Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1REW3

Protein Details
Accession N1REW3    Localization Confidence High Confidence Score 17.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-27QSNWTTTTHGGRRKKRKGALTDNSSYHydrophilic
91-112GNFTKPGKRTSKKTKAQTGLEQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-18GRRKKRK
118-130KGLGPARIRGRIK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MQSNWTTTTHGGRRKKRKGALTDNSSYSMTSSSLVRTEQMTLLDARFDKIEERYNEDMEDDMQSMSAVSTMSTVQGPVRGDFDNIMDDFLGNFTKPGKRTSKKTKAQTGLEQLEEIRKGLGPARIRGRIK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.82
3 0.82
4 0.83
5 0.85
6 0.86
7 0.85
8 0.82
9 0.77
10 0.7
11 0.64
12 0.55
13 0.44
14 0.34
15 0.25
16 0.17
17 0.13
18 0.11
19 0.1
20 0.11
21 0.11
22 0.12
23 0.11
24 0.12
25 0.13
26 0.12
27 0.12
28 0.12
29 0.12
30 0.13
31 0.12
32 0.11
33 0.1
34 0.1
35 0.1
36 0.12
37 0.19
38 0.18
39 0.25
40 0.26
41 0.26
42 0.26
43 0.25
44 0.23
45 0.16
46 0.16
47 0.09
48 0.07
49 0.06
50 0.06
51 0.05
52 0.05
53 0.04
54 0.04
55 0.03
56 0.04
57 0.04
58 0.05
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.08
63 0.09
64 0.09
65 0.11
66 0.11
67 0.12
68 0.12
69 0.12
70 0.12
71 0.11
72 0.11
73 0.08
74 0.08
75 0.07
76 0.08
77 0.08
78 0.05
79 0.06
80 0.08
81 0.13
82 0.14
83 0.21
84 0.31
85 0.37
86 0.47
87 0.58
88 0.66
89 0.71
90 0.79
91 0.83
92 0.81
93 0.81
94 0.79
95 0.77
96 0.7
97 0.62
98 0.53
99 0.44
100 0.4
101 0.34
102 0.26
103 0.18
104 0.14
105 0.14
106 0.18
107 0.24
108 0.24
109 0.31
110 0.39