Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1RDG7

Protein Details
Accession N1RDG7    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
55-75SSNPSRTSTPKPQPQPQPASAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019474  Ub_conjug_fac_E4_core  
IPR045132  UBE4  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000151  C:ubiquitin ligase complex  
GO:0034450  F:ubiquitin-ubiquitin ligase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
GO:0030433  P:ubiquitin-dependent ERAD pathway  
Pfam View protein in Pfam  
PF04564  U-box  
PF10408  Ufd2P_core  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51698  U_BOX  
Amino Acid Sequences MDPNEQPSWAGGDAPDKEKMEQARPQIRARRLAKLGTSTPVSAKSDENKAPDSESSNPSRTSTPKPQPQPQPASAESRPKINVTPAAPPASSSPNPFDKLGVKAEPSSSTADRPSPKPSTTQPESDESYADRTLSQIFRITVDPHNMVNSSGQRLTFLPNLNEELNESGEPLKLSVNTLDQALMEAASSYPHDKPLMNYFLPCWKRAVKASLQFKGTEGPKFEVHEEAKRLCMSGCLFALTMPDLYGRSPNPKHDTLMPYLLKGVQDENGLCFNFIQEAIKRFDDDEAFPALFNDAMVQISSKLGTISMDQDYKPYIQAMLTYTRFPPLIVNLAKHPTFTMAQSAAGIEKHTLLGPFFRISPLQNEVIKSYFPGARGLDKGRIANSQDALRMVLRTHQDDLFAITNAFIRAGQETRSRTLDWFAYIMNSNHKRRALQVDPREVASNGFMINVTTILDRFCEPFMDMDFSKVNKIDDNYFRKQPRINISDETKLNADQSYADSFYANKIPGETNFISEAFFLTLAAHHYGSEACNSQLKNLDRDIKYLEKRVKIMEADRIKFVNNPVQLQQYDKAVQRHVDALEKSIAVKLSIEGVLLDERMQSTSLRFMRIVAVWLLRLVTRSEYKPGQESKEIQLPLPAEKSDVFSCLPEYTLQNIVDNFKFIFRWLPKILPSAVGDEMIALCVTFLRSTEYIKNPYLKSSLVSLLFSATWPLMHLKRGVLGDQLVGSQFANDHLLKGLMKFYIECESTGADSAFYDKFNIRYEIFQVIKCVWVNDHYKRQLTRESRVNKQFFVQFVNMLLNDATYVLDEALTKFPKIRAIEKELEDPSIPQEDRQKKEEEMQQLANQATSFMQLANETLEMMKLFTEAMSEAFTMPEIVSRLASMLNYNLETLAGKKAAAELSVSNRDKYHFRPIQIISDIVDIYLNLGNSPVFIDAVAADGRSYKPEVLERVSRILISKHQKDPADVARWDKLRVKFVDAKTLLDQAELDLGDIPAEFEDPIMGDLMKDPVLLPSKHIVDRSTIVQHLLSDPKDPFTRQAMTIDDAIPQTELKERIEQWREERVQAAKDKLKSDVMDTTEG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.31
3 0.29
4 0.29
5 0.34
6 0.38
7 0.39
8 0.41
9 0.48
10 0.52
11 0.56
12 0.64
13 0.68
14 0.69
15 0.72
16 0.7
17 0.69
18 0.65
19 0.65
20 0.61
21 0.59
22 0.55
23 0.5
24 0.49
25 0.41
26 0.39
27 0.39
28 0.37
29 0.31
30 0.33
31 0.33
32 0.38
33 0.41
34 0.43
35 0.41
36 0.4
37 0.41
38 0.39
39 0.38
40 0.36
41 0.37
42 0.4
43 0.4
44 0.4
45 0.4
46 0.42
47 0.42
48 0.45
49 0.5
50 0.54
51 0.6
52 0.67
53 0.74
54 0.8
55 0.85
56 0.85
57 0.79
58 0.76
59 0.69
60 0.69
61 0.64
62 0.64
63 0.55
64 0.53
65 0.49
66 0.44
67 0.44
68 0.42
69 0.43
70 0.35
71 0.41
72 0.4
73 0.42
74 0.39
75 0.37
76 0.35
77 0.36
78 0.35
79 0.32
80 0.33
81 0.36
82 0.39
83 0.38
84 0.38
85 0.33
86 0.36
87 0.37
88 0.34
89 0.3
90 0.3
91 0.31
92 0.3
93 0.29
94 0.3
95 0.26
96 0.26
97 0.27
98 0.32
99 0.35
100 0.36
101 0.42
102 0.42
103 0.42
104 0.44
105 0.48
106 0.51
107 0.51
108 0.54
109 0.5
110 0.5
111 0.53
112 0.48
113 0.42
114 0.34
115 0.33
116 0.27
117 0.24
118 0.19
119 0.15
120 0.2
121 0.19
122 0.2
123 0.2
124 0.19
125 0.21
126 0.23
127 0.26
