FuNGI

N1R8V4

Protein Details

Accession

N1R8V4

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
451-480	APVLSAKAAKKEKKRKSRETSDKKQKKGQS	Hydrophilic
521-541	ETKLAASKSKKQKTNRAGSPD	Hydrophilic
572-597	SASTPVTSSKKQKKVKEASVPAPRQS	Hydrophilic
621-654	QPPASPSQGKEKRAKKRKDKDGKKTPSGKKETPV	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
457-479	KAAKKEKKRKSRETSDKKQKKGQ
620-650	SQPPASPSQGKEKRAKKRKDKDGKKTPSGKK

Subcellular Location(s)

nucl 24.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013240 DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34
Gene Ontology	GO:0006360 P:transcription by RNA polymerase I
Pfam	View protein in Pfam PF08208 RNA_polI_A34

Amino Acid Sequences

MAPKEPYKVHSLNKHIENTKKGLSAEAQFNRRPGNRAATIKKESSDPNNIFANNDGDDDDESGSGSDSDSSSDGPADFISKLISTTKPASATPRRRSKDDEIADSDAERNASKKSTSVKKTAPAKSKPQPSSDSSSEDESDDEKTKAKTNGTSPTKASESTSSSSESVSDSDSDEEDKKAPKPSTKKQDDSASTSDSSSEDESEDEADAKAKPALNGKAATTPDSSSEDSDSESEDEEQDAKPAAKPAAKPVAPEPGSSSSEEEDSDDEMVDESMHIEDREGQLALPNFIAPDFVLRKGDDGTNGRDVAEICNKANLEGKQFWYFTVPSNVPISVVQNLEIPMNQSQSTDKLFSHNGEDYGVSFESIAPKGNIQIMIPSDRPQYQPATKQIDQVMQVKKITQLGSTNSVAPVPKPAPRAQPTGLKARYQPIGVNEPMGSIGDDEDVEMGDAPVLSAKAAKKEKKRKSRETSDKKQKKGQSIPEPPSSRTTEAPTPDTRKNKRKLATSEDDAVAVAEQLQEETKLAASKSKKQKTNRAGSPDLGSEPASAAAKKYTPVLPPAIPTAGTPTPKSASTPVTSSKKQKKVKEASVPAPRQSVVPIPSIPHSSPPRSSPARAPASQPPASPSQGKEKRAKKRKDKDGKKTPSGKKETPVVPPVPLSSSE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.72
2	0.7
3	0.71
4	0.69
5	0.65
6	0.62
7	0.57
8	0.5
9	0.45
10	0.43
11	0.41
12	0.45
13	0.47
14	0.49
15	0.47
16	0.5
17	0.54
18	0.53
19	0.52
20	0.47
21	0.48
22	0.5
23	0.57
24	0.61
25	0.62
26	0.65
27	0.64
28	0.59
29	0.55
30	0.53
31	0.52
32	0.54
33	0.48
34	0.46
35	0.47
36	0.46
37	0.42
38	0.38
39	0.34
40	0.24
41	0.23
42	0.19
43	0.15
44	0.16
45	0.16
46	0.15
47	0.11
48	0.1
49	0.1
50	0.1
51	0.08
52	0.08
53	0.08
54	0.07
55	0.09
56	0.09
57	0.1
58	0.1
59	0.11
60	0.11
61	0.1
62	0.1
63	0.11
64	0.1
65	0.1
66	0.11
67	0.1
68	0.11
69	0.13
70	0.15
71	0.17
72	0.2
73	0.24
74	0.24
75	0.26
76	0.34
77	0.41
78	0.5
79	0.56
80	0.63
81	0.65
82	0.68
83	0.74
84	0.73
85	0.73
86	0.69
87	0.66
88	0.61
89	0.59
90	0.55
91	0.48
92	0.4
93	0.31
94	0.25
95	0.19
96	0.15
97	0.14
98	0.16
99	0.15
100	0.18
101	0.26
102	0.35
103	0.41
104	0.47
105	0.5
106	0.57
107	0.66
108	0.7
109	0.71
110	0.68
111	0.72
112	0.73
113	0.78
114	0.74
115	0.7
116	0.66
117	0.62
118	0.63
119	0.56
120	0.52
