Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0CRJ5

Protein Details
Accession B0CRJ5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
129-154YSLKTEYSKEKYKKRKEAKYSKSFTTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
141-144KKRK
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto 12, cyto_nucl 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_301185  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MSTSNINSELRTSRIQSGDMVLVRLPNGDVRSIKPERDSTVVIGKFGSFFANELIDEQYGLTFEILGKHLKVVPPRTLQEVEDTDATNELINDGEFVQPLTLEEIQALKQSGVHASDIIKRQIEQHANYSLKTEYSKEKYKKRKEAKYSKSFTTIEPTLFNVCEYWFIKDQNRIRDIRIDSLSQILNLANIRPGGKYLAIDDASGIVVSGILERLGGEGKLITICDTDSPPAYPVMSQMNFKTGITTVLASLNWATCQKDYTPVLPPSELPSDQIRSERQKSRLNKRKAALDFLNKTRDDLFAGGFDGLIVASEYEPHSIIEKMAPYLAGSASIVVHTPHVQVAADLQTRLRNLPQYLCPTVTESWLRRYQVLPGRTHPTMAMSGSGGFIMHAIKMLVAFHYSND
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.35
3 0.32
4 0.33
5 0.34
6 0.31
7 0.28
8 0.22
9 0.21
10 0.2
11 0.19
12 0.17
13 0.15
14 0.15
15 0.19
16 0.2
17 0.22
18 0.31
19 0.34
20 0.36
21 0.37
22 0.4
23 0.39
24 0.42
25 0.41
26 0.35
27 0.41
28 0.39
29 0.34
30 0.3
31 0.27
32 0.23
33 0.21
34 0.19
35 0.1
36 0.1
37 0.11
38 0.11
39 0.11
40 0.12
41 0.13
42 0.12
43 0.11
44 0.11
45 0.09
46 0.08
47 0.09
48 0.07
49 0.06
50 0.06
51 0.09
52 0.11
53 0.12
54 0.12
55 0.14
56 0.17
57 0.2
58 0.27
59 0.29
60 0.35
61 0.39
62 0.41
63 0.45
64 0.44
65 0.41
66 0.4
67 0.37
68 0.33
69 0.28
70 0.27
71 0.21
72 0.2
73 0.19
74 0.13
75 0.1
76 0.08
77 0.07
78 0.06
79 0.06
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.06
86 0.07
87 0.1
88 0.09
89 0.08
90 0.09
91 0.1
92 0.11
93 0.13
94 0.13
95 0.09
96 0.1
97 0.11
98 0.12
99 0.12
100 0.12
101 0.12
102 0.13
103 0.19
104 0.22
105 0.23
106 0.22
107 0.21
108 0.24
109 0.3
110 0.34
111 0.31
112 0.31
113 0.37
114 0.37
115 0.37
116 0.36
117 0.28
118 0.24
119 0.23
120 0.21
121 0.21
122 0.26
123 0.36
124 0.42
125 0.51
126 0.61
127 0.7
128 0.78
129 0.8
130 0.84
131 0.86
132 0.89
133 0.9
134 0.9
135 0.85
136 0.77
137 0.73
138 0.64
139 0.54
140 0.49
141 0.4
142 0.31
143 0.27
144 0.25
145 0.2
146 0.19
147 0.18
148 0.12
149 0.1
150 0.13
151 0.13
152 0.15
153 0.16
154 0.18
155 0.22
156 0.29
157 0.34
158 0.37
159 0.41
160 0.39
161 0.38
162 0.42
163 0.41
164 0.38
165 0.35
166 0.28
167 0.24
168 0.25
169 0.24
170 0.17
171 0.15
172 0.1
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.07
177 0.08
178 0.08
179 0.07
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.11
186 0.1
187 0.1
188 0.1
189 0.09
190 0.08
191 0.08
192 0.07
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.02
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.05
212 0.06
213 0.07
214 0.07
215 0.08
216 0.08
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.08
221 0.09
222 0.14
223 0.14
224 0.15
225 0.15
226 0.17
227 0.17
228 0.17
229 0.17
230 0.11
231 0.11
232 0.11
233 0.11
234 0.09
235 0.09
236 0.09
237 0.08
238 0.09
239 0.08
240 0.08
241 0.09
242 0.09
243 0.08
244 0.1
245 0.11
246 0.17
247 0.18
248 0.2
249 0.26
250 0.28
251 0.29
252 0.28
253 0.28
254 0.26
255 0.28
256 0.25
257 0.2
258 0.21
259 0.22
260 0.23
261 0.25
262 0.27
263 0.3
264 0.38
265 0.43
266 0.46
267 0.52
268 0.6
269 0.69
270 0.74
271 0.76
272 0.76
273 0.72
274 0.75
275 0.69
276 0.67
277 0.62
278 0.61
279 0.58
280 0.55
281 0.58
282 0.49
283 0.48
284 0.41
285 0.35
286 0.27
287 0.22
288 0.18
289 0.12
290 0.13
291 0.12
292 0.1
293 0.09
294 0.07
295 0.06
296 0.05
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.05
301 0.06
302 0.07
303 0.08
304 0.08
305 0.1
306 0.1
307 0.11
308 0.12
309 0.13
310 0.13
311 0.13
312 0.12
313 0.11
314 0.12
315 0.11
316 0.09
317 0.08
318 0.08
319 0.07
320 0.07
321 0.08
322 0.07
323 0.09
324 0.09
325 0.1
326 0.1
327 0.11
328 0.1
329 0.1
330 0.12
331 0.17
332 0.17
333 0.17
334 0.18
335 0.2
336 0.22
337 0.24
338 0.25
339 0.25
340 0.26
341 0.31
342 0.37
343 0.41
344 0.43
345 0.42
346 0.4
347 0.38
348 0.36
349 0.36
350 0.36
351 0.32
352 0.36
353 0.41
354 0.42
355 0.4
356 0.4
357 0.44
358 0.45
359 0.49
360 0.47
361 0.46
362 0.52
363 0.5
364 0.5
365 0.41
366 0.36
367 0.32
368 0.28
369 0.23
370 0.16
371 0.16
372 0.15
373 0.15
374 0.11
375 0.08
376 0.08
377 0.08
378 0.07
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.08
383 0.09
384 0.09
385 0.11