Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0CZ01

Protein Details
Accession B0CZ01    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
96-115AGSNRRRRPHATSSSRPPGIHydrophilic
904-925TEKLPFYRIRHLRNPWNHEREVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 5, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR007275  YTH_domain  
IPR045168  YTH_prot  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_312062  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04146  YTH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS50882  YTH  
CDD cd00590  RRM_SF  
cd21134  YTH  
Amino Acid Sequences MPTSEDVDSRFPTPPSPPTPGPNSKSSMAKTGQEQLFDSVPTTQGISSFYDSAATNTSPILKPTDGESGLGTSCDSMYGGESRASADSSMSGPARAGSNRRRRPHATSSSRPPGIQPSHSPTTQNYGLPPPFGPHENTQPPTSFLGPPLHYHQPSGVPFNQGSGFVGQYPMSPHPPPVTMGHPQPSFTYPHAFHHPTVPDNNMAASTNILGSHQNVLHHPPPVYPYSNVLDGSSQHASFTGAANSPVYSPHQGHALNSPLSPSAAGPGSPLSPYIGTTPFRYSAPHFTYSQSFPTATNAYRGSYGPAAYGQHQHFPPSSPEADPTGAWWYPPHAMTPQGYESTPPSYGPRYPFQYFQTGHRDLDGPYNSASPSSGNPFPMSPNRPPSEEAPSHNSPYIGPSSDPDSAASGQSQVPDKPVIRRSYHPNPPAHRSEWVMWVGNVPSDSVHDGLWRFFNQPPEGYSPNNDAWASGVLSIFLISRSSCAFVNFDSEQSLHAAIERFNGKQLRPQEARCPKLVCRVRRKDDDLKAGVGGQRGVGLHVQWIKDQKGKAKEAMKGAPMIASDRPTPTMGNPDPLSRPLASVSLSSDHESLKRAHSKHSSSSGSYASTDSSVLTRYFPKRYFILKSLTRYDLDLSVESGLWATQKHNEGILDQAFRTSKDVYLIFGVNKSGEFYGYARMAGPVRRSEAHVSWASRNDSGSRSSRSPDAAQATMQMMTPTSPFRQSAAKSLSNAYFPPSSGKFVGNSPMPVDGSPALNLEGTEEPGDATTPGLHHRQQARSAPAILGKPQSPLTLRTPYQKQSLPTMNALTPTPADSFELDASAPVRAMRGNHGTTSESSSKVVPPLEVVTEAEEEKAEDQEDDGGLERAEDKVAEGGDEPEGGAGGREDAWGDCFKIEWLCTEKLPFYRIRHLRNPWNHEREVKVSRDGTELEPIVGQRLLDEWQNLAEPPAVGPGKPSGSTRRSAPKSSAGGSTKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.38
3 0.43
4 0.45
5 0.48
6 0.57
7 0.63
8 0.62
9 0.6
10 0.58
11 0.55
12 0.58
13 0.54
14 0.52
15 0.46
16 0.45
17 0.44
18 0.48
19 0.46
20 0.42
21 0.41
22 0.36
23 0.34
24 0.3
25 0.27
26 0.19
27 0.18
28 0.16
29 0.16
30 0.13
31 0.12
32 0.14
33 0.16
34 0.18
35 0.18
36 0.17
37 0.18
38 0.18
39 0.18
40 0.2
41 0.17
42 0.14
43 0.15
44 0.2
45 0.18
46 0.2
47 0.23
48 0.2
49 0.2
50 0.23
51 0.3
52 0.25
53 0.25
54 0.24
55 0.22
56 0.21
57 0.21
58 0.17
59 0.1
60 0.1
61 0.09
62 0.08
63 0.06
64 0.08
65 0.1
66 0.11
67 0.12
68 0.12
69 0.14
70 0.14
71 0.15
72 0.13
73 0.12
74 0.12
75 0.12
76 0.16
77 0.14
78 0.14
79 0.13
80 0.14
81 0.17
82 0.2
83 0.27
84 0.33
85 0.44
86 0.54
87 0.61
88 0.68
89 0.7
90 0.75
91 0.77
92 0.78
93 0.77
94 0.76
95 0.79
96 0.81
97 0.77
98 0.69
99 0.6
100 0.59
101 0.55
102 0.51
103 0.47
104 0.46
105 0.49
106 0.5
107 0.49
108 0.41
109 0.43
110 0.42
111 0.36
112 0.31