121	0.44
122	0.42
123	0.38
124	0.33
125	0.28
126	0.21
127	0.22
128	0.2
129	0.18
130	0.18
131	0.19
132	0.24
133	0.27
134	0.29
135	0.31
136	0.34
137	0.43
138	0.46
139	0.49
140	0.44
141	0.45
142	0.43
143	0.39
144	0.36
145	0.3
146	0.28
147	0.26
148	0.27
149	0.24
150	0.23
151	0.22
152	0.2
153	0.17
154	0.14
155	0.13
156	0.12
157	0.1
158	0.11
159	0.11
160	0.13
161	0.14
162	0.14
163	0.16
164	0.18
165	0.2
166	0.27
167	0.3
168	0.35
169	0.43
170	0.52
171	0.6
172	0.66
173	0.68
174	0.66
175	0.72
176	0.68
177	0.65
178	0.59
179	0.51
180	0.42
181	0.38
182	0.33
183	0.24
184	0.21
185	0.16
186	0.13
187	0.1
188	0.09
189	0.1
190	0.1
191	0.1
192	0.09
193	0.08
194	0.08
195	0.08
196	0.09
197	0.11
198	0.11
199	0.12
200	0.18
201	0.2
202	0.22
203	0.23
204	0.23
205	0.26
206	0.26
207	0.27
208	0.22
209	0.2
210	0.19
211	0.21
212	0.21
213	0.17
214	0.18
215	0.16
216	0.15
217	0.15
218	0.14
219	0.11
220	0.11
221	0.1
222	0.09
223	0.09
224	0.1
225	0.09
226	0.09
227	0.09
228	0.09
229	0.1
230	0.12
231	0.14
232	0.16
233	0.16
234	0.22
235	0.3
236	0.29
237	0.3
238	0.29
239	0.36
240	0.34
241	0.33
242	0.31
243	0.27
244	0.28
245	0.28
246	0.27
247	0.18
248	0.18
249	0.18
250	0.15
251	0.11
252	0.1
253	0.09
254	0.08
255	0.07
256	0.07
257	0.06
258	0.06
259	0.05
260	0.04
261	0.04
262	0.05
263	0.05
264	0.05
265	0.07
266	0.08
267	0.09
268	0.08
269	0.08
270	0.11
271	0.11
272	0.12
273	0.09
274	0.09
275	0.07
276	0.07
277	0.08
278	0.04
279	0.08
280	0.09
281	0.1
282	0.11
283	0.11
284	0.12
285	0.13
286	0.14
287	0.14
288	0.15
289	0.17
290	0.18
291	0.19
292	0.18
293	0.17
294	0.17
295	0.16
296	0.19
297	0.17
298	0.14
299	0.16
300	0.16
301	0.16
302	0.2
303	0.18
304	0.18
305	0.19
306	0.21
307	0.22
308	0.22
309	0.22
310	0.2
311	0.19
312	0.16
313	0.19
314	0.17
315	0.16
316	0.17
317	0.16
318	0.14
319	0.14
320	0.14
321	0.11
322	0.11
323	0.1
324	0.09
325	0.1
326	0.09
327	0.09
328	0.09
329	0.08
330	0.1
331	0.09
332	0.09
333	0.09
334	0.11
335	0.13
336	0.13
337	0.12
338	0.13
339	0.14
340	0.15
341	0.17
342	0.16
343	0.15
344	0.14
345	0.14
346	0.11
347	0.12
348	0.11
349	0.08
350	0.07
351	0.07
352	0.09
353	0.09
354	0.1
355	0.08
356	0.08
357	0.09
358	0.1
359	0.11
360	0.08
361	0.1
362	0.1
363	0.13
364	0.13
365	0.14
366	0.15
367	0.16
368	0.18
369	0.18
370	0.22
371	0.23
372	0.28
373	0.33
374	0.39
375	0.38
376	0.41
377	0.4
378	0.38
379	0.37
380	0.39
381	0.35
382	0.29
383	0.29
384	0.26
385	0.26
386	0.26