128 0.26
129 0.3
130 0.3
131 0.27
132 0.28
133 0.27
134 0.25
135 0.27
136 0.25
137 0.24
138 0.24
139 0.23
140 0.23
141 0.23
142 0.27
143 0.27
144 0.28
145 0.25
146 0.26
147 0.29
148 0.28
149 0.27
150 0.24
151 0.21
152 0.19
153 0.17
154 0.15
155 0.13
156 0.13
157 0.13
158 0.12
159 0.12
160 0.11
161 0.12
162 0.13
163 0.15
164 0.14
165 0.15
166 0.14
167 0.12
168 0.13
169 0.11
170 0.09
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.08
176 0.1
177 0.1
178 0.13
179 0.15
180 0.15
181 0.19
182 0.26
183 0.31
184 0.29
185 0.29
186 0.29
187 0.37
188 0.38
189 0.36
190 0.32
191 0.29
192 0.33
193 0.37
194 0.41
195 0.4
196 0.47
197 0.55
198 0.56
199 0.54
200 0.5
201 0.46
202 0.47
203 0.41
204 0.37
205 0.31
206 0.29
207 0.29
208 0.31
209 0.32
210 0.32
211 0.32
212 0.33
213 0.35
214 0.32
215 0.33
216 0.31
217 0.3
218 0.24
219 0.24
220 0.2
221 0.19
222 0.18
223 0.16
224 0.16
225 0.15
226 0.16
227 0.13
228 0.12
229 0.08
230 0.09
231 0.08
232 0.09
233 0.13
234 0.13
235 0.21
236 0.24
237 0.32
238 0.37
239 0.39
240 0.41
241 0.44
242 0.47
243 0.42
244 0.48
245 0.41
246 0.35
247 0.34
248 0.33
249 0.26
250 0.22
251 0.19
252 0.12
253 0.14
254 0.14
255 0.15
256 0.16
257 0.16
258 0.15
259 0.14
260 0.13
261 0.11
262 0.11
263 0.12
264 0.12
265 0.15
266 0.19
267 0.2
268 0.2
269 0.2
270 0.22
271 0.22
272 0.2
273 0.19
274 0.18
275 0.17
276 0.17
277 0.16
278 0.14
279 0.11
280 0.1
281 0.08
282 0.05
283 0.05
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.07
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.07
294 0.1
295 0.12
296 0.14
297 0.14
298 0.15
299 0.16
300 0.16
301 0.16
302 0.13
303 0.11
304 0.09
305 0.11
306 0.12
307 0.17
308 0.18
309 0.19
310 0.19
311 0.2
312 0.2
313 0.18
314 0.17
315 0.13
316 0.19
317 0.19
318 0.2
319 0.22
320 0.27
321 0.26
322 0.25
323 0.23
324 0.18
325 0.18
326 0.17
327 0.17
328 0.13
329 0.14
330 0.14
331 0.14
332 0.12
333 0.11
334 0.11
335 0.07
336 0.07
337 0.08
338 0.08
339 0.08
340 0.08
341 0.09
342 0.1
343 0.11
344 0.1
345 0.11
346 0.12
347 0.12
348 0.16
349 0.18
350 0.2
351 0.21
352 0.22
353 0.22
354 0.22
355 0.21
356 0.18
357 0.17
358 0.15
359 0.14
360 0.16
361 0.16
362 0.17
363 0.2
364 0.22
365 0.24
366 0.24
367 0.24
368 0.23
369 0.25
370 0.24
371 0.24
372 0.23
373 0.2
374 0.19
375 0.19
376 0.18
377 0.15
378 0.14
379 0.11
380 0.14
381 0.15
382 0.16
383 0.18
384 0.17
385 0.17
386 0.17
387 0.2
388 0.16
389 0.14
390 0.12
391 0.1
392 0.1
393 0.1
394 0.1
395 0.07
396 0.06
397 0.08
398 0.08
399 0.11
400 0.15
401 0.17
402 0.2
403 0.22
404 0.23
405 0.22
406 0.23
407 0.22
408 0.17
409 0.16
410 0.13
411 0.12
412 0.13
413 0.14
414 0.2
415 0.26
416 0.28
417 0.32
418 0.33
419 0.32
420 0.34
421 0.42
422 0.4
423 0.42
424 0.47
425 0.51
426 0.5
427 0.5
428 0.48
429 0.4
430 0.33
431 0.24
432 0.17
433 0.09
434 0.08
435 0.07
436 0.06
437 0.06
