Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1RMC6

Protein Details
Accession N1RMC6    Localization Confidence High Confidence Score 17.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-57CGDVLTKKKLDPHRNRCRGATFHydrophilic
81-111DQKYQGALYKDKKNKKQKHSHPNDNQQHYTQHydrophilic
243-272SKSERRKSRTSTEKKDKKRKRLHIDVPSDQBasic
312-335SPASPLKKSKHSKHSKHSKHASAGHydrophilic
341-386MIAGSKPKSKSKTKTKSSNKTKKSSSSSKKSHKEKKPQQLIEYRPQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
244-263KSERRKSRTSTEKKDKKRKR
317-377LKKSKHSKHSKHSKHASAGHSLFGMIAGSKPKSKSKTKTKSSNKTKKSSSSSKKSHKEKKP
Subcellular Location(s) mito_nucl 14.166, nucl 13.5, mito 12.5, cyto_nucl 7.999, cyto_mito 7.499
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039999  LYAR  
IPR014898  Znf_C2H2_LYAR  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF08790  zf-LYAR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51804  ZF_C2HC_LYAR  
Amino Acid Sequences MLSPPLVFLKYPSTPPRRIERVSIVLHPTYTLHAACGDVLTKKKLDPHRNRCRGATFTCIDCMVYFPGVQYRSHTSCMTEDQKYQGALYKDKKNKKQKHSHPNDNQQHYTQDQAMAEVQTLPNNTGNMSHYAYVEDVPEDQFGWAEYEESSDDESPNGPPPEAPTPPSAAPEPHVDVFEFLVGTGQTPNASNMNLDAEPGNSLVPYEPKDKSDEYGFMDDDEEPAVEYGSGPVPAAEFVTPASKSERRKSRTSTEKKDKKRKRLHIDVPSDQVMTDAPPVLHSGLTGGINRMMRPVFPPSPDYSGGDAPEISPASPLKKSKHSKHSKHSKHASAGHSLFGMIAGSKPKSKSKTKTKSSNKTKKSSSSSKKSHKEKKPQQLIEYRPQSKDGKTDPSAGQVVLYKPRADVFLSFVDKGPESEKGVSLNRVLKRFHREREATGSELGKGKEEKELWRSLRLRQNEQGEIVLFSVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.56
3 0.64
4 0.65
5 0.65
6 0.65
7 0.64
8 0.64
9 0.61
10 0.61
11 0.56
12 0.49
13 0.45
14 0.39
15 0.31
16 0.26
17 0.25
18 0.19
19 0.15
20 0.14
21 0.15
22 0.14
23 0.14
24 0.14
25 0.15
26 0.19
27 0.22
28 0.23
29 0.24
30 0.33
31 0.42
32 0.51
33 0.58
34 0.65
35 0.73
36 0.81
37 0.84
38 0.8
39 0.77
40 0.72
41 0.65
42 0.62
43 0.53
44 0.46
45 0.43
46 0.38
47 0.32
48 0.25
49 0.24
50 0.18
51 0.15
52 0.13
53 0.12
54 0.17
55 0.18
56 0.19
57 0.21
58 0.26
59 0.28
60 0.32
61 0.32
62 0.28
63 0.29
64 0.37
65 0.38
66 0.34
67 0.33
68 0.34
69 0.36
70 0.34
71 0.32
72 0.3
73 0.27
74 0.32
75 0.37
76 0.43
77 0.5
78 0.59
79 0.69
80 0.74
81 0.81
82 0.84
83 0.88
84 0.89
85 0.91
86 0.92
87 0.93
88 0.93
89 0.93
90 0.92
91 0.89
92 0.81
93 0.72
94 0.65
95 0.55
96 0.47
97 0.37
98 0.31
99 0.23
100 0.21
101 0.2
102 0.16
103 0.16
104 0.14
105 0.13
106 0.12
107 0.12
108 0.13
109 0.13
110 0.13
111 0.13
112 0.13
113 0.15
114 0.16
115 0.17
116 0.16
117 0.15
118 0.15
119 0.16
120 0.14
121 0.13
122 0.1
123 0.09
124 0.09
125 0.09
126 0.08
127 0.08
128 0.07
129 0.07
130 0.08
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.08
135 0.08
136 0.09
137 0.1
138 0.09
139 0.1
140 0.09
141 0.1
142 0.1
143 0.16
144 0.16
145 0.14
146 0.13
147 0.17
148 0.22
149 0.23
150 0.23
151 0.2
152 0.22
153 0.23
154 0.25
