Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N4TM40

Protein Details
Accession N4TM40    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
179-205AESAKAKEFRDKRKKKEVKLSKPTSISHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
158-199KRKPSSDSPSRSRSRSRSRPTAESAKAKEFRDKRKKKEVKLS
Subcellular Location(s) mito 14.5, mito_nucl 13.333, nucl 11, cyto_nucl 6.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MAPETPRAVSSRLLTMKFMQRAVASENSSPDSETHSSKKRKTGHSPAAGRLDLNIDQAAIKAALDAQETKRQEALEKHVGADTHWVLDNPFAGLKAASQTKAPLNVVYVGYGDMDSSNDSGDNEDVPRNGQSQKTSDNESESEDEDSDDANTPAHGQKRKPSSDSPSRSRSRSRSRPTAESAKAKEFRDKRKKKEVKLSKPTSISSGGGISSGGGSQFSPAGKAMTCYKCHQTGHKAVDCPKRGQMAHMYD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.37
3 0.44
4 0.44
5 0.42
6 0.35
7 0.31
8 0.32
9 0.34
10 0.33
11 0.28
12 0.26
13 0.28
14 0.29
15 0.28
16 0.27
17 0.22
18 0.23
19 0.23
20 0.26
21 0.3
22 0.37
23 0.45
24 0.5
25 0.58
26 0.6
27 0.67
28 0.72
29 0.76
30 0.77
31 0.78
32 0.78
33 0.76
34 0.73
35 0.64
36 0.54
37 0.43
38 0.37
39 0.27
40 0.24
41 0.18
42 0.12
43 0.11
44 0.11
45 0.12
46 0.08
47 0.07
48 0.05
49 0.06
50 0.07
51 0.08
52 0.1
53 0.12
54 0.2
55 0.21
56 0.23
57 0.24
58 0.23
59 0.26
60 0.27
61 0.32
62 0.33
63 0.32
64 0.31
65 0.31
66 0.31
67 0.27
68 0.28
69 0.2
70 0.13
71 0.13
72 0.12
73 0.11
74 0.12
75 0.12
76 0.08
77 0.07
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.09
83 0.1
84 0.1
85 0.1
86 0.12
87 0.13
88 0.16
89 0.16
90 0.13
91 0.13
92 0.14
93 0.14
94 0.12
95 0.11
96 0.08
97 0.08
98 0.07
99 0.06
100 0.04
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.04
105 0.04
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.06
110 0.06
111 0.07
112 0.07
113 0.08
114 0.08
115 0.1
116 0.11
117 0.12
118 0.13
119 0.15
120 0.19
121 0.2
122 0.23
123 0.22
124 0.23
125 0.22
126 0.22
127 0.21
128 0.18
129 0.17
130 0.13
131 0.13
132 0.1
133 0.1
134 0.08
135 0.08
136 0.07
137 0.06
138 0.06
139 0.07
140 0.1
141 0.16
142 0.19
143 0.2
144 0.27
145 0.36
146 0.4
147 0.43
148 0.45
149 0.48
150 0.54
151 0.6
152 0.6
153 0.6
154 0.61
155 0.61
156 0.63
157 0.64
158 0.64
159 0.67
160 0.69
161 0.7
162 0.72
163 0.73
164 0.72
165 0.72
166 0.68
167 0.65
168 0.61
169 0.59
170 0.58
171 0.54
172 0.57
173 0.55
174 0.6
175 0.64
176 0.7
177 0.7
178 0.76
179 0.84
180 0.84
181 0.87
182 0.87
183 0.87
184 0.89
185 0.87
186 0.83
187 0.78
188 0.7
189 0.62
190 0.54
191 0.43
192 0.33
193 0.27
194 0.19
195 0.15
196 0.14
197 0.1
198 0.08
199 0.07
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.08
205 0.08
206 0.09
207 0.1
208 0.11
209 0.11
210 0.14
211 0.22
212 0.26
213 0.3
214 0.33
215 0.38
216 0.43
217 0.47
218 0.52
219 0.52
220 0.56
221 0.62
222 0.63
223 0.63
224 0.66
225 0.72
226 0.69
227 0.64
228 0.61
229 0.59
230 0.53
231 0.52