Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1R6S3

Protein Details
Accession N1R6S3    Localization Confidence High Confidence Score 23.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
130-155LTNTFDRKGPSKRERKVRHATHCVHVHydrophilic
190-233VDRWRRNSGLEKKPTPKKPAKENAKSKGKGKKVQDRKSRDWGAEBasic
382-411KSAVTAKKKSTKKTKEPTRNPTRKTRPKTEHydrophilic
937-958PQTSARTRRRGPAKVAKEKPSAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-35RKRLRESPPPGEGRASKAAKEKPDSSRRK
140-144SKRER
195-227RNSGLEKKPTPKKPAKENAKSKGKGKKVQDRKS
375-409KKAKTATKSAVTAKKKSTKKTKEPTRNPTRKTRPK
629-645LRPGAKGVKVFKNKGKG
813-825RARKEDEKRRKKA
942-971RTRRRGPAKVAKEKPSAGRATRRSTRSGRK
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 4, cyto 4, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018327  BHD_2  
IPR004583  DNA_repair_Rad4  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR018325  Rad4/PNGase_transGLS-fold  
IPR018326  Rad4_beta-hairpin_dom1  
IPR018328  Rad4_beta-hairpin_dom3  
IPR042488  Rad4_BHD3_sf  
IPR036985  Transglutaminase-like_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF10403  BHD_1  
PF10404  BHD_2  
PF10405  BHD_3  
PF03835  Rad4  
Amino Acid Sequences MPPLVPRKRLRESPPPGEGRASKAAKEKPDSSRRKATLYDDLDASATPNSNSILHGFGNDDDDESSLTSLSEDEFEDVMPPNQLKGKEEDSEDEDIEFEDVQAPVAPLPDAPVTSGDLELTLTRDTRISLTNTFDRKGPSKRERKVRHATHCVHVMLLLWHNAIRNAWLCDPEVQATMISHLPPRLWDEVDRWRRNSGLEKKPTPKKPAKENAKSKGKGKKVQDRKSRDWGAEAERLEEGAVDMSHGDPLFRLMQTLSAWWKQRFRVTAPGLRKWGYMSLERLDRLTKAQKVESHDPEQFGEKISNLEDFRHHARTCEGSRDVGAQLFTALLRGLDLEARMVANLPCLGFGWNKLEEAEPEKSVSADQINETPEKKAKTATKSAVTAKKKSTKKTKEPTRNPTRKTRPKTEVESDPDDLELEYKDTDDESIVEMDVTPRKTSAKTPAKKYDADMEFPHYWTEVISPVTNKCLPVDAIVKNVVGTNRDLIESLEPRGAKADKARQIMAYIVAYSRDGTGKDVTVRYLKRNMLPGRTKGVRMTPEKVPVYNRHGKVKRYDQFDWFKTAISGYLRGSKDHPVTEVDEMEEATDLKPAKPEKKEIKEGQETLQYYKQSKEFVLERHLKREEALRPGAKGVKVFKNKGKGGKVEDEDVFLRSDVLNVKSAETWHKQGRAPLAGEQPLKRVPYRAATINRRREIMEAEAATGQKVLQGLYSWEQTDWIIPPPIKDGVIPKNEYGNIDLFAEHMCPEGAVHVPFRGAMRVCKKLQIDYAEAVVDFEFGHRMAVPVIQGVVIAEENHDMVMVELEKDEAERARKEDEKRRKKALAQWRRFLMGMRIAERIRQEYGEITDEISVFGHARDSVQTKKQPQVEDEEMAGGFLPEGYVEEEEEEEPQAHHTSSFFPAVDEDDDGDDGLVMEHDGADQQRVMMQMESEPPQTSARTRRRGPAKVAKEKPSAGRATRRSTRSGRKVVSYDEDAMEEEDEVGDSYAESEDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.75
3 0.69
4 0.67
5 0.61
6 0.57
7 0.57
8 0.51
9 0.45
10 0.49
11 0.53
12 0.54
13 0.59
14 0.6
15 0.61
16 0.69
17 0.74
18 0.73
19 0.78
20 0.73
21 0.71
22 0.68
23 0.64
24 0.64
25 0.6
26 0.55
27 0.45
28 0.42
29 0.38
30 0.32
31 0.27
32 0.19
33 0.15
34 0.12
35 0.12
36 0.13
37 0.13
38 0.14
39 0.15
40 0.15
41 0.14
42 0.15
43 0.16
44 0.15
45 0.17
46 0.16
47 0.16
48 0.13
49 0.14
50 0.13
51 0.12
52 0.12
53 0.09
54 0.08
55 0.08
56 0.07
57 0.08
58 0.08
59 0.08
60 0.1
61 0.1
62 0.1
63 0.12
