Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5AP95

Protein Details
Accession Q5AP95    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
215-244HGSHRPIKMKRPTIKRRKRNVSDKKSKDEVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
218-239HRPIKMKRPTIKRRKRNVSDKK
Subcellular Location(s) nucl 26.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039355  Transcription_factor_GATA  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0000976  F:transcription cis-regulatory region binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0071280  P:cellular response to copper ion  
GO:0071281  P:cellular response to iron ion  
GO:0006879  P:intracellular iron ion homeostasis  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG cal:CAALFM_C110020WA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00344  GATA_ZN_FINGER_1  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MPTSPTESIPNSSTKEQPILPKMLPTAKSPHTTPAQSPQNSDHHHHHQQTPPQPTDGQQCSNCGTTKTPLWRRAPDGTLICNACGLYYRSNNTHRPVNLKRPPNTIAVVKEEEGSCKGDGRCNGTGGSAACKGCPAYNNRIVAKKALEKSPKNDSSRAPIDKSLKRSTSTDATTEDESSLAIACFNCGTTITPLWRRDDAGNTICNACGLFYRLHGSHRPIKMKRPTIKRRKRNVSDKKSKDEVQMHSSDQSPIVASDPISPTPHNNENNNNVTNITTTTKTPTRSPHYYQPPPQYPYQHHPINSTTSSAINRLPPISYQSPYQTAPLSHSPMQSSSSYSPGASSVIPSSYYPPYSGSGRIPNGPGPVPGPPPPPPPTQSQPHHQQITTSPTSQSYGSLRAPIHITKRGYTPENIRLPSIQLTSSTSSNSETKLPPITNHSEKCCSNCAGPKSLAPMAIDFTASYRFNNIDSQTKLTKEDQNDSEGVSRDNDTRDENKPIKQEEHRSALSIGKLLNG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.39
3 0.4
4 0.46
5 0.47
6 0.48
7 0.45
8 0.44
9 0.45
10 0.48
11 0.46
12 0.41
13 0.42
14 0.42
15 0.45
16 0.43
17 0.46
18 0.45
19 0.47
20 0.47
21 0.49
22 0.53
23 0.51
24 0.53
25 0.52
26 0.54
27 0.55
28 0.57
29 0.54
30 0.54
31 0.61
32 0.63
33 0.64
34 0.63
35 0.67
36 0.71
37 0.71
38 0.65
39 0.59
40 0.54
41 0.51
42 0.52
43 0.49
44 0.47
45 0.4
46 0.4
47 0.4
48 0.42
49 0.4
50 0.32
51 0.3
52 0.27
53 0.33
54 0.4
55 0.46
56 0.52
57 0.58
58 0.61
59 0.64
60 0.66
61 0.62
62 0.59
63 0.53
64 0.47
65 0.46
66 0.41
67 0.35
68 0.3
69 0.27
70 0.19
71 0.19
72 0.18
73 0.18
74 0.22
75 0.26
76 0.32
77 0.39
78 0.45
79 0.46
80 0.51
81 0.48
82 0.52
83 0.56
84 0.6
85 0.63
86 0.66
87 0.66
88 0.65
89 0.65
90 0.6
91 0.55
92 0.49
93 0.43
94 0.4
95 0.38
96 0.32
97 0.31
98 0.28
99 0.26
100 0.23
101 0.23
102 0.17
103 0.2
104 0.2
105 0.23
106 0.25
107 0.3
108 0.3
109 0.29
110 0.29
111 0.24
112 0.25
113 0.21
114 0.22
115 0.2
116 0.18
117 0.16
118 0.17
119 0.17
120 0.17
121 0.21
122 0.23
123 0.27
124 0.33
125 0.39
126 0.41
127 0.45
128 0.44
129 0.43
130 0.42
131 0.41
132 0.39
133 0.41
134 0.47
135 0.47
136 0.51
137 0.58
138 0.61
139 0.57
140 0.58
141 0.52
142 0.51
143 0.55
144 0.54
145 0.46
146 0.45
147 0.49
148 0.5
149 0.54
150 0.53
151 0.48
152 0.46
153 0.45
154 0.44
155 0.42
156 0.39
157 0.34
158 0.29
159 0.29
160 0.28
161 0.26
162 0.22
163 0.15
164 0.13
165 0.11
166 0.09
167 0.06
168 0.06
169 0.05
170 0.05
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.07
