Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1RBP0

Protein Details
Accession N1RBP0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-44IEPVTKSQHDKHKHSAKRRRLNPPTPDPSQSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
24-37KHKHSAKRRRLNPP
49-55GSRRSKR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11.833, mito_nucl 10.666, cyto 5, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046797  PDDEXK_12  
Pfam View protein in Pfam  
PF20516  PDDEXK_12  
Amino Acid Sequences MSLDQRIQTWLRRIEPVTKSQHDKHKHSAKRRRLNPPTPDPSQSSRSMGSRRSKRRAIDALDVNDDNDDILDTPRPPKLQAPRSESGTSLASSSAASGYSSPTKQLRELKFHPRGVDSRELKDFQNKPASLKTLLQKIDDSVSGFGILPTSQRTCMTELDIKVYDNFEWVKAKPPRDIFFSDDRDDLGHTPPPEVIQTILHQAGECSERGHSEASWNVEVHHLVLKAALRPLQGPQSSQFFDFLLSTTASILPDYQATSASKKVDFCMYIDPQHDGSAQIRETILALMNVLPMGMFNHTNLLPLSDRPIAVSIETKKTGEGWDNARLQMEVWMAAHWQFLRKVLQLHRLAAGAVSSLEQTAGFNSYETRKLPEFLPGIIIQGHDWYLIITTSEGEKTIFWHKENFGQTSKSKGIYTIIHNLQLLRKWAQEVYWEWMRELLLSWPRHRGKVFAVADY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.55
3 0.58
4 0.59
5 0.59
6 0.63
7 0.65
8 0.72
9 0.72
10 0.73
11 0.75
12 0.76
13 0.79
14 0.82
15 0.85
16 0.86
17 0.88
18 0.9
19 0.91
20 0.91
21 0.91
22 0.9
23 0.9
24 0.87
25 0.81
26 0.77
27 0.71
28 0.66
29 0.61
30 0.55
31 0.48
32 0.44
33 0.45
34 0.45
35 0.48
36 0.53
37 0.58
38 0.65
39 0.7
40 0.73
41 0.72
42 0.76
43 0.76
44 0.72
45 0.7
46 0.68
47 0.62
48 0.6
49 0.56
50 0.47
51 0.38
52 0.31
53 0.22
54 0.14
55 0.11
56 0.06
57 0.08
58 0.1
59 0.12
60 0.15
61 0.19
62 0.2
63 0.21
64 0.28
65 0.37
66 0.44
67 0.51
68 0.56
69 0.57
70 0.62
71 0.61
72 0.54
73 0.46
74 0.39
75 0.3
76 0.22
77 0.18
78 0.12
79 0.11
80 0.11
81 0.08
82 0.07
83 0.07
84 0.06
85 0.1
86 0.14
87 0.15
88 0.18
89 0.21
90 0.23
91 0.29
92 0.38
93 0.41
94 0.45
95 0.51
96 0.58
97 0.63
98 0.64
99 0.6
100 0.56
101 0.53
102 0.5
103 0.54
104 0.47
105 0.42
106 0.44
107 0.44
108 0.41
109 0.46
110 0.43
111 0.4
112 0.46
113 0.42
114 0.4
115 0.43
116 0.45
117 0.38
118 0.4
119 0.38
120 0.36
121 0.37
122 0.35
123 0.31
124 0.29
125 0.28
126 0.24
127 0.21
128 0.14
129 0.12
130 0.12
131 0.11
132 0.1
133 0.08
134 0.07
135 0.07
136 0.09
137 0.1
138 0.11
139 0.12
140 0.14
141 0.15
142 0.16
143 0.2
144 0.22
145 0.21
146 0.24
147 0.24
148 0.23
149 0.21
150 0.21
151 0.17
152 0.14
153 0.14
154 0.12
155 0.14
156 0.14
157 0.22
158 0.27
159 0.29
160 0.33
161 0.37
162 0.38
163 0.41
164 0.43
165 0.38
166 0.4
167 0.42
168 0.38
169 0.33
170 0.31
171 0.27
172 0.25