64 0.13
65 0.14
66 0.16
67 0.15
68 0.16
69 0.2
70 0.22
71 0.22
72 0.26
73 0.3
74 0.3
75 0.33
76 0.35
77 0.34
78 0.37
79 0.34
80 0.29
81 0.24
82 0.21
83 0.19
84 0.15
85 0.1
86 0.09
87 0.08
88 0.09
89 0.1
90 0.1
91 0.09
92 0.1
93 0.1
94 0.07
95 0.1
96 0.11
97 0.1
98 0.11
99 0.12
100 0.13
101 0.14
102 0.14
103 0.11
104 0.1
105 0.11
106 0.1
107 0.11
108 0.11
109 0.1
110 0.11
111 0.11
112 0.12
113 0.14
114 0.17
115 0.19
116 0.21
117 0.26
118 0.34
119 0.37
120 0.37
121 0.37
122 0.38
123 0.41
124 0.47
125 0.51
126 0.54
127 0.61
128 0.69
129 0.78
130 0.82
131 0.85
132 0.88
133 0.87
134 0.87
135 0.87
136 0.83
137 0.78
138 0.75
139 0.65
140 0.54
141 0.44
142 0.35
143 0.27
144 0.24
145 0.19
146 0.14
147 0.14
148 0.15
149 0.16
150 0.15
151 0.15
152 0.16
153 0.18
154 0.19
155 0.2
156 0.21
157 0.22
158 0.24
159 0.22
160 0.2
161 0.17
162 0.16
163 0.15
164 0.15
165 0.14
166 0.13
167 0.13
168 0.13
169 0.13
170 0.14
171 0.18
172 0.19
173 0.2
174 0.21
175 0.24
176 0.34
177 0.45
178 0.49
179 0.47
180 0.46
181 0.45
182 0.47
183 0.52
184 0.51
185 0.51
186 0.55
187 0.61
188 0.68
189 0.77
190 0.81
191 0.81
192 0.8
193 0.77
194 0.79
195 0.81
196 0.83
197 0.84
198 0.86
199 0.86
200 0.88
201 0.83
202 0.8
203 0.79
204 0.77
205 0.74
206 0.74
207 0.74
208 0.75
209 0.81
210 0.84
211 0.84
212 0.82
213 0.84
214 0.8
215 0.7
216 0.63
217 0.57
218 0.53
219 0.49
220 0.42
221 0.34
222 0.28
223 0.27
224 0.23
225 0.18
226 0.12
227 0.08
228 0.07
229 0.05
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.06
236 0.09
237 0.11
238 0.1
239 0.11
240 0.09
241 0.12
242 0.12
243 0.15
244 0.17
245 0.2
246 0.26
247 0.29
248 0.33
249 0.34
250 0.4
251 0.41
252 0.4
253 0.45
254 0.46
255 0.51
256 0.52
257 0.55
258 0.53
259 0.5
260 0.47
261 0.38
262 0.37
263 0.32
264 0.29
265 0.26
266 0.26
267 0.28
268 0.28
269 0.28
270 0.25
271 0.22
272 0.24
273 0.28
274 0.28
275 0.28
276 0.31
277 0.34
278 0.41
279 0.48
280 0.49
281 0.48
282 0.46
283 0.44
284 0.41
285 0.4
286 0.32
287 0.25
288 0.2
289 0.15
290 0.14
291 0.13
292 0.17
293 0.14
294 0.15
295 0.15
296 0.18
297 0.22
298 0.28
299 0.27
300 0.24
301 0.26
302 0.31
303 0.32
304 0.34
305 0.31
306 0.26
307 0.26
308 0.27
309 0.25
310 0.2
311 0.18
312 0.11
313 0.1
314 0.09
315 0.08
316 0.06
317 0.06
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.06
327 0.06
328 0.07
329 0.06
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.09
336 0.08
337 0.1
338 0.13
339 0.12
340 0.13
341 0.13
342 0.14
343 0.14
344 0.18
345 0.19
346 0.15
347 0.15
348 0.15
349 0.15
350 0.14
351 0.14
352 0.11
353 0.09
354 0.09
355 0.11
356 0.13
357 0.15
358 0.16
359 0.17
360 0.2
361 0.2
362 0.2
363 0.24
364 0.28
365 0.32
366 0.39
367 0.41
368 0.41
369 0.44
370 0.5
371 0.53
372 0.51
