Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1RB00

Protein Details
Accession N1RB00    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
562-586HPLIIPKRSRQKPTRRHSLSKRVVSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
569-577RSRQKPTRR
Subcellular Location(s) extr 10, mito 8, cyto 4, mito_nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012341  6hp_glycosidase-like_sf  
IPR044674  EDEM1/2/3  
IPR001382  Glyco_hydro_47  
IPR036026  Seven-hairpin_glycosidases  
Gene Ontology GO:0044322  C:endoplasmic reticulum quality control compartment  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005509  F:calcium ion binding  
GO:0004571  F:mannosyl-oligosaccharide 1,2-alpha-mannosidase activity  
GO:0005975  P:carbohydrate metabolic process  
GO:1904380  P:endoplasmic reticulum mannose trimming  
GO:1904382  P:mannose trimming involved in glycoprotein ERAD pathway  
GO:0006486  P:protein glycosylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF01532  Glyco_hydro_47  
Amino Acid Sequences MSRRPRHWLFEPGGMMLLVWVQLLIWASLSWTAQAMRQDHLVRLRQQTVDMFYHGFGNYMKYAFPEDELRPLTCSPLTRDRENPAHIGLNDALGNYSLTLIDSLSTLAILAGGPEDASGTGSKALSDFQDGIADFVRYYGDGRPGVSGQGIRATGFDLDSKVQVFETVIRGLGGLLSAHLFAIGELPINGYTVQPAWATQADDPLELAPITWPNGFKYDGQLLRLALDLGQRLLPAFYTDTGIPYPRVNLRHGIPFYTNSPLFRHMESKPETASGEITETCSAGAGSLTLEFTVLSRLSGDVRFEQAAKRAFWAVWGRRSEIGLVGNGLDAEGGQWIGPHAGIGAGMDSFFEYALKSHILLSGHGMPNKSTTSRQSSTEWLDPNVLHPPLPTELQTSEAFLDAWHQAHASVKRYFLGAFYPGLLAMAGEVDEAVEANLVYTALWTRYAALPERWSVRENTVDQGLGWWPGRPEFIESTYYIYRATQDPWYLHVGEMVLKDIERRCRAPCGWAGLQDVRTGELSDRMESFFLGETTKYMYLLFDPDHALNKVDAAFVFSTEGHPLIIPKRSRQKPTRRHSLSKRVVSKNDTIDESFTHSCPVPTVPGLSGSATAARPDLFSVALFVDLHNTPNVHGPLEAVEKGHVTRYRAKTNHTMFPWTLPPTMLPHDGVCAAPVERVMTWIEFPPGDTASSLVSRFGTSLVWYSHNGPTVRNLDGMRLQLEQQKGGKGADRSWRITHAASRELGRHENVFFHAEHVRSYKDDAFTCIRRKDIVEIDLLLDTPEKSNASAPAPAQGVNVSSEILPSHAALPSESLLKSLLRAVSSVFEPAYTDLPETETDGPGPTILRWTAYTSTGPGAFPLPPITDTPMVGSPSYNSRKPVANFPWKTVFLGGEACGAPLPESSSRQHQIIVIRRGGCSFSEKLERIPSFPASPHTLQLVIVIDEGDDSEEGPDEIVRPLLTTAQVTPRGMGRLNGVPLVLMRGAKGDYERFGEAKGVGMRRKYVVESQGMLIENAIVL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.3
3 0.21
4 0.16
5 0.09
6 0.06
7 0.05
8 0.04
9 0.06
10 0.07
11 0.07
12 0.07
13 0.06
14 0.08
15 0.1
16 0.1
17 0.09
18 0.1
19 0.11
20 0.14
21 0.2
22 0.21
23 0.21
24 0.28
25 0.3
26 0.33
27 0.4
28 0.44
29 0.45
30 0.5
31 0.53
32 0.47
33 0.48
34 0.47
35 0.45
36 0.41
37 0.37
38 0.31
39 0.26
40 0.28
41 0.25
42 0.22
43 0.17
44 0.18
45 0.18
46 0.17
47 0.17
48 0.15
49 0.19
50 0.18
51 0.2
52 0.22
53 0.21
54 0.28
55 0.31
56 0.31
57 0.3
58 0.3
59 0.31
60 0.28
61 0.29
62 0.28
63 0.36
64 0.4
65 0.43
66 0.48
67 0.52
68 0.57
69 0.58
70 0.54
71 0.47
72 0.47
73 0.42
74 0.41
75 0.33
76 0.28
77 0.24
78 0.21
79 0.18
80 0.13
