Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1RDP8

Protein Details
Accession N1RDP8    Localization Confidence Low Confidence Score 9.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
100-156HIHRLASRKRCLRGKNSHQQRHRKIPEFTRKATEEQRKAIERKKKSRQETYNQWGYLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
104-146LASRKRCLRGKNSHQQRHRKIPEFTRKATEEQRKAIERKKKSR
Subcellular Location(s) mito 15.5, cyto_mito 11, cyto 5.5, nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF13812  PPR_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51375  PPR  
Amino Acid Sequences MPTALVLRACTRLELPITPQAWTRRAVFLALRYNTTRSRSRLIRSYHLDTQPSVSEVGSQILSQLRPRNATPNPPKTQTYTPPSLRDRKQIQERVRASSHIHRLASRKRCLRGKNSHQQRHRKIPEFTRKATEEQRKAIERKKKSRQETYNQWGYLRHQHSGDELVAVRRQFNIWKRRIKLLEAPVKPRSWPWLDHGKFLYELESTSDMRKAWHGLDIESRKKIWPTAMLSTLHSCPGKAVQVLESTLDPLPQGYAILDVAHFCISNLKLNNVKIMRDRVTKADEVLELFAKLVEDLPSGHVPIRQSTLGRLGKNLPLEQAVEMLQILQKSGIKLHRNTLLHFARKLASSSAYKSKAFELLREIADKGHDLNSAGFASVVTTLLLSRQAKNGWSTSDESFPPQRALEYFLERGFSPNLINFTSLVESLCLQGDIAEAVRLPLLLAENGVELDKRCYTTVFRGAKASLKASNVQLALDVARAAKVPYVDVLNNTLHSIFYFAEMESRERQYPPPWTVPIFGTMLRIYAKKFDLEPLQWLLPDTLPLILSQEDVDGIEKFRSGPRREWGFRTTIVPVVNEFFERRAPRQKPNAETLAIMLRAYVKTLYRPYDLMSFYSFFKSRLEEHGTEKNWGRELVEDQGSVVHDTLIQVMLGQKSLLRPALQVFGDMLRSTLTSKTKEEGIETTSPTDGIQAHPAPSLFTFTILLHGLLMRREKMLGEQMLQVMREHNLEPNDVTWNTLVKGYASMQNLSQTVGTLQDLEAAGYKPDAYTFKAFSRLKDQTRALETMEKIIDENKKRLEQHHSQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.28
3 0.32
4 0.32
5 0.32
6 0.37
7 0.39
8 0.38
9 0.39
10 0.37
11 0.34
12 0.34
13 0.36
14 0.34
15 0.35
16 0.41
17 0.4
18 0.42
19 0.39
20 0.43
21 0.45
22 0.47
23 0.47
24 0.43
25 0.5
26 0.52
27 0.57
28 0.61
29 0.62
30 0.66
31 0.66
32 0.69
33 0.69
34 0.67
35 0.63
36 0.55
37 0.52
38 0.45
39 0.39
40 0.32
41 0.22
42 0.19
43 0.17
44 0.18
45 0.15
46 0.12
47 0.13
48 0.16
49 0.18
50 0.21
51 0.28
52 0.3
53 0.33
54 0.36
55 0.42
56 0.44
57 0.54
58 0.59
59 0.61
60 0.64
61 0.66
62 0.67
63 0.64
64 0.66
65 0.64
66 0.62
67 0.61
68 0.6
69 0.63
70 0.68
71 0.72
72 0.69
73 0.69
74 0.68
75 0.69
76 0.74
77 0.75
78 0.75
79 0.76
80 0.75
81 0.72
82 0.67
83 0.6
84 0.55
85 0.55
86 0.56
87 0.52
88 0.5
89 0.47
90 0.53
91 0.6
92 0.64
93 0.65
94 0.63
95 0.65
96 0.72
97 0.76
98 0.78
99 0.79
100 0.81
101 0.82
102 0.86
103 0.87
104 0.88
105 0.91
106 0.9
107 0.9
108 0.89
109 0.86
110 0.83
111 0.84
112 0.86
113 0.82
114 0.77
115 0.74
116 0.67
117 0.64
118 0.67
119 0.66
120 0.61
121 0.59
122 0.63
123 0.62
124 0.66
125 0.68
126 0.68
127 0.68
128 0.72
129 0.77
130 0.8
131 0.81
132 0.86
133 0.87
134 0.87
135 0.87
136 0.86
137 0.84
138 0.75
139 0.67
140 0.58
141 0.53
142 0.53
143 0.46
144 0.39
145 0.31
146 0.31
147 0.32
148 0.32
149 0.28
150 0.21
151 0.18
152 0.18
153 0.2
154 0.2
155 0.19
156 0.16
157 0.17
158 0.22
159 0.3
160 0.38
161 0.43
162 0.52
163 0.55
