Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1RIH9

Protein Details
Accession N1RIH9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-44VRGDSPEKERPSKRAKRQGSPDSEGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
27-35ERPSKRAKR
Subcellular Location(s) nucl 11.5, mito 9, cyto_nucl 8.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR033315  Fan1-like  
IPR011856  tRNA_endonuc-like_dom_sf  
IPR014883  VRR_NUC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0004528  F:phosphodiesterase I activity  
GO:0036297  P:interstrand cross-link repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF08774  VRR_NUC  
CDD cd22326  FAN1-like  
Amino Acid Sequences MDAFVTRLSKPPSQLREQVRGDSPEKERPSKRAKRQGSPDSEGGLCPDHPQDISPREDFPDNEAAKTKYQTEEHPRITGIESALPPAAEGQEAVEQYETMKSSQASAHVEDDTTETTQPLWVKGRSSIYVDAFNLALDTVLEEESHLFDGKETEVFKQWRELNYEAQYLYVRLFLRKTASWHRHSRLGYHNDISDLEAAITTLQSSRVLPASTATPIQSPVHDLELEESRLDETFSFADRSEDHFDSVEEAASLLSLDELKELAKEAKVQGRNKSELIRSLVKMSKQQSGLMSVGLSRHNSRGSVSEDQENLDAKAKGKDTAKLRREDSNREQHFLTKILAVLGPCIRLSPPAFKLFERVHLVFYRSTEWTEKSLTTIILAKIARRHFPEYIVCRTSTIFMSRLHLLEYETAIRMEAEVDAWEFSSPPGDEGLRLMVNIFEKVYPRWKILVEEEQHKEHTVYEMGEGAYLRRFTPGHSYTRIVHKAAPVFGKLKQHLREHELLTELLDQRLFHPARRGSWYQRKALLEEHYMPALDPNPKFTDPEQQKKHWKKIAVATCEAGLQDPDCHLIFHYDLQKRLVKLEKKLRIPRRLQHDFGHVDLQKPIEHTIKGIQLKKDIIAKGGRQVSTKTIWLDELDTQEECSVEAMCLSQYRSEGWKGYHAEGGIIRTLFAYLFYDILFIYIPNVFQTAYQTCPLDLHTDAFYPSRASEINHRLVEIANGEAPRLIRKVWESEHERRTSVVGLNWDFEIDDLVELAGCFEGSALAAVCKVMAQEYRQRGGGIPDLILWRTNNLPEDSKKVPGRPKGEVMFSEVKSANDRLSDTQRLWIHVLTGAGVKVALCNAIAKEVREVD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.63
3 0.67
4 0.67
5 0.67
6 0.63
7 0.62
8 0.57
9 0.56
10 0.54
11 0.54
12 0.57
13 0.6
14 0.59
15 0.62
16 0.7
17 0.73
18 0.79
19 0.8
20 0.82
21 0.83
22 0.89
23 0.9
24 0.88
25 0.84
26 0.76
27 0.69
28 0.6
29 0.5
30 0.42
31 0.34
32 0.25
33 0.21
34 0.19
35 0.17
36 0.17
37 0.18
38 0.24
39 0.26
40 0.31
41 0.31
42 0.31
43 0.33
44 0.36
45 0.36
46 0.33
47 0.38
48 0.34
49 0.34
50 0.36
51 0.35
52 0.35
53 0.37
54 0.35
55 0.31
56 0.33
57 0.4
58 0.46
59 0.53
60 0.53
61 0.52
62 0.49
63 0.45
64 0.45
65 0.39
66 0.3
67 0.26
68 0.22
69 0.22
70 0.22
71 0.2
72 0.18
73 0.16
74 0.15
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.12
79 0.12
80 0.13
81 0.12
82 0.12
83 0.12
84 0.15
85 0.14
86 0.11
87 0.14
88 0.13
89 0.15
90 0.17
91 0.2
92 0.21
93 0.22
94 0.24
95 0.22
96 0.22
97 0.21
98 0.21
99 0.19
100 0.17
101 0.14
102 0.12
103 0.12
104 0.15
105 0.16
106 0.18
107 0.21
108 0.21
109 0.23
110 0.28
111 0.32
112 0.31
113 0.34
114 0.35
115 0.32
116 0.34
117 0.32
118 0.28
119 0.24
120 0.21
121 0.17
122 0.12
123 0.09
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.06
130 0.06
131 0.08
132 0.09
133 0.09
134 0.08
135 0.08
136 0.1
137 0.11
138 0.13
139 0.13
140 0.14
141 0.21
142 0.23
143 0.24
144 0.3
145 0.33
146 0.34
147 0.39
148 0.4
149 0.39
150 0.42
151 0.43
152 0.36
153 0.32
154 0.29
155 0.23
156 0.21
157 0.19
158 0.16
159 0.15
160 0.16
161 0.17
162 0.21
163 0.22
164 0.28
165 0.35
