Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1RDV0

Protein Details
Accession N1RDV0    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-31DHAAAKAEKKAKKEKKRAREEDAAADTBasic
47-74PEASSDLKAEKKKKKSKKDKHAEDAVAQHydrophilic
76-104ETKAPAVEEKPEKKHKKKKHHDAEVAVTEBasic
110-131VAADSEKKKKSKKNHKETEAIEHydrophilic
409-432AETAKMRKGKKGGQRVQRRRIPEFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-42AKAEKKAKKEKKRAREEDAAADTERKHKKSKSVA
52-68DLKAEKKKKKSKKDKHA
79-95APAVEEKPEKKHKKKKH
116-141KKKKSKKNHKETEAIEIAERPKKSKK
413-428KMRKGKKGGQRVQRRR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12.666, mito_nucl 10.166, cyto 8, cyto_mito 6.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041901  RNAP_I_Rpa43_N  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
CDD cd04328  RNAP_I_Rpa43_N  
Amino Acid Sequences MAPIDHAAAKAEKKAKKEKKRAREEDAAADTERKHKKSKSVAAVEAPEASSDLKAEKKKKKSKKDKHAEDAVAQAETKAPAVEEKPEKKHKKKKHHDAEVAVTEEVDTPVAADSEKKKKSKKNHKETEAIEIAERPKKSKKDETAVEPEEDASPADPDAMEIDMPPPAKPSKSNSNIYQPPDIPANPQFPFFTQTVSLYEPLFPIGWAQPVTNCQQQHLSHLRNKYVPSLRGVLLDYKNVAFGENPGRKGAATDDESPATVMAKGESAVGFGWITADVDLFVPSRGAWMEGSVNLQTEGHIGVVCFGKFNASIEARRLPPDWKWVPNESPEAQGFEETASVITADDHGVVRQIHSTGFWADGNGDKVKGKIRFRIRNFDVGTSGETSYLSLEGTMLDKAGEKAVVAEEAETAKMRKGKKGGQRVQRRRIPEFSMTRFAVEGEEQTEDNEAEKREVLALPEDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.63
3 0.69
4 0.79
5 0.82
6 0.84
7 0.92
8 0.93
9 0.9
10 0.89
11 0.83
12 0.81
13 0.75
14 0.66
15 0.56
16 0.5
17 0.43
18 0.43
19 0.46
20 0.41
21 0.44
22 0.47
23 0.55
24 0.62
25 0.71
26 0.72
27 0.72
28 0.73
29 0.71
30 0.69
31 0.6
32 0.51
33 0.41
34 0.3
35 0.23
36 0.19
37 0.13
38 0.11
39 0.12
40 0.17
41 0.25
42 0.35
43 0.44
44 0.54
45 0.65
46 0.75
47 0.83
48 0.88
49 0.91
50 0.93
51 0.95
52 0.95
53 0.93
54 0.92
55 0.85
56 0.76
57 0.69
58 0.59
59 0.49
60 0.38
61 0.28
62 0.2
63 0.17
64 0.15
65 0.09
66 0.08
67 0.1
68 0.12
69 0.2
70 0.27
71 0.34
72 0.42
73 0.53
74 0.63
75 0.71
76 0.81
77 0.83
78 0.86
79 0.9
80 0.93
81 0.93
82 0.94
83 0.91
84 0.87
85 0.84
86 0.77
87 0.68
88 0.57
89 0.45
90 0.35
91 0.27
92 0.21
93 0.13
94 0.07
95 0.05
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.09
100 0.15
101 0.25
102 0.32
103 0.38
104 0.46
105 0.54
106 0.65
107 0.73
108 0.78
109 0.8
110 0.84
111 0.85
112 0.85
113 0.78
114 0.76
115 0.68
116 0.57
117 0.46
118 0.38
119 0.35
120 0.32
121 0.31
122 0.25
123 0.3
124 0.35
125 0.42
126 0.49
127 0.53
128 0.57
129 0.62
130 0.66
131 0.68
132 0.64
133 0.57
134 0.48
135 0.4
136 0.32
137 0.26
138 0.19
139 0.1
140 0.08
141 0.07
142 0.07
143 0.05
144 0.05
145 0.06
146 0.06
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.07