373 0.5
374 0.5
375 0.54
376 0.55
377 0.6
378 0.64
379 0.66
380 0.71
381 0.78
382 0.81
383 0.84
384 0.88
385 0.9
386 0.91
387 0.9
388 0.84
389 0.84
390 0.84
391 0.83
392 0.81
393 0.8
394 0.76
395 0.74
396 0.76
397 0.71
398 0.68
399 0.63
400 0.6
401 0.51
402 0.44
403 0.37
404 0.3
405 0.23
406 0.16
407 0.11
408 0.07
409 0.06
410 0.06
411 0.06
412 0.05
413 0.06
414 0.05
415 0.06
416 0.06
417 0.06
418 0.06
419 0.06
420 0.06
421 0.07
422 0.1
423 0.11
424 0.1
425 0.1
426 0.12
427 0.13
428 0.16
429 0.25
430 0.33
431 0.38
432 0.46
433 0.54
434 0.57
435 0.56
436 0.55
437 0.53
438 0.45
439 0.41
440 0.34
441 0.32
442 0.28
443 0.28
444 0.27
445 0.17
446 0.15
447 0.13
448 0.12
449 0.08
450 0.08
451 0.08
452 0.1
453 0.1
454 0.13
455 0.14
456 0.13
457 0.12
458 0.12
459 0.12
460 0.13
461 0.17
462 0.14
463 0.15
464 0.16
465 0.15
466 0.14
467 0.15
468 0.13
469 0.1
470 0.1
471 0.09
472 0.09
473 0.09
474 0.09
475 0.09
476 0.11
477 0.11
478 0.11
479 0.12
480 0.12
481 0.11
482 0.14
483 0.14
484 0.12
485 0.16
486 0.23
487 0.26
488 0.28
489 0.29
490 0.27
491 0.27
492 0.26
493 0.23
494 0.15
495 0.09
496 0.07
497 0.07
498 0.07
499 0.07
500 0.07
501 0.06
502 0.07
503 0.08
504 0.09
505 0.09
506 0.11
507 0.11
508 0.12
509 0.17
510 0.18
511 0.2
512 0.25
513 0.26
514 0.26
515 0.34
516 0.36
517 0.38
518 0.41
519 0.41
520 0.42
521 0.41
522 0.4
523 0.33
524 0.35
525 0.33
526 0.32
527 0.34
528 0.3
529 0.36
530 0.36
531 0.36
532 0.35
533 0.33
534 0.38
535 0.42
536 0.41
537 0.44
538 0.48
539 0.49
540 0.53
541 0.58
542 0.56
543 0.54
544 0.55
545 0.53
546 0.55
547 0.54
548 0.52
549 0.42
550 0.36
551 0.29
552 0.26
553 0.21
554 0.15
555 0.15
556 0.11
557 0.18
558 0.19
559 0.19
560 0.21
561 0.24
562 0.25
563 0.24
564 0.24
565 0.19
566 0.2
567 0.21
568 0.19
569 0.14
570 0.12
571 0.11
572 0.1
573 0.08
574 0.07
575 0.05
576 0.08
577 0.08
578 0.08
579 0.12
580 0.16
581 0.23
582 0.25
583 0.34
584 0.41
585 0.48
586 0.56
587 0.57
588 0.62
589 0.61
590 0.6
591 0.54
592 0.5
593 0.44
594 0.38
595 0.37
596 0.31
597 0.26
598 0.27
599 0.27
600 0.23
601 0.22
602 0.23
603 0.22
604 0.23
605 0.3
606 0.36
607 0.36
608 0.41
609 0.42
610 0.38
611 0.36
612 0.4
613 0.36
614 0.33
615 0.38
616 0.32
617 0.31
618 0.33
619 0.36
620 0.3
621 0.28
622 0.28
623 0.31
624 0.36
625 0.4
626 0.43
627 0.48
628 0.52
629 0.56
630 0.55
631 0.51
632 0.49
633 0.52
634 0.49
635 0.44
636 0.4
637 0.35
638 0.3
639 0.27
640 0.22
641 0.14
642 0.13
643 0.09
644 0.11
645 0.11
646 0.12
647 0.15
648 0.15
649 0.16
650 0.16
651 0.18
652 0.22
653 0.22
654 0.26
655 0.27
656 0.31
657 0.31
658 0.34
659 0.38
660 0.36
661 0.35
662 0.34
663 0.34
664 0.34
665 0.36
666 0.33
667 0.31
668 0.3
669 0.31
670 0.27
671 0.25
672 0.23
673 0.25
674 0.28
675 0.32