81 0.13
82 0.09
83 0.09
84 0.06
85 0.06
86 0.07
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.05
103 0.04
104 0.06
105 0.06
106 0.07
107 0.09
108 0.09
109 0.1
110 0.1
111 0.11
112 0.11
113 0.14
114 0.14
115 0.12
116 0.16
117 0.16
118 0.17
119 0.16
120 0.16
121 0.12
122 0.11
123 0.11
124 0.08
125 0.1
126 0.12
127 0.16
128 0.17
129 0.18
130 0.2
131 0.2
132 0.2
133 0.21
134 0.19
135 0.14
136 0.18
137 0.17
138 0.15
139 0.15
140 0.15
141 0.13
142 0.13
143 0.14
144 0.11
145 0.12
146 0.13
147 0.14
148 0.13
149 0.12
150 0.12
151 0.12
152 0.12
153 0.14
154 0.14
155 0.13
156 0.12
157 0.12
158 0.12
159 0.11
160 0.09
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.04
169 0.06
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.08
177 0.07
178 0.08
179 0.08
180 0.09
181 0.08
182 0.09
183 0.11
184 0.12
185 0.14
186 0.14
187 0.18
188 0.18
189 0.18
190 0.18
191 0.15
192 0.14
193 0.12
194 0.12
195 0.08
196 0.09
197 0.11
198 0.12
199 0.13
200 0.13
201 0.16
202 0.18
203 0.17
204 0.2
205 0.26
206 0.27
207 0.27
208 0.28
209 0.26
210 0.24
211 0.24
212 0.19
213 0.12
214 0.12
215 0.11
216 0.1
217 0.11
218 0.1
219 0.1
220 0.1
221 0.09
222 0.08
223 0.09
224 0.09
225 0.11
226 0.11
227 0.13
228 0.14
229 0.15
230 0.15
231 0.14
232 0.17
233 0.2
234 0.22
235 0.23
236 0.26
237 0.27
238 0.34
239 0.35
240 0.34
241 0.31
242 0.31
243 0.31
244 0.33
245 0.31
246 0.25
247 0.26
248 0.28
249 0.28
250 0.27
251 0.3
252 0.24
253 0.31
254 0.34
255 0.34
256 0.31
257 0.3
258 0.29
259 0.25
260 0.24
261 0.17
262 0.14
263 0.12
264 0.13
265 0.12
266 0.11
267 0.1
268 0.09
269 0.08
270 0.06
271 0.06
272 0.04
273 0.04
274 0.05
275 0.05
276 0.04
277 0.05
278 0.04
279 0.05
280 0.07
281 0.07
282 0.06
283 0.06
284 0.07
285 0.09
286 0.11
287 0.13
288 0.12
289 0.14
290 0.15
291 0.15
292 0.16
293 0.2
294 0.23
295 0.21
296 0.21
297 0.21
298 0.19
299 0.24
300 0.31
301 0.3
302 0.34
303 0.35
304 0.36
305 0.36
306 0.36
307 0.32
308 0.25
309 0.22
310 0.15
311 0.13
312 0.11
313 0.1
314 0.09
315 0.08
316 0.05
317 0.04
318 0.03
319 0.03
320 0.03
321 0.03
322 0.03
323 0.03
324 0.04
325 0.04
326 0.04
327 0.03
328 0.03
329 0.03
330 0.03
331 0.03
332 0.03
333 0.03
334 0.03
335 0.03
336 0.03
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.06
342 0.06
343 0.07
344 0.07
345 0.1
346 0.1
347 0.1
348 0.13
349 0.19
350 0.21
351 0.22
352 0.22
353 0.2
354 0.22
355 0.23
356 0.22
357 0.17
358 0.2
359 0.26
360 0.28
361 0.3
362 0.3
363 0.33
364 0.36
365 0.39
366 0.35
367 0.28
368 0.28
369 0.25
370 0.24
371 0.24
372 0.2
373 0.15
374 0.13
375 0.14
376 0.14
377 0.15
378 0.14
379 0.12
380 0.12
381 0.15
382 0.16
383 0.14
384 0.13
385 0.12
386 0.12
387 0.09
388 0.11
389 0.08
390 0.09
391 0.08
392 0.08
393 0.08
394 0.12
395 0.16