151 0.08
152 0.08
153 0.1
154 0.11
155 0.12
156 0.15
157 0.2
158 0.28
159 0.35
160 0.4
161 0.41
162 0.49
163 0.54
164 0.54
165 0.53
166 0.43
167 0.38
168 0.35
169 0.32
170 0.26
171 0.24
172 0.26
173 0.22
174 0.23
175 0.22
176 0.19
177 0.22
178 0.19
179 0.17
180 0.13
181 0.13
182 0.14
183 0.15
184 0.15
185 0.12
186 0.13
187 0.11
188 0.11
189 0.1
190 0.08
191 0.08
192 0.07
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.09
197 0.11
198 0.14
199 0.18
200 0.17
201 0.16
202 0.21
203 0.21
204 0.28
205 0.32
206 0.34
207 0.34
208 0.37
209 0.39
210 0.36
211 0.37
212 0.37
213 0.35
214 0.31
215 0.29
216 0.29
217 0.27
218 0.25
219 0.25
220 0.23
221 0.19
222 0.18
223 0.16
224 0.13
225 0.13
226 0.12
227 0.11
228 0.07
229 0.08
230 0.17
231 0.19
232 0.2
233 0.2
234 0.2
235 0.2
236 0.2
237 0.19
238 0.15
239 0.15
240 0.16
241 0.18
242 0.18
243 0.18
244 0.17
245 0.16
246 0.12
247 0.09
248 0.06
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.06
253 0.05
254 0.06
255 0.05
256 0.06
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.04
261 0.05
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.07
277 0.08
278 0.1
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.08
284 0.07
285 0.07
286 0.06
287 0.06
288 0.05
289 0.07
290 0.09
291 0.08
292 0.08
293 0.07
294 0.09
295 0.09
296 0.1
297 0.13
298 0.14
299 0.16
300 0.19
301 0.23
302 0.23
303 0.26
304 0.26
305 0.23
306 0.23
307 0.32
308 0.33
309 0.35
310 0.38
311 0.41
312 0.42
313 0.44
314 0.47
315 0.39
316 0.38
317 0.33
318 0.31
319 0.26
320 0.23
321 0.19
322 0.14
323 0.13
324 0.09
325 0.08
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.09
336 0.09
337 0.1
338 0.11
339 0.11
340 0.1
341 0.11
342 0.12
343 0.11
344 0.12
345 0.12
346 0.1
347 0.11
348 0.13
349 0.16
350 0.16
351 0.16
352 0.15
353 0.17
354 0.24
355 0.3
356 0.32
357 0.38
358 0.47
359 0.56
360 0.61
361 0.7
362 0.67
363 0.69
364 0.67
365 0.6
366 0.52
367 0.43
368 0.4
369 0.31
370 0.27
371 0.18
372 0.16
373 0.14
374 0.12
375 0.11
376 0.09
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.07
381 0.07
382 0.06
383 0.07
384 0.08
385 0.09
386 0.1
387 0.09
388 0.08
389 0.09
390 0.1
391 0.11
392 0.1
393 0.09
394 0.09
395 0.1
396 0.11
397 0.11
398 0.11
399 0.15
400 0.2
401 0.22
402 0.28
403 0.35
404 0.43
405 0.51
406 0.62
407 0.67
408 0.73
409 0.81
410 0.85
411 0.88
412 0.87
413 0.84
414 0.8
415 0.77
416 0.73
417 0.71
418 0.69
419 0.65
420 0.66
421 0.59
422 0.53
423 0.47
424 0.41
425 0.33
426 0.26
427 0.21
428 0.15
429 0.17
430 0.15
431 0.16
432 0.17
433 0.15
434 0.15
435 0.17
436 0.17
437 0.17
438 0.18
439 0.18
440 0.19
441 0.2
442 0.21