176 0.09
177 0.11
178 0.15
179 0.21
180 0.24
181 0.27
182 0.27
183 0.28
184 0.27
185 0.3
186 0.31
187 0.27
188 0.26
189 0.24
190 0.24
191 0.21
192 0.2
193 0.15
194 0.1
195 0.07
196 0.08
197 0.07
198 0.08
199 0.12
200 0.12
201 0.15
202 0.18
203 0.23
204 0.28
205 0.34
206 0.42
207 0.41
208 0.49
209 0.55
210 0.62
211 0.65
212 0.69
213 0.74
214 0.76
215 0.84
216 0.86
217 0.88
218 0.89
219 0.9
220 0.91
221 0.91
222 0.91
223 0.91
224 0.87
225 0.83
226 0.77
227 0.7
228 0.66
229 0.61
230 0.53
231 0.47
232 0.44
233 0.37
234 0.34
235 0.32
236 0.25
237 0.19
238 0.15
239 0.1
240 0.08
241 0.08
242 0.07
243 0.07
244 0.09
245 0.1
246 0.11
247 0.12
248 0.12
249 0.12
250 0.17
251 0.24
252 0.25
253 0.26
254 0.29
255 0.34
256 0.38
257 0.38
258 0.33
259 0.26
260 0.23
261 0.21
262 0.18
263 0.14
264 0.11
265 0.1
266 0.14
267 0.17
268 0.19
269 0.21
270 0.26
271 0.32
272 0.37
273 0.41
274 0.46
275 0.53
276 0.58
277 0.62
278 0.64
279 0.63
280 0.6
281 0.59
282 0.55
283 0.5
284 0.48
285 0.49
286 0.44
287 0.38
288 0.38
289 0.37
290 0.36
291 0.32
292 0.28
293 0.22
294 0.2
295 0.2
296 0.19
297 0.18
298 0.16
299 0.16
300 0.15
301 0.15
302 0.13
303 0.18
304 0.2
305 0.19
306 0.19
307 0.21
308 0.23
309 0.23
310 0.24
311 0.2
312 0.17
313 0.2
314 0.22
315 0.24
316 0.24
317 0.24
318 0.24
319 0.23
320 0.26
321 0.22
322 0.22
323 0.18
324 0.19
325 0.18
326 0.17
327 0.16
328 0.14
329 0.14
330 0.1
331 0.1
332 0.09
333 0.09
334 0.1
335 0.1
336 0.13
337 0.14
338 0.15
339 0.14
340 0.15
341 0.17
342 0.18
343 0.2
344 0.2
345 0.24
346 0.25
347 0.27
348 0.27
349 0.27
350 0.27
351 0.25
352 0.23
353 0.18
354 0.19
355 0.2
356 0.21
357 0.23
358 0.24
359 0.29
360 0.33
361 0.36
362 0.35
363 0.39
364 0.42
365 0.47
366 0.48
367 0.5
368 0.55
369 0.59
370 0.61
371 0.54
372 0.5
373 0.46
374 0.49
375 0.45
376 0.37
377 0.3
378 0.27
379 0.28
380 0.26
381 0.24
382 0.19
383 0.2
384 0.2
385 0.24
386 0.22
387 0.23
388 0.26
389 0.28
390 0.31
391 0.33
392 0.34
393 0.31
394 0.36
395 0.39
396 0.39
397 0.39
398 0.41
399 0.43
400 0.49
401 0.48
402 0.44
403 0.4
404 0.4
405 0.39
406 0.33
407 0.24
408 0.18
409 0.21
410 0.22
411 0.22
412 0.21
413 0.18
414 0.19
415 0.21
416 0.21
417 0.22
418 0.21
419 0.23
420 0.28
421 0.29
422 0.27
423 0.33
424 0.4
425 0.43
426 0.47
427 0.49
428 0.5
429 0.51
430 0.53
431 0.51
432 0.45
433 0.42
434 0.45
435 0.43
436 0.43
437 0.43
438 0.4
439 0.41
440 0.41
441 0.38
442 0.31
443 0.27
444 0.24
445 0.22
446 0.21
447 0.14
448 0.14
449 0.16
450 0.16
451 0.16
452 0.16
453 0.16
454 0.18
455 0.23
456 0.25
457 0.28
458 0.3
459 0.36
460 0.37
461 0.38
462 0.41
463 0.41
464 0.45
465 0.43
466 0.48
467 0.44
468 0.45
469 0.44
470 0.41
471 0.41
472 0.35
473 0.31
474 0.24
475 0.24
476 0.23
477 0.25
478 0.25
479 0.27
480 0.3
481 0.34
482 0.41
483 0.44
484 0.46
485 0.51
486 0.55
487 0.57
488 0.61
489 0.66
490 0.64
491 0.68
492 0.63
493 0.58
494 0.55
495 0.51
496 0.44
497 0.37