173 0.21
174 0.16
175 0.14
176 0.13
177 0.13
178 0.13
179 0.13
180 0.13
181 0.11
182 0.1
183 0.08
184 0.09
185 0.11
186 0.11
187 0.11
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.07
194 0.07
195 0.08
196 0.09
197 0.1
198 0.08
199 0.09
200 0.11
201 0.13
202 0.15
203 0.14
204 0.14
205 0.14
206 0.14
207 0.12
208 0.12
209 0.1
210 0.08
211 0.09
212 0.1
213 0.1
214 0.11
215 0.11
216 0.09
217 0.1
218 0.11
219 0.16
220 0.16
221 0.16
222 0.16
223 0.19
224 0.2
225 0.19
226 0.19
227 0.13
228 0.13
229 0.12
230 0.11
231 0.08
232 0.08
233 0.07
234 0.07
235 0.08
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.05
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.07
244 0.08
245 0.1
246 0.13
247 0.14
248 0.15
249 0.15
250 0.16
251 0.17
252 0.17
253 0.16
254 0.2
255 0.2
256 0.22
257 0.22
258 0.23
259 0.21
260 0.21
261 0.2
262 0.15
263 0.14
264 0.14
265 0.13
266 0.12
267 0.12
268 0.11
269 0.11
270 0.1
271 0.1
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.05
277 0.05
278 0.04
279 0.03
280 0.04
281 0.05
282 0.06
283 0.06
284 0.08
285 0.09
286 0.1
287 0.1
288 0.11
289 0.11
290 0.11
291 0.15
292 0.14
293 0.14
294 0.14
295 0.15
296 0.13
297 0.13
298 0.18
299 0.18
300 0.21
301 0.22
302 0.22
303 0.2
304 0.21
305 0.23
306 0.22
307 0.22
308 0.22
309 0.28
310 0.3
311 0.3
312 0.3
313 0.27
314 0.23
315 0.22
316 0.18
317 0.12
318 0.1
319 0.1
320 0.1
321 0.1
322 0.12
323 0.09
324 0.12
325 0.12
326 0.14
327 0.17
328 0.19
329 0.25
330 0.28
331 0.37
332 0.38
333 0.38
334 0.37
335 0.34
336 0.32
337 0.26
338 0.2
339 0.11
340 0.08
341 0.07
342 0.06
343 0.05
344 0.06
345 0.05
346 0.06
347 0.06
348 0.08
349 0.08
350 0.08
351 0.1
352 0.13
353 0.17
354 0.18
355 0.22
356 0.21
357 0.23
358 0.24
359 0.29
360 0.27
361 0.24
362 0.27
363 0.22
364 0.22
365 0.21
366 0.21
367 0.13
368 0.13
369 0.13
370 0.09
371 0.08
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.06
377 0.07
378 0.09
379 0.09
380 0.1
381 0.1
382 0.1
383 0.12
384 0.21
385 0.24
386 0.24
387 0.29
388 0.31
389 0.38
390 0.43
391 0.45
392 0.4
393 0.41
394 0.42
395 0.43
396 0.45
397 0.4
398 0.35
399 0.32
400 0.32
401 0.32
402 0.36
403 0.38
404 0.37
405 0.37
406 0.38
407 0.38
408 0.38
409 0.37
410 0.37
411 0.3
412 0.29
413 0.29
414 0.29
415 0.28
416 0.3
417 0.3
418 0.32
419 0.37
420 0.35
421 0.33
422 0.34
423 0.32
424 0.27
425 0.25
426 0.25
427 0.26
428 0.31
429 0.34
430 0.42
431 0.46
432 0.51
433 0.51
434 0.47
435 0.45
436 0.5