Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1RR38

Protein Details
Accession N1RR38    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
112-136QRQPELKTRRFRRYNYQRAKCEDPTHydrophilic
462-488LEQENRIVGRRRRGKRTRLQRGGPLTIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
470-480GRRRRGKRTRL
Subcellular Location(s) nucl 13, cysk 6, cyto 4, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004875  DDE_SF_endonuclease_dom  
IPR006600  HTH_CenpB_DNA-bd_dom  
IPR007889  HTH_Psq  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03184  DDE_1  
PF05225  HTH_psq  
PF03221  HTH_Tnp_Tc5  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51253  HTH_CENPB  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MSESLYEARILLALQALQNDPKLSGRKAASIYQVNYRTLNRRRQGIQSKHDITTKSRNLSDLEEQIIVQFVLDLDSRGFPPRRDFVEKMANSLLADRDVSPVGIRWVHNFIQRQPELKTRRFRRYNYQRAKCEDPTIIRDWFRLVENTVAKYGIQLDDMWNFDETGFMMGMIEPGMVVTSSERQGMPKKVQPGNREWITAIEAINAEGQSIPPFIIGSGQYHLANWYRECDLPGDWVIALSENGWTNNQLGLDWLKHFDRSTKDRSVGSYRLLILDGHESHHSAEFMRYCEEKKIITLCMPAHASHLLQPLDVGCFGPLKKAYGRAIERLIGCSINHISKTEFFPAFHAAHRATITENNIRGGFRGAGLAPLNPENIISKLDVQLRTPTPPAEVTAPSTPWASRTPKTVLEAQSHSKYLKARIINHKSSSPESMLEAVGHFEKAASVLIYKIVLLEDRVKQLEQENRIVGRRRRGKRTRLQRGGPLTIEEASQVIDQMDVDTQVAAESSRSGGQGSSGRPRVWHCGTCGKAGHNARTCQEVIEVNMEEYSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.13
3 0.14
4 0.16
5 0.18
6 0.18
7 0.18
8 0.22
9 0.27
10 0.26
11 0.32
12 0.32
13 0.36
14 0.39
15 0.43
16 0.45
17 0.47
18 0.48
19 0.49
20 0.51
21 0.48
22 0.48
23 0.48
24 0.5
25 0.51
26 0.59
27 0.56
28 0.59
29 0.61
30 0.68
31 0.74
32 0.74
33 0.73
34 0.74
35 0.73
36 0.69
37 0.69
38 0.61
39 0.57
40 0.58
41 0.57
42 0.53
43 0.49
44 0.48
45 0.46
46 0.48
47 0.48
48 0.4
49 0.35
50 0.3
51 0.28
52 0.26
53 0.24
54 0.18
55 0.12
56 0.09
57 0.06
58 0.07
59 0.07
60 0.08
61 0.08
62 0.1
63 0.11
64 0.18
65 0.21
66 0.22
67 0.28
68 0.33
69 0.39
70 0.46
71 0.47
72 0.46
73 0.55
74 0.52
75 0.5
76 0.46
77 0.4
78 0.32
79 0.31
80 0.25
81 0.16
82 0.17
83 0.13
84 0.13
85 0.13
86 0.13
87 0.12
88 0.12
89 0.14
90 0.16
91 0.16
92 0.17
93 0.22
94 0.25
95 0.31
96 0.33
97 0.34
98 0.41
99 0.42
100 0.42
101 0.4
102 0.47
103 0.49
104 0.53
105 0.6
106 0.58
107 0.67
108 0.72
109 0.73
110 0.76
111 0.79
112 0.82
113 0.83
114 0.84
115 0.81
116 0.79
117 0.81
118 0.73
119 0.66
120 0.6
121 0.53
122 0.49
123 0.46
124 0.43
125 0.37
126 0.34
127 0.31
128 0.27
129 0.25
130 0.21
131 0.19
132 0.21
133 0.23
134 0.24
135 0.23
136 0.21
137 0.19
138 0.18
139 0.19
140 0.13
141 0.11
142 0.1
143 0.11
144 0.13
145 0.14
146 0.14
147 0.12
148 0.12
149 0.11
150 0.11
151 0.09
152 0.08
153 0.07
154 0.06
155 0.06
156 0.05
157 0.06
158 0.05
159 0.05
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.04
166 0.07
167 0.08
168 0.09
169 0.1
170 0.13
171 0.19
172 0.24
173 0.28
174 0.3
175 0.38
176 0.42
177 0.48
178 0.5
179 0.5
180 0.54
181 0.5
182 0.47
183 0.39
184 0.34
185 0.31
186 0.27
187 0.21
188 0.13
189 0.11
190 0.11
191 0.11
192 0.1
193 0.08
194 0.06
195 0.07