166 0.42
167 0.48
168 0.56
169 0.58
170 0.61
171 0.6
172 0.6
173 0.59
174 0.58
175 0.55
176 0.49
177 0.46
178 0.39
179 0.38
180 0.33
181 0.24
182 0.17
183 0.12
184 0.09
185 0.08
186 0.07
187 0.06
188 0.06
189 0.05
190 0.06
191 0.07
192 0.07
193 0.09
194 0.11
195 0.11
196 0.11
197 0.12
198 0.13
199 0.14
200 0.15
201 0.14
202 0.12
203 0.15
204 0.15
205 0.14
206 0.15
207 0.15
208 0.16
209 0.16
210 0.15
211 0.15
212 0.17
213 0.18
214 0.15
215 0.14
216 0.12
217 0.12
218 0.12
219 0.09
220 0.08
221 0.08
222 0.1
223 0.11
224 0.1
225 0.12
226 0.12
227 0.18
228 0.22
229 0.22
230 0.21
231 0.2
232 0.2
233 0.21
234 0.2
235 0.15
236 0.09
237 0.08
238 0.07
239 0.06
240 0.06
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.05
249 0.06
250 0.08
251 0.08
252 0.1
253 0.13
254 0.21
255 0.28
256 0.32
257 0.39
258 0.44
259 0.46
260 0.46
261 0.47
262 0.42
263 0.39
264 0.41
265 0.37
266 0.32
267 0.35
268 0.36
269 0.33
270 0.37
271 0.35
272 0.35
273 0.32
274 0.33
275 0.29
276 0.29
277 0.27
278 0.22
279 0.19
280 0.13
281 0.14
282 0.13
283 0.14
284 0.12
285 0.14
286 0.15
287 0.15
288 0.15
289 0.17
290 0.21
291 0.24
292 0.25
293 0.27
294 0.26
295 0.27
296 0.27
297 0.24
298 0.2
299 0.18
300 0.17
301 0.14
302 0.18
303 0.18
304 0.2
305 0.21
306 0.26
307 0.31
308 0.4
309 0.45
310 0.46
311 0.48
312 0.52
313 0.55
314 0.58
315 0.59
316 0.59
317 0.55
318 0.52
319 0.5
320 0.45
321 0.42
322 0.35
323 0.27
324 0.17
325 0.15
326 0.14
327 0.14
328 0.11
329 0.11
330 0.1
331 0.1
332 0.09
333 0.09
334 0.08
335 0.1
336 0.12
337 0.15
338 0.18
339 0.22
340 0.24
341 0.24
342 0.29
343 0.27
344 0.31
345 0.31
346 0.29
347 0.27
348 0.26
349 0.28
350 0.24
351 0.24
352 0.21
353 0.16
354 0.17
355 0.17
356 0.17
357 0.17
358 0.18
359 0.17
360 0.15
361 0.16
362 0.14
363 0.12
364 0.14
365 0.12
366 0.15
367 0.15
368 0.15
369 0.19
370 0.21
371 0.24
372 0.24
373 0.28
374 0.24
375 0.27
376 0.32
377 0.32
378 0.36
379 0.34
380 0.31
381 0.28
382 0.27
383 0.26
384 0.2
385 0.17
386 0.14
387 0.13
388 0.15
389 0.16
390 0.16
391 0.15
392 0.14
393 0.13
394 0.11
395 0.11
396 0.09
397 0.08
398 0.08
399 0.08
400 0.07
401 0.06
402 0.06
403 0.05
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.04
412 0.06
413 0.05
414 0.05
415 0.06
416 0.06
417 0.06
418 0.07
419 0.08
420 0.07
421 0.07
422 0.06
423 0.07
424 0.07
425 0.07
426 0.07
427 0.06
428 0.08
429 0.09
430 0.15
431 0.16
432 0.17
433 0.18
434 0.19
435 0.2
436 0.22
437 0.29
438 0.25
439 0.3
440 0.31
441 0.31
442 0.31
443 0.29
444 0.26
445 0.19
446 0.17
447 0.12
448 0.1
449 0.09
450 0.09
451 0.09
452 0.09
453 0.09
454 0.07
455 0.08
456 0.08
457 0.08
458 0.09
459 0.09
460 0.09
461 0.18
462 0.21
463 0.24
464 0.26
465 0.28
466 0.29
467 0.37
468 0.39
469 0.31
470 0.29
471 0.28
472 0.28
473 0.28
474 0.27
475 0.21
476 0.2
477 0.22
478 0.26
479 0.26
480 0.31
481 0.34
482 0.37
483 0.39
484 0.43
485 0.44
486 0.39
487 0.37
488 0.32
489 0.26
490 0.22
491 0.22
492 0.17
493 0.13
494 0.12
495 0.11
496 0.1
497 0.19
498 0.19
499 0.16
500 0.23