164 0.63
165 0.65
166 0.63
167 0.63
168 0.63
169 0.64
170 0.6
171 0.63
172 0.59
173 0.56
174 0.52
175 0.45
176 0.42
177 0.36
178 0.33
179 0.32
180 0.39
181 0.39
182 0.43
183 0.43
184 0.38
185 0.35
186 0.32
187 0.28
188 0.17
189 0.16
190 0.14
191 0.16
192 0.15
193 0.15
194 0.17
195 0.16
196 0.16
197 0.18
198 0.17
199 0.15
200 0.19
201 0.18
202 0.18
203 0.27
204 0.33
205 0.37
206 0.36
207 0.37
208 0.34
209 0.34
210 0.35
211 0.29
212 0.28
213 0.27
214 0.3
215 0.33
216 0.32
217 0.33
218 0.34
219 0.32
220 0.29
221 0.25
222 0.2
223 0.16
224 0.17
225 0.18
226 0.16
227 0.16
228 0.14
229 0.16
230 0.16
231 0.16
232 0.14
233 0.13
234 0.12
235 0.12
236 0.09
237 0.08
238 0.07
239 0.06
240 0.06
241 0.04
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.07
249 0.06
250 0.06
251 0.09
252 0.1
253 0.16
254 0.16
255 0.19
256 0.23
257 0.23
258 0.3
259 0.28
260 0.29
261 0.28
262 0.33
263 0.34
264 0.35
265 0.36
266 0.33
267 0.36
268 0.34
269 0.31
270 0.27
271 0.23
272 0.19
273 0.19
274 0.15
275 0.11
276 0.1
277 0.09
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.09
285 0.09
286 0.1
287 0.11
288 0.12
289 0.12
290 0.13
291 0.16
292 0.14
293 0.14
294 0.15
295 0.23
296 0.26
297 0.25
298 0.26
299 0.26
300 0.28
301 0.3
302 0.29
303 0.2
304 0.17
305 0.17
306 0.15
307 0.14
308 0.11
309 0.08
310 0.08
311 0.07
312 0.07
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.07
317 0.07
318 0.11
319 0.18
320 0.22
321 0.23
322 0.27
323 0.33
324 0.33
325 0.34
326 0.39
327 0.38
328 0.37
329 0.36
330 0.33
331 0.28
332 0.27
333 0.27
334 0.19
335 0.17
336 0.16
337 0.19
338 0.24
339 0.26
340 0.25
341 0.25
342 0.25
343 0.29
344 0.27
345 0.25
346 0.22
347 0.22
348 0.23
349 0.23
350 0.22
351 0.16
352 0.16
353 0.15
354 0.11
355 0.1
356 0.09
357 0.09
358 0.08
359 0.1
360 0.09
361 0.09
362 0.07
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.05
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.09
372 0.1
373 0.1
374 0.12
375 0.13
376 0.14
377 0.16
378 0.17
379 0.14
380 0.15
381 0.17
382 0.16
383 0.18
384 0.17
385 0.18
386 0.19
387 0.18
388 0.17
389 0.14
390 0.13
391 0.11
392 0.16
393 0.15
394 0.17
395 0.17
396 0.16
397 0.17
398 0.17
399 0.18
400 0.14
401 0.12
402 0.09
403 0.09
404 0.11
405 0.1
406 0.11
407 0.09
408 0.1
409 0.1
410 0.09
411 0.08
412 0.07
413 0.07
414 0.07
415 0.07
416 0.06
417 0.05
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.03
424 0.04
425 0.04
426 0.04
427 0.03
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.05
438 0.07
439 0.08
440 0.09
441 0.09
442 0.1
443 0.12
444 0.16
445 0.26
446 0.26
447 0.26
448 0.27
449 0.28
450 0.31
451 0.3
452 0.28
453 0.21
454 0.2
455 0.21
456 0.2
457 0.22
458 0.18
459 0.17
460 0.14
461 0.12
462 0.11
463 0.09
464 0.08
465 0.05
466 0.05
467 0.05
468 0.05
469 0.06
470 0.06
471 0.06
472 0.07