396 0.18
397 0.19
398 0.19
399 0.19
400 0.2
401 0.19
402 0.15
403 0.14
404 0.11
405 0.09
406 0.09
407 0.09
408 0.08
409 0.08
410 0.07
411 0.05
412 0.04
413 0.03
414 0.03
415 0.02
416 0.02
417 0.02
418 0.02
419 0.02
420 0.02
421 0.02
422 0.02
423 0.02
424 0.03
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.04
429 0.04
430 0.05
431 0.05
432 0.06
433 0.08
434 0.1
435 0.12
436 0.13
437 0.14
438 0.16
439 0.19
440 0.19
441 0.19
442 0.19
443 0.19
444 0.22
445 0.22
446 0.21
447 0.19
448 0.17
449 0.16
450 0.15
451 0.13
452 0.11
453 0.1
454 0.09
455 0.08
456 0.09
457 0.09
458 0.09
459 0.11
460 0.11
461 0.12
462 0.14
463 0.14
464 0.17
465 0.17
466 0.17
467 0.14
468 0.13
469 0.13
470 0.12
471 0.13
472 0.12
473 0.14
474 0.14
475 0.16
476 0.18
477 0.17
478 0.16
479 0.14
480 0.12
481 0.12
482 0.11
483 0.1
484 0.07
485 0.07
486 0.09
487 0.11
488 0.17
489 0.17
490 0.19
491 0.2
492 0.25
493 0.26
494 0.27
495 0.27
496 0.28
497 0.26
498 0.26
499 0.28
500 0.24
501 0.24
502 0.22
503 0.2
504 0.14
505 0.13
506 0.11
507 0.09
508 0.11
509 0.11
510 0.11
511 0.11
512 0.11
513 0.11
514 0.1
515 0.11
516 0.07
517 0.07
518 0.06
519 0.06
520 0.06
521 0.08
522 0.08
523 0.08
524 0.07
525 0.07
526 0.07
527 0.09
528 0.09
529 0.08
530 0.09
531 0.09
532 0.11
533 0.12
534 0.12
535 0.1
536 0.11
537 0.1
538 0.09
539 0.08
540 0.08
541 0.08
542 0.07
543 0.08
544 0.07
545 0.08
546 0.08
547 0.08
548 0.06
549 0.06
550 0.07
551 0.09
552 0.15
553 0.16
554 0.21
555 0.31
556 0.37
557 0.46
558 0.54
559 0.63
560 0.67
561 0.75
562 0.81
563 0.78
564 0.81
565 0.81
566 0.83
567 0.81
568 0.79
569 0.8
570 0.74
571 0.7
572 0.65
573 0.61
574 0.54
575 0.47
576 0.4
577 0.32
578 0.27
579 0.23
580 0.24
581 0.2
582 0.16
583 0.15
584 0.14
585 0.13
586 0.13
587 0.14
588 0.1
589 0.09
590 0.1
591 0.09
592 0.1
593 0.11
594 0.1
595 0.1
596 0.08
597 0.1
598 0.09
599 0.09
600 0.08
601 0.08
602 0.07
603 0.07
604 0.08
605 0.06
606 0.06
607 0.06
608 0.06
609 0.07
610 0.06
611 0.06
612 0.08
613 0.08
614 0.09
615 0.09
616 0.09
617 0.09
618 0.14
619 0.15
620 0.12
621 0.12
622 0.11
623 0.13
624 0.15
625 0.15
626 0.1
627 0.1
628 0.1
629 0.11
630 0.15
631 0.16
632 0.16
633 0.25
634 0.31
635 0.39
636 0.41
637 0.45
638 0.5
639 0.52
640 0.56
641 0.49
642 0.47
643 0.38
644 0.4
645 0.39
646 0.32
647 0.28
648 0.21
649 0.2
650 0.19
651 0.22
652 0.2
653 0.17
654 0.14
655 0.15
656 0.15
657 0.14
658 0.11
659 0.09
660 0.08
661 0.07
662 0.08
663 0.08
664 0.07
665 0.08
666 0.09
667 0.08
668 0.09
669 0.1
670 0.11
671 0.1
672 0.1
673 0.11
674 0.11
675 0.1
676 0.09
677 0.09
678 0.09
679 0.11
680 0.1
681 0.09
682 0.09
683 0.09
684 0.09
685 0.09
686 0.08
687 0.07
688 0.1
689 0.11
690 0.13
691 0.14
692 0.17
693 0.19
694 0.24
695 0.24
696 0.22
