Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0CQ39

Protein Details
Accession B0CQ39    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
273-296AYFVGKSKNAPKPRAKKEEKVFLEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
42-62SQKPRGGPAARGGKYYSRGGK
88-107EGGRGRGRGGRGGPGRGRSR
279-338SKNAPKPRAKKEEKVFLEIDARFERPDRGGRGRGRGGDRGGDRGDRGRGGRGRGGARGGR
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_nucl 13, nucl 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_291498  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
Amino Acid Sequences MSVASKNPFALLDAEDASRPSSPVAVPLADAPTPPTAPARGSQKPRGGPAARGGKYYSRGGKPPARDANPNQTLEEPSTVEGERKLVEGGRGRGRGGRGGPGRGRSRQYDRHSQTGRIDTDKRIHQSWGGDDGNTELKAEQAATVDAAVEATTNAAVEATTNDWAGDAGAPAAGEWGAPEAGADAWAAPAGDATAAATTPAAAEGEKPEGRPRREREPEEEDNTLTLDQYLAQQKEKDTVIPKLENTRKANEGADANIWKDVVPLSKNEEEDAYFVGKSKNAPKPRAKKEEKVFLEIDARFERPDRGGRGRGRGGDRGGDRGDRGRGGRGRGGARGGRQNGTPAVNVDDQTAFPSLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.17
3 0.18
4 0.18
5 0.16
6 0.15
7 0.12
8 0.13
9 0.12
10 0.16
11 0.18
12 0.16
13 0.16
14 0.18
15 0.21
16 0.18
17 0.18
18 0.17
19 0.17
20 0.17
21 0.18
22 0.18
23 0.16
24 0.18
25 0.23
26 0.29
27 0.34
28 0.42
29 0.49
30 0.55
31 0.57
32 0.6
33 0.64
34 0.58
35 0.53
36 0.54
37 0.56
38 0.5
39 0.47
40 0.46
41 0.41
42 0.43
43 0.46
44 0.45
45 0.39
46 0.42
47 0.48
48 0.52
49 0.52
50 0.58
51 0.61
52 0.57
53 0.6
54 0.62
55 0.65
56 0.65
57 0.61
58 0.53
59 0.45
60 0.43
61 0.38
62 0.34
63 0.24
64 0.17
65 0.18
66 0.17
67 0.16
68 0.15
69 0.14
70 0.13
71 0.12
72 0.13
73 0.11
74 0.15
75 0.2
76 0.25
77 0.3
78 0.31
79 0.31
80 0.33
81 0.34
82 0.34
83 0.29
84 0.32
85 0.28
86 0.33
87 0.36
88 0.4
89 0.44
90 0.45
91 0.47
92 0.45
93 0.5
94 0.53
95 0.56
96 0.6
97 0.59
98 0.64
99 0.63
100 0.61
101 0.58
102 0.55
103 0.51
104 0.46
105 0.44
106 0.38
107 0.41
108 0.42
109 0.4
110 0.35
111 0.33
112 0.3
113 0.3
114 0.28
115 0.29
116 0.25
117 0.21
118 0.19
119 0.2
120 0.2
121 0.18
122 0.16
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.07
128 0.05
129 0.06
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.04
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.04
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.06
152 0.06
153 0.05
154 0.04
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.02
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.02
178 0.02
179 0.02
180 0.02
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.04
191 0.05
192 0.1
193 0.11
194 0.11
195 0.18
196 0.25
197 0.3
198 0.38
199 0.41
200 0.47
201 0.56
202 0.59
203 0.59
204 0.61
205 0.63
206 0.59
207 0.55
208 0.45
209 0.36
210 0.33
211 0.26
212 0.17
213 0.11
214 0.07
215 0.05
216 0.09
217 0.15
218 0.15
219 0.17
220 0.18
221 0.19
222 0.23
223 0.23
224 0.23
225 0.21
226 0.25
227 0.28
228 0.29
229 0.3
230 0.36
231 0.41
232 0.46
233 0.46
234 0.45
235 0.42
236 0.42
237 0.41
238 0.34
239 0.3
240 0.23
241 0.23
242 0.21
243 0.19
244 0.17
245 0.16
246 0.13
247 0.12
248 0.12
249 0.12
250 0.12
251 0.13
252 0.19
253 0.23
254 0.23
255 0.23
256 0.23
257 0.2
258 0.2
259 0.2
260 0.15
261 0.12
262 0.13
263 0.13
264 0.13
265 0.17
266 0.25
267 0.32
268 0.39
269 0.48
270 0.57
271 0.66
272 0.75
273 0.83
274 0.81
275 0.82
276 0.83
277 0.85
278 0.78
279 0.74
280 0.64
281 0.55
282 0.55
283 0.45
284 0.41
285 0.33
286 0.3
287 0.25
288 0.26
289 0.26
290 0.23
291 0.3
292 0.32
293 0.36
294 0.44
295 0.48
296 0.55
297 0.58
298 0.61
299 0.59
300 0.57
301 0.53
302 0.52
303 0.48
304 0.45
305 0.42
306 0.37
307 0.35
308 0.34
309 0.35
310 0.32
311 0.32
312 0.35
313 0.37
314 0.4
315 0.43
316 0.44
317 0.44
318 0.43
319 0.47
320 0.43
321 0.45
322 0.49
323 0.48
324 0.45
325 0.43
326 0.44
327 0.41
328 0.39
329 0.35
330 0.27
331 0.28
332 0.28
333 0.28
334 0.26
335 0.23
336 0.21
337 0.22