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.06
444 0.06
445 0.07
446 0.08
447 0.08
448 0.08
449 0.08
450 0.1
451 0.12
452 0.12
453 0.13
454 0.14
455 0.14
456 0.15
457 0.15
458 0.14
459 0.12
460 0.14
461 0.17
462 0.24
463 0.31
464 0.34
465 0.4
466 0.41
467 0.42
468 0.44
469 0.44
470 0.45
471 0.41
472 0.4
473 0.38
474 0.4
475 0.42
476 0.4
477 0.35
478 0.27
479 0.24
480 0.21
481 0.17
482 0.13
483 0.08
484 0.1
485 0.1
486 0.1
487 0.1
488 0.09
489 0.09
490 0.1
491 0.12
492 0.11
493 0.09
494 0.1
495 0.1
496 0.11
497 0.17
498 0.16
499 0.15
500 0.15
501 0.16
502 0.15
503 0.14
504 0.14
505 0.07
506 0.07
507 0.05
508 0.04
509 0.05
510 0.06
511 0.07
512 0.07
513 0.06
514 0.07
515 0.07
516 0.07
517 0.08
518 0.08
519 0.07
520 0.1
521 0.11
522 0.11
523 0.17
524 0.18
525 0.19
526 0.22
527 0.29
528 0.26
529 0.28
530 0.3
531 0.3
532 0.31
533 0.35
534 0.37
535 0.31
536 0.32
537 0.32
538 0.31
539 0.26
540 0.26
541 0.28
542 0.29
543 0.28
544 0.28
545 0.28
546 0.26
547 0.25
548 0.25
549 0.23
550 0.18
551 0.18
552 0.18
553 0.21
554 0.21
555 0.22
556 0.21
557 0.17
558 0.19
559 0.21
560 0.22
561 0.2
562 0.21
563 0.19
564 0.21
565 0.19
566 0.2
567 0.17
568 0.17
569 0.16
570 0.15
571 0.15
572 0.13
573 0.13
574 0.08
575 0.08
576 0.07
577 0.07
578 0.07
579 0.07
580 0.05
581 0.06
582 0.06
583 0.06
584 0.06
585 0.05
586 0.05
587 0.05
588 0.06
589 0.06
590 0.06
591 0.13
592 0.14
593 0.15
594 0.15
595 0.15
596 0.17
597 0.17
598 0.18
599 0.12
600 0.11
601 0.1
602 0.1
603 0.09
604 0.08
605 0.08
606 0.07
607 0.09
608 0.12
609 0.13
610 0.17
611 0.18
612 0.19
613 0.24
614 0.27
615 0.28
616 0.28
617 0.3
618 0.3
619 0.34
620 0.33
621 0.28
622 0.27
623 0.25
624 0.22
625 0.21
626 0.18
627 0.13
628 0.13
629 0.16
630 0.13
631 0.14
632 0.13
633 0.11
634 0.13
635 0.12
636 0.12
637 0.1
638 0.11
639 0.12
640 0.15
641 0.15
642 0.15
643 0.16
644 0.18
645 0.17
646 0.16
647 0.14
648 0.11
649 0.11
650 0.1
651 0.17
652 0.15
653 0.21
654 0.22
655 0.24
656 0.25
657 0.28
658 0.28
659 0.23
660 0.23
661 0.2
662 0.18
663 0.16
664 0.14
665 0.11
666 0.11
667 0.08
668 0.07
669 0.04
670 0.03
671 0.03
672 0.04
673 0.04
674 0.04
675 0.07
676 0.08
677 0.12
678 0.18
679 0.22
680 0.26
681 0.28
682 0.34
683 0.31
684 0.33
685 0.32
686 0.26
687 0.23
688 0.21
689 0.22
690 0.17
691 0.17
692 0.15
693 0.14
694 0.13
695 0.12
696 0.1
697 0.07
698 0.06
699 0.06
700 0.1
701 0.1
702 0.12
703 0.14
704 0.13
705 0.17
706 0.17
707 0.17
708 0.15
709 0.14
710 0.13
711 0.12
712 0.12
713 0.08
714 0.08
715 0.07
716 0.06
717 0.06
718 0.06
719 0.09
720 0.09
721 0.09
722 0.09
723 0.11
724 0.11
725 0.11
726 0.12
727 0.09
728 0.09
729 0.09
730 0.1
731 0.14
732 0.14
733 0.14
734 0.13
735 0.14
736 0.14
737 0.15
738 0.13
739 0.08
740 0.08
741 0.1
742 0.1
743 0.09
744 0.11
745 0.11
746 0.13
747 0.16
748 0.19
749 0.17
750 0.18
751 0.2
752 0.25
753 0.26
754 0.24
755 0.23
