Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1RDR3

Protein Details
Accession N1RDR3    Localization Confidence High Confidence Score 21.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-58KGAADAFKKQREKKGWKATAAHydrophilic
79-103GDDSSKSSKSSKKKSSKKDSSSSASHydrophilic
285-310SDSDAKETKKDKKIKKEKEAKDSSDSBasic
379-406LIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
88-94SSKKKSS
184-189KAKKQK
293-303KKDKKIKKEKE
385-398KGFTKEKNKKKRGS
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11.5, mito 5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MGKKSTKAAAPKNDAASAPPPGQLMDLVENFLSDHSFKGAADAFKKQREKKGWKATAATDEEGNPSLVSVYQTWEATKGDDSSKSSKSSKKKSSKKDSSSSASSDSSSDSSDAKEEDVDMKDAESSSDSDSSSDSDSDDEAAKPKASNTLKRKAPVDESSSDSSSDSDSDSSSSDSETDSDKPKAKKQKRAASSSSSSDSSSSSSESSDSSDSSDSSDSDSSSDSDDESAKSDSGSSSSDSSSDSSSDSDSSDSDDDAAAKVPLPDSDSSSSDSDSASSDSDSDSDSDAKETKKDKKIKKEKEAKDSSDSSVTLDKTSPEFQSNSAYPPLPPDPVVNGNGRKKQNEPFSRIPKNIKVDAKFASNEYVSIAYSQKAHEDLIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDIHDKKGIYFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.51
3 0.45
4 0.4
5 0.33
6 0.28
7 0.25
8 0.22
9 0.23
10 0.19
11 0.19
12 0.19
13 0.18
14 0.17
15 0.17
16 0.16
17 0.16
18 0.15
19 0.14
20 0.09
21 0.1
22 0.1
23 0.11
24 0.11
25 0.14
26 0.19
27 0.21
28 0.24
29 0.32
30 0.37
31 0.45
32 0.54
33 0.57
34 0.63
35 0.69
36 0.75
37 0.77
38 0.82
39 0.81
40 0.78
41 0.76
42 0.71
43 0.69
44 0.64
45 0.54
46 0.45
47 0.38
48 0.34
49 0.3
50 0.26
51 0.17
52 0.12
53 0.11
54 0.1
55 0.11
56 0.09
57 0.11
58 0.13
59 0.14
60 0.14
61 0.16
62 0.16
63 0.16
64 0.17
65 0.16
66 0.17
67 0.2
68 0.24
69 0.27
70 0.3
71 0.33
72 0.37
73 0.42
74 0.49
75 0.57
76 0.63
77 0.68
78 0.75
79 0.81
80 0.87
81 0.9
82 0.89
83 0.87
84 0.84
85 0.8
86 0.74
87 0.66
88 0.58
89 0.48
90 0.4
91 0.33
92 0.27
93 0.21
94 0.17
95 0.16
96 0.12
97 0.12
98 0.13
99 0.12
100 0.11
101 0.1
102 0.1
103 0.13
104 0.14
105 0.14
106 0.13
107 0.12
108 0.13
109 0.12
110 0.12
111 0.09
112 0.09
113 0.1
114 0.11
115 0.11
116 0.11
117 0.11
118 0.12
119 0.12
120 0.11
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.1
125 0.1
126 0.1
127 0.1
128 0.12
129 0.12
130 0.12
131 0.12
132 0.2
133 0.23
134 0.32
135 0.37
136 0.45
137 0.49
138 0.52
139 0.54
140 0.49
141 0.5
142 0.46
143 0.44
144 0.37
145 0.37
146 0.37
147 0.35
148 0.32
149 0.26
150 0.21
151 0.17
152 0.15
153 0.11
154 0.08
155 0.07
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.07
162 0.07
163 0.08
164 0.09
165 0.11
166 0.14
167 0.17
168 0.23
169 0.26
170 0.33
171 0.43
172 0.49
173 0.57
174 0.63
175 0.69
176 0.7
177 0.75
178 0.72
179 0.68
180 0.63
181 0.56
182 0.48
183 0.4
184 0.33
185 0.26
186 0.22
187 0.17
188 0.14
189 0.12
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.1
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.1
202 0.08
203 0.09
204 0.1
205 0.08
206 0.09
207 0.09
208 0.08
209 0.09
210 0.09
211 0.07
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.09
216 0.1
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.09
223 0.08
224 0.09
225 0.09
226 0.1
227 0.1
228 0.11
229 0.1
230 0.1
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.09
236 0.09
237 0.08
238 0.1
239 0.09
240 0.09
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.06
247 0.06
248 0.07
249 0.06
250 0.07
251 0.09
252 0.09
253 0.12
254 0.15
255 0.16
256 0.18
257 0.19
258 0.19
259 0.17
260 0.16
261 0.13
262 0.11
263 0.11
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.09
273 0.09
274 0.11
275 0.13
276 0.14
277 0.18
278 0.24
279 0.32
280 0.4
281 0.5
282 0.57
283 0.65
284 0.76
285 0.81
286 0.86
287 0.88
288 0.87
289 0.88
290 0.88
291 0.81
292 0.77
293 0.69
294 0.61
295 0.53
296 0.44
297 0.35
298 0.31
299 0.27
300 0.22
301 0.2
302 0.18
303 0.18
304 0.21
305 0.21
306 0.2
307 0.21
308 0.21
309 0.26
310 0.26
311 0.26
312 0.26
313 0.24
314 0.21
315 0.26
316 0.27
317 0.22
318 0.22
319 0.21
320 0.22
321 0.26
322 0.29
323 0.3
324 0.35
325 0.41
326 0.48
327 0.51
328 0.5
329 0.51
330 0.56
331 0.61
332 0.61
333 0.62
334 0.64
335 0.69
336 0.74
337 0.76
338 0.75
339 0.72
340 0.71
341 0.7
342 0.68
343 0.61
344 0.58
345 0.55
346 0.52
347 0.45
348 0.4
349 0.36
350 0.28
351 0.26
352 0.22
353 0.2
354 0.16
355 0.16
356 0.16
357 0.13
358 0.14
359 0.15
360 0.16
361 0.16
362 0.16
363 0.16
364 0.17
365 0.18
366 0.23
367 0.28
368 0.25
369 0.26
370 0.3
371 0.32
372 0.36
373 0.39
374 0.42
375 0.48
376 0.59
377 0.67
378 0.74
379 0.82
380 0.83
381 0.9
382 0.91
383 0.9
384 0.9
385 0.88
386 0.86
387 0.84
388 0.78
389 0.68
390 0.6
391 0.6
392 0.53
393 0.47
394 0.4
395 0.32
396 0.28