676 0.38
677 0.46
678 0.55
679 0.63
680 0.62
681 0.58
682 0.55
683 0.5
684 0.44
685 0.37
686 0.33
687 0.23
688 0.22
689 0.23
690 0.22
691 0.2
692 0.17
693 0.13
694 0.09
695 0.09
696 0.07
697 0.06
698 0.06
699 0.09
700 0.11
701 0.13
702 0.13
703 0.12
704 0.13
705 0.13
706 0.14
707 0.12
708 0.13
709 0.15
710 0.15
711 0.16
712 0.18
713 0.2
714 0.18
715 0.18
716 0.22
717 0.25
718 0.31
719 0.33
720 0.3
721 0.33
722 0.34
723 0.34
724 0.3
725 0.23
726 0.18
727 0.17
728 0.15
729 0.12
730 0.11
731 0.11
732 0.08
733 0.08
734 0.06
735 0.06
736 0.06
737 0.07
738 0.08
739 0.09
740 0.1
741 0.1
742 0.1
743 0.11
744 0.12
745 0.14
746 0.14
747 0.2
748 0.26
749 0.33
750 0.34
751 0.39
752 0.4
753 0.39
754 0.43
755 0.4
756 0.37
757 0.32
758 0.32
759 0.26
760 0.24
761 0.21
762 0.16
763 0.11
764 0.08
765 0.07
766 0.07
767 0.06
768 0.07
769 0.06
770 0.07
771 0.07
772 0.08
773 0.08
774 0.07
775 0.08
776 0.07
777 0.07
778 0.06
779 0.07
780 0.06
781 0.06
782 0.06
783 0.06
784 0.06
785 0.06
786 0.06
787 0.05
788 0.05
789 0.07
790 0.06
791 0.06
792 0.06
793 0.07
794 0.07
795 0.07
796 0.09
797 0.1
798 0.14
799 0.16
800 0.19
801 0.24
802 0.31
803 0.39
804 0.48
805 0.56
806 0.63
807 0.68
808 0.75
809 0.76
810 0.76
811 0.78
812 0.79
813 0.79
814 0.77
815 0.77
816 0.71
817 0.67
818 0.61
819 0.53
820 0.48
821 0.44
822 0.39
823 0.33
824 0.35
825 0.32
826 0.35
827 0.36
828 0.33
829 0.28
830 0.24
831 0.23
832 0.21
833 0.23
834 0.23
835 0.21
836 0.18
837 0.18
838 0.17
839 0.16
840 0.14
841 0.11
842 0.08
843 0.08
844 0.09
845 0.08
846 0.09
847 0.13
848 0.17
849 0.22
850 0.3
851 0.38
852 0.42
853 0.49
854 0.54
855 0.54
856 0.53
857 0.55
858 0.52
859 0.47
860 0.42
861 0.36
862 0.3
863 0.26
864 0.23
865 0.14
866 0.09
867 0.06
868 0.05
869 0.03
870 0.05
871 0.06
872 0.07
873 0.07
874 0.08
875 0.1
876 0.11
877 0.12
878 0.12
879 0.1
880 0.1
881 0.13
882 0.13
883 0.12
884 0.13
885 0.13
886 0.15
887 0.18
888 0.21
889 0.18
890 0.17
891 0.18
892 0.2
893 0.21
894 0.18
895 0.16
896 0.14
897 0.14
898 0.14
899 0.12
900 0.1
901 0.08
902 0.07
903 0.06
904 0.05
905 0.04
906 0.04
907 0.05
908 0.07
909 0.07
910 0.09
911 0.09
912 0.09
913 0.11
914 0.12
915 0.14
916 0.12
917 0.13
918 0.14
919 0.18
920 0.21
921 0.21
922 0.21
923 0.22
924 0.23
925 0.25
926 0.29
927 0.36
928 0.43
929 0.5
930 0.54
931 0.62
932 0.7
933 0.75
934 0.78
935 0.78
936 0.79
937 0.81
938 0.84
939 0.83
940 0.8
941 0.77
942 0.73
943 0.7
944 0.67
945 0.64
946 0.65
947 0.65
948 0.68
949 0.71
950 0.69
951 0.69
952 0.71
953 0.75
954 0.75
955 0.77
956 0.73
957 0.72
958 0.71
959 0.69
960 0.67
961 0.61
962 0.54
963 0.45
964 0.41
965 0.34
966 0.31
967 0.26
968 0.19
969 0.14
970 0.1
971 0.09
972 0.09
973 0.08
974 0.07
975 0.06
976 0.07
977 0.07