113 0.34
114 0.34
115 0.34
116 0.32
117 0.27
118 0.27
119 0.28
120 0.29
121 0.26
122 0.34
123 0.4
124 0.43
125 0.43
126 0.41
127 0.41
128 0.4
129 0.39
130 0.31
131 0.26
132 0.3
133 0.29
134 0.31
135 0.34
136 0.39
137 0.36
138 0.36
139 0.35
140 0.35
141 0.36
142 0.39
143 0.35
144 0.31
145 0.3
146 0.32
147 0.3
148 0.24
149 0.23
150 0.18
151 0.16
152 0.12
153 0.14
154 0.11
155 0.12
156 0.15
157 0.17
158 0.2
159 0.2
160 0.22
161 0.23
162 0.24
163 0.26
164 0.25
165 0.27
166 0.27
167 0.31
168 0.37
169 0.35
170 0.34
171 0.34
172 0.33
173 0.32
174 0.29
175 0.32
176 0.26
177 0.3
178 0.37
179 0.38
180 0.37
181 0.4
182 0.41
183 0.37
184 0.39
185 0.36
186 0.3
187 0.28
188 0.27
189 0.21
190 0.19
191 0.15
192 0.13
193 0.11
194 0.09
195 0.08
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.13
200 0.14
201 0.15
202 0.16
203 0.22
204 0.24
205 0.26
206 0.25
207 0.22
208 0.25
209 0.27
210 0.29
211 0.24
212 0.26
213 0.25
214 0.27
215 0.26
216 0.23
217 0.2
218 0.18
219 0.22
220 0.2
221 0.17
222 0.14
223 0.14
224 0.15
225 0.14
226 0.15
227 0.13
228 0.11
229 0.12
230 0.12
231 0.12
232 0.11
233 0.12
234 0.14
235 0.15
236 0.15
237 0.16
238 0.21
239 0.21
240 0.22
241 0.24
242 0.26
243 0.24
244 0.22
245 0.23
246 0.18
247 0.17
248 0.17
249 0.12
250 0.1
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.09
255 0.1
256 0.1
257 0.1
258 0.09
259 0.09
260 0.1
261 0.12
262 0.14
263 0.15
264 0.17
265 0.2
266 0.2
267 0.2
268 0.22
269 0.22
270 0.28
271 0.31
272 0.32
273 0.3
274 0.31
275 0.35
276 0.34
277 0.33
278 0.26
279 0.23
280 0.2
281 0.22
282 0.23
283 0.2
284 0.22
285 0.2
286 0.19
287 0.2
288 0.2
289 0.18
290 0.17
291 0.16
292 0.13
293 0.13
294 0.14
295 0.14
296 0.2
297 0.19
298 0.23
299 0.23
300 0.25
301 0.24
302 0.25
303 0.26
304 0.24
305 0.25
306 0.2
307 0.22
308 0.22
309 0.22
310 0.2
311 0.18
312 0.18
313 0.16
314 0.15
315 0.14
316 0.13
317 0.15
318 0.15
319 0.15
320 0.12
321 0.15
322 0.15
323 0.18
324 0.18
325 0.17
326 0.17
327 0.17
328 0.17
329 0.17
330 0.17
331 0.15
332 0.15
333 0.16
334 0.2
335 0.23
336 0.26
337 0.3
338 0.31
339 0.34
340 0.34
341 0.39
342 0.36
343 0.38
344 0.42
345 0.38
346 0.36
347 0.34
348 0.32
349 0.25
350 0.31
351 0.27
352 0.2
353 0.18
354 0.19
355 0.17
356 0.16
357 0.16
358 0.09
359 0.1
360 0.13
361 0.14
362 0.14
363 0.15
364 0.15
365 0.19
366 0.24
367 0.28
368 0.28
369 0.34
370 0.35
371 0.36
372 0.38
373 0.37
374 0.39
375 0.36
376 0.35
377 0.35
378 0.36
379 0.36
380 0.34
381 0.32
382 0.23
383 0.23
384 0.21
385 0.15
386 0.12
387 0.12
388 0.15
389 0.16
390 0.16
391 0.14
