FuNGI

N1S247

Protein Details

Accession

N1S247

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
100-119	KRDFHRVTRRAKRLYWRNLI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 8, extr 8, mito 6, nucl 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR000477 RT_dom
Gene Ontology	GO:0005739 C:mitochondrion
Pfam	View protein in Pfam PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50878 RT_POL
CDD	cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

MQPGRVRVTTDNELKRFAEIVELGAAGLPTADSTPSELDELASALVNLLTSAAKAAGRPTRKGARTAPWWTEECAGAAAAFRAIRRLYPLGFNEEVQIAKRDFHRVTRRAKRLYWRNLIDSFTDSSAVFKAVRWLKSPGPFQPPPLQVGDVVYETQLDKANALRRATLERRTADDDIKNPWIPVSFPRSIPFPLEISLDEAQYATLHTGNTSPGSDNITVDLLKAVWHIIGTHVRRLFERCLSVGHHPKPFREAEVVMIAKPGRRDLTSPRAWRPISLLSCLGKGLERLIARRLAWAAIHYSVLHPQQAGALPKRSATDLVTALIHDIEEAFARKKVATLVTMDIQGAFDTVMRNRLVLRLREQGWPDHLARWAGSFMSGRSARVRYQDTLTSSSPLECGLPQGSPVSPILFLLYTEPIYRLGNPQGRFGYADDTAILSIGDTVDETTAMASGAIDEMVRWGAMNGVSFDTKKTEVMHFSRSKLRAAPAPTICEDSPTRNTARCRLPYEVPSEHVSSPCCSTAPRRGTQAHPGRDGINPLKTYLQATNISYRE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.48
3	0.41
4	0.33
5	0.29
6	0.2
7	0.2
8	0.17
9	0.17
10	0.15
11	0.14
12	0.14
13	0.08
14	0.07
15	0.05
16	0.05
17	0.05
18	0.06
19	0.06
20	0.08
21	0.1
22	0.11
23	0.13
24	0.12
25	0.12
26	0.12
27	0.12
28	0.1
29	0.09
30	0.07
31	0.07
32	0.07
33	0.06
34	0.05
35	0.06
36	0.05
37	0.05
38	0.06
39	0.07
40	0.08
41	0.08
42	0.15
43	0.22
44	0.27
45	0.3
46	0.37
47	0.46
48	0.48
49	0.54
50	0.54
51	0.55
52	0.59
53	0.63
54	0.61
55	0.56
56	0.55
57	0.51
58	0.47
59	0.39
60	0.31
61	0.24
62	0.19
63	0.13
64	0.12
65	0.1
66	0.1
67	0.1
68	0.09
69	0.12
70	0.12
71	0.13
72	0.18
73	0.21
74	0.21
75	0.27
76	0.29
77	0.32
78	0.33
79	0.33
80	0.29
81	0.27
82	0.26
83	0.21
84	0.22
85	0.16
86	0.18
87	0.2
88	0.26
89	0.26
90	0.35
91	0.44
92	0.48
93	0.58
94	0.66
95	0.73
96	0.72
97	0.76
98	0.77
99	0.78
100	0.8
101	0.79
102	0.74
103	0.7
104	0.66
105	0.62
106	0.53
107	0.45
108	0.37
109	0.28
110	0.24
111	0.18
112	0.16
113	0.15
114	0.14
115	0.12
116	0.1
117	0.18
118	0.22
119	0.25
120	0.27
121	0.3
122	0.34
123	0.41
124	0.45
125	0.43
126	0.46
127	0.45
128	0.47
129	0.51
130	0.48
131	0.44
132	0.41
133	0.36
134	0.27
135	0.27
136	0.24
137	0.16
138	0.14
139	0.11
140	0.1
141	0.09
142	0.11
143	0.12
144	0.1
145	0.1
146	0.14
147	0.2
148	0.25
149	0.25
150	0.25
151	0.24
152	0.32
153	0.36
154	0.39
155	0.39
156	0.36
157	0.39
158	0.43
159	0.43
160	0.4
161	0.39
162	0.34
163	0.32
164	0.35
165	0.32
166	0.27
167	0.25
168	0.21
169	0.18
170	0.21
171	0.24
172	0.21
173	0.22
174	0.23
175	0.25
176	0.26
177	0.27
178	0.24
179	0.18
180	0.16
181	0.16
182	0.15
183	0.17
184	0.17
185	0.14
186	0.13
187	0.11
188	0.1
189	0.09
190	0.09
191	0.05
192	0.06
193	0.06
194	0.06
195	0.07
196	0.08
197	0.09
198	0.09
199	0.09
200	0.09
201	0.13
202	0.13
203	0.12
204	0.12
205	0.12
206	0.11
207	0.1
208	0.1
209	0.06
210	0.06
211	0.06
212	0.05
213	0.04
214	0.04
215	0.04
216	0.07