756 0.21
757 0.23
758 0.22
759 0.2
760 0.14
761 0.18
762 0.24
763 0.29
764 0.37
765 0.39
766 0.44
767 0.45
768 0.48
769 0.52
770 0.51
771 0.52
772 0.52
773 0.53
774 0.58
775 0.65
776 0.64
777 0.56
778 0.54
779 0.5
780 0.42
781 0.41
782 0.33
783 0.24
784 0.22
785 0.23
786 0.19
787 0.16
788 0.15
789 0.09
790 0.08
791 0.08
792 0.07
793 0.05
794 0.05
795 0.04
796 0.05
797 0.06
798 0.07
799 0.12
800 0.13
801 0.13
802 0.15
803 0.16
804 0.22
805 0.25
806 0.3
807 0.32
808 0.39
809 0.45
810 0.45
811 0.5
812 0.45
813 0.43
814 0.37
815 0.31
816 0.25
817 0.26
818 0.23
819 0.2
820 0.29
821 0.36
822 0.4
823 0.43
824 0.44
825 0.4
826 0.47
827 0.51
828 0.48
829 0.44
830 0.44
831 0.42
832 0.42
833 0.4
834 0.34
835 0.27
836 0.21
837 0.15
838 0.13
839 0.11
840 0.08
841 0.08
842 0.07
843 0.08
844 0.09
845 0.08
846 0.08
847 0.07
848 0.08
849 0.07
850 0.07
851 0.07
852 0.06
853 0.06
854 0.05
855 0.06
856 0.06
857 0.06
858 0.07
859 0.08
860 0.08
861 0.08
862 0.08
863 0.08
864 0.07
865 0.09
866 0.09
867 0.09
868 0.09
869 0.09
870 0.09
871 0.09
872 0.1
873 0.09
874 0.1
875 0.11
876 0.12
877 0.12
878 0.11
879 0.11
880 0.11
881 0.11
882 0.13
883 0.11
884 0.1
885 0.1
886 0.13
887 0.13
888 0.13
889 0.13
890 0.12
891 0.18
892 0.28
893 0.3
894 0.29
895 0.29
896 0.31
897 0.34
898 0.36
899 0.41
900 0.36
901 0.37
902 0.44
903 0.45
904 0.5
905 0.48
906 0.44
907 0.34
908 0.3
909 0.28
910 0.2
911 0.17
912 0.1
913 0.1
914 0.11
915 0.1
916 0.08
917 0.08
918 0.08
919 0.08
920 0.09
921 0.08
922 0.06
923 0.06
924 0.06
925 0.06
926 0.08
927 0.08
928 0.07
929 0.07
930 0.08
931 0.09
932 0.11
933 0.14
934 0.13
935 0.15
936 0.2
937 0.25
938 0.29
939 0.35
940 0.35
941 0.37
942 0.37
943 0.35
944 0.32
945 0.3
946 0.34
947 0.37
948 0.42
949 0.44
950 0.5
951 0.51
952 0.52
953 0.56
954 0.55
955 0.53
956 0.48
957 0.46
958 0.47
959 0.47
960 0.49
961 0.49
962 0.46
963 0.47
964 0.47
965 0.5
966 0.51
967 0.51
968 0.58
969 0.51
970 0.5
971 0.44
972 0.46
973 0.38
974 0.3
975 0.28
976 0.18
977 0.2
978 0.16
979 0.14
980 0.1
981 0.1
982 0.1
983 0.09
984 0.09
985 0.06
986 0.07
987 0.06
988 0.05
989 0.06
990 0.06
991 0.07
992 0.07
993 0.07
994 0.06
995 0.08
996 0.1
997 0.1
998 0.09
999 0.09
1000 0.14
1001 0.2
1002 0.2
1003 0.22
1004 0.27
1005 0.32
1006 0.35
1007 0.37
1008 0.32
1009 0.31
1010 0.34
1011 0.35
1012 0.34
1013 0.3
1014 0.29
1015 0.27
1016 0.27
1017 0.27
1018 0.3
1019 0.26
1020 0.26
1021 0.26
1022 0.3
1023 0.33
1024 0.33
1025 0.33
1026 0.33
1027 0.37
1028 0.34
1029 0.36
1030 0.34
1031 0.34
1032 0.35
1033 0.31
1034 0.27
1035 0.23
1036 0.22
1037 0.19
1038 0.16
1039 0.14
1040 0.18
1041 0.2
1042 0.2
1043 0.26
1044 0.29
1045 0.38
1046 0.45
1047 0.49
1048 0.49
1049 0.57
1050 0.57
1051 0.53
1052 0.55
1053 0.5
1054 0.51
1055 0.52
1056 0.56
1057 0.52
1058 0.54
1059 0.54
1060 0.52
1061 0.53
1062 0.47
1063 0.44
1064 0.42