392 0.14
393 0.14
394 0.14
395 0.13
396 0.1
397 0.1
398 0.11
399 0.12
400 0.11
401 0.12
402 0.14
403 0.15
404 0.2
405 0.25
406 0.28
407 0.3
408 0.34
409 0.41
410 0.47
411 0.55
412 0.56
413 0.56
414 0.55
415 0.58
416 0.59
417 0.52
418 0.45
419 0.39
420 0.35
421 0.32
422 0.3
423 0.24
424 0.19
425 0.19
426 0.17
427 0.14
428 0.12
429 0.08
430 0.06
431 0.07
432 0.08
433 0.07
434 0.07
435 0.08
436 0.08
437 0.09
438 0.11
439 0.11
440 0.13
441 0.14
442 0.18
443 0.18
444 0.18
445 0.2
446 0.23
447 0.24
448 0.22
449 0.22
450 0.22
451 0.21
452 0.22
453 0.19
454 0.14
455 0.13
456 0.13
457 0.12
458 0.08
459 0.07
460 0.06
461 0.06
462 0.06
463 0.05
464 0.04
465 0.04
466 0.04
467 0.05
468 0.05
469 0.06
470 0.07
471 0.07
472 0.08
473 0.08
474 0.12
475 0.12
476 0.12
477 0.12
478 0.12
479 0.11
480 0.11
481 0.12
482 0.07
483 0.07
484 0.08
485 0.07
486 0.1
487 0.11
488 0.1
489 0.14
490 0.16
491 0.15
492 0.2
493 0.23
494 0.29
495 0.3
496 0.32
497 0.39
498 0.45
499 0.47
500 0.45
501 0.44
502 0.37
503 0.44
504 0.49
505 0.48
506 0.51
507 0.58
508 0.62
509 0.65
510 0.71
511 0.7
512 0.69
513 0.68
514 0.59
515 0.5
516 0.43
517 0.38
518 0.33
519 0.24
520 0.18
521 0.1
522 0.09
523 0.08
524 0.09
525 0.08
526 0.06
527 0.08
528 0.11
529 0.11
530 0.12
531 0.15
532 0.17
533 0.2
534 0.22
535 0.26
536 0.3
537 0.32
538 0.36
539 0.38
540 0.4
541 0.41
542 0.42
543 0.36
544 0.31
545 0.28
546 0.23
547 0.18
548 0.16
549 0.12
550 0.12
551 0.12
552 0.12
553 0.13
554 0.13
555 0.13
556 0.12
557 0.19
558 0.18
559 0.22
560 0.21
561 0.22
562 0.23
563 0.23
564 0.25
565 0.17
566 0.17
567 0.14
568 0.14
569 0.12
570 0.11
571 0.12
572 0.12
573 0.12
574 0.13
575 0.13
576 0.13
577 0.13
578 0.15
579 0.15
580 0.19
581 0.24
582 0.24
583 0.3
584 0.36
585 0.39
586 0.41
587 0.47
588 0.44
589 0.38
590 0.4
591 0.34
592 0.28
593 0.26
594 0.21
595 0.15
596 0.12
597 0.11
598 0.09
599 0.08
600 0.09
601 0.08
602 0.1
603 0.15
604 0.19
605 0.24
606 0.26
607 0.28
608 0.3
609 0.34
610 0.38
611 0.35
612 0.39
613 0.39
614 0.42
615 0.44
616 0.43
617 0.38
618 0.34
619 0.32
620 0.26
621 0.22
622 0.18
623 0.14
624 0.12
625 0.11
626 0.1
627 0.09
628 0.07
629 0.06
630 0.06
631 0.07
632 0.11
633 0.13
634 0.14
635 0.15
636 0.15
637 0.15
638 0.18
639 0.2
640 0.17
641 0.14
642 0.16
643 0.16
644 0.16
645 0.18
646 0.15
647 0.13
648 0.15
649 0.15
650 0.14
651 0.16
652 0.17
653 0.15
654 0.14
655 0.14
656 0.11
657 0.11
658 0.11
659 0.09
660 0.08
661 0.08
662 0.09
663 0.12
664 0.12
665 0.12
666 0.11
667 0.13
668 0.14
669 0.16
670 0.18
671 0.17
672 0.2
673 0.21
674 0.24