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.07
204 0.07
205 0.08
206 0.1
207 0.1
208 0.1
209 0.12
210 0.13
211 0.14
212 0.13
213 0.14
214 0.14
215 0.15
216 0.16
217 0.15
218 0.13
219 0.14
220 0.14
221 0.12
222 0.1
223 0.09
224 0.09
225 0.08
226 0.07
227 0.05
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.09
235 0.08
236 0.07
237 0.07
238 0.08
239 0.09
240 0.09
241 0.11
242 0.1
243 0.11
244 0.11
245 0.14
246 0.19
247 0.23
248 0.29
249 0.31
250 0.33
251 0.33
252 0.36
253 0.37
254 0.34
255 0.3
256 0.26
257 0.22
258 0.2
259 0.2
260 0.16
261 0.11
262 0.13
263 0.11
264 0.1
265 0.1
266 0.1
267 0.1
268 0.11
269 0.11
270 0.08
271 0.1
272 0.1
273 0.11
274 0.12
275 0.13
276 0.13
277 0.15
278 0.16
279 0.14
280 0.15
281 0.16
282 0.15
283 0.15
284 0.17
285 0.15
286 0.16
287 0.17
288 0.16
289 0.15
290 0.15
291 0.14
292 0.14
293 0.18
294 0.15
295 0.14
296 0.14
297 0.12
298 0.12
299 0.12
300 0.09
301 0.05
302 0.07
303 0.07
304 0.1
305 0.1
306 0.11
307 0.12
308 0.17
309 0.19
310 0.25
311 0.27
312 0.28
313 0.29
314 0.3
315 0.3
316 0.27
317 0.25
318 0.19
319 0.16
320 0.16
321 0.16
322 0.14
323 0.14
324 0.13
325 0.14
326 0.15
327 0.18
328 0.21
329 0.2
330 0.18
331 0.2
332 0.23
333 0.23
334 0.21
335 0.22
336 0.17
337 0.18
338 0.18
339 0.17
340 0.14
341 0.16
342 0.19
343 0.21
344 0.21
345 0.21
346 0.22
347 0.21
348 0.2
349 0.19
350 0.15
351 0.11
352 0.11
353 0.09
354 0.11
355 0.11
356 0.11
357 0.11
358 0.11
359 0.11
360 0.1
361 0.1
362 0.09
363 0.1
364 0.1
365 0.1
366 0.1
367 0.14
368 0.19
369 0.2
370 0.2
371 0.25
372 0.26
373 0.28
374 0.28
375 0.24
376 0.21
377 0.21
378 0.21
379 0.18
380 0.17
381 0.19
382 0.2
383 0.2
384 0.19
385 0.2
386 0.18
387 0.17
388 0.22
389 0.23
390 0.23
391 0.27
392 0.3
393 0.32
394 0.36
395 0.4
396 0.38
397 0.38
398 0.41
399 0.42
400 0.41
401 0.39
402 0.36
403 0.33
404 0.32
405 0.31
406 0.34
407 0.34
408 0.39
409 0.49
410 0.58
411 0.61
412 0.62
413 0.61
414 0.58
415 0.55
416 0.5
417 0.41
418 0.33
419 0.28
420 0.26
421 0.22
422 0.19
423 0.16
424 0.14
425 0.12
426 0.11
427 0.09
428 0.08
429 0.07
430 0.07
431 0.08
432 0.06
433 0.06
434 0.07
435 0.08
436 0.08
437 0.08
438 0.07
439 0.07
440 0.07
441 0.09
442 0.14
443 0.16
444 0.2
445 0.22
446 0.22
447 0.23
448 0.29
449 0.34
450 0.34
451 0.36
452 0.36
453 0.38
454 0.44
455 0.51
456 0.5
457 0.53
458 0.59
459 0.63
460 0.69
461 0.76
462 0.81
463 0.83
464 0.88
465 0.89
466 0.89
467 0.87
468 0.85
469 0.83
470 0.78
471 0.68
472 0.59
473 0.5
474 0.4
475 0.34
476 0.25
477 0.18
478 0.13
479 0.12
480 0.1
481 0.08
482 0.07
483 0.07
484 0.08
485 0.08
486 0.08
487 0.08
488 0.07
489 0.07
490 0.07
491 0.07
492 0.06
493 0.06
494 0.06
495 0.08
496 0.09
497 0.1
498 0.1
499 0.1
500 0.14
501 0.19
502 0.23
503 0.31
504 0.34
505 0.35
506 0.37
507 0.41
508 0.46
509 0.48
510 0.47
511 0.43
512 0.49
513 0.5
514 0.54
515 0.53
516 0.47
517 0.49
518 0.51
519 0.56
520 0.53
521 0.55
522 0.5
523 0.52
524 0.5
525 0.42
526 0.39
527 0.32
528 0.27
529 0.28
530 0.27
531 0.23