473 0.09
474 0.09
475 0.1
476 0.13
477 0.12
478 0.12
479 0.12
480 0.12
481 0.09
482 0.09
483 0.1
484 0.07
485 0.08
486 0.08
487 0.08
488 0.1
489 0.11
490 0.14
491 0.15
492 0.17
493 0.18
494 0.19
495 0.21
496 0.23
497 0.29
498 0.31
499 0.33
500 0.32
501 0.32
502 0.32
503 0.31
504 0.29
505 0.24
506 0.19
507 0.17
508 0.14
509 0.14
510 0.14
511 0.14
512 0.12
513 0.15
514 0.15
515 0.15
516 0.15
517 0.18
518 0.21
519 0.21
520 0.24
521 0.23
522 0.22
523 0.21
524 0.21
525 0.18
526 0.14
527 0.13
528 0.1
529 0.08
530 0.08
531 0.07
532 0.08
533 0.07
534 0.08
535 0.07
536 0.07
537 0.06
538 0.06
539 0.07
540 0.06
541 0.07
542 0.07
543 0.07
544 0.08
545 0.13
546 0.21
547 0.24
548 0.28
549 0.36
550 0.45
551 0.48
552 0.53
553 0.52
554 0.47
555 0.45
556 0.42
557 0.36
558 0.3
559 0.27
560 0.23
561 0.2
562 0.18
563 0.17
564 0.16
565 0.14
566 0.12
567 0.17
568 0.2
569 0.24
570 0.33
571 0.37
572 0.45
573 0.54
574 0.61
575 0.6
576 0.63
577 0.63
578 0.53
579 0.48
580 0.41
581 0.35
582 0.27
583 0.22
584 0.16
585 0.14
586 0.12
587 0.13
588 0.13
589 0.1
590 0.14
591 0.19
592 0.23
593 0.23
594 0.23
595 0.25
596 0.29
597 0.29
598 0.26
599 0.24
600 0.22
601 0.21
602 0.25
603 0.24
604 0.19
605 0.2
606 0.21
607 0.2
608 0.26
609 0.32
610 0.29
611 0.34
612 0.42
613 0.42
614 0.44
615 0.45
616 0.42
617 0.36
618 0.34
619 0.3
620 0.24
621 0.25
622 0.26
623 0.24
624 0.21
625 0.19
626 0.2
627 0.2
628 0.18
629 0.15
630 0.1
631 0.08
632 0.08
633 0.09
634 0.08
635 0.07
636 0.06
637 0.09
638 0.1
639 0.09
640 0.09
641 0.1
642 0.1
643 0.14
644 0.16
645 0.13
646 0.14
647 0.16
648 0.21
649 0.2
650 0.19
651 0.18
652 0.17
653 0.18
654 0.16
655 0.14
656 0.1
657 0.1
658 0.11
659 0.16
660 0.2
661 0.21
662 0.24
663 0.26
664 0.29
665 0.29
666 0.31
667 0.28
668 0.28
669 0.28
670 0.28
671 0.27
672 0.24
673 0.23
674 0.2
675 0.2
676 0.15
677 0.13
678 0.18
679 0.18
680 0.19
681 0.2
682 0.21
683 0.2
684 0.19
685 0.22
686 0.16
687 0.15
688 0.16
689 0.14
690 0.17
691 0.17
692 0.16
693 0.12
694 0.13
695 0.13
696 0.16
697 0.19
698 0.17
699 0.18
700 0.18
701 0.18
702 0.21
703 0.27
704 0.26
705 0.25
706 0.26
707 0.28
708 0.3
709 0.3
710 0.26
711 0.2
712 0.19
713 0.19
714 0.18
715 0.2
716 0.2
717 0.21
718 0.21
719 0.21
720 0.25
721 0.23
722 0.24
723 0.2
724 0.2
725 0.19
726 0.19
727 0.18
728 0.13
729 0.16
730 0.17
731 0.21
732 0.22
733 0.22
734 0.22
735 0.26
736 0.25
737 0.24
738 0.21
739 0.16
740 0.14
741 0.14
742 0.14
743 0.11
744 0.1
745 0.13
746 0.13
747 0.13
748 0.15
749 0.13
750 0.13
751 0.13
752 0.13
753 0.1
754 0.13
755 0.15
756 0.17
757 0.21
758 0.24
759 0.27
760 0.36
761 0.38
762 0.38
763 0.46
764 0.51
765 0.52
766 0.57
767 0.59
768 0.57
769 0.61
770 0.59
771 0.52
772 0.51
773 0.45
774 0.43
775 0.4
776 0.32
777 0.27
778 0.31
779 0.37
780 0.36
781 0.42
782 0.44
783 0.5
784 0.53
785 0.58