Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0D0I9

Protein Details
Accession B0D0I9    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
242-263LTPTSRRRLQKRIYMRRKRAEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
248-263RRLQKRIYMRRKRAEA
271-295ESARLRPGRKIRDKPVRLRPKTYKK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039601  Rrn5  
Gene Ontology GO:0000500  C:RNA polymerase I upstream activating factor complex  
GO:0042790  P:nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_313665  -  
Amino Acid Sequences MGYEAEFQKHLAEVQCHLSGDYGKQLPPSFVHPSTYWSSTEKNAFFHALSIHSRLRPDLIAASIGTKSVLDVCAYLDILHVAAIDANSPIARLSLPCAMEVSESWMNWEEAAASRIQQCQLDEGKTNPGTSYSVATIECQKFNLASGENEVNPPQQKEALKMLDACHLAVMESMLREAEEKGIGLEQDVGTTSNTDYPRDAVCQSPPVTSSPDNIESDNSQILQLRSPTPTPPYQQDDNLNLTPTSRRRLQKRIYMRRKRAEAMGEAFDPESARLRPGRKIRDKPVRLRPKTYKKTANLNKGPISNVDDHAPTKHPNKGGLNRPYRIKQQFMERKIDAQTLNEHDLGFLHLSTLARFMKIFRSGYDFPKAGAEAAISDDTIRLLTSIAVEFTTELVHLSMTLREQERSVKGNIKVWRQNHEEVTPEHVRQGLTMMGATYSSKESYFKTLLGPEASLIADEREPSPPGEGNNKSIDHTNEDGIPIYPRATIHNGTHLEQVTLPLSLSMVDSFQEEDSKCFNTLMPPEEEDGDLELELDAEMEIDDFDMHRSKEYEDRLWDSESLDIIRE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.29
3 0.28
4 0.28
5 0.26
6 0.23
7 0.22
8 0.27
9 0.25
10 0.24
11 0.28
12 0.29
13 0.29
14 0.29
15 0.33
16 0.34
17 0.32
18 0.35
19 0.31
20 0.35
21 0.38
22 0.39
23 0.35
24 0.31
25 0.32
26 0.33
27 0.41
28 0.37
29 0.34
30 0.35
31 0.35
32 0.32
33 0.31
34 0.27
35 0.23
36 0.24
37 0.27
38 0.29
39 0.29
40 0.3
41 0.29
42 0.3
43 0.27
44 0.26
45 0.23
46 0.19
47 0.18
48 0.17
49 0.18
50 0.16
51 0.15
52 0.13
53 0.1
54 0.09
55 0.1
56 0.1
57 0.09
58 0.09
59 0.1
60 0.11
61 0.11
62 0.11
63 0.09
64 0.08
65 0.08
66 0.08
67 0.07
68 0.05
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.06
80 0.1
81 0.15
82 0.15
83 0.16
84 0.16
85 0.16
86 0.17
87 0.16
88 0.2
89 0.17
90 0.16
91 0.18
92 0.2
93 0.19
94 0.18
95 0.18
96 0.12
97 0.11
98 0.12
99 0.1
100 0.1
101 0.13
102 0.16
103 0.17
104 0.18
105 0.17
106 0.21
107 0.24
108 0.25
109 0.25
110 0.24
111 0.3
112 0.3
113 0.3
114 0.24
115 0.22
116 0.21
117 0.2
118 0.21
119 0.14
120 0.14
121 0.14
122 0.15
123 0.22
124 0.24
125 0.23
126 0.21
127 0.21
128 0.19
129 0.2
130 0.22
131 0.15
132 0.13
133 0.17
134 0.19
135 0.19
136 0.2
137 0.19
138 0.2
139 0.21
140 0.22
141 0.19
142 0.22
143 0.22
144 0.24
145 0.3
146 0.28
147 0.27
148 0.28
149 0.27
150 0.27
151 0.27
152 0.23
153 0.17
154 0.15
155 0.13
156 0.11
157 0.1
158 0.06
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.06
164 0.06
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.08
170 0.08
171 0.07
172 0.09
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.08
177 0.07
178 0.08
179 0.08
180 0.12
181 0.13
182 0.13
183 0.14
184 0.15
185 0.16
186 0.17
187 0.18
188 0.14
189 0.15
190 0.2
191 0.21
192 0.2
193 0.19
194 0.19
195 0.22
196 0.21
197 0.21
198 0.2
199 0.23
200 0.23
201 0.22
202 0.22
203 0.18
204 0.19
205 0.18
206 0.14
207 0.11
208 0.12
209 0.12
210 0.12
211 0.14
212 0.14