675 0.27
676 0.26
677 0.29
678 0.3
679 0.31
680 0.31
681 0.35
682 0.34
683 0.3
684 0.3
685 0.26
686 0.24
687 0.26
688 0.27
689 0.27
690 0.26
691 0.27
692 0.29
693 0.3
694 0.3
695 0.31
696 0.31
697 0.27
698 0.25
699 0.25
700 0.23
701 0.2
702 0.19
703 0.13
704 0.09
705 0.09
706 0.1
707 0.11
708 0.12
709 0.14
710 0.14
711 0.15
712 0.22
713 0.22
714 0.29
715 0.33
716 0.34
717 0.33
718 0.37
719 0.37
720 0.32
721 0.31
722 0.27
723 0.21
724 0.18
725 0.22
726 0.2
727 0.22
728 0.22
729 0.23
730 0.21
731 0.21
732 0.26
733 0.23
734 0.22
735 0.19
736 0.2
737 0.19
738 0.18
739 0.19
740 0.14
741 0.14
742 0.13
743 0.13
744 0.12
745 0.11
746 0.11
747 0.11
748 0.11
749 0.11
750 0.11
751 0.1
752 0.1
753 0.1
754 0.1
755 0.07
756 0.07
757 0.07
758 0.07
759 0.11
760 0.15
761 0.17
762 0.23
763 0.3
764 0.35
765 0.41
766 0.47
767 0.48
768 0.47
769 0.47
770 0.41
771 0.38
772 0.36
773 0.32
774 0.28
775 0.24
776 0.24
777 0.23
778 0.25
779 0.23
780 0.25
781 0.28
782 0.32
783 0.33
784 0.39
785 0.44
786 0.45
787 0.5
788 0.49
789 0.46
790 0.47
791 0.53
792 0.48
793 0.45
794 0.44
795 0.39
796 0.36
797 0.34
798 0.27
799 0.2
800 0.18
801 0.16
802 0.14
803 0.14
804 0.13
805 0.15
806 0.14
807 0.14
808 0.12
809 0.12
810 0.12
811 0.1
812 0.1
813 0.08
814 0.08
815 0.09
816 0.11
817 0.16
818 0.22
819 0.24
820 0.25
821 0.27
822 0.28
823 0.28
824 0.34
825 0.31
826 0.26
827 0.25
828 0.25
829 0.25
830 0.26
831 0.25
832 0.18
833 0.18
834 0.18
835 0.19
836 0.18
837 0.17
838 0.15
839 0.16
840 0.16
841 0.14
842 0.12
843 0.12
844 0.12
845 0.12
846 0.1
847 0.09
848 0.09
849 0.1
850 0.1
851 0.1
852 0.11
853 0.1
854 0.09
855 0.1
856 0.1
857 0.09
858 0.09
859 0.08
860 0.08
861 0.09
862 0.1
863 0.1
864 0.1
865 0.11
866 0.11
867 0.11
868 0.1
869 0.08
870 0.08
871 0.07
872 0.06
873 0.05
874 0.06
875 0.06
876 0.06
877 0.07
878 0.08
879 0.11
880 0.12
881 0.13
882 0.12
883 0.12
884 0.13
885 0.15
886 0.15
887 0.17
888 0.21
889 0.23
890 0.24
891 0.27
892 0.3
893 0.31
894 0.35
895 0.37
896 0.37
897 0.46
898 0.52
899 0.57
900 0.62
901 0.68
902 0.75
903 0.78
904 0.82
905 0.82
906 0.81
907 0.77
908 0.73
909 0.7
910 0.67
911 0.64
912 0.59
913 0.55
914 0.5
915 0.47
916 0.45
917 0.42
918 0.36
919 0.36
920 0.33
921 0.26
922 0.25
923 0.24
924 0.23
925 0.21
926 0.18
927 0.11
928 0.12
929 0.13
930 0.14
931 0.15
932 0.14
933 0.14
934 0.16
935 0.16
936 0.16
937 0.16
938 0.13
939 0.13
940 0.2
941 0.19
942 0.17
943 0.19
944 0.23
945 0.24
946 0.26
947 0.3
948 0.31
949 0.35
950 0.39
951 0.44
952 0.5
953 0.53
954 0.56
955 0.57
956 0.57
957 0.58
958 0.57
959 0.59