Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1SBD4

Protein Details
Accession N1SBD4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
287-340EKSGEKKDKSDETKRKRKNNEAWSAKHEKEDERVERREKRRKRREAEATSKMTDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
281-281K
284-331LEEEKSGEKKDKSDETKRKRKNNEAWSAKHEKEDERVERREKRRKRRE
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12.5, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025313  DUF4217  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004386  F:helicase activity  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF13959  DUF4217  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MKDGGILEDRKTPASLQMAYMVKPASQKLPALAELLRQLPIKPQRSIVFLSTCAAVDYFQHVLPAILPEGFALVPLHGKHPAKVREKNFNRFLNSVAPTILLTTDLAARGLDIPQVDLVVQIDAPSDPKAFIHRSGRAGRAGRKGLAVVMLHPGREEDYVQFLEIRKTPISKLEKPTVFTSEEDAVAATKKMRDLVLTDRALFDKAQKGFVSWARSYGAHQATSIFRAADLDWADLGNAWGLLRMPRMPELKSWKGDKMCGLEIDWDNYAYKEKTREQARKAALEEEKSGEKKDKSDETKRKRKNNEAWSAKHEKEDERVERREKRRKRREAEATSKMTDEEKFKQMELNELIAEVRRQNREKAAAEAAAAKKDKEDEFAGFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.3
3 0.25
4 0.31
5 0.31
6 0.31
7 0.33
8 0.27
9 0.23
10 0.25
11 0.26
12 0.23
13 0.25
14 0.25
15 0.26
16 0.29
17 0.28
18 0.28
19 0.26
20 0.24
21 0.24
22 0.24
23 0.24
24 0.21
25 0.2
26 0.27
27 0.35
28 0.38
29 0.37
30 0.42
31 0.42
32 0.45
33 0.48
34 0.44
35 0.38
36 0.33
37 0.32
38 0.27
39 0.24
40 0.2
41 0.17
42 0.12
43 0.1
44 0.13
45 0.13
46 0.12
47 0.13
48 0.12
49 0.12
50 0.13
51 0.13
52 0.1
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.09
57 0.08
58 0.08
59 0.07
60 0.06
61 0.09
62 0.1
63 0.13
64 0.18
65 0.19
66 0.22
67 0.31
68 0.39
69 0.46
70 0.54
71 0.58
72 0.63
73 0.7
74 0.76
75 0.76
76 0.73
77 0.69
78 0.61
79 0.57
80 0.53
81 0.47
82 0.39
83 0.3
84 0.24
85 0.19
86 0.19
87 0.16
88 0.09
89 0.07
90 0.06
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.08
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.08
103 0.07
104 0.06
105 0.06
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.06
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.08
116 0.12
117 0.14
118 0.19
119 0.25
120 0.27
121 0.33
122 0.37
123 0.39
124 0.41
125 0.43
126 0.44
127 0.45
128 0.43
129 0.38
130 0.34
131 0.32
132 0.26
133 0.25
134 0.18
135 0.12
136 0.15
137 0.15
138 0.14
139 0.14
140 0.14
141 0.12
142 0.13
143 0.13
144 0.08
145 0.11
146 0.11
147 0.11
148 0.13
149 0.12
150 0.14
151 0.15
152 0.17
153 0.14
154 0.15
155 0.15
156 0.22
157 0.29
158 0.33
159 0.37
160 0.42
161 0.43
162 0.44
163 0.46
164 0.4
165 0.35
166 0.29
167 0.27
168 0.2
169 0.18
170 0.15
171 0.13
172 0.1
173 0.09
174 0.09
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.08
180 0.08
181 0.1
182 0.15
183 0.22
184 0.22
185 0.22
186 0.21
187 0.22
188 0.22
189 0.2
190 0.17
191 0.16
192 0.15
193 0.18
194 0.17
195 0.17
196 0.2
197 0.23
198 0.26
199 0.2
200 0.21
201 0.2
202 0.2
203 0.21
204 0.25
205 0.24
206 0.18
207 0.18
208 0.19
209 0.18
210 0.19
211 0.19
212 0.11
213 0.09
214 0.1
215 0.1
216 0.11
217 0.11
218 0.1
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.08
223 0.08
224 0.05
225 0.04
226 0.03
227 0.04
228 0.04
229 0.05
230 0.06
231 0.07
232 0.09
233 0.13
234 0.16
235 0.17
236 0.22
237 0.3
238 0.35
239 0.39
240 0.41
241 0.42
242 0.41
243 0.42
244 0.4
245 0.36
246 0.32
247 0.28
248 0.26
249 0.25
250 0.24
251 0.24
252 0.21
253 0.17
254 0.16
255 0.15
256 0.18
257 0.14
258 0.15
259 0.19
260 0.22
261 0.29
262 0.39
263 0.46
264 0.48
265 0.56
266 0.58
267 0.57
268 0.55
269 0.54
270 0.48
271 0.43
272 0.4
273 0.34
274 0.35
275 0.31
276 0.32
277 0.31
278 0.29
279 0.29
280 0.34
281 0.4
282 0.43
283 0.53
284 0.62
285 0.67
286 0.76
287 0.82
288 0.86
289 0.87
290 0.89
291 0.88
292 0.88
293 0.88
294 0.86
295 0.82
296 0.8
297 0.78
298 0.69
299 0.63
300 0.56
301 0.48
302 0.46
303 0.5
304 0.51
305 0.5
306 0.56
307 0.6
308 0.67
309 0.74
310 0.78
311 0.79
312 0.82
313 0.86
314 0.89
315 0.88
316 0.89
317 0.9
318 0.9
319 0.89
320 0.87
321 0.82
322 0.73
323 0.66
324 0.56
325 0.47
326 0.4
327 0.35
328 0.32
329 0.32
330 0.31
331 0.31
332 0.34
333 0.33
334 0.37
335 0.34
336 0.31
337 0.25
338 0.24
339 0.24
340 0.21
341 0.23
342 0.21
343 0.24
344 0.3
345 0.34
346 0.39
347 0.46
348 0.52
349 0.52
350 0.52
351 0.5
352 0.43
353 0.41
354 0.43
355 0.38
356 0.37
357 0.36
358 0.31
359 0.28
360 0.32
361 0.32
362 0.28
363 0.3
364 0.26