387	0.24
388	0.18
389	0.17
390	0.18
391	0.22
392	0.22
393	0.21
394	0.18
395	0.19
396	0.17
397	0.15
398	0.17
399	0.14
400	0.17
401	0.2
402	0.23
403	0.31
404	0.34
405	0.4
406	0.37
407	0.43
408	0.43
409	0.49
410	0.47
411	0.41
412	0.39
413	0.38
414	0.37
415	0.3
416	0.29
417	0.23
418	0.26
419	0.24
420	0.24
421	0.2
422	0.18
423	0.17
424	0.15
425	0.11
426	0.06
427	0.06
428	0.05
429	0.05
430	0.05
431	0.05
432	0.04
433	0.04
434	0.04
435	0.04
436	0.03
437	0.03
438	0.03
439	0.04
440	0.04
441	0.04
442	0.07
443	0.08
444	0.16
445	0.24
446	0.32
447	0.42
448	0.53
449	0.63
450	0.71
451	0.8
452	0.83
453	0.86
454	0.9
455	0.91
456	0.91
457	0.92
458	0.93
459	0.91
460	0.86
461	0.85
462	0.8
463	0.78
464	0.77
465	0.75
466	0.75
467	0.76
468	0.76
469	0.76
470	0.73
471	0.65
472	0.61
473	0.55
474	0.47
475	0.39
476	0.38
477	0.34
478	0.35
479	0.38
480	0.39
481	0.41
482	0.46
483	0.54
484	0.59
485	0.63
486	0.68
487	0.72
488	0.72
489	0.75
490	0.75
491	0.74
492	0.72
493	0.67
494	0.64
495	0.55
496	0.49
497	0.4
498	0.32
499	0.23
500	0.15
501	0.1
502	0.05
503	0.05
504	0.05
505	0.06
506	0.06
507	0.06
508	0.07
509	0.07
510	0.09
511	0.09
512	0.16
513	0.2
514	0.29
515	0.4
516	0.48
517	0.55
518	0.62
519	0.73
520	0.76
521	0.83
522	0.81
523	0.79
524	0.74
525	0.68
526	0.63
527	0.54
528	0.45
529	0.36
530	0.28
531	0.2
532	0.17
533	0.16
534	0.14
535	0.12
536	0.12
537	0.13
538	0.13
539	0.14
540	0.17
541	0.19
542	0.2
543	0.24
544	0.28
545	0.27
546	0.28
547	0.3
548	0.28
549	0.24
550	0.21
551	0.24
552	0.24
553	0.26
554	0.25
555	0.25
556	0.26
557	0.27
558	0.29
559	0.27
560	0.27
561	0.27
562	0.3
563	0.35
564	0.4
565	0.46
566	0.54
567	0.6
568	0.65
569	0.71
570	0.76
571	0.78
572	0.81
573	0.85
574	0.85
575	0.83
576	0.83
577	0.85
578	0.81
579	0.73
580	0.66
581	0.56
582	0.46
583	0.4
584	0.37
585	0.29
586	0.28
587	0.26
588	0.26
589	0.29
590	0.33
591	0.31
592	0.33
593	0.37
594	0.39
595	0.41
596	0.43
597	0.48
598	0.49
599	0.52
600	0.51
601	0.54
602	0.57
603	0.55
604	0.56
605	0.57
606	0.6
607	0.59
608	0.51
609	0.46
610	0.43
611	0.45
612	0.44
613	0.38
614	0.41
615	0.46
616	0.52
617	0.58
618	0.62
619	0.7
620	0.76
621	0.84
622	0.84
623	0.87
624	0.91
625	0.93
626	0.94
627	0.94
628	0.95
629	0.94
630	0.94
631	0.93
632	0.92
633	0.91
634	0.9
635	0.84
636	0.79
637	0.78
638	0.74
639	0.71
640	0.69
641	0.61
642	0.55
643	0.51
644	0.47

N1R8V4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer