Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0DGG0

Protein Details
Accession B0DGG0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
37-62ICNKVLSRKHDLSRHKKTHNPVKDFIHydrophilic
121-148GPRDPTSRSAKSRQRRARKDPSESFRRYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
130-139AKSRQRRARK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10.5, cyto 4.5, mito 2, extr 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_294677  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
Amino Acid Sequences MPASRKAQAAAKAAKSTSFEVPSVLAVAPPGGAVCDICNKVLSRKHDLSRHKKTHNPVKDFICACCNRGWSNLQELNIHLDRKAGNKPHKCPFTDCEFKTADPASLTRHKKNIHQYVPQVGPRDPTSRSAKSRQRRARKDPSESFRRYSESYRSRCSSPSGSSSASSSDFPSTPSDRSSLDLSTCIEDLCLHDIGPEGVFVPWTFPWESVVDDPNFELSCPSSHGFFLHRRVTPEDPSATPRDTHAAHESSSVTRGHEQGCQDIQVLGSGKSEEQLLTKSSTKKSPDHTDSDPSNIHLPLLSLPYPFITFMDSIEAASSPNFNGYYHHRVLQQETEMFNNVIVAHSPQHEQVPVQYYGDLPAPQESVDFDLTPAPFNVDAAIFAQLSQFEQNPYAPYQQLDFNLDMGTLKQNSYTPQEPTEQQFNCDFGQGMFEQNPFAPQEPSCQEFHLDLDLDQGTVEQELFSPQEPIYQQLDFNLDQGMDLMALTVEQQQLQQGISDMMANTQYLYNGYIYQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.45
3 0.42
4 0.39
5 0.35
6 0.3
7 0.27
8 0.27
9 0.25
10 0.23
11 0.2
12 0.13
13 0.1
14 0.1
15 0.09
16 0.08
17 0.07
18 0.05
19 0.06
20 0.06
21 0.07
22 0.14
23 0.15
24 0.16
25 0.19
26 0.2
27 0.27
28 0.34
29 0.38
30 0.41
31 0.48
32 0.55
33 0.61
34 0.7
35 0.74
36 0.78
37 0.82
38 0.8
39 0.8
40 0.83
41 0.85
42 0.84
43 0.81
44 0.77
45 0.72
46 0.73
47 0.67
48 0.59
49 0.58
50 0.49
51 0.43
52 0.4
53 0.39
54 0.32
55 0.35
56 0.36
57 0.3
58 0.37
59 0.39
60 0.37
61 0.35
62 0.34
63 0.37
64 0.36
65 0.34
66 0.24
67 0.24
68 0.24
69 0.27
70 0.34
71 0.36
72 0.43
73 0.51
74 0.58
75 0.65
76 0.7
77 0.69
78 0.67
79 0.63
80 0.62
81 0.63
82 0.57
83 0.53
84 0.48
85 0.44
86 0.43
87 0.39
88 0.31
89 0.23
90 0.24
91 0.24
92 0.31
93 0.38
94 0.38
95 0.44
96 0.45
97 0.51
98 0.6
99 0.65
100 0.63
101 0.64
102 0.63
103 0.64
104 0.67
105 0.63
106 0.56
107 0.46
108 0.42
109 0.38
110 0.37
111 0.31
112 0.31
113 0.35
114 0.39
115 0.44
116 0.51
117 0.57
118 0.64
119 0.73
120 0.77
121 0.8
122 0.83
123 0.87
124 0.89
125 0.88
126 0.88
127 0.87
128 0.85
129 0.84
130 0.78
131 0.71
132 0.63
133 0.58
134 0.51
135 0.46
136 0.48
137 0.47
138 0.47
139 0.51
140 0.52
141 0.49
142 0.48
143 0.48
144 0.43
145 0.37
146 0.36
147 0.33
148 0.31
149 0.3
150 0.29
151 0.26
152 0.22
153 0.2
154 0.17
155 0.15
156 0.14
157 0.15
158 0.19
159 0.19
160 0.19
161 0.19
162 0.19
163 0.18
164 0.2
165 0.2
166 0.17
167 0.15
168 0.15
169 0.15
170 0.15
171 0.14
172 0.12
173 0.1
174 0.09
175 0.09
176 0.11
177 0.1
178 0.08
179 0.08
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.07
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.07
189 0.06
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.11
194 0.11
195 0.13
196 0.12
197 0.16
198 0.14
199 0.14
200 0.14
201 0.14
202 0.13
203 0.11
204 0.1
205 0.07
206 0.07
207 0.1
208 0.11
209 0.1
210 0.1
211 0.11
212 0.14
213 0.17
214 0.23
215 0.26
216 0.27
217 0.29
218 0.33
219 0.35
220 0.34
221 0.34
222 0.3
223 0.25
224 0.27
225 0.27
226 0.24
227 0.21
228 0.19
229 0.19
230 0.17
231 0.18
232 0.19
233 0.17
234 0.17
235 0.18
236 0.18
237 0.16
238 0.17
239 0.15
240 0.12
241 0.12
242 0.13
243 0.13
244 0.15
245 0.15
246 0.16
247 0.16
248 0.15
249 0.14
250 0.13
251 0.11
252 0.1
253 0.1
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.07
258 0.07
259 0.08
260 0.06
261 0.06
262 0.07
263 0.08
264 0.11
265 0.15
266 0.19
267 0.21
268 0.26
269 0.29
270 0.32
271 0.37
272 0.43
273 0.44
274 0.45
275 0.46
276 0.46
277 0.43
278 0.43
279 0.37
280 0.29
281 0.27
282 0.21
283 0.18
284 0.12
285 0.12
286 0.09
287 0.12
288 0.11
289 0.09
290 0.09
291 0.1
292 0.1
293 0.1
294 0.09
295 0.08
296 0.07
297 0.07
298 0.1
299 0.09
300 0.09
301 0.09
302 0.09
303 0.07
304 0.07
305 0.08
306 0.05
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.09
311 0.15
312 0.22
313 0.23
314 0.26
315 0.28
316 0.29
317 0.32
318 0.33
319 0.29
320 0.25
321 0.24
322 0.23
323 0.22
324 0.2
325 0.17
326 0.14
327 0.11
328 0.08
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.09
333 0.11
334 0.11
335 0.12
336 0.13
337 0.12
338 0.14
339 0.18
340 0.18
341 0.17
342 0.16
343 0.15
344 0.16
345 0.18
346 0.15
347 0.1
348 0.11
349 0.1
350 0.1
351 0.1
352 0.09
353 0.1
354 0.11
355 0.11
356 0.1
357 0.13
358 0.13
359 0.14
360 0.13
361 0.12
362 0.11
363 0.11
364 0.11
365 0.08
366 0.08
367 0.08
368 0.1
369 0.08
370 0.08
371 0.08
372 0.08
373 0.09
374 0.1
375 0.1
376 0.09
377 0.11
378 0.12
379 0.14
380 0.17
381 0.18
382 0.17
383 0.17
384 0.18
385 0.2
386 0.2
387 0.22
388 0.2
389 0.18
390 0.17
391 0.16
392 0.15
393 0.12
394 0.15
395 0.12
396 0.12
397 0.13
398 0.14
399 0.17
400 0.23
401 0.25
402 0.24
403 0.26
404 0.3
405 0.31
406 0.35
407 0.41
408 0.36
409 0.35
410 0.34
411 0.34
412 0.3
413 0.28
414 0.24
415 0.15
416 0.18
417 0.15
418 0.16
419 0.16
420 0.16
421 0.16
422 0.15
423 0.18
424 0.16
425 0.17
426 0.16
427 0.14
428 0.21
429 0.24
430 0.27
431 0.26
432 0.26
433 0.26
434 0.25
435 0.26
436 0.22
437 0.19
438 0.16
439 0.18
440 0.17
441 0.15
442 0.14
443 0.13
444 0.09
445 0.09
446 0.09
447 0.05
448 0.06
449 0.08
450 0.09
451 0.1
452 0.12
453 0.11
454 0.16
455 0.17
456 0.21
457 0.22
458 0.22
459 0.22
460 0.22
461 0.27
462 0.22
463 0.22
464 0.19
465 0.15
466 0.14
467 0.14
468 0.12
469 0.07
470 0.07
471 0.06
472 0.05
473 0.05
474 0.06
475 0.08
476 0.09
477 0.1
478 0.1
479 0.12
480 0.14
481 0.14
482 0.14
483 0.12
484 0.12
485 0.12
486 0.13
487 0.11
488 0.11
489 0.12
490 0.11
491 0.11
492 0.11
493 0.12
494 0.11
495 0.12