697 0.26
698 0.27
699 0.26
700 0.26
701 0.24
702 0.21
703 0.23
704 0.24
705 0.19
706 0.17
707 0.18
708 0.2
709 0.21
710 0.22
711 0.21
712 0.21
713 0.21
714 0.21
715 0.24
716 0.21
717 0.25
718 0.3
719 0.33
720 0.35
721 0.35
722 0.38
723 0.36
724 0.36
725 0.35
726 0.31
727 0.29
728 0.27
729 0.28
730 0.28
731 0.29
732 0.3
733 0.27
734 0.25
735 0.22
736 0.22
737 0.22
738 0.21
739 0.18
740 0.18
741 0.2
742 0.18
743 0.19
744 0.2
745 0.19
746 0.18
747 0.22
748 0.23
749 0.23
750 0.24
751 0.26
752 0.3
753 0.35
754 0.41
755 0.39
756 0.37
757 0.35
758 0.35
759 0.37
760 0.36
761 0.32
762 0.27
763 0.25
764 0.25
765 0.23
766 0.22
767 0.16
768 0.11
769 0.1
770 0.09
771 0.1
772 0.09
773 0.09
774 0.11
775 0.14
776 0.15
777 0.18
778 0.17
779 0.2
780 0.2
781 0.2
782 0.18
783 0.16
784 0.15
785 0.13
786 0.13
787 0.1
788 0.09
789 0.09
790 0.08
791 0.09
792 0.08
793 0.07
794 0.08
795 0.09
796 0.1
797 0.09
798 0.11
799 0.11
800 0.14
801 0.13
802 0.12
803 0.12
804 0.12
805 0.12
806 0.14
807 0.15
808 0.12
809 0.13
810 0.13
811 0.14
812 0.15
813 0.16
814 0.12
815 0.1
816 0.11
817 0.12
818 0.14
819 0.12
820 0.12
821 0.1
822 0.12
823 0.13
824 0.15
825 0.16
826 0.14
827 0.14
828 0.14
829 0.14
830 0.13
831 0.14
832 0.1
833 0.12
834 0.12
835 0.13
836 0.13
837 0.17
838 0.18
839 0.2
840 0.21
841 0.19
842 0.21
843 0.21
844 0.19
845 0.16
846 0.16
847 0.14
848 0.14
849 0.15
850 0.14
851 0.14
852 0.16
853 0.2
854 0.19
855 0.19
856 0.21
857 0.22
858 0.22
859 0.21
860 0.2
861 0.17
862 0.25
863 0.31
864 0.31
865 0.3
866 0.31
867 0.39
868 0.41
869 0.49
870 0.5
871 0.55
872 0.54
873 0.57
874 0.62
875 0.56
876 0.54
877 0.46
878 0.36
879 0.27
880 0.26
881 0.21
882 0.17
883 0.16
884 0.15
885 0.13
886 0.12
887 0.11
888 0.1
889 0.13
890 0.13
891 0.17
892 0.2
893 0.28
894 0.31
895 0.31
896 0.32
897 0.32
898 0.37
899 0.43
900 0.47
901 0.45
902 0.43
903 0.43
904 0.43
905 0.41
906 0.34
907 0.3
908 0.25
909 0.24
910 0.31
911 0.31
912 0.34
913 0.42
914 0.41
915 0.38
916 0.4
917 0.39
918 0.33
919 0.34
920 0.35
921 0.33
922 0.33
923 0.33
924 0.31
925 0.28
926 0.25
927 0.26
928 0.23
929 0.16
930 0.15
931 0.13
932 0.1
933 0.1
934 0.1
935 0.08
936 0.06
937 0.06
938 0.06
939 0.07
940 0.07
941 0.07
942 0.07
943 0.08
944 0.08
945 0.09
946 0.09
947 0.09
948 0.1
949 0.12
950 0.13
951 0.14
952 0.16
953 0.23
954 0.27
955 0.27
956 0.28
957 0.29
958 0.3
959 0.3
960 0.28
961 0.25
962 0.27
963 0.28
964 0.27
965 0.24
966 0.21
967 0.2
968 0.22
969 0.19
970 0.14
971 0.12
972 0.13
973 0.14
974 0.15
975 0.18
976 0.18
977 0.19
978 0.23
979 0.26
980 0.24
981 0.25
982 0.26
983 0.22
984 0.25
985 0.28
986 0.31
987 0.33
988 0.36
989 0.38
990 0.38
991 0.41
992 0.4
993 0.4
994 0.4
995 0.41
996 0.4
997 0.38
998 0.4
999 0.38
1000 0.33
1001 0.26