213 0.15
214 0.16
215 0.17
216 0.19
217 0.22
218 0.23
219 0.26
220 0.3
221 0.31
222 0.33
223 0.35
224 0.34
225 0.36
226 0.34
227 0.3
228 0.24
229 0.22
230 0.23
231 0.22
232 0.23
233 0.25
234 0.3
235 0.36
236 0.45
237 0.51
238 0.56
239 0.65
240 0.72
241 0.76
242 0.81
243 0.84
244 0.82
245 0.8
246 0.72
247 0.65
248 0.57
249 0.49
250 0.42
251 0.35
252 0.27
253 0.23
254 0.21
255 0.17
256 0.13
257 0.1
258 0.09
259 0.07
260 0.09
261 0.12
262 0.14
263 0.21
264 0.28
265 0.38
266 0.45
267 0.52
268 0.61
269 0.68
270 0.72
271 0.75
272 0.78
273 0.79
274 0.73
275 0.74
276 0.74
277 0.75
278 0.76
279 0.75
280 0.73
281 0.66
282 0.74
283 0.74
284 0.74
285 0.68
286 0.65
287 0.6
288 0.52
289 0.49
290 0.39
291 0.35
292 0.26
293 0.22
294 0.18
295 0.17
296 0.16
297 0.17
298 0.17
299 0.17
300 0.19
301 0.22
302 0.22
303 0.26
304 0.32
305 0.38
306 0.45
307 0.51
308 0.54
309 0.53
310 0.56
311 0.55
312 0.57
313 0.53
314 0.47
315 0.4
316 0.45
317 0.51
318 0.51
319 0.54
320 0.46
321 0.45
322 0.43
323 0.44
324 0.33
325 0.26
326 0.26
327 0.22
328 0.24
329 0.22
330 0.2
331 0.16
332 0.16
333 0.16
334 0.12
335 0.08
336 0.06
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.11
341 0.1
342 0.1
343 0.1
344 0.11
345 0.15
346 0.19
347 0.2
348 0.17
349 0.24
350 0.27
351 0.3
352 0.35
353 0.3
354 0.26
355 0.27
356 0.26
357 0.19
358 0.16
359 0.12
360 0.07
361 0.09
362 0.09
363 0.07
364 0.07
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.05
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.06
386 0.06
387 0.07
388 0.11
389 0.12
390 0.13
391 0.14
392 0.19
393 0.22
394 0.24
395 0.27
396 0.3
397 0.31
398 0.37
399 0.42
400 0.46
401 0.49
402 0.49
403 0.53
404 0.52
405 0.54
406 0.52
407 0.48
408 0.43
409 0.37
410 0.41
411 0.37
412 0.32
413 0.28
414 0.26
415 0.24
416 0.2
417 0.21
418 0.14
419 0.11
420 0.11
421 0.09
422 0.07
423 0.08
424 0.08
425 0.08
426 0.09
427 0.09
428 0.1
429 0.11
430 0.13
431 0.19
432 0.2
433 0.2
434 0.21
435 0.22
436 0.25
437 0.24
438 0.23
439 0.16
440 0.16
441 0.15
442 0.13
443 0.11
444 0.09
445 0.09
446 0.1
447 0.11
448 0.12
449 0.13
450 0.14
451 0.16
452 0.17
453 0.19
454 0.27
455 0.28
456 0.3
457 0.34
458 0.34
459 0.33
460 0.35
461 0.34
462 0.31
463 0.31
464 0.29
465 0.24
466 0.24
467 0.24
468 0.2
469 0.2
470 0.15
471 0.14
472 0.13
473 0.13
474 0.16
475 0.21
476 0.24
477 0.24
478 0.31
479 0.33
480 0.34
481 0.39
482 0.35
483 0.31
484 0.27
485 0.27
486 0.2
487 0.17
488 0.15
489 0.1
490 0.09
491 0.09
492 0.09
493 0.08
494 0.07
495 0.07
496 0.08
497 0.09
498 0.1
499 0.15
500 0.14
501 0.16
502 0.19
503 0.21
504 0.22
505 0.21
506 0.21
507 0.22
508 0.26
509 0.29
510 0.29
511 0.29
512 0.3
513 0.3
514 0.3
515 0.24
516 0.21
517 0.17
518 0.14
519 0.12
520 0.1
521 0.08
522 0.08
523 0.07
524 0.05
525 0.04
526 0.04
527 0.04
528 0.04
529 0.04
530 0.05
531 0.05
532 0.08
533 0.13
534 0.13
535 0.16
536 0.18
537 0.21
538 0.28
539 0.34
540 0.38
541 0.4
542 0.46
543 0.46
544 0.48
545 0.45
546 0.39
547 0.35
548 0.3