217	0.13
218	0.15
219	0.2
220	0.21
221	0.22
222	0.23
223	0.27
224	0.27
225	0.23
226	0.24
227	0.19
228	0.19
229	0.21
230	0.27
231	0.32
232	0.34
233	0.37
234	0.36
235	0.37
236	0.39
237	0.37
238	0.32
239	0.26
240	0.22
241	0.18
242	0.22
243	0.21
244	0.17
245	0.17
246	0.16
247	0.14
248	0.14
249	0.14
250	0.1
251	0.11
252	0.13
253	0.18
254	0.27
255	0.33
256	0.37
257	0.39
258	0.44
259	0.44
260	0.42
261	0.38
262	0.36
263	0.3
264	0.28
265	0.27
266	0.21
267	0.21
268	0.21
269	0.18
270	0.11
271	0.1
272	0.09
273	0.1
274	0.1
275	0.11
276	0.13
277	0.15
278	0.15
279	0.16
280	0.15
281	0.12
282	0.12
283	0.11
284	0.11
285	0.09
286	0.09
287	0.08
288	0.09
289	0.11
290	0.12
291	0.11
292	0.1
293	0.09
294	0.1
295	0.13
296	0.16
297	0.15
298	0.18
299	0.17
300	0.19
301	0.19
302	0.18
303	0.17
304	0.14
305	0.15
306	0.12
307	0.13
308	0.12
309	0.11
310	0.11
311	0.1
312	0.08
313	0.05
314	0.04
315	0.04
316	0.04
317	0.06
318	0.07
319	0.08
320	0.09
321	0.09
322	0.09
323	0.11
324	0.12
325	0.12
326	0.13
327	0.15
328	0.15
329	0.16
330	0.15
331	0.13
332	0.11
333	0.1
334	0.08
335	0.05
336	0.05
337	0.06
338	0.06
339	0.1
340	0.1
341	0.1
342	0.11
343	0.16
344	0.2
345	0.22
346	0.26
347	0.29
348	0.31
349	0.35
350	0.37
351	0.34
352	0.33
353	0.34
354	0.31
355	0.26
356	0.26
357	0.22
358	0.2
359	0.19
360	0.16
361	0.12
362	0.12
363	0.11
364	0.09
365	0.16
366	0.16
367	0.16
368	0.2
369	0.22
370	0.23
371	0.27
372	0.31
373	0.27
374	0.3
375	0.33
376	0.32
377	0.35
378	0.33
379	0.3
380	0.26
381	0.24
382	0.21
383	0.17
384	0.14
385	0.09
386	0.11
387	0.1
388	0.09
389	0.1
390	0.11
391	0.11
392	0.12
393	0.12
394	0.11
395	0.1
396	0.1
397	0.1
398	0.09
399	0.09
400	0.09
401	0.1
402	0.1
403	0.11
404	0.11
405	0.12
406	0.13
407	0.14
408	0.15
409	0.22
410	0.28
411	0.28
412	0.33
413	0.32
414	0.32
415	0.33
416	0.3
417	0.26
418	0.2
419	0.19
420	0.14
421	0.14
422	0.12
423	0.11
424	0.1
425	0.05
426	0.05
427	0.05
428	0.04
429	0.04
430	0.04
431	0.05
432	0.05
433	0.05
434	0.04
435	0.05
436	0.05
437	0.04
438	0.04
439	0.04
440	0.04
441	0.04
442	0.04
443	0.04
444	0.05
445	0.05
446	0.05
447	0.05
448	0.05
449	0.07
450	0.08
451	0.09
452	0.09
453	0.11
454	0.13
455	0.14
456	0.15
457	0.17
458	0.17
459	0.18
460	0.19
461	0.22
462	0.28
463	0.31
464	0.4
465	0.4
466	0.43
467	0.5
468	0.49
469	0.48
470	0.45
471	0.45
472	0.42
473	0.42
474	0.47
475	0.42
476	0.45
477	0.44
478	0.45
479	0.4
480	0.39
481	0.36
482	0.34
483	0.35
484	0.34
485	0.36
486	0.37
487	0.42
488	0.45
489	0.52
490	0.53
491	0.54
492	0.56
493	0.59
494	0.58
495	0.62
496	0.57
497	0.51
498	0.47
499	0.46
500	0.42
501	0.38
502	0.35
503	0.29
504	0.29
505	0.27
506	0.24
507	0.23
508	0.28
509	0.35
510	0.41
511	0.43
512	0.47
513	0.51
514	0.55
515	0.64
516	0.67
517	0.64
518	0.6
519	0.58
520	0.52
521	0.5
522	0.53
523	0.48
524	0.45
525	0.39
526	0.37
527	0.37
528	0.36
529	0.37
530	0.32
531	0.32
532	0.29
533	0.32

N1S247

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer