Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N4UDS8

Protein Details
Accession N4UDS8    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
531-553TAALPKTSSCKAKRRRSLRSKHLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
542-551AKRRRSLRSK
Subcellular Location(s) extr 23, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000743  Glyco_hydro_28  
IPR024535  Pectate_lyase_SF_prot  
IPR012334  Pectin_lyas_fold  
IPR011050  Pectin_lyase_fold/virulence  
Gene Ontology GO:0004650  F:polygalacturonase activity  
GO:0005975  P:carbohydrate metabolic process  
GO:0071555  P:cell wall organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF00295  Glyco_hydro_28  
PF12708  Pectate_lyase_3  
Amino Acid Sequences MRHSFISALIAVGSAVQAAAQLNGKVGPLTTPSAKAAVKTCNIVDYGAKANAKTDNGPAIQKAWNDCRTGGGEVYVPEGDYGLGTWVTLTSSKPMSFRLDGIIYRIGTDGGNMFMFKHLEDFEFYSSTSKGAIQGYGYEFHKKDEYGPRILRFADVKSFSIHDVALVDSPAFHFSIDTCSDGEVYNMAIHGGNRGGLDGIDVWGTNIHIHDVEVSNKDECVTVKNPSDHLLIENIFCNWSGGCAMGSLATDTDIHDIEYNNIYTQRSNQMYMFKSYGGSGTVNNVALKNFAGHSNAYTLDLDAQWSSMKPIAGDGILYTNMTFSGWSGTCADGHQRGPIKFNCPADVPCTDMQVDDFTVGSNKGDTVEHVCKNAYGSGACLKKGDGGAYTTTQTVDAASAATQTMNGEIENGLGLTVSIAIPTIRPSFFPGVAAISPRMADASKAQATARVETSVPTEAETAADTSIAADVIVPINTSAPVDTSAAADEVVPVATPTASVDKPNSLLPEEHSTLATAVEAFTSAKAAAETTAALPKTSSCKAKRRRSLRSKHL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.04
3 0.04
4 0.05
5 0.05
6 0.07
7 0.09
8 0.1
9 0.11
10 0.12
11 0.12
12 0.11
13 0.11
14 0.11
15 0.12
16 0.16
17 0.18
18 0.2
19 0.21
20 0.26
21 0.26
22 0.28
23 0.29
24 0.32
25 0.32
26 0.33
27 0.32
28 0.3
29 0.3
30 0.28
31 0.25
32 0.21
33 0.23
34 0.25
35 0.26
36 0.23
37 0.25
38 0.28
39 0.29
40 0.28
41 0.26
42 0.27
43 0.28
44 0.3
45 0.29
46 0.28
47 0.3
48 0.31
49 0.34
50 0.36
51 0.38
52 0.38
53 0.37
54 0.38
55 0.37
56 0.36
57 0.3
58 0.23
59 0.2
60 0.18
61 0.21
62 0.17
63 0.14
64 0.11
65 0.11
66 0.1
67 0.08
68 0.07
69 0.06
70 0.06
71 0.05
72 0.06
73 0.06
74 0.07
75 0.08
76 0.08
77 0.11
78 0.14
79 0.16
80 0.17
81 0.2
82 0.25
83 0.26
84 0.26
85 0.27
86 0.27
87 0.25
88 0.28
89 0.29
90 0.23
91 0.22
92 0.21
93 0.17
94 0.14
95 0.14
96 0.11
97 0.09
98 0.09
99 0.08
100 0.09
101 0.1
102 0.11
103 0.1
104 0.11
105 0.11
106 0.11
107 0.14
108 0.15
109 0.16
110 0.16
111 0.16
112 0.16
113 0.15
114 0.15
115 0.13
116 0.12
117 0.13
118 0.13
119 0.13
120 0.11
121 0.14
122 0.16
123 0.19
124 0.19
125 0.23
126 0.22
127 0.23
128 0.25
129 0.23
130 0.28
131 0.34
132 0.38
133 0.4
134 0.45
135 0.44
136 0.45
137 0.45
138 0.4
139 0.32
140 0.3
141 0.28
142 0.26
143 0.25
144 0.24
145 0.25
146 0.22
147 0.21
148 0.19
149 0.12
150 0.1
151 0.1
152 0.09
153 0.08
154 0.07
155 0.06
156 0.07
157 0.08
158 0.07
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.11
163 0.12
164 0.12
165 0.11
166 0.12
167 0.12
168 0.12
169 0.12
170 0.08
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.06
184 0.06
185 0.05
186 0.06
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.07
