180 0.64
181 0.58
182 0.5
183 0.44
184 0.37
185 0.32
186 0.24
187 0.21
188 0.18
189 0.15
190 0.13
191 0.12
192 0.1
193 0.09
194 0.1
195 0.09
196 0.11
197 0.12
198 0.14
199 0.14
200 0.16
201 0.17
202 0.18
203 0.22
204 0.27
205 0.27
206 0.28
207 0.29
208 0.28
209 0.3
210 0.31
211 0.28
212 0.23
213 0.22
214 0.19
215 0.16
216 0.19
217 0.22
218 0.23
219 0.23
220 0.22
221 0.21
222 0.22
223 0.21
224 0.19
225 0.12
226 0.09
227 0.07
228 0.06
229 0.06
230 0.05
231 0.07
232 0.07
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.09
237 0.1
238 0.12
239 0.1
240 0.1
241 0.12
242 0.14
243 0.15
244 0.16
245 0.15
246 0.13
247 0.15
248 0.16
249 0.14
250 0.13
251 0.14
252 0.13
253 0.17
254 0.17
255 0.15
256 0.14
257 0.15
258 0.16
259 0.15
260 0.15
261 0.1
262 0.13
263 0.14
264 0.18
265 0.2
266 0.19
267 0.21
268 0.2
269 0.21
270 0.19
271 0.19
272 0.16
273 0.16
274 0.17
275 0.15
276 0.16
277 0.18
278 0.18
279 0.19
280 0.19
281 0.17
282 0.15
283 0.16
284 0.19
285 0.18
286 0.21
287 0.2
288 0.22
289 0.27
290 0.3
291 0.31
292 0.28
293 0.34
294 0.36
295 0.37
296 0.39
297 0.41
298 0.38
299 0.37
300 0.38
301 0.4
302 0.45
303 0.47
304 0.45
305 0.38
306 0.37
307 0.38
308 0.42
309 0.41
310 0.36
311 0.37
312 0.37
313 0.39
314 0.39
315 0.39
316 0.37
317 0.29
318 0.25
319 0.24
320 0.23
321 0.21
322 0.22
323 0.27
324 0.27