Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5ADW5

Protein Details
Accession Q5ADW5    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
46-72DPVVARLKEKRRLEREQKERELREKKGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
51-84RLKEKRRLEREQKERELREKKGLPPKKTTTSKPK
197-230PQRASKPVPVIKAPLPPRQPSSKIKQRLEEKRKS
325-328KRKR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 15.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0042393  F:histone binding  
GO:0006334  P:nucleosome assembly  
GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
KEGG cal:CAALFM_C307630CA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MGLSSILQQIEKKGKIQQKQVPVEKKSDTVVTKDKFKNYSQDRPIDPVVARLKEKRRLEREQKERELREKKGLPPKKTTTSKPKSSTSTRSGSRQPSSQRSRTSSPSLAPQPPQPPQPPKKKLNYNELLKKAATIDHNKLSINLLQKSKSPEAKSKPLDTKSGPAPRQSTQKPIGNPRHTSPPTTAYPQKPHVKPIPQRASKPVPVIKAPLPPRQPSSKIKQRLEEKRKSRSYEEVEEEDDLSDFVEDDEEYDDGYGADEINREEIWAMFNKGKKRSMYYGDDYDSDDMEATGAEIFDEEYQSRLDAEREDRREMEEEKRLQALKRKRLNRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.52
3 0.61
4 0.62
5 0.64
6 0.72
7 0.79
8 0.8
9 0.75
10 0.73
11 0.66
12 0.6
13 0.53
14 0.49
15 0.42
16 0.39
17 0.45
18 0.42
19 0.49
20 0.53
21 0.56
22 0.54
23 0.55
24 0.59
25 0.58
26 0.64
27 0.62
28 0.64
29 0.6
30 0.62
31 0.6
32 0.54
33 0.46
34 0.44
35 0.42
36 0.39
37 0.4
38 0.42
39 0.49
40 0.54
41 0.62
42 0.64
43 0.66
44 0.72
45 0.8
46 0.82
47 0.85
48 0.86
49 0.87
50 0.86
51 0.84
52 0.83
53 0.8
54 0.74
55 0.73
56 0.69
57 0.68
58 0.69
59 0.72
60 0.67
61 0.69
62 0.71
63 0.72
64 0.72
65 0.73
66 0.73
67 0.74
68 0.77
69 0.74
70 0.73
71 0.7
72 0.7
73 0.69
74 0.64
75 0.62
76 0.56
77 0.56
78 0.57
79 0.57
80 0.53
81 0.52
82 0.53
83 0.56
84 0.6
85 0.62
86 0.61
87 0.6
88 0.61
89 0.6
90 0.59
91 0.51
92 0.45
93 0.45
94 0.45
95 0.43
96 0.4
97 0.4
98 0.4
99 0.4
100 0.44
101 0.44
102 0.48
103 0.53
104 0.62
105 0.65
106 0.67
107 0.73
108 0.77
109 0.77
110 0.77
111 0.77
112 0.75
113 0.75
114 0.7
115 0.63
116 0.53
117 0.47
118 0.37
119 0.32
120 0.27
121 0.24
122 0.25
123 0.26
124 0.27
125 0.27
126 0.27
127 0.25
128 0.23
129 0.23
130 0.23
131 0.22
132 0.21
133 0.24
134 0.29
135 0.32
136 0.35
137 0.33
138 0.37
139 0.41
140 0.49
141 0.5
142 0.51
143 0.53
144 0.5
145 0.5
146 0.44
147 0.41
148 0.4
149 0.45
150 0.39
151 0.36
152 0.37
153 0.36
154 0.42
155 0.4
156 0.39
157 0.37
158 0.4
159 0.4
160 0.46
161 0.53
162 0.51
163 0.53
164 0.48
165 0.53
166 0.49
167 0.48
168 0.4
169 0.36
170 0.32
171 0.35
172 0.39
173 0.34
174 0.38
175 0.43
176 0.5
177 0.46
178 0.49
179 0.51
180 0.54
181 0.55
182 0.61
183 0.64
184 0.6
185 0.62
186 0.63
187 0.63
188 0.57
189 0.57
190 0.5
191 0.42
192 0.38
193 0.4
194 0.35
195 0.36
196 0.37
197 0.39
198 0.39
199 0.39
200 0.42
201 0.45
202 0.48
203 0.47
204 0.52
205 0.54
206 0.6
207 0.61
208 0.65
209 0.69
210 0.74
211 0.77
212 0.78
213 0.76
214 0.76
215 0.79
216 0.76
217 0.7
218 0.68
219 0.65
220 0.62
221 0.59
222 0.52
223 0.46
224 0.42
225 0.38
226 0.29
227 0.23
228 0.15
229 0.1
230 0.07
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.04
235 0.05
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.05
245 0.05
246 0.06
247 0.07
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.1
254 0.12
255 0.15
256 0.17
257 0.22
258 0.28
259 0.34
260 0.39
261 0.4
262 0.44
263 0.48
264 0.52
265 0.55
266 0.55
267 0.55
268 0.52
269 0.49
270 0.45
271 0.39
272 0.32
273 0.24
274 0.18
275 0.12
276 0.1
277 0.08
278 0.06
279 0.06
280 0.05
281 0.05
282 0.04
283 0.05
284 0.06
285 0.08
286 0.08
287 0.09
288 0.1
289 0.1
290 0.11
291 0.11
292 0.12
293 0.15
294 0.23
295 0.32
296 0.36
297 0.4
298 0.4
299 0.43
300 0.46
301 0.45
302 0.45
303 0.45
304 0.44
305 0.43
306 0.48
307 0.47
308 0.48
309 0.54
310 0.56
311 0.57
312 0.63