198 0.08
199 0.1
200 0.12
201 0.13
202 0.13
203 0.13
204 0.13
205 0.12
206 0.11
207 0.14
208 0.14
209 0.17
210 0.21
211 0.22
212 0.23
213 0.24
214 0.25
215 0.2
216 0.19
217 0.17
218 0.14
219 0.13
220 0.13
221 0.11
222 0.1
223 0.09
224 0.09
225 0.06
226 0.06
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.07
243 0.07
244 0.08
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.1
249 0.1
250 0.09
251 0.12
252 0.16
253 0.16
254 0.18
255 0.19
256 0.23
257 0.24
258 0.26
259 0.25
260 0.19
261 0.18
262 0.16
263 0.15
264 0.11
265 0.1
266 0.07
267 0.08
268 0.09
269 0.1
270 0.1
271 0.1
272 0.09
273 0.09
274 0.08
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.09
282 0.09
283 0.1
284 0.09
285 0.09
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.06
290 0.07
291 0.06
292 0.06
293 0.07
294 0.07
295 0.08
296 0.07
297 0.07
298 0.08
299 0.07
300 0.07
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.04
311 0.07
312 0.07
313 0.09
314 0.1
315 0.1
316 0.11
317 0.11
318 0.14
319 0.13
320 0.14
321 0.17
322 0.21
323 0.22
324 0.26
325 0.28
326 0.3
327 0.32
328 0.33
329 0.3
330 0.27
331 0.27
332 0.25
333 0.24
334 0.23
335 0.19
336 0.19
337 0.17
338 0.15
339 0.15
340 0.12
341 0.12
342 0.08
343 0.08
344 0.06
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.06
349 0.06
350 0.07
351 0.07
352 0.08
353 0.14
354 0.2
355 0.21
356 0.22
357 0.22
358 0.21
359 0.22
360 0.22
361 0.17
362 0.1
363 0.11
364 0.16
365 0.18
366 0.18
367 0.17
368 0.16
369 0.18
370 0.18
371 0.18
372 0.12
373 0.12
374 0.14
375 0.15
376 0.16
377 0.14
378 0.13
379 0.12
380 0.11
381 0.09
382 0.08
383 0.06
384 0.06
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.06
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.03
403 0.04
404 0.04
405 0.03
406 0.04
407 0.04
408 0.05
409 0.08
410 0.11
411 0.11
412 0.11
413 0.17
414 0.2
415 0.2
416 0.21
417 0.19
418 0.18
419 0.19
420 0.2
421 0.16
422 0.13
423 0.13
424 0.12
425 0.12
426 0.1
427 0.1
428 0.1
429 0.17
430 0.18
431 0.19
432 0.19
433 0.23
434 0.25
435 0.26
436 0.26
437 0.2
438 0.19
439 0.18
440 0.21
441 0.2
442 0.18
443 0.16
444 0.15
445 0.13
446 0.14
447 0.14
448 0.12
449 0.08
450 0.08
451 0.07
452 0.06
453 0.07
454 0.06
455 0.05
456 0.04
457 0.05
458 0.06
459 0.06
460 0.06
461 0.06
462 0.07
463 0.07
464 0.08
465 0.07
466 0.07
467 0.09
468 0.09
469 0.1
470 0.1
471 0.1
472 0.1
473 0.1
474 0.09
475 0.08
476 0.07
477 0.07
478 0.06
479 0.05
480 0.05
481 0.05
482 0.05
483 0.07
484 0.12
485 0.12
486 0.15
487 0.18
488 0.2
489 0.22
490 0.25
491 0.26
492 0.23
493 0.24
494 0.26
495 0.31
496 0.31
497 0.3
498 0.28
499 0.26
500 0.24
501 0.22
502 0.18
503 0.1
504 0.08
505 0.07
506 0.07
507 0.07
508 0.07
509 0.08
510 0.08
511 0.08
512 0.08
513 0.08
514 0.08
515 0.09
516 0.1
517 0.1
518 0.16
519 0.16
520 0.16
521 0.16
522 0.19
523 0.24
524 0.3
525 0.37
526 0.39
527 0.5
528 0.6
529 0.71
530 0.79
531 0.83
532 0.88
533 0.89