501 0.25
502 0.27
503 0.33
504 0.37
505 0.37
506 0.47
507 0.51
508 0.48
509 0.52
510 0.5
511 0.46
512 0.46
513 0.41
514 0.35
515 0.32
516 0.29
517 0.23
518 0.22
519 0.2
520 0.17
521 0.16
522 0.17
523 0.15
524 0.17
525 0.21
526 0.22
527 0.24
528 0.23
529 0.31
530 0.34
531 0.44
532 0.46
533 0.49
534 0.6
535 0.67
536 0.75
537 0.7
538 0.66
539 0.61
540 0.65
541 0.66
542 0.61
543 0.54
544 0.46
545 0.4
546 0.37
547 0.31
548 0.22
549 0.14
550 0.09
551 0.07
552 0.07
553 0.09
554 0.08
555 0.09
556 0.09
557 0.1
558 0.1
559 0.14
560 0.22
561 0.23
562 0.24
563 0.28
564 0.31
565 0.3
566 0.34
567 0.38
568 0.35
569 0.41
570 0.5
571 0.54
572 0.6
573 0.69
574 0.74
575 0.75
576 0.78
577 0.76
578 0.76
579 0.75
580 0.69
581 0.63
582 0.61
583 0.54
584 0.47
585 0.48
586 0.39
587 0.33
588 0.31
589 0.28
590 0.22
591 0.21
592 0.22
593 0.18
594 0.17
595 0.17
596 0.19
597 0.25
598 0.31
599 0.34
600 0.33
601 0.34
602 0.35
603 0.36
604 0.38
605 0.32
606 0.3
607 0.29
608 0.28
609 0.32
610 0.36
611 0.35
612 0.3
613 0.31
614 0.31
615 0.3
616 0.31
617 0.25
618 0.2
619 0.2
620 0.19
621 0.2
622 0.18
623 0.18
624 0.17
625 0.16
626 0.16
627 0.15
628 0.14
629 0.12
630 0.1
631 0.08
632 0.06
633 0.06
634 0.06
635 0.06
636 0.08
637 0.09
638 0.1
639 0.1
640 0.12
641 0.15
642 0.18
643 0.2
644 0.2
645 0.26
646 0.28
647 0.29
648 0.29
649 0.26
650 0.25
651 0.24
652 0.24
653 0.19
654 0.16
655 0.14
656 0.12
657 0.12
658 0.1
659 0.09
660 0.09
661 0.07
662 0.08
663 0.08
664 0.08
665 0.08
666 0.08
667 0.08
668 0.05
669 0.06
670 0.07
671 0.07
672 0.07
673 0.08
674 0.08
675 0.08
676 0.13
677 0.14
678 0.16
679 0.18
680 0.18
681 0.18
682 0.18
683 0.19
684 0.18
685 0.16
686 0.16
687 0.15
688 0.15
689 0.16
690 0.16
691 0.16
692 0.14
693 0.13
694 0.13
695 0.13
696 0.14
697 0.22
698 0.29
699 0.36
700 0.35
701 0.35
702 0.33
703 0.33
704 0.33
705 0.24
706 0.18
707 0.14
708 0.13
709 0.13
710 0.14
711 0.14
712 0.16
713 0.16
714 0.15
715 0.15
716 0.18
717 0.25
718 0.27
719 0.35
720 0.4
721 0.49
722 0.57
723 0.56
724 0.54
725 0.48
726 0.47
727 0.41
728 0.36
729 0.3
730 0.29
731 0.27
732 0.28
733 0.27
734 0.25
735 0.21
736 0.18
737 0.16
738 0.09
739 0.08
740 0.06
741 0.06
742 0.06
743 0.06
744 0.07
745 0.05
746 0.04
747 0.04
748 0.04
749 0.04
750 0.04
751 0.05
752 0.05
753 0.05
754 0.06
755 0.06
756 0.06
757 0.06
758 0.06
759 0.08
760 0.1
761 0.15
762 0.24
763 0.3
764 0.33
765 0.34
766 0.35
767 0.34
768 0.35
769 0.37
770 0.29
771 0.23
772 0.23
773 0.24
774 0.24
775 0.25
776 0.21
777 0.18
778 0.19
779 0.23
780 0.24
781 0.25
782 0.31
783 0.32
784 0.38
785 0.39
786 0.44
787 0.46
788 0.49
789 0.55
790 0.57
791 0.6
792 0.6
793 0.65
794 0.61
795 0.62
796 0.55
797 0.54
798 0.53
799 0.47
800 0.47
801 0.4
802 0.37
803 0.36
804 0.36
805 0.3
806 0.25
807 0.28
808 0.27
809 0.33
810 0.37
811 0.34
812 0.41
813 0.41
814 0.42
815 0.42
816 0.36
817 0.31
818 0.27
819 0.26
820 0.19
821 0.19
822 0.15
823 0.13
824 0.12
825 0.11
826 0.09
827 0.1
828 0.09
829 0.07
830 0.1
831 0.1
832 0.17
833 0.19
834 0.2