Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1RHI6

Protein Details
Accession N1RHI6    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
283-304WTTTTHGGRRKKRKGALTDNSSHydrophilic
368-392LGNFTKPGKRTSKKTKAQTGLEQLEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
290-296GRRKKRK
396-408KGLGPARIRGRIK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPRKWIDKKSAQHFTLVHRPQNDPLIHDENAPAMVLNPTQTKKGSSKSKDLDDLASELGYEAEDVRANEGEAASYGVYFDDSEYDYMQHLRDLNTGGGEVVFVESTATANKGKGKQKQSLEDALKKLDIEQNAGDILDDEILPSKNLTRVTYEAQQDIPDSIKGFQPDMDPRLREVLEALEDDAYVDDGDDDIFKELAKDGRELEDYEFDGADFDEDDGWESDATAKPNKEYKDDNIPQLVPTEQPEEGPSQDWLEDFKQFKKEQKGGKVPVAPSQSEMQSNWTTTTHGGRRKKRKGALTDNSSYSMTSSSLVRTEQMTLLDARFDKIEERYNEDMEDDMQSMSAVSTMSTVQGPVRGDFDNIMDDFLGNFTKPGKRTSKKTKAQTGLEQLEEIRKGLGPARIRGRIK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.64
3 0.62
4 0.57
5 0.51
6 0.53
7 0.51
8 0.57
9 0.51
10 0.42
11 0.43
12 0.42
13 0.39
14 0.37
15 0.33
16 0.26
17 0.25
18 0.22
19 0.14
20 0.1
21 0.11
22 0.1
23 0.12
24 0.17
25 0.18
26 0.22
27 0.23
28 0.28
29 0.31
30 0.4
31 0.48
32 0.48
33 0.57
34 0.6
35 0.65
36 0.66
37 0.63
38 0.57
39 0.48
40 0.44
41 0.34
42 0.27
43 0.21
44 0.15
45 0.12
46 0.09
47 0.07
48 0.06
49 0.06
50 0.08
51 0.09
52 0.11
53 0.11
54 0.11
55 0.12
56 0.11
57 0.1
58 0.09
59 0.1
60 0.07
61 0.07
62 0.07
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.06
67 0.07
68 0.08
69 0.09
70 0.1
71 0.1
72 0.11
73 0.12
74 0.12
75 0.13
76 0.14
77 0.14
78 0.15
79 0.17
80 0.16
81 0.15
82 0.15
83 0.13
84 0.11
85 0.09
86 0.07
87 0.06
88 0.05
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.05
93 0.06
94 0.07
95 0.08
96 0.1
97 0.15
98 0.23
99 0.31
100 0.39
101 0.45
102 0.51
103 0.57
104 0.62
105 0.62
106 0.63
107 0.63
108 0.61
109 0.56
110 0.5
111 0.44
112 0.37
113 0.34
114 0.28
115 0.22
116 0.18
117 0.17
118 0.16
119 0.15
120 0.15
121 0.12
122 0.09
123 0.08
124 0.06
125 0.05
126 0.05
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.08
132 0.11
133 0.13
134 0.14
135 0.15
136 0.17
137 0.21
138 0.27
139 0.27
140 0.26
141 0.25
142 0.24
143 0.21
144 0.19
145 0.17
146 0.11
147 0.1
148 0.1
149 0.11
150 0.12
151 0.11
152 0.12
153 0.14
154 0.17
155 0.2
156 0.22
157 0.21
158 0.21
159 0.24
160 0.23
161 0.19
162 0.17
163 0.14
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.05
172 0.04
173 0.04
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.05
183 0.06
184 0.08
185 0.09
186 0.1
187 0.1
188 0.12
189 0.13
190 0.14
191 0.14
192 0.13
193 0.12
194 0.12
195 0.11
196 0.09
197 0.08
198 0.07
199 0.06
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.05
205 0.05
206 0.06
207 0.05
208 0.05
209 0.07
210 0.09
211 0.11
212 0.13
213 0.13
214 0.15
215 0.21
216 0.22
217 0.24
218 0.25
219 0.27
220 0.35
221 0.37
222 0.38
223 0.36
224 0.35
225 0.31
226 0.29
227 0.26
228 0.16
229 0.14
230 0.14
231 0.11
232 0.11
233 0.12
234 0.13
235 0.13
236 0.13
237 0.12
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.11
242 0.11
243 0.16
244 0.17
245 0.19
246 0.26
247 0.28
248 0.34
249 0.41
250 0.46
251 0.48
252 0.56
253 0.62
254 0.6
255 0.63
256 0.62
257 0.54
258 0.54
259 0.5
260 0.4
261 0.33
262 0.31
263 0.27
264 0.23
265 0.22
266 0.21
267 0.2
268 0.2
269 0.19
270 0.17
271 0.17
272 0.17
273 0.24
274 0.26
275 0.33
276 0.41
277 0.5
278 0.6
279 0.69
280 0.77
281 0.77
282 0.79
283 0.81
284 0.82
285 0.82
286 0.79
287 0.74
288 0.67
289 0.62
290 0.53
291 0.43
292 0.33
293 0.24
294 0.16
295 0.12
296 0.11
297 0.1
298 0.11
299 0.12
300 0.12
301 0.12
302 0.14
303 0.15
304 0.14
305 0.15
306 0.14
307 0.14
308 0.17
309 0.16
310 0.15
311 0.14
312 0.13
313 0.14
314 0.16
315 0.24
316 0.23
317 0.3
318 0.33
319 0.33
320 0.33
321 0.31
322 0.28
323 0.21
324 0.21
325 0.14
326 0.11
327 0.09
328 0.09
329 0.09
330 0.08
331 0.07
332 0.05
333 0.04
334 0.05
335 0.06
336 0.07
337 0.07
338 0.08
339 0.08
340 0.12
341 0.14
342 0.14
343 0.17
344 0.16
345 0.17
346 0.17
347 0.18
348 0.18
349 0.17
350 0.16
351 0.13
352 0.13
353 0.12
354 0.12
355 0.12
356 0.08
357 0.09
358 0.12
359 0.19
360 0.2
361 0.28
362 0.38
363 0.45
364 0.55
365 0.66
366 0.73
367 0.76
368 0.85
369 0.87
370 0.85
371 0.85
372 0.84
373 0.82
374 0.77
375 0.68
376 0.59
377 0.5
378 0.47
379 0.4
380 0.31
381 0.23
382 0.18
383 0.18
384 0.22
385 0.27
386 0.27
387 0.34
388 0.42