155 0.22
156 0.17
157 0.18
158 0.19
159 0.21
160 0.18
161 0.18
162 0.16
163 0.15
164 0.15
165 0.13
166 0.09
167 0.06
168 0.06
169 0.05
170 0.06
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.06
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.1
181 0.1
182 0.1
183 0.09
184 0.08
185 0.08
186 0.09
187 0.08
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.07
192 0.09
193 0.13
194 0.14
195 0.15
196 0.18
197 0.19
198 0.2
199 0.2
200 0.2
201 0.19
202 0.2
203 0.19
204 0.16
205 0.16
206 0.14
207 0.13
208 0.1
209 0.07
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.05
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.05
222 0.05
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.07
227 0.07
228 0.08
229 0.12
230 0.16
231 0.21
232 0.29
233 0.38
234 0.41
235 0.46
236 0.51
237 0.56
238 0.63
239 0.68
240 0.71
241 0.73
242 0.78
243 0.83
244 0.88
245 0.88
246 0.88
247 0.89
248 0.89
249 0.87
250 0.88
251 0.87
252 0.86
253 0.85
254 0.77
255 0.7
256 0.6
257 0.5
258 0.39
259 0.3
260 0.2
261 0.13
262 0.1
263 0.07
264 0.06
265 0.06
266 0.07
267 0.08
268 0.07
269 0.06
270 0.06
271 0.07
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.1
276 0.11
277 0.11
278 0.13
279 0.11
280 0.11
281 0.13
282 0.19
283 0.18
284 0.19
285 0.23
286 0.23
287 0.28
288 0.29
289 0.29
290 0.25
291 0.24
292 0.23
293 0.2
294 0.17
295 0.13
296 0.14
297 0.12
298 0.09
299 0.09
300 0.1
301 0.12
302 0.17
303 0.21
304 0.23
305 0.33
306 0.42
307 0.5
308 0.6
309 0.68
310 0.73
311 0.79
312 0.87
313 0.86
314 0.88
315 0.88
316 0.83
317 0.8
318 0.78
319 0.7
320 0.67
321 0.58
322 0.48
323 0.39
324 0.32
325 0.24
326 0.17
327 0.14
328 0.06
329 0.06
330 0.09
331 0.1
332 0.14
333 0.17
334 0.24
335 0.3
336 0.4
337 0.48
338 0.57
339 0.66
340 0.72
341 0.81
342 0.85
343 0.89
344 0.92
345 0.92
346 0.89
347 0.87
348 0.84
349 0.82
350 0.8
351 0.8
352 0.79
353 0.78
354 0.8
355 0.82
356 0.85
357 0.87
358 0.89
359 0.88
360 0.89
361 0.89
362 0.9
363 0.91
364 0.88
365 0.85
366 0.84
367 0.81
368 0.8
369 0.79
370 0.73
371 0.64
372 0.62
373 0.58
374 0.51
375 0.52
376 0.46
377 0.45
378 0.42
379 0.47
380 0.42
381 0.44
382 0.43
383 0.35
384 0.31
385 0.26
386 0.26
387 0.28
388 0.29
389 0.24
390 0.23
391 0.25
392 0.25
393 0.23
394 0.21
395 0.18
396 0.23
397 0.26
398 0.27
399 0.26
400 0.27
401 0.26
402 0.26
403 0.24
404 0.21
405 0.21
406 0.22
407 0.23
408 0.25
409 0.28
410 0.29
411 0.32
412 0.36
413 0.37
414 0.4
415 0.42
416 0.45
417 0.52
418 0.58
419 0.61
420 0.63
421 0.62
422 0.63
423 0.7
424 0.67
425 0.59
426 0.55
427 0.48
428 0.41
429 0.41
430 0.36
431 0.31
432 0.28
433 0.27
434 0.3
435 0.33
436 0.36
437 0.38
438 0.47
439 0.45
440 0.53
441 0.55
442 0.56
443 0.61
444 0.62
445 0.64
446 0.63
447 0.67
448 0.61
449 0.61
450 0